MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 109593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018078	GCC	2	6	63740	63745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430467
1502	NC_018078	TCG	2	6	63767	63772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430467
1503	NC_018078	GAC	2	6	63814	63819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430467
1504	NC_018078	GCC	2	6	63833	63838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430467
1505	NC_018078	GCC	2	6	63841	63846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430467
1506	NC_018078	GT	3	6	63892	63897	0 %	50 %	50 %	0 %	392430467
1507	NC_018078	TCA	2	6	63968	63973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430467
1508	NC_018078	TAC	2	6	63985	63990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430467
1509	NC_018078	AAGG	2	8	63992	63999	50 %	0 %	50 %	0 %	392430467
1510	NC_018078	AGG	3	9	63997	64005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018078	CCT	2	6	64033	64038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430468
1512	NC_018078	CGC	2	6	64118	64123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430468
1513	NC_018078	TCG	3	9	64191	64199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430468
1514	NC_018078	CAT	2	6	64228	64233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430468
1515	NC_018078	CCA	2	6	64242	64247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430468
1516	NC_018078	CAG	2	6	64418	64423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430468
1517	NC_018078	C	6	6	64450	64455	0 %	0 %	0 %	100 %	392430468
1518	NC_018078	GC	3	6	64510	64515	0 %	0 %	50 %	50 %	392430468
1519	NC_018078	GCG	2	6	64534	64539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430468
1520	NC_018078	CAG	2	6	64547	64552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430468
1521	NC_018078	CGC	2	6	64553	64558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430468
1522	NC_018078	CCGATC	2	12	64635	64646	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392430468
1523	NC_018078	AACC	2	8	64769	64776	50 %	0 %	0 %	50 %	392430468
1524	NC_018078	ACT	2	6	64787	64792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430468
1525	NC_018078	GCT	2	6	64912	64917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430468
1526	NC_018078	CGA	2	6	65020	65025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430468
1527	NC_018078	TCG	2	6	65080	65085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_018078	GCT	2	6	65127	65132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430469
1529	NC_018078	CGGA	2	8	65133	65140	25 %	0 %	50 %	25 %	392430469
1530	NC_018078	ACC	2	6	65155	65160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430469
1531	NC_018078	GGC	2	6	65165	65170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430469
1532	NC_018078	CCG	2	6	65189	65194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430469
1533	NC_018078	ACTTCA	2	12	65439	65450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430469
1534	NC_018078	CGG	2	6	65481	65486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430469
1535	NC_018078	TGCCG	2	10	65582	65591	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1536	NC_018078	GCC	2	6	65634	65639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_018078	GTC	2	6	65732	65737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430470
1538	NC_018078	ATT	2	6	65765	65770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392430470
1539	NC_018078	TCA	2	6	65785	65790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430470
1540	NC_018078	CG	3	6	65805	65810	0 %	0 %	50 %	50 %	392430470
1541	NC_018078	CCT	2	6	65823	65828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430470
1542	NC_018078	CGG	2	6	65957	65962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430470
1543	NC_018078	CGC	2	6	65970	65975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430470
1544	NC_018078	GC	3	6	65974	65979	0 %	0 %	50 %	50 %	392430470
1545	NC_018078	CCG	2	6	65989	65994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430470
1546	NC_018078	CCG	2	6	66055	66060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430470
1547	NC_018078	CGG	2	6	66069	66074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430470
1548	NC_018078	GCG	2	6	66097	66102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430470
1549	NC_018078	GGC	2	6	66105	66110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430470
1550	NC_018078	CGA	2	6	66248	66253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430470
1551	NC_018078	TCG	2	6	66257	66262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430470
1552	NC_018078	GCTG	2	8	66398	66405	0 %	25 %	50 %	25 %	392430470
1553	NC_018078	GCC	2	6	66421	66426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430470
1554	NC_018078	CG	5	10	66451	66460	0 %	0 %	50 %	50 %	392430470
1555	NC_018078	ACC	2	6	66490	66495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430470
