MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 109593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2366	NC_018078	GCC	2	6	99476	99481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2368	NC_018078	ACCG	2	8	99574	99581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2369	NC_018078	TGC	2	6	99632	99637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2371	NC_018078	GTT	2	6	99695	99700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2372	NC_018078	CG	4	8	99744	99751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2373	NC_018078	GCC	2	6	99769	99774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2374	NC_018078	CAG	2	6	99894	99899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430502
2375	NC_018078	GCC	3	9	99954	99962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430502
2376	NC_018078	GCT	2	6	99998	100003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430502
2377	NC_018078	CGAT	2	8	100007	100014	25 %	25 %	25 %	25 %	392430502
2378	NC_018078	CGG	2	6	100049	100054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430502
2379	NC_018078	GTC	2	6	100101	100106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430502
2380	NC_018078	ACCG	2	8	100178	100185	25 %	0 %	25 %	50 %	392430502
2381	NC_018078	ATCG	2	8	100218	100225	25 %	25 %	25 %	25 %	392430502
2382	NC_018078	CCG	2	6	100270	100275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430502
2383	NC_018078	GGT	2	6	100281	100286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430502
2384	NC_018078	CTA	2	6	100304	100309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430502
2385	NC_018078	CAC	2	6	100368	100373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430502
2386	NC_018078	CGG	2	6	100379	100384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430502
2387	NC_018078	GCGGT	2	10	100405	100414	0 %	20 %	60 %	20 %	392430502
2388	NC_018078	CG	3	6	100458	100463	0 %	0 %	50 %	50 %	392430502
2389	NC_018078	GGC	2	6	100523	100528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430502
2390	NC_018078	CTG	2	6	100545	100550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430502
2391	NC_018078	TGC	2	6	100555	100560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430502
2392	NC_018078	GAC	2	6	100582	100587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2393	NC_018078	CCG	2	6	100591	100596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2394	NC_018078	GGC	2	6	100614	100619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2395	NC_018078	GGTGA	2	10	100623	100632	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2396	NC_018078	GCC	3	9	100658	100666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2397	NC_018078	GAG	2	6	100701	100706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2398	NC_018078	GAC	2	6	100714	100719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430503
2399	NC_018078	TGCG	2	8	100789	100796	0 %	25 %	50 %	25 %	392430503
2400	NC_018078	CAA	2	6	100819	100824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430503
2401	NC_018078	CCG	2	6	100921	100926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430503
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2403	NC_018078	GCT	2	6	101002	101007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430503
2404	NC_018078	CGC	2	6	101023	101028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430503
2405	NC_018078	TGCC	2	8	101076	101083	0 %	25 %	25 %	50 %	392430503
2406	NC_018078	GC	3	6	101115	101120	0 %	0 %	50 %	50 %	392430503
2407	NC_018078	GCG	2	6	101144	101149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430503
2408	NC_018078	CGCC	2	8	101179	101186	0 %	0 %	25 %	75 %	392430503
2409	NC_018078	CGC	2	6	101191	101196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430503
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2413	NC_018078	TATT	2	8	101323	101330	25 %	75 %	0 %	0 %	392430503
2414	NC_018078	CGG	2	6	101340	101345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430503
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2417	NC_018078	GGC	2	6	101425	101430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430503
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2422	NC_018078	G	7	7	101629	101635	0 %	0 %	100 %	0 %	392430503
2423	NC_018078	CGG	2	6	101644	101649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430503
2424	NC_018078	CAC	2	6	101650	101655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430503
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2426	NC_018078	GGC	2	6	101683	101688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430503
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2429	NC_018078	CGT	2	6	102028	102033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430503
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2441	NC_018078	ACG	2	6	102630	102635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430503
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2443	NC_018078	CAT	2	6	102709	102714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430503
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2456	NC_018078	GCGCC	2	10	103237	103246	0 %	0 %	40 %	60 %	392430504
2457	NC_018078	ACG	2	6	103276	103281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430504
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2459	NC_018078	GCG	2	6	103438	103443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430504
2460	NC_018078	CGG	2	6	103446	103451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430504
2461	NC_018078	CGGG	2	8	103481	103488	0 %	0 %	75 %	25 %	392430504
2462	NC_018078	CTGG	2	8	103517	103524	0 %	25 %	50 %	25 %	392430504
2463	NC_018078	GC	3	6	103599	103604	0 %	0 %	50 %	50 %	392430504
2464	NC_018078	CG	4	8	103633	103640	0 %	0 %	50 %	50 %	392430504
2465	NC_018078	CGC	2	6	103709	103714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430504
2466	NC_018078	GTG	2	6	103751	103756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430504
2467	NC_018078	GTG	2	6	103803	103808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2468	NC_018078	GTC	4	12	103851	103862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430505
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2470	NC_018078	GTG	2	6	103887	103892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430505
2471	NC_018078	GGTGG	2	10	103925	103934	0 %	20 %	80 %	0 %	392430505
2472	NC_018078	GTT	2	6	103962	103967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430505
2473	NC_018078	GTGG	2	8	103968	103975	0 %	25 %	75 %	0 %	392430505
2474	NC_018078	GTG	2	6	104067	104072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430505
2475	NC_018078	AGT	2	6	104240	104245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430505
2476	NC_018078	GCC	3	9	104295	104303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430505
2477	NC_018078	GGTC	2	8	104333	104340	0 %	25 %	50 %	25 %	392430505
2478	NC_018078	GTG	3	9	104344	104352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430505
2479	NC_018078	GC	4	8	104408	104415	0 %	0 %	50 %	50 %	392430505
2480	NC_018078	CAG	2	6	104424	104429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430505
2481	NC_018078	CGT	2	6	104432	104437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430505
2482	NC_018078	GGC	2	6	104475	104480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430505
2483	NC_018078	GTG	2	6	104491	104496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430505
2484	NC_018078	GTC	2	6	104514	104519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430505
2485	NC_018078	GGC	2	6	104538	104543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430505
2486	NC_018078	G	6	6	104582	104587	0 %	0 %	100 %	0 %	392430505
2487	NC_018078	CGT	2	6	104615	104620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430505
2488	NC_018078	TCGGTG	2	12	104662	104673	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392430505
2489	NC_018078	TCG	2	6	104728	104733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430505
2490	NC_018078	CGG	2	6	104771	104776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430505
2491	NC_018078	CGG	2	6	104801	104806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2492	NC_018078	GCGGTG	2	12	104873	104884	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2493	NC_018078	GGCTT	2	10	104938	104947	0 %	40 %	40 %	20 %	392430506
2494	NC_018078	CGGC	2	8	104959	104966	0 %	0 %	50 %	50 %	392430506
2495	NC_018078	GC	3	6	104999	105004	0 %	0 %	50 %	50 %	392430506
2496	NC_018078	GCC	2	6	105015	105020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430506
2497	NC_018078	TTC	2	6	105024	105029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430506
2498	NC_018078	GTTG	2	8	105050	105057	0 %	50 %	50 %	0 %	392430506
2499	NC_018078	CCG	2	6	105074	105079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430506
2500	NC_018078	CTC	2	6	105207	105212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430506

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