MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 109593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018078	CG	5	10	127378	127387	0 %	0 %	50 %	50 %	392430518
3002	NC_018078	GCA	2	6	127395	127400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3003	NC_018078	CGG	2	6	127404	127409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430518
3004	NC_018078	GGT	2	6	127420	127425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430518
3005	NC_018078	TGC	2	6	127455	127460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3006	NC_018078	GC	3	6	127467	127472	0 %	0 %	50 %	50 %	392430518
3007	NC_018078	ACC	2	6	127475	127480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3008	NC_018078	GCGAG	2	10	127555	127564	20 %	0 %	60 %	20 %	392430518
3009	NC_018078	GCG	2	6	127598	127603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430518
3010	NC_018078	CCA	2	6	127623	127628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3011	NC_018078	GCA	2	6	127704	127709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3012	NC_018078	GCC	2	6	127732	127737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3013	NC_018078	GCA	2	6	127752	127757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3014	NC_018078	GCC	2	6	127796	127801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3015	NC_018078	CCG	2	6	127818	127823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3016	NC_018078	CG	3	6	127828	127833	0 %	0 %	50 %	50 %	392430518
3017	NC_018078	GCG	2	6	127838	127843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430518
3018	NC_018078	CG	3	6	127870	127875	0 %	0 %	50 %	50 %	392430518
3019	NC_018078	CGA	2	6	127887	127892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3020	NC_018078	TGC	2	6	127896	127901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3021	NC_018078	TCG	2	6	127994	127999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3022	NC_018078	CCA	2	6	128016	128021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3023	NC_018078	GC	3	6	128026	128031	0 %	0 %	50 %	50 %	392430518
3024	NC_018078	CCG	2	6	128034	128039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3025	NC_018078	ACC	2	6	128042	128047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3026	NC_018078	GCC	2	6	128126	128131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3027	NC_018078	CCG	2	6	128157	128162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3028	NC_018078	CAC	3	9	128164	128172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3029	NC_018078	CGG	2	6	128208	128213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430518
3030	NC_018078	CCG	2	6	128214	128219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3031	NC_018078	TCA	2	6	128265	128270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430518
3032	NC_018078	TGC	2	6	128298	128303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3033	NC_018078	TGC	2	6	128317	128322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3034	NC_018078	GCG	2	6	128415	128420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430518
3035	NC_018078	GTC	2	6	128443	128448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3036	NC_018078	GCC	2	6	128457	128462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3037	NC_018078	GCC	2	6	128500	128505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3038	NC_018078	GGGGT	2	10	128564	128573	0 %	20 %	80 %	0 %	392430518
3039	NC_018078	GCA	2	6	128583	128588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3040	NC_018078	GGC	2	6	128593	128598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430518
3041	NC_018078	GCGGCA	2	12	128627	128638	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392430518
3042	NC_018078	GCTG	2	8	128665	128672	0 %	25 %	50 %	25 %	392430518
3043	NC_018078	TGG	2	6	128676	128681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430518
3044	NC_018078	CAA	2	6	128704	128709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430518
3045	NC_018078	GGT	2	6	128722	128727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430518
3046	NC_018078	CCG	2	6	128799	128804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3047	NC_018078	TCG	2	6	128861	128866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3048	NC_018078	CG	3	6	128965	128970	0 %	0 %	50 %	50 %	392430518
3049	NC_018078	ACC	2	6	129065	129070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3050	NC_018078	GCA	2	6	129096	129101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3051	NC_018078	CCCAC	2	10	129126	129135	20 %	0 %	0 %	80 %	392430518
3052	NC_018078	ACC	2	6	129164	129169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3053	NC_018078	TCGGGT	2	12	129266	129277	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392430518
3054	NC_018078	GTC	3	9	129322	129330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3055	NC_018078	TGCA	2	8	129352	129359	25 %	25 %	25 %	25 %	392430518
3056	NC_018078	ACC	2	6	129404	129409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3057	NC_018078	GGC	2	6	129423	129428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430518
3058	NC_018078	CCG	2	6	129486	129491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3059	NC_018078	GCCG	2	8	129544	129551	0 %	0 %	50 %	50 %	392430518
3060	NC_018078	ACC	2	6	129562	129567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3061	NC_018078	CCA	2	6	129573	129578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3062	NC_018078	CCGGC	2	10	129636	129645	0 %	0 %	40 %	60 %	392430518
3063	NC_018078	CCG	2	6	129686	129691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3064	NC_018078	ACG	2	6	129695	129700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3065	NC_018078	GCC	2	6	129716	129721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3066	NC_018078	GCC	2	6	129725	129730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3067	NC_018078	CGA	2	6	129766	129771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3068	NC_018078	GAT	2	6	129772	129777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430518
3069	NC_018078	CAC	2	6	129781	129786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3070	NC_018078	GCC	2	6	129851	129856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3071	NC_018078	AGC	2	6	129893	129898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3072	NC_018078	GCC	3	9	129929	129937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3073	NC_018078	GCG	2	6	129944	129949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430518
3074	NC_018078	TGG	2	6	130038	130043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430518
3075	NC_018078	TGCGG	2	10	130046	130055	0 %	20 %	60 %	20 %	392430518
3076	NC_018078	CGA	2	6	130180	130185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430518
3077	NC_018078	CCAG	2	8	130193	130200	25 %	0 %	25 %	50 %	392430518
3078	NC_018078	ACC	2	6	130283	130288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3079	NC_018078	CTC	2	6	130348	130353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430518
3080	NC_018078	GGC	2	6	130360	130365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430518
3081	NC_018078	CGG	2	6	130441	130446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430518
