MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 153331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018027	GCCG	2	8	105263	105270	0 %	0 %	50 %	50 %	392414011
3002	NC_018027	GGCC	2	8	105286	105293	0 %	0 %	50 %	50 %	392414011
3003	NC_018027	GCC	2	6	105339	105344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414011
3004	NC_018027	GAA	2	6	105359	105364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414011
3005	NC_018027	GCC	2	6	105381	105386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414011
3006	NC_018027	GAC	2	6	105423	105428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414011
3007	NC_018027	GC	3	6	105447	105452	0 %	0 %	50 %	50 %	392414011
3008	NC_018027	GCC	2	6	105493	105498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414011
3009	NC_018027	GCT	2	6	105505	105510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414011
3010	NC_018027	CGA	2	6	105511	105516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414011
3011	NC_018027	TCTCGG	2	12	105580	105591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414011
3012	NC_018027	CAC	2	6	105611	105616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414011
3013	NC_018027	CCG	2	6	105619	105624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414011
3014	NC_018027	CGG	2	6	105691	105696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414011
3015	NC_018027	GCTG	2	8	105742	105749	0 %	25 %	50 %	25 %	392414011
3016	NC_018027	GGC	2	6	105764	105769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414011
3017	NC_018027	CG	3	6	105772	105777	0 %	0 %	50 %	50 %	392414011
3018	NC_018027	GAT	2	6	105809	105814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414011
3019	NC_018027	CGATC	2	10	105824	105833	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3020	NC_018027	TGC	2	6	105871	105876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_018027	GCT	2	6	105889	105894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_018027	CGT	2	6	105895	105900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_018027	CGC	2	6	105927	105932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_018027	CG	3	6	105934	105939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_018027	CG	3	6	105967	105972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_018027	TCG	2	6	106030	106035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_018027	CCA	2	6	106065	106070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414012
3028	NC_018027	CGA	2	6	106093	106098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414012
3029	NC_018027	TCG	2	6	106104	106109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414012
3030	NC_018027	TCG	2	6	106122	106127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414012
3031	NC_018027	CGA	3	9	106138	106146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414012
3032	NC_018027	GCC	2	6	106166	106171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414012
3033	NC_018027	GTG	2	6	106200	106205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414012
3034	NC_018027	TGC	2	6	106227	106232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414012
3035	NC_018027	GTCG	2	8	106261	106268	0 %	25 %	50 %	25 %	392414012
3036	NC_018027	CAC	2	6	106279	106284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414012
3037	NC_018027	GGCCC	2	10	106285	106294	0 %	0 %	40 %	60 %	392414012
3038	NC_018027	GTG	2	6	106304	106309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414012
3039	NC_018027	GCGG	2	8	106326	106333	0 %	0 %	75 %	25 %	392414012
3040	NC_018027	CCG	2	6	106347	106352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414012
3041	NC_018027	CG	3	6	106351	106356	0 %	0 %	50 %	50 %	392414012
3042	NC_018027	GAC	2	6	106398	106403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414012
3043	NC_018027	CGGC	2	8	106428	106435	0 %	0 %	50 %	50 %	392414012
3044	NC_018027	GCG	2	6	106439	106444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414012
3045	NC_018027	TTC	2	6	106457	106462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414012
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3047	NC_018027	GTG	2	6	106511	106516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414012
3048	NC_018027	CCT	2	6	106594	106599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414012
3049	NC_018027	CGG	3	9	106633	106641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414012
3050	NC_018027	GGC	2	6	106666	106671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414012
3051	NC_018027	CCG	2	6	106677	106682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414012
3052	NC_018027	CGTGGT	2	12	106693	106704	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392414012
3053	NC_018027	CGC	2	6	106713	106718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414012
3054	NC_018027	CCG	2	6	106752	106757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414012
3055	NC_018027	ACC	2	6	106799	106804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414012
3056	NC_018027	CGG	2	6	106857	106862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414012
3057	NC_018027	CGG	2	6	106882	106887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414012
3058	NC_018027	CGCGGT	2	12	106891	106902	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414012
3059	NC_018027	TGC	2	6	106947	106952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414012
3060	NC_018027	GATTC	2	10	106985	106994	20 %	40 %	20 %	20 %	392414012
3061	NC_018027	GCAC	2	8	107026	107033	25 %	0 %	25 %	50 %	392414012
3062	NC_018027	GGC	2	6	107037	107042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414012
3063	NC_018027	GCC	2	6	107099	107104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414012
3064	NC_018027	GTG	2	6	107120	107125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414012
3065	NC_018027	TGG	3	9	107256	107264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414013
3066	NC_018027	GAA	2	6	107329	107334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414013
3067	NC_018027	GCG	2	6	107367	107372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414013
3068	NC_018027	GTC	2	6	107417	107422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414013
3069	NC_018027	GCT	2	6	107431	107436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414013
3070	NC_018027	GCC	2	6	107443	107448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414013
3071	NC_018027	GCC	2	6	107464	107469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414013
3072	NC_018027	GCA	2	6	107515	107520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414013
3073	NC_018027	CGG	2	6	107529	107534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414013
