MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 116558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018027	TCG	2	6	74	79	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018027	CAC	2	6	253	258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018027	GCG	2	6	390	395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018027	CCG	2	6	424	429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_018027	ACA	2	6	484	489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018027	ACG	3	9	492	500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018027	ACC	2	6	613	618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413906
8	NC_018027	TCG	2	6	621	626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
9	NC_018027	AAC	2	6	635	640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392413906
10	NC_018027	GTC	2	6	641	646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
11	NC_018027	CGG	2	6	664	669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413906
12	NC_018027	GCA	2	6	694	699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
13	NC_018027	GCT	2	6	751	756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
14	NC_018027	TCG	2	6	813	818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
15	NC_018027	GCC	2	6	828	833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413906
16	NC_018027	CGA	2	6	892	897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
17	NC_018027	GAC	3	9	950	958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
18	NC_018027	CGA	3	9	961	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
19	NC_018027	GAG	2	6	992	997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413906
20	NC_018027	CGC	2	6	1123	1128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413906
21	NC_018027	CTG	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
22	NC_018027	CGG	2	6	1221	1226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413906
23	NC_018027	TCA	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413906
24	NC_018027	CCG	2	6	1321	1326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413906
25	NC_018027	TGC	2	6	1362	1367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
26	NC_018027	CGA	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
27	NC_018027	TTC	2	6	1418	1423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413906
28	NC_018027	AAG	2	6	1592	1597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413906
29	NC_018027	CGA	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
30	NC_018027	TGC	2	6	1755	1760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
31	NC_018027	CCA	2	6	1779	1784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413906
32	NC_018027	GCC	2	6	1814	1819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413906
33	NC_018027	CCG	2	6	1821	1826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413906
34	NC_018027	CGA	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
35	NC_018027	GAA	2	6	1993	1998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413906
36	NC_018027	CGC	2	6	2021	2026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413906
37	NC_018027	CAC	2	6	2053	2058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413906
38	NC_018027	CAC	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018027	CCG	2	6	2269	2274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_018027	CGC	2	6	2291	2296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018027	CAT	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018027	CCG	2	6	2356	2361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018027	CTA	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018027	AGA	2	6	2443	2448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018027	GGT	2	6	2552	2557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018027	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018027	CGA	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413907
48	NC_018027	TGC	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413907
49	NC_018027	CTG	2	6	2875	2880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413907
50	NC_018027	CGA	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413907
51	NC_018027	GAC	2	6	3138	3143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413907
52	NC_018027	GCC	2	6	3201	3206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413907
53	NC_018027	GGC	2	6	3305	3310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413907
54	NC_018027	AGG	2	6	3373	3378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413907
55	NC_018027	CTG	2	6	3381	3386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413907
56	NC_018027	GCA	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413907
57	NC_018027	GCT	2	6	3455	3460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413907
58	NC_018027	TGC	2	6	3580	3585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413907
59	NC_018027	CGA	2	6	3602	3607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413907
60	NC_018027	GAG	2	6	3621	3626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413907
61	NC_018027	CAC	2	6	3734	3739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413907
62	NC_018027	GCC	2	6	3745	3750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413907
63	NC_018027	CGG	2	6	3751	3756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413907
64	NC_018027	CCG	2	6	3766	3771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413907
65	NC_018027	TGC	2	6	3782	3787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413907
66	NC_018027	TGG	2	6	3797	3802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413907
67	NC_018027	TCG	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413908
68	NC_018027	CGG	2	6	3957	3962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413908
69	NC_018027	CGT	2	6	4050	4055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413908
70	NC_018027	TCG	2	6	4211	4216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413908
71	NC_018027	CGG	2	6	4272	4277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413908
72	NC_018027	GGA	2	6	4341	4346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413908
73	NC_018027	TGA	2	6	4421	4426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413908
74	NC_018027	CTG	2	6	4450	4455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413908
75	NC_018027	GCC	2	6	4456	4461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413908
76	NC_018027	GCA	2	6	4533	4538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413908
77	NC_018027	GAG	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413908
78	NC_018027	CGC	2	6	4728	4733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413908
79	NC_018027	CGG	2	6	4749	4754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413908
80	NC_018027	TCG	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413909
