MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 153331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018027	TGG	2	6	499261	499266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414379
14002	NC_018027	CCA	2	6	499267	499272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414379
14003	NC_018027	CCGCT	2	10	499292	499301	0 %	20 %	20 %	60 %	392414379
14004	NC_018027	TCT	2	6	499333	499338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414379
14005	NC_018027	GCG	2	6	499347	499352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414379
14006	NC_018027	CGGTG	2	10	499367	499376	0 %	20 %	60 %	20 %	392414379
14007	NC_018027	GTG	3	9	499374	499382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414379
14008	NC_018027	ACC	2	6	499422	499427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414379
14009	NC_018027	CACG	2	8	499435	499442	25 %	0 %	25 %	50 %	392414379
14010	NC_018027	GGC	2	6	499472	499477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414379
14011	NC_018027	GGC	2	6	499496	499501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414379
14012	NC_018027	CTG	3	9	499536	499544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414379
14013	NC_018027	GCT	2	6	499550	499555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414379
14014	NC_018027	TGG	2	6	499567	499572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414379
14015	NC_018027	GTCG	2	8	499691	499698	0 %	25 %	50 %	25 %	392414379
14016	NC_018027	CGG	2	6	499708	499713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414379
14017	NC_018027	TCG	2	6	499729	499734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414379
14018	NC_018027	GTG	2	6	499746	499751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414379
14019	NC_018027	CCG	2	6	499754	499759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414379
14020	NC_018027	CGT	2	6	499867	499872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414380
14021	NC_018027	GCA	3	9	499918	499926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414380
14022	NC_018027	GGC	2	6	499973	499978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414380
14023	NC_018027	TCCGAC	2	12	500012	500023	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392414380
14024	NC_018027	GAT	2	6	500068	500073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414380
14025	NC_018027	GGC	2	6	500110	500115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414380
14026	NC_018027	CAGATC	2	12	500225	500236	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392414380
14027	NC_018027	CTA	2	6	500266	500271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414380
14028	NC_018027	ACG	2	6	500277	500282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414380
14029	NC_018027	GCA	2	6	500341	500346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414380
14030	NC_018027	AAG	2	6	500375	500380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414380
14031	NC_018027	GTG	2	6	500384	500389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414380
14032	NC_018027	GCG	2	6	500439	500444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414380
14033	NC_018027	TGC	2	6	500460	500465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414380
14034	NC_018027	CACC	2	8	500472	500479	25 %	0 %	0 %	75 %	392414380
14035	NC_018027	CGC	2	6	500512	500517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414380
14036	NC_018027	GCT	2	6	500530	500535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414380
14037	NC_018027	CGG	2	6	500657	500662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414380
14038	NC_018027	CTACGA	2	12	500674	500685	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392414380
14039	NC_018027	GCAAGG	2	12	500766	500777	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	392414380
14040	NC_018027	CCG	2	6	500811	500816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414380
14041	NC_018027	CAT	2	6	500857	500862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414380
14042	NC_018027	TTC	2	6	500891	500896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414380
14043	NC_018027	GGC	2	6	500897	500902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414380
14044	NC_018027	CCT	2	6	501015	501020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414380
14045	NC_018027	GCC	2	6	501057	501062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414380
14046	NC_018027	GCG	2	6	501117	501122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414380
14047	NC_018027	TCG	2	6	501141	501146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414380
14048	NC_018027	GGC	2	6	501213	501218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414380
14049	NC_018027	GAC	2	6	501269	501274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414380
14050	NC_018027	TGG	2	6	501306	501311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414380
14051	NC_018027	CGA	2	6	501330	501335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414380
14052	NC_018027	GATC	2	8	501339	501346	25 %	25 %	25 %	25 %	392414380
14053	NC_018027	CTG	2	6	501478	501483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414381
14054	NC_018027	GTC	2	6	501502	501507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414381
14055	NC_018027	CGG	2	6	501552	501557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414381
14056	NC_018027	ACG	2	6	501581	501586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414381
14057	NC_018027	GC	3	6	501665	501670	0 %	0 %	50 %	50 %	392414381
14058	NC_018027	GGC	2	6	501672	501677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414381
14059	NC_018027	GTC	2	6	501757	501762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414381
14060	NC_018027	TGC	2	6	501776	501781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414381
14061	NC_018027	TTC	2	6	501814	501819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414381
14062	NC_018027	GCT	2	6	501843	501848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414381
14063	NC_018027	CCG	2	6	501886	501891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414381
14064	NC_018027	GCC	2	6	501958	501963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414381
14065	NC_018027	TAC	2	6	501970	501975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414381
14066	NC_018027	GGCCG	2	10	501989	501998	0 %	0 %	60 %	40 %	392414381
14067	NC_018027	CCG	2	6	502047	502052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414381