3082	NC_018078	CAC	2	6	130510	130515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3083	NC_018078	CAC	2	6	130522	130527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3084	NC_018078	CCG	2	6	130569	130574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430518
3085	NC_018078	CTGT	2	8	130611	130618	0 %	50 %	25 %	25 %	392430518
3086	NC_018078	CAC	2	6	130635	130640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430518
3087	NC_018078	GCGA	2	8	130797	130804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3088	NC_018078	CGGG	2	8	130840	130847	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_018078	ACG	2	6	130897	130902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_018078	G	6	6	131005	131010	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_018078	CGA	2	6	131012	131017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_018078	GGT	2	6	131036	131041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430519
3093	NC_018078	CCG	2	6	131063	131068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430519
3094	NC_018078	TGG	2	6	131095	131100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430519
3095	NC_018078	CAC	2	6	131124	131129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430519
3096	NC_018078	CGG	2	6	131346	131351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_018078	GCTC	2	8	131352	131359	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_018078	GGT	2	6	131363	131368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_018078	CCA	2	6	131475	131480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430520
3100	NC_018078	ATCAC	2	10	131525	131534	40 %	20 %	0 %	40 %	392430520
3101	NC_018078	GCG	2	6	131549	131554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3102	NC_018078	ATCGG	2	10	131573	131582	20 %	20 %	40 %	20 %	392430520
3103	NC_018078	CGA	2	6	131616	131621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430520
3104	NC_018078	GCA	2	6	131824	131829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430520
3105	NC_018078	CCCA	2	8	131855	131862	25 %	0 %	0 %	75 %	392430520
3106	NC_018078	ATC	2	6	131882	131887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430520
3107	NC_018078	CGG	2	6	131935	131940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3108	NC_018078	CGG	2	6	131965	131970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3109	NC_018078	CGG	2	6	131974	131979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3110	NC_018078	GGT	2	6	131993	131998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430520
3111	NC_018078	CGG	2	6	132001	132006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3112	NC_018078	CGG	2	6	132028	132033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3113	NC_018078	CGG	2	6	132037	132042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3114	NC_018078	CGG	2	6	132046	132051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3115	NC_018078	GCGG	2	8	132071	132078	0 %	0 %	75 %	25 %	392430520
3116	NC_018078	GGCG	2	8	132079	132086	0 %	0 %	75 %	25 %	392430520
3117	NC_018078	GCT	2	6	132097	132102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430520
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3119	NC_018078	CGG	2	6	132121	132126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3120	NC_018078	CAC	2	6	132142	132147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430520
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3122	NC_018078	CGG	2	6	132211	132216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3123	NC_018078	GCG	2	6	132222	132227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3124	NC_018078	CGG	2	6	132229	132234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3125	NC_018078	CGG	2	6	132253	132258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
3126	NC_018078	CGG	2	6	132271	132276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430520
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3189	NC_018078	CGGG	2	8	134064	134071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3190	NC_018078	GTCG	2	8	134132	134139	0 %	25 %	50 %	25 %	392430522
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3213	NC_018078	GAC	2	6	134956	134961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430522
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3224	NC_018078	CGG	2	6	135408	135413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430522
3225	NC_018078	CGC	2	6	135415	135420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430522
3226	NC_018078	TCGCCG	2	12	135425	135436	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392430522
3227	NC_018078	GCC	2	6	135538	135543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430522
3228	NC_018078	GGCC	2	8	135657	135664	0 %	0 %	50 %	50 %	392430522
3229	NC_018078	CGTTG	2	10	135700	135709	0 %	40 %	40 %	20 %	392430522
3230	NC_018078	TCG	2	6	135714	135719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430522
3231	NC_018078	CGACC	2	10	135772	135781	20 %	0 %	20 %	60 %	392430522
3232	NC_018078	AGCG	2	8	135810	135817	25 %	0 %	50 %	25 %	392430522
3233	NC_018078	CAC	2	6	135856	135861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430522
3234	NC_018078	CGG	2	6	135877	135882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430522
3235	NC_018078	GGA	2	6	135910	135915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430522
3236	NC_018078	CAA	2	6	135997	136002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430522
3237	NC_018078	CCG	2	6	136140	136145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3238	NC_018078	TG	3	6	136186	136191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3239	NC_018078	TGA	2	6	136207	136212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_018078	GTG	2	6	136223	136228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_018078	GC	4	8	136321	136328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3242	NC_018078	ATG	2	6	136450	136455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430523
3243	NC_018078	GCC	2	6	136483	136488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430523
3244	NC_018078	CTAC	2	8	136505	136512	25 %	25 %	0 %	50 %	392430523
3245	NC_018078	CGG	2	6	136649	136654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430523
3246	NC_018078	CCGG	2	8	136665	136672	0 %	0 %	50 %	50 %	392430523
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3362	NC_018078	GGCGCT	2	12	142215	142226	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392430528
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3443	NC_018078	CGG	2	6	145408	145413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430530
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3488	NC_018078	CG	3	6	147471	147476	0 %	0 %	50 %	50 %	392430531
3489	NC_018078	TCG	2	6	147523	147528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430531
3490	NC_018078	CGG	2	6	147566	147571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430531
3491	NC_018078	CGA	2	6	147623	147628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430531
3492	NC_018078	CGT	2	6	147644	147649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430531
3493	NC_018078	TCG	2	6	147703	147708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430531
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