MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 109593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018078	GC	3	6	228210	228215	0 %	0 %	50 %	50 %	392430609
5502	NC_018078	CGG	2	6	228230	228235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430609
5503	NC_018078	CAACGC	2	12	228237	228248	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	392430609
5504	NC_018078	GTT	2	6	228284	228289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430609
5505	NC_018078	GAC	2	6	228297	228302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5506	NC_018078	AGG	2	6	228343	228348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430609
5507	NC_018078	TGC	2	6	228349	228354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5508	NC_018078	CGC	2	6	228393	228398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430609
5509	NC_018078	CGA	2	6	228470	228475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5510	NC_018078	GT	3	6	228564	228569	0 %	50 %	50 %	0 %	392430609
5511	NC_018078	GCA	2	6	228602	228607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5512	NC_018078	CACC	2	8	228639	228646	25 %	0 %	0 %	75 %	392430609
5513	NC_018078	CGC	2	6	228663	228668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430609
5514	NC_018078	CTG	2	6	228669	228674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5515	NC_018078	CTG	2	6	228705	228710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5516	NC_018078	TGG	2	6	228712	228717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430609
5517	NC_018078	CTG	2	6	228738	228743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5518	NC_018078	CGC	2	6	228783	228788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430609
5519	NC_018078	TGG	2	6	228807	228812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430609
5520	NC_018078	CGT	2	6	228920	228925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5521	NC_018078	GCCTGG	2	12	228943	228954	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392430609
5522	NC_018078	GAC	2	6	228966	228971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5523	NC_018078	CCG	2	6	229000	229005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430609
5524	NC_018078	GTG	2	6	229062	229067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430609
5525	NC_018078	TGG	2	6	229084	229089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430609
5526	NC_018078	GCT	2	6	229091	229096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5527	NC_018078	CAC	2	6	229130	229135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430609
5528	NC_018078	CGG	2	6	229194	229199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430609
5529	NC_018078	CGG	2	6	229246	229251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430609
5530	NC_018078	GAC	2	6	229317	229322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5531	NC_018078	GCT	2	6	229352	229357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5532	NC_018078	TAC	2	6	229365	229370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430609
5533	NC_018078	ACC	2	6	229401	229406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430609
5534	NC_018078	TCGG	2	8	229452	229459	0 %	25 %	50 %	25 %	392430609
5535	NC_018078	TGT	2	6	229492	229497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430609
5536	NC_018078	CGA	2	6	229529	229534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
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5538	NC_018078	GGC	2	6	229553	229558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430609
5539	NC_018078	GCT	2	6	229574	229579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5540	NC_018078	CGT	2	6	229594	229599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5541	NC_018078	CGG	2	6	229603	229608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430609
5542	NC_018078	GTG	2	6	229630	229635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430609
5543	NC_018078	CCGG	2	8	229713	229720	0 %	0 %	50 %	50 %	392430609
5544	NC_018078	GGT	2	6	229727	229732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430609
5545	NC_018078	TCG	2	6	229735	229740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5546	NC_018078	TGG	2	6	229777	229782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430609
5547	NC_018078	ACGG	2	8	229930	229937	25 %	0 %	50 %	25 %	392430609
5548	NC_018078	GAT	2	6	229994	229999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430609
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5550	NC_018078	CTG	3	9	230115	230123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5551	NC_018078	GTG	2	6	230163	230168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430609
5552	NC_018078	CACCCT	2	12	230177	230188	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	392430609
5553	NC_018078	GAC	2	6	230201	230206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5554	NC_018078	GCT	2	6	230310	230315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
5555	NC_018078	GGC	2	6	230339	230344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430609
5556	NC_018078	AACT	2	8	230562	230569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5557	NC_018078	TGT	2	6	230702	230707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_018078	GGAA	2	8	230737	230744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_018078	CAC	2	6	230745	230750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_018078	G	6	6	230752	230757	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_018078	GAG	2	6	230803	230808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430610