14068	NC_018027	CTG	2	6	502057	502062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414381
14069	NC_018027	CGG	2	6	502130	502135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414381
14070	NC_018027	GAT	2	6	502149	502154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414381
14071	NC_018027	CCG	2	6	502160	502165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414381
14072	NC_018027	GC	4	8	502226	502233	0 %	0 %	50 %	50 %	392414381
14073	NC_018027	CCA	2	6	502257	502262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14074	NC_018027	TCA	2	6	502289	502294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414382
14075	NC_018027	TCG	2	6	502307	502312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14076	NC_018027	TCCG	2	8	502356	502363	0 %	25 %	25 %	50 %	392414382
14077	NC_018027	ACG	2	6	502490	502495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14078	NC_018027	CGA	2	6	502581	502586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14079	NC_018027	CGG	3	9	502649	502657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414382
14080	NC_018027	TCG	2	6	502676	502681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14081	NC_018027	CGA	2	6	502695	502700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14082	NC_018027	ACG	2	6	502727	502732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14083	NC_018027	CCCA	2	8	502738	502745	25 %	0 %	0 %	75 %	392414382
14084	NC_018027	GGT	4	12	502752	502763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414382
14085	NC_018027	CGC	2	6	502803	502808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414382
14086	NC_018027	CGCGG	2	10	502813	502822	0 %	0 %	60 %	40 %	392414382
14087	NC_018027	TCG	2	6	502832	502837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14088	NC_018027	ACGAGG	2	12	502844	502855	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	392414382
14089	NC_018027	GCC	2	6	502924	502929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414382
14090	NC_018027	CGA	2	6	502964	502969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14091	NC_018027	GGTCG	2	10	503055	503064	0 %	20 %	60 %	20 %	392414382
14092	NC_018027	GAG	3	9	503200	503208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414382
14093	NC_018027	CTG	2	6	503212	503217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14094	NC_018027	ACC	2	6	503252	503257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414382
14095	NC_018027	GCTCG	2	10	503292	503301	0 %	20 %	40 %	40 %	392414382
14096	NC_018027	ACG	2	6	503324	503329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14097	NC_018027	CGG	2	6	503384	503389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414382
14098	NC_018027	GCC	2	6	503407	503412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414382
14099	NC_018027	CGGG	2	8	503422	503429	0 %	0 %	75 %	25 %	392414382
14100	NC_018027	ACG	2	6	503471	503476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14101	NC_018027	GGC	2	6	503503	503508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414382
14102	NC_018027	GGA	2	6	503523	503528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414382
14103	NC_018027	GAA	3	9	503529	503537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414382
14104	NC_018027	CAG	2	6	503542	503547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14105	NC_018027	ACCGC	2	10	503627	503636	20 %	0 %	20 %	60 %	392414382
14106	NC_018027	GCG	2	6	503654	503659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414382
14107	NC_018027	CGA	2	6	503721	503726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14108	NC_018027	CGT	2	6	503750	503755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414382
14109	NC_018027	CGTCGC	3	18	503777	503794	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392414383
14110	NC_018027	CCG	2	6	503812	503817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414383
14111	NC_018027	AGA	2	6	503911	503916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414383
14112	NC_018027	ACG	2	6	503929	503934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414383
14113	NC_018027	GGC	2	6	504054	504059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414383
14114	NC_018027	CGGG	2	8	504080	504087	0 %	0 %	75 %	25 %	392414383
14115	NC_018027	CT	3	6	504107	504112	0 %	50 %	0 %	50 %	392414383
14116	NC_018027	ACC	2	6	504120	504125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414383
14117	NC_018027	GC	3	6	504140	504145	0 %	0 %	50 %	50 %	392414383
14118	NC_018027	CCG	2	6	504161	504166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414383
14119	NC_018027	GTC	2	6	504225	504230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414383
14120	NC_018027	GAC	2	6	504231	504236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414383
14121	NC_018027	TCG	2	6	504250	504255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414383
14122	NC_018027	CCG	2	6	504268	504273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414383
14123	NC_018027	TGG	2	6	504298	504303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414383
14124	NC_018027	GC	3	6	504334	504339	0 %	0 %	50 %	50 %	392414383
14125	NC_018027	CTA	2	6	504362	504367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414383
14126	NC_018027	CAT	2	6	504392	504397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414383
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14129	NC_018027	TGA	2	6	504469	504474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414383
14130	NC_018027	GTC	2	6	504489	504494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414383
14131	NC_018027	TGG	2	6	504532	504537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414383
14132	NC_018027	GGC	2	6	504642	504647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414383
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14134	NC_018027	TCGACA	2	12	504757	504768	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392414383
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14138	NC_018027	GTC	2	6	504995	505000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414383
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14140	NC_018027	CA	3	6	505071	505076	50 %	0 %	0 %	50 %	392414383
14141	NC_018027	CGT	2	6	505126	505131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414383
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14144	NC_018027	ACGC	2	8	505211	505218	25 %	0 %	25 %	50 %	392414383