1556	NC_018078	GGCGA	2	10	66514	66523	20 %	0 %	60 %	20 %	392430470
1557	NC_018078	CAC	2	6	66645	66650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430470
1558	NC_018078	GC	3	6	66662	66667	0 %	0 %	50 %	50 %	392430470
1559	NC_018078	CGGA	2	8	66707	66714	25 %	0 %	50 %	25 %	392430470
1560	NC_018078	CGTCGG	2	12	66837	66848	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_018078	GGT	2	6	66922	66927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_018078	TGC	2	6	66960	66965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_018078	GCC	2	6	67063	67068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430471
1564	NC_018078	GCC	2	6	67078	67083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430471
1565	NC_018078	CTGG	2	8	67130	67137	0 %	25 %	50 %	25 %	392430471
1566	NC_018078	TTC	2	6	67146	67151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430471
1567	NC_018078	GAC	2	6	67180	67185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430471
1568	NC_018078	CGG	2	6	67244	67249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430471
1569	NC_018078	AAC	2	6	67309	67314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430471
1570	NC_018078	ACG	2	6	67418	67423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430471
1571	NC_018078	CCA	2	6	67424	67429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430471
1572	NC_018078	CGGG	2	8	67431	67438	0 %	0 %	75 %	25 %	392430471
1573	NC_018078	CGCC	2	8	67448	67455	0 %	0 %	25 %	75 %	392430471
1574	NC_018078	CGGC	2	8	67490	67497	0 %	0 %	50 %	50 %	392430471
1575	NC_018078	CGGT	2	8	67526	67533	0 %	25 %	50 %	25 %	392430471
1576	NC_018078	GCG	2	6	67553	67558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430471
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1579	NC_018078	ACC	2	6	67661	67666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430471
1580	NC_018078	GCGGTG	2	12	67688	67699	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	392430471
1581	NC_018078	CGT	2	6	67761	67766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430471
1582	NC_018078	CCG	2	6	67832	67837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430471
1583	NC_018078	CCGG	2	8	67912	67919	0 %	0 %	50 %	50 %	392430471
1584	NC_018078	GGC	2	6	67924	67929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430471
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1588	NC_018078	CGG	2	6	68061	68066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430471
1589	NC_018078	ACG	2	6	68080	68085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430471
1590	NC_018078	CGG	2	6	68117	68122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430471
1591	NC_018078	GC	3	6	68180	68185	0 %	0 %	50 %	50 %	392430471
1592	NC_018078	GGC	2	6	68332	68337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430471
1593	NC_018078	CCG	2	6	68365	68370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430471
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1596	NC_018078	CTG	2	6	68586	68591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430472
1597	NC_018078	GCC	3	9	68610	68618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430472
1598	NC_018078	GCC	2	6	68633	68638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430472
1599	NC_018078	TCG	2	6	68686	68691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_018078	AGG	2	6	68710	68715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_018078	CTG	2	6	68772	68777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430473
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1604	NC_018078	CTG	2	6	68895	68900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430473
1605	NC_018078	TGG	2	6	68935	68940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430473
1606	NC_018078	TGCT	2	8	68950	68957	0 %	50 %	25 %	25 %	392430473
1607	NC_018078	CTG	2	6	68964	68969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430473
1608	NC_018078	TCGC	2	8	68975	68982	0 %	25 %	25 %	50 %	392430473
1609	NC_018078	CGA	2	6	68999	69004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430473
1610	NC_018078	GCCG	2	8	69049	69056	0 %	0 %	50 %	50 %	392430473
1611	NC_018078	GGTGT	2	10	69090	69099	0 %	40 %	60 %	0 %	392430473
1612	NC_018078	TTCG	2	8	69113	69120	0 %	50 %	25 %	25 %	392430473
1613	NC_018078	GTT	2	6	69137	69142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430473
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1615	NC_018078	CGG	2	6	69299	69304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430473
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1620	NC_018078	GCC	2	6	69585	69590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430473
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1622	NC_018078	GCT	2	6	69635	69640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430473
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1624	NC_018078	AT	3	6	69689	69694	50 %	50 %	0 %	0 %	392430473
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