MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 109593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_018078	CGA	2	6	207627	207632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430591
5003	NC_018078	GGT	2	6	207673	207678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430591
5004	NC_018078	TGG	2	6	207738	207743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430591
5005	NC_018078	TGT	2	6	207813	207818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430591
5006	NC_018078	CGG	3	9	207879	207887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430591
5007	NC_018078	GGC	3	9	207895	207903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430591
5008	NC_018078	GGT	2	6	207940	207945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430591
5009	NC_018078	AATG	2	8	207953	207960	50 %	25 %	25 %	0 %	392430591
5010	NC_018078	CG	3	6	207977	207982	0 %	0 %	50 %	50 %	392430591
5011	NC_018078	CCGC	2	8	208090	208097	0 %	0 %	25 %	75 %	392430591
5012	NC_018078	TGT	2	6	208206	208211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430591
5013	NC_018078	ACC	2	6	208234	208239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430591
5014	NC_018078	CG	3	6	208287	208292	0 %	0 %	50 %	50 %	392430591
5015	NC_018078	CGA	2	6	208306	208311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430591
5016	NC_018078	TGA	2	6	208323	208328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430591
5017	NC_018078	CGT	2	6	208363	208368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430592
5018	NC_018078	GCT	2	6	208392	208397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430592
5019	NC_018078	AGC	2	6	208527	208532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430592
5020	NC_018078	CCACG	2	10	208635	208644	20 %	0 %	20 %	60 %	392430592
5021	NC_018078	TGG	2	6	208778	208783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430592
5022	NC_018078	GGT	2	6	208821	208826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430592
5023	NC_018078	CAG	2	6	208884	208889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430592
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5045	NC_018078	GCCA	2	8	209650	209657	25 %	0 %	25 %	50 %	392430594
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5105	NC_018078	ACCGC	2	10	212309	212318	20 %	0 %	20 %	60 %	392430596
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5122	NC_018078	GGT	2	6	213001	213006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430597
5123	NC_018078	CCA	2	6	213018	213023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430597
5124	NC_018078	CGG	2	6	213039	213044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430597
5125	NC_018078	CGG	2	6	213108	213113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430597
5126	NC_018078	CGG	2	6	213226	213231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430597
5127	NC_018078	CGG	2	6	213249	213254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430597
5128	NC_018078	CGG	2	6	213357	213362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430597
5129	NC_018078	GCA	2	6	213402	213407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430597
5130	NC_018078	GCA	2	6	213468	213473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430597
5131	NC_018078	GCA	3	9	213480	213488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430597
5132	NC_018078	TGC	2	6	213515	213520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430597
5133	NC_018078	GCC	2	6	213524	213529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430597
5134	NC_018078	CGA	2	6	213561	213566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430597
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5142	NC_018078	CAGG	2	8	213718	213725	25 %	0 %	50 %	25 %	392430597
5143	NC_018078	TGG	2	6	213729	213734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430597
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5146	NC_018078	TCG	2	6	213920	213925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430597
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5154	NC_018078	ACC	2	6	214215	214220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430598
5155	NC_018078	GA	3	6	214258	214263	50 %	0 %	50 %	0 %	392430598
5156	NC_018078	GCG	2	6	214359	214364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430598
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5159	NC_018078	GCC	2	6	214472	214477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430598
5160	NC_018078	CGT	2	6	214489	214494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430598
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5162	NC_018078	GGT	2	6	214552	214557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430598
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5165	NC_018078	CCGG	2	8	214601	214608	0 %	0 %	50 %	50 %	392430598
5166	NC_018078	CG	3	6	214616	214621	0 %	0 %	50 %	50 %	392430598
5167	NC_018078	CTG	2	6	214622	214627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430598
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5169	NC_018078	TGC	2	6	214683	214688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430598
5170	NC_018078	TG	3	6	214742	214747	0 %	50 %	50 %	0 %	392430598
5171	NC_018078	CGA	2	6	214828	214833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430598
5172	NC_018078	GCCGA	2	10	214865	214874	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5173	NC_018078	CTG	2	6	214942	214947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430599
