MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 109593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018078	ATG	2	6	22267	22272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430427
502	NC_018078	GTA	2	6	22299	22304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430427
503	NC_018078	TGC	2	6	22307	22312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430427
504	NC_018078	GAT	2	6	22314	22319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430427
505	NC_018078	CG	3	6	22320	22325	0 %	0 %	50 %	50 %	392430427
506	NC_018078	TCA	2	6	22346	22351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430427
507	NC_018078	ACC	2	6	22394	22399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430427
508	NC_018078	GCTG	2	8	22454	22461	0 %	25 %	50 %	25 %	392430427
509	NC_018078	CGGC	2	8	22474	22481	0 %	0 %	50 %	50 %	392430427
510	NC_018078	GTC	3	9	22506	22514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430427
511	NC_018078	CGTAGT	2	12	22553	22564	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392430427
512	NC_018078	CGA	2	6	22565	22570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430427
513	NC_018078	CGA	3	9	22577	22585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430427
514	NC_018078	GCC	3	9	22602	22610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430427
515	NC_018078	CAG	2	6	22719	22724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430427
516	NC_018078	CCT	2	6	22826	22831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430427
517	NC_018078	TCG	2	6	22849	22854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430427
518	NC_018078	GTC	2	6	22875	22880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430427
519	NC_018078	GCA	2	6	22910	22915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430427
520	NC_018078	CG	3	6	22922	22927	0 %	0 %	50 %	50 %	392430427
521	NC_018078	GC	3	6	23047	23052	0 %	0 %	50 %	50 %	392430427
522	NC_018078	CAG	2	6	23073	23078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430427
523	NC_018078	TCG	2	6	23092	23097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430427
524	NC_018078	GCCG	2	8	23145	23152	0 %	0 %	50 %	50 %	392430427
525	NC_018078	CCCA	2	8	23157	23164	25 %	0 %	0 %	75 %	392430427
526	NC_018078	GTT	2	6	23214	23219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430427
527	NC_018078	GC	3	6	23244	23249	0 %	0 %	50 %	50 %	392430427
528	NC_018078	CG	3	6	23273	23278	0 %	0 %	50 %	50 %	392430427
529	NC_018078	C	6	6	23308	23313	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
530	NC_018078	GC	3	6	23324	23329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_018078	TCG	2	6	23355	23360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_018078	GTC	2	6	23438	23443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430428
533	NC_018078	GTC	2	6	23545	23550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430428
534	NC_018078	GTC	2	6	23569	23574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430428
535	NC_018078	GC	3	6	23576	23581	0 %	0 %	50 %	50 %	392430428
536	NC_018078	CG	3	6	23615	23620	0 %	0 %	50 %	50 %	392430428
537	NC_018078	CAC	2	6	23641	23646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430428
538	NC_018078	CG	3	6	23675	23680	0 %	0 %	50 %	50 %	392430428
539	NC_018078	CAT	2	6	23716	23721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430428
540	NC_018078	CAA	2	6	23788	23793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430428
541	NC_018078	GGT	2	6	23917	23922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018078	GAT	2	6	23977	23982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430429
543	NC_018078	ATCAC	2	10	24002	24011	40 %	20 %	0 %	40 %	392430429
544	NC_018078	GTG	2	6	24053	24058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430429
545	NC_018078	TGG	2	6	24063	24068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430429
546	NC_018078	AC	3	6	24129	24134	50 %	0 %	0 %	50 %	392430429
547	NC_018078	GAT	2	6	24175	24180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430429
548	NC_018078	CGT	2	6	24219	24224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430429
549	NC_018078	CGG	2	6	24249	24254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430429
550	NC_018078	GCC	2	6	24262	24267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430429
551	NC_018078	GCTG	2	8	24296	24303	0 %	25 %	50 %	25 %	392430429
552	NC_018078	CGTAGT	2	12	24330	24341	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392430429
553	NC_018078	CGGC	2	8	24344	24351	0 %	0 %	50 %	50 %	392430429
554	NC_018078	GAG	2	6	24375	24380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430429
555	NC_018078	GCC	3	9	24427	24435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430429
556	NC_018078	GCCG	2	8	24444	24451	0 %	0 %	50 %	50 %	392430429
557	NC_018078	CGGG	2	8	24519	24526	0 %	0 %	75 %	25 %	392430429
558	NC_018078	CTC	2	6	24556	24561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430429
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560	NC_018078	GCC	2	6	24613	24618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430429
561	NC_018078	GCC	2	6	24637	24642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430429
562	NC_018078	GCCGG	2	10	24689	24698	0 %	0 %	60 %	40 %	392430429
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564	NC_018078	GCG	2	6	24726	24731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430429
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569	NC_018078	CCA	2	6	24980	24985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430429
570	NC_018078	GTC	2	6	25015	25020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430429
571	NC_018078	TCG	2	6	25028	25033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430429
572	NC_018078	GCCCCT	2	12	25038	25049	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	392430429
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574	NC_018078	CGA	2	6	25210	25215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430429
575	NC_018078	GAC	2	6	25228	25233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430429
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578	NC_018078	GCA	2	6	25425	25430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430429
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581	NC_018078	GAGC	2	8	25643	25650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
582	NC_018078	GGCC	2	8	25657	25664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_018078	CCG	2	6	25678	25683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_018078	CTA	2	6	25713	25718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_018078	TCC	2	6	25730	25735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_018078	GTT	2	6	25737	25742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018078	TCG	3	9	25857	25865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_018078	GCC	2	6	25871	25876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_018078	GC	3	6	26021	26026	0 %	0 %	50 %	50 %	392430430
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612	NC_018078	CCAA	2	8	26823	26830	50 %	0 %	0 %	50 %	392430430
613	NC_018078	GCC	2	6	26845	26850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430430
614	NC_018078	CAGC	2	8	26889	26896	25 %	0 %	25 %	50 %	392430430
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620	NC_018078	CGAGC	2	10	27069	27078	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
621	NC_018078	CAC	2	6	27166	27171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430431
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