81	NC_018027	TCG	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413909
82	NC_018027	GGT	2	6	5005	5010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413909
83	NC_018027	TCG	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413909
84	NC_018027	ACG	2	6	5028	5033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413909
85	NC_018027	TGC	2	6	5133	5138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413909
86	NC_018027	GTT	2	6	5146	5151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392413909
87	NC_018027	CGA	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413909
88	NC_018027	CCA	2	6	5220	5225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413909
89	NC_018027	CGC	2	6	5242	5247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413909
90	NC_018027	GGT	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413909
91	NC_018027	CGC	2	6	5395	5400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413909
92	NC_018027	CTG	2	6	5453	5458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413909
93	NC_018027	CGC	2	6	5476	5481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413909
94	NC_018027	GGT	2	6	5506	5511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413909
95	NC_018027	GGC	2	6	5521	5526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413909
96	NC_018027	GCC	2	6	5558	5563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413909
97	NC_018027	GAT	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413909
98	NC_018027	GGC	2	6	5725	5730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413909
99	NC_018027	TGC	2	6	5769	5774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413909
100	NC_018027	CGA	2	6	5776	5781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413909
101	NC_018027	GCG	2	6	5806	5811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413909
102	NC_018027	GCG	2	6	5813	5818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413909
103	NC_018027	CGG	2	6	5862	5867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413909
104	NC_018027	ACG	2	6	5871	5876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413909
105	NC_018027	CGC	2	6	5883	5888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413909
106	NC_018027	CGA	3	9	5964	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413910
107	NC_018027	CCG	2	6	5984	5989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413910
108	NC_018027	CGC	2	6	5999	6004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413910
109	NC_018027	GCG	2	6	6042	6047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413910
110	NC_018027	GGA	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413910
111	NC_018027	CGG	2	6	6124	6129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413910
112	NC_018027	CGG	3	9	6145	6153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413910
113	NC_018027	ACC	2	6	6173	6178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413910
114	NC_018027	CGT	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413910
115	NC_018027	CGC	2	6	6297	6302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413910
116	NC_018027	CGT	2	6	6317	6322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413910
117	NC_018027	GGC	2	6	6345	6350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413910
118	NC_018027	CGC	3	9	6411	6419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413910
119	NC_018027	GTC	2	6	6433	6438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413910
120	NC_018027	CGT	2	6	6470	6475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413910
121	NC_018027	GCC	2	6	6557	6562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018027	CGC	2	6	6648	6653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018027	GGT	2	6	6672	6677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018027	AGA	3	9	6763	6771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413911
125	NC_018027	GGT	2	6	6896	6901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413911
126	NC_018027	CGA	2	6	6914	6919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413911
127	NC_018027	CGG	2	6	6968	6973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413911
128	NC_018027	CGA	2	6	6986	6991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413911
129	NC_018027	TGC	2	6	7057	7062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413911
130	NC_018027	CGG	2	6	7067	7072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413911
131	NC_018027	GAA	2	6	7080	7085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413911
132	NC_018027	CGG	2	6	7103	7108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413911
133	NC_018027	GGT	2	6	7130	7135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413911
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137	NC_018027	CGA	2	6	7379	7384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413911
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165	NC_018027	CGC	4	12	8672	8683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413911
166	NC_018027	CGA	2	6	8684	8689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413911
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239	NC_018027	AGG	2	6	12202	12207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413913
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241	NC_018027	GCA	3	9	12428	12436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413913
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243	NC_018027	CGG	2	6	12564	12569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413913
244	NC_018027	TTC	2	6	12621	12626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413913
245	NC_018027	GAT	2	6	12632	12637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413913
246	NC_018027	CGG	2	6	12665	12670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413913
247	NC_018027	CTG	2	6	12711	12716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413913
248	NC_018027	CGG	2	6	12770	12775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413913
249	NC_018027	GCG	2	6	12777	12782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413913
250	NC_018027	TGC	2	6	12805	12810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413913
251	NC_018027	GCC	2	6	12819	12824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413913
252	NC_018027	GAC	2	6	12851	12856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413913
253	NC_018027	TGG	2	6	12862	12867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413913
254	NC_018027	TCG	2	6	12949	12954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_018027	TCC	2	6	13035	13040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
256	NC_018027	CGC	2	6	13107	13112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413914
257	NC_018027	ACG	2	6	13274	13279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413915
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