5174	NC_018078	CGG	2	6	215018	215023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430599
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5176	NC_018078	CACCAT	2	12	215094	215105	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	392430599
5177	NC_018078	GCG	2	6	215110	215115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430599
5178	NC_018078	CGG	2	6	215162	215167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430599
5179	NC_018078	ACG	2	6	215171	215176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430599
5180	NC_018078	TGG	2	6	215267	215272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430599
5181	NC_018078	CCTCG	2	10	215301	215310	0 %	20 %	20 %	60 %	392430599
5182	NC_018078	CGA	2	6	215330	215335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430599
5183	NC_018078	CCA	2	6	215423	215428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430599
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5185	NC_018078	CGT	2	6	215500	215505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430599
5186	NC_018078	GC	3	6	215515	215520	0 %	0 %	50 %	50 %	392430599
5187	NC_018078	AGCC	2	8	215532	215539	25 %	0 %	25 %	50 %	392430599
5188	NC_018078	TCG	2	6	215557	215562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430599
5189	NC_018078	GC	3	6	215571	215576	0 %	0 %	50 %	50 %	392430599
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5192	NC_018078	TCGGT	3	15	215801	215815	0 %	40 %	40 %	20 %	392430600
5193	NC_018078	GAC	2	6	215838	215843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430600
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5195	NC_018078	GC	3	6	215904	215909	0 %	0 %	50 %	50 %	392430600
5196	NC_018078	GGC	2	6	215912	215917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430600
5197	NC_018078	GGC	2	6	215943	215948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430600
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5200	NC_018078	CGT	2	6	216131	216136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430600
5201	NC_018078	AGG	2	6	216145	216150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430600
5202	NC_018078	CGA	3	9	216211	216219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430601
5203	NC_018078	TG	3	6	216303	216308	0 %	50 %	50 %	0 %	392430601
5204	NC_018078	TTG	2	6	216350	216355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430601
5205	NC_018078	CCG	2	6	216423	216428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430601
5206	NC_018078	GC	3	6	216497	216502	0 %	0 %	50 %	50 %	392430601
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5208	NC_018078	GC	3	6	216545	216550	0 %	0 %	50 %	50 %	392430601
5209	NC_018078	GTT	2	6	216595	216600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430601
5210	NC_018078	ATC	2	6	216626	216631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430601
5211	NC_018078	CAG	3	9	216638	216646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430601
5212	NC_018078	CGA	3	9	216657	216665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430601
5213	NC_018078	CTGG	2	8	216703	216710	0 %	25 %	50 %	25 %	392430601
5214	NC_018078	TTG	2	6	216749	216754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430601
5215	NC_018078	GGC	2	6	216799	216804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430601
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5217	NC_018078	ACG	2	6	216855	216860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430601
5218	NC_018078	GC	3	6	216930	216935	0 %	0 %	50 %	50 %	392430601
5219	NC_018078	GGCC	2	8	216937	216944	0 %	0 %	50 %	50 %	392430601
5220	NC_018078	GTGCG	2	10	216955	216964	0 %	20 %	60 %	20 %	392430601
5221	NC_018078	ACCG	2	8	217001	217008	25 %	0 %	25 %	50 %	392430601
5222	NC_018078	GCC	2	6	217016	217021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430601
5223	NC_018078	CGG	2	6	217067	217072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430601
5224	NC_018078	GCGCCG	2	12	217118	217129	0 %	0 %	50 %	50 %	392430601
5225	NC_018078	TGC	3	9	217182	217190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430601
5226	NC_018078	GCT	2	6	217201	217206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430601
5227	NC_018078	CGCT	2	8	217209	217216	0 %	25 %	25 %	50 %	392430601
5228	NC_018078	CGG	2	6	217246	217251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430601
5229	NC_018078	G	6	6	217306	217311	0 %	0 %	100 %	0 %	392430601
5230	NC_018078	CTG	2	6	217373	217378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430601
5231	NC_018078	TGAG	2	8	217392	217399	25 %	25 %	50 %	0 %	392430601
5232	NC_018078	AGTTCG	2	12	217425	217436	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392430601
5233	NC_018078	CGG	2	6	217452	217457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430601
5234	NC_018078	GCTG	2	8	217465	217472	0 %	25 %	50 %	25 %	392430601
5235	NC_018078	CGC	2	6	217573	217578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430601
5236	NC_018078	CAT	2	6	217663	217668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430601
5237	NC_018078	TGG	2	6	217950	217955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430601
5238	NC_018078	GGC	2	6	217961	217966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430601
5239	NC_018078	CGGTTG	2	12	218063	218074	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392430601
5240	NC_018078	CGG	2	6	218114	218119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430601
5241	NC_018078	ACG	2	6	218157	218162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430601