3074	NC_018027	CGA	2	6	107557	107562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414013
3075	NC_018027	GC	3	6	107572	107577	0 %	0 %	50 %	50 %	392414013
3076	NC_018027	CTG	2	6	107654	107659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414013
3077	NC_018027	GACG	2	8	107679	107686	25 %	0 %	50 %	25 %	392414013
3078	NC_018027	CGG	2	6	107698	107703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414013
3079	NC_018027	CGG	3	9	107710	107718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_018027	TCG	2	6	107768	107773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_018027	CGT	2	6	107778	107783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_018027	AACC	2	8	107889	107896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_018027	TAG	2	6	107900	107905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_018027	CG	3	6	107912	107917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_018027	CGC	2	6	107989	107994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414014
3086	NC_018027	CCA	2	6	108014	108019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414014
3087	NC_018027	CGC	2	6	108027	108032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414014
3088	NC_018027	GAC	2	6	108058	108063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414014
3089	NC_018027	ACT	2	6	108104	108109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414014
3090	NC_018027	GCC	2	6	108151	108156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414014
3091	NC_018027	ACG	2	6	108179	108184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414014
3092	NC_018027	GC	3	6	108199	108204	0 %	0 %	50 %	50 %	392414014
3093	NC_018027	GCT	2	6	108231	108236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414014
3094	NC_018027	GC	3	6	108261	108266	0 %	0 %	50 %	50 %	392414014
3095	NC_018027	AGG	2	6	108281	108286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414014
3096	NC_018027	GCG	2	6	108395	108400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414014
3097	NC_018027	TGCG	2	8	108408	108415	0 %	25 %	50 %	25 %	392414014
3098	NC_018027	GCTCG	2	10	108453	108462	0 %	20 %	40 %	40 %	392414014
3099	NC_018027	GCTG	2	8	108467	108474	0 %	25 %	50 %	25 %	392414014
3100	NC_018027	GCT	2	6	108528	108533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414014
3101	NC_018027	CGAGA	2	10	108547	108556	40 %	0 %	40 %	20 %	392414014
3102	NC_018027	CGC	2	6	108572	108577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414014
3103	NC_018027	TCG	2	6	108628	108633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_018027	CG	3	6	108850	108855	0 %	0 %	50 %	50 %	392414015
3105	NC_018027	GCC	2	6	108871	108876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414015
3106	NC_018027	GGC	2	6	108898	108903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414015
3107	NC_018027	GC	3	6	108920	108925	0 %	0 %	50 %	50 %	392414015
3108	NC_018027	CGGG	2	8	108989	108996	0 %	0 %	75 %	25 %	392414015
3109	NC_018027	GCT	2	6	109000	109005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414015
3110	NC_018027	CGA	2	6	109033	109038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414015
3111	NC_018027	TCA	2	6	109043	109048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414015
3112	NC_018027	CGC	2	6	109069	109074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414015
3113	NC_018027	CCG	2	6	109080	109085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414015
3114	NC_018027	GAC	2	6	109124	109129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414015
3115	NC_018027	GCG	2	6	109130	109135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414015
3116	NC_018027	GCC	2	6	109163	109168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414015
3117	NC_018027	CGT	2	6	109171	109176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414015
3118	NC_018027	GAGCG	2	10	109180	109189	20 %	0 %	60 %	20 %	392414015
3119	NC_018027	GGCGAC	2	12	109210	109221	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392414015
3120	NC_018027	CGA	2	6	109285	109290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414015
3121	NC_018027	GGT	2	6	109296	109301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414015
3122	NC_018027	TTC	2	6	109352	109357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414015
3123	NC_018027	AAC	2	6	109358	109363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392414015
3124	NC_018027	TGGG	2	8	109368	109375	0 %	25 %	75 %	0 %	392414015
3125	NC_018027	CCG	2	6	109456	109461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414016
3126	NC_018027	CAC	2	6	109462	109467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414016
3127	NC_018027	CCG	2	6	109503	109508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414016
3128	NC_018027	GAGG	2	8	109534	109541	25 %	0 %	75 %	0 %	392414016
3129	NC_018027	GCCGC	2	10	109553	109562	0 %	0 %	40 %	60 %	392414016
3130	NC_018027	CTG	2	6	109589	109594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414016
3131	NC_018027	CCG	2	6	109595	109600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414016
3132	NC_018027	TCG	2	6	109696	109701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414017
3133	NC_018027	GCT	2	6	109744	109749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414017
3134	NC_018027	ACG	3	9	109765	109773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414017
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3136	NC_018027	GTG	3	9	109800	109808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414017
3137	NC_018027	CTA	2	6	109841	109846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414017
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3139	NC_018027	AGC	2	6	109906	109911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414017
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3144	NC_018027	AGC	2	6	110059	110064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414017
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3152	NC_018027	TCG	2	6	110435	110440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414018
3153	NC_018027	CGG	2	6	110447	110452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414018
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3155	NC_018027	TCG	2	6	110481	110486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414018
3156	NC_018027	AGA	2	6	110496	110501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414018
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3159	NC_018027	TCG	2	6	110639	110644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414018
3160	NC_018027	GCGCA	2	10	110665	110674	20 %	0 %	40 %	40 %	392414018
3161	NC_018027	GCCG	2	8	110697	110704	0 %	0 %	50 %	50 %	392414018
3162	NC_018027	GCT	2	6	110721	110726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414018