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5563	NC_018078	GGT	2	6	230865	230870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430610
5564	NC_018078	GCGA	2	8	230872	230879	25 %	0 %	50 %	25 %	392430610
5565	NC_018078	GC	3	6	230937	230942	0 %	0 %	50 %	50 %	392430610
5566	NC_018078	CCA	2	6	230984	230989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430610
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5576	NC_018078	GCC	2	6	231277	231282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430610
5577	NC_018078	TGC	2	6	231308	231313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430610
5578	NC_018078	GCAC	2	8	231335	231342	25 %	0 %	25 %	50 %	392430610
5579	NC_018078	CGCA	2	8	231427	231434	25 %	0 %	25 %	50 %	392430610
5580	NC_018078	TGCGC	2	10	231447	231456	0 %	20 %	40 %	40 %	392430610
5581	NC_018078	TGAT	2	8	231469	231476	25 %	50 %	25 %	0 %	392430610
5582	NC_018078	ACGT	2	8	231489	231496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5583	NC_018078	GGCCG	2	10	231499	231508	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5584	NC_018078	GTG	2	6	231520	231525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_018078	ACAT	2	8	231556	231563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5586	NC_018078	GCG	2	6	231578	231583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_018078	TGG	2	6	231606	231611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430611
5588	NC_018078	TGC	2	6	231669	231674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430611
5589	NC_018078	GCG	2	6	231681	231686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430611
5590	NC_018078	ACT	2	6	231708	231713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430611
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5592	NC_018078	G	6	6	231796	231801	0 %	0 %	100 %	0 %	392430611
5593	NC_018078	GCT	2	6	231808	231813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430611
5594	NC_018078	CAG	2	6	231839	231844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430611
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5596	NC_018078	GGCG	2	8	231898	231905	0 %	0 %	75 %	25 %	392430611
5597	NC_018078	CG	3	6	231940	231945	0 %	0 %	50 %	50 %	392430611
5598	NC_018078	GCG	2	6	231950	231955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430611
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5601	NC_018078	CGC	2	6	232098	232103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430611
5602	NC_018078	CTG	3	9	232133	232141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430611
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5608	NC_018078	GCC	2	6	232367	232372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430612
5609	NC_018078	GAG	2	6	232390	232395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430612
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5612	NC_018078	CGG	4	12	232482	232493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430612
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5615	NC_018078	CGG	2	6	232617	232622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430612
5616	NC_018078	CG	3	6	232628	232633	0 %	0 %	50 %	50 %	392430612
5617	NC_018078	TCG	2	6	232664	232669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430612
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5621	NC_018078	CGT	2	6	232767	232772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430612
5622	NC_018078	GGC	2	6	232839	232844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430612
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5733	NC_018078	TGC	2	6	237272	237277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430615
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5739	NC_018078	GAC	2	6	237432	237437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430615
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5985	NC_018078	CCA	3	9	247580	247588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430622
5986	NC_018078	GCG	2	6	247591	247596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430622
5987	NC_018078	TCG	2	6	247615	247620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430622
5988	NC_018078	CCAC	2	8	247709	247716	25 %	0 %	0 %	75 %	392430622
5989	NC_018078	ACC	2	6	247723	247728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430622
5990	NC_018078	CGGC	2	8	247792	247799	0 %	0 %	50 %	50 %	392430622
5991	NC_018078	CAG	2	6	247821	247826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430622
5992	NC_018078	CGGC	2	8	247869	247876	0 %	0 %	50 %	50 %	392430622
5993	NC_018078	TCA	3	9	248049	248057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430623
5994	NC_018078	AAC	2	6	248101	248106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430623
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5997	NC_018078	GCA	2	6	248177	248182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430623
5998	NC_018078	GCCG	2	8	248226	248233	0 %	0 %	50 %	50 %	392430623
5999	NC_018078	GGTC	2	8	248261	248268	0 %	25 %	50 %	25 %	392430623
6000	NC_018078	GCG	2	6	248269	248274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430623

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