5242	NC_018078	CGGTGG	2	12	218202	218213	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	392430601
5243	NC_018078	CGG	2	6	218220	218225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430601
5244	NC_018078	GGCC	2	8	218257	218264	0 %	0 %	50 %	50 %	392430601
5245	NC_018078	GGCC	2	8	218284	218291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5246	NC_018078	TCG	2	6	218346	218351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5247	NC_018078	ACAGCC	2	12	218417	218428	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5248	NC_018078	GGT	2	6	218517	218522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_018078	AT	3	6	218554	218559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_018078	CTG	2	6	218606	218611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5251	NC_018078	GC	3	6	218612	218617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5252	NC_018078	CGGT	2	8	218620	218627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5253	NC_018078	CAACC	2	10	218657	218666	40 %	0 %	0 %	60 %	392430602
5254	NC_018078	CGA	2	6	218707	218712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430602
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5257	NC_018078	CTG	2	6	218801	218806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430602
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5259	NC_018078	TGGC	2	8	218870	218877	0 %	25 %	50 %	25 %	392430602
5260	NC_018078	GGT	2	6	218902	218907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430602
5261	NC_018078	AGCG	2	8	218958	218965	25 %	0 %	50 %	25 %	392430602
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5265	NC_018078	CGGCG	2	10	219110	219119	0 %	0 %	60 %	40 %	392430602
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5272	NC_018078	TGC	2	6	219398	219403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5273	NC_018078	TCA	2	6	219438	219443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430603
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5276	NC_018078	CGA	2	6	219502	219507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430603
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5334	NC_018078	CGGT	2	8	221964	221971	0 %	25 %	50 %	25 %	392430605
5335	NC_018078	CTG	2	6	221982	221987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430605
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5341	NC_018078	CAC	2	6	222127	222132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5343	NC_018078	ACG	2	6	222256	222261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430606
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5352	NC_018078	ACG	2	6	222664	222669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430606
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5356	NC_018078	CGGCG	2	10	222771	222780	0 %	0 %	60 %	40 %	392430606
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5360	NC_018078	CAC	2	6	222868	222873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430606
5361	NC_018078	GAT	2	6	222909	222914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430606
5362	NC_018078	CCTACA	2	12	222938	222949	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	392430606
5363	NC_018078	GTG	2	6	222952	222957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430606
5364	NC_018078	ATC	2	6	222958	222963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430606
5365	NC_018078	CGT	2	6	222969	222974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430606
5366	NC_018078	CTGGC	2	10	222994	223003	0 %	20 %	40 %	40 %	392430606
5367	NC_018078	CGC	2	6	223008	223013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430606
5368	NC_018078	TGG	2	6	223046	223051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430606
5369	NC_018078	TCG	2	6	223088	223093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430606
5370	NC_018078	CGG	2	6	223109	223114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430606
5371	NC_018078	CTG	2	6	223171	223176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430606
5372	NC_018078	TGC	2	6	223229	223234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430606
5373	NC_018078	CGG	2	6	223238	223243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430606
5374	NC_018078	GCG	3	9	223253	223261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430606
5375	NC_018078	CAT	2	6	223311	223316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430606
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5380	NC_018078	GTT	2	6	223401	223406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430606
5381	NC_018078	CAG	2	6	223470	223475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5412	NC_018078	AGC	2	6	224701	224706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430608
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5421	NC_018078	GCT	2	6	225011	225016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430608
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5433	NC_018078	TCG	2	6	225424	225429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430608
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5481	NC_018078	TGC	2	6	227501	227506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430609
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5488	NC_018078	CGGC	2	8	227673	227680	0 %	0 %	50 %	50 %	392430609
5489	NC_018078	CAG	2	6	227712	227717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430609
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5491	NC_018078	GCCG	2	8	227758	227765	0 %	0 %	50 %	50 %	392430609
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