3163	NC_018027	CCG	2	6	110728	110733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414018
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3167	NC_018027	ATC	2	6	110866	110871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3168	NC_018027	CCG	2	6	110891	110896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3173	NC_018027	CG	3	6	110997	111002	0 %	0 %	50 %	50 %	392414019
3174	NC_018027	ACG	2	6	111055	111060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414019
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3180	NC_018027	TCG	2	6	111353	111358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414019
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3183	NC_018027	ACG	2	6	111374	111379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414019
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3188	NC_018027	GTGCT	2	10	111500	111509	0 %	40 %	40 %	20 %	392414019
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3197	NC_018027	CTGCGG	2	12	111796	111807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414019
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3199	NC_018027	GTT	2	6	111843	111848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392414019
3200	NC_018027	GCC	2	6	111889	111894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414019
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3204	NC_018027	TCG	2	6	112001	112006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414019
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3219	NC_018027	TAC	2	6	112680	112685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414020
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3228	NC_018027	CTG	2	6	113032	113037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3229	NC_018027	TGC	2	6	113049	113054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3230	NC_018027	CCGGTG	2	12	113063	113074	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414021
3231	NC_018027	TCG	3	9	113120	113128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3232	NC_018027	GAG	2	6	113182	113187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414021
3233	NC_018027	GTG	2	6	113233	113238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414021
3234	NC_018027	CG	3	6	113240	113245	0 %	0 %	50 %	50 %	392414021
3235	NC_018027	TCG	2	6	113261	113266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3236	NC_018027	TGC	2	6	113270	113275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3237	NC_018027	TCA	2	6	113288	113293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414021
3238	NC_018027	CGG	2	6	113307	113312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414021
3239	NC_018027	TCA	2	6	113408	113413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414021
3240	NC_018027	GAC	2	6	113466	113471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3241	NC_018027	CGT	2	6	113550	113555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3242	NC_018027	GAC	2	6	113559	113564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3243	NC_018027	CCG	2	6	113604	113609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414022
3244	NC_018027	GC	3	6	113617	113622	0 %	0 %	50 %	50 %	392414022
3245	NC_018027	GCC	2	6	113639	113644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414022
3246	NC_018027	CG	3	6	113671	113676	0 %	0 %	50 %	50 %	392414022
3247	NC_018027	TCG	2	6	113709	113714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414022
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3252	NC_018027	TCG	2	6	113835	113840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414022
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3358	NC_018027	CCAGGG	2	12	117961	117972	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392414025
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3362	NC_018027	GCC	2	6	118174	118179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414025
3363	NC_018027	CCG	2	6	118193	118198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414025
3364	NC_018027	GCCGGG	2	12	118204	118215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414025
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3366	NC_018027	G	6	6	118291	118296	0 %	0 %	100 %	0 %	392414025
3367	NC_018027	CGA	2	6	118308	118313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414026
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3457	NC_018027	CCGG	2	8	122340	122347	0 %	0 %	50 %	50 %	392414028
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3470	NC_018027	GCC	2	6	122863	122868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414029
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3478	NC_018027	ACG	3	9	123098	123106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414029
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3480	NC_018027	CAG	2	6	123166	123171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414029
3481	NC_018027	CCA	2	6	123191	123196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414029
3482	NC_018027	CGA	2	6	123204	123209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414029
3483	NC_018027	CGT	2	6	123328	123333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414030
3484	NC_018027	CGGG	2	8	123342	123349	0 %	0 %	75 %	25 %	392414030
3485	NC_018027	GTC	2	6	123357	123362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414030
3486	NC_018027	TGC	2	6	123367	123372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414030
3487	NC_018027	GTC	2	6	123384	123389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414030
3488	NC_018027	GC	3	6	123397	123402	0 %	0 %	50 %	50 %	392414030
3489	NC_018027	GCTGGC	2	12	123404	123415	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414030
3490	NC_018027	CCG	2	6	123421	123426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414030
3491	NC_018027	GGTG	2	8	123439	123446	0 %	25 %	75 %	0 %	392414030
3492	NC_018027	TGC	2	6	123454	123459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414030
3493	NC_018027	TGC	3	9	123496	123504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414030
3494	NC_018027	CG	3	6	123531	123536	0 %	0 %	50 %	50 %	392414030
3495	NC_018027	GGCGC	2	10	123554	123563	0 %	0 %	60 %	40 %	392414030
3496	NC_018027	CGG	2	6	123574	123579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414030
3497	NC_018027	CTG	2	6	123582	123587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414030
3498	NC_018027	TCG	2	6	123637	123642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414030
3499	NC_018027	CCGGCG	2	12	123665	123676	0 %	0 %	50 %	50 %	392414030
3500	NC_018027	GC	3	6	123696	123701	0 %	0 %	50 %	50 %	392414030

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