14145	NC_018027	TGC	2	6	505242	505247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414384
14146	NC_018027	GCG	2	6	505264	505269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414384
14147	NC_018027	GTCGCG	2	12	505272	505283	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414384
14148	NC_018027	CCTG	2	8	505298	505305	0 %	25 %	25 %	50 %	392414384
14149	NC_018027	GCG	2	6	505342	505347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414384
14150	NC_018027	GAT	2	6	505413	505418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414384
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14153	NC_018027	CGG	2	6	505607	505612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414384
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14155	NC_018027	CGC	2	6	505647	505652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414384
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14159	NC_018027	GC	3	6	505739	505744	0 %	0 %	50 %	50 %	392414384
14160	NC_018027	CCGA	2	8	505783	505790	25 %	0 %	25 %	50 %	392414384
14161	NC_018027	CGGC	2	8	505829	505836	0 %	0 %	50 %	50 %	392414384
14162	NC_018027	GCA	2	6	505847	505852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414384
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14166	NC_018027	CAG	2	6	506025	506030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414384
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14169	NC_018027	CGA	2	6	506111	506116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414384
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14174	NC_018027	C	7	7	506220	506226	0 %	0 %	0 %	100 %	392414384
14175	NC_018027	CGG	2	6	506258	506263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414384
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14179	NC_018027	CGG	2	6	506373	506378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414384
14180	NC_018027	CGA	2	6	506423	506428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414384
14181	NC_018027	TCG	2	6	506473	506478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414384
14182	NC_018027	ACG	2	6	506485	506490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414384
14183	NC_018027	GATCG	2	10	506498	506507	20 %	20 %	40 %	20 %	392414384
14184	NC_018027	TGC	2	6	506537	506542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414384
14185	NC_018027	AC	3	6	506547	506552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14186	NC_018027	CGGT	2	8	506558	506565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14187	NC_018027	GGC	2	6	506600	506605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414385
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14193	NC_018027	GAC	2	6	506721	506726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414385
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14196	NC_018027	GGTC	2	8	506900	506907	0 %	25 %	50 %	25 %	392414385
14197	NC_018027	TCGGCG	2	12	506923	506934	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414385
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14200	NC_018027	AAGC	2	8	507104	507111	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14201	NC_018027	GGT	2	6	507121	507126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14202	NC_018027	CCG	2	6	507229	507234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14203	NC_018027	ATCT	2	8	507271	507278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14204	NC_018027	GAC	2	6	507345	507350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414386
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14207	NC_018027	CGC	2	6	507398	507403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414386
14208	NC_018027	GCT	2	6	507404	507409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414386
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14210	NC_018027	GTC	2	6	507470	507475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414387
14211	NC_018027	CGG	2	6	507544	507549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414387
14212	NC_018027	TCCTGT	2	12	507648	507659	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	392414387
14213	NC_018027	GCAGG	2	10	507676	507685	20 %	0 %	60 %	20 %	392414387
14214	NC_018027	CACCAA	2	12	507760	507771	50 %	0 %	0 %	50 %	392414387
14215	NC_018027	GGCA	2	8	507774	507781	25 %	0 %	50 %	25 %	392414387
14216	NC_018027	GCC	2	6	507851	507856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414387
14217	NC_018027	CGCC	2	8	507895	507902	0 %	0 %	25 %	75 %	392414387
14218	NC_018027	GCA	2	6	507903	507908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414387
14219	NC_018027	GCA	2	6	507948	507953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414387
14220	NC_018027	TGC	2	6	507960	507965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414387
14221	NC_018027	TCG	2	6	507978	507983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414387
14222	NC_018027	GTC	2	6	508040	508045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414387
14223	NC_018027	GC	3	6	508061	508066	0 %	0 %	50 %	50 %	392414387
14224	NC_018027	CGG	2	6	508078	508083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414387
14225	NC_018027	GCCA	2	8	508091	508098	25 %	0 %	25 %	50 %	392414387
14226	NC_018027	CGG	3	9	508126	508134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414387
14227	NC_018027	CTT	2	6	508135	508140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414387
14228	NC_018027	CTG	2	6	508205	508210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414387
14229	NC_018027	TCA	2	6	508215	508220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414387
14230	NC_018027	GCA	2	6	508257	508262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414387
14231	NC_018027	CGC	2	6	508303	508308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414387
14232	NC_018027	CTC	2	6	508328	508333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414387
14233	NC_018027	CACGG	2	10	508349	508358	20 %	0 %	40 %	40 %	392414387
14234	NC_018027	CCG	3	9	508365	508373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414387
14235	NC_018027	GCC	2	6	508376	508381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414387
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14239	NC_018027	CAT	2	6	508585	508590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414387
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14351	NC_018027	CGGC	2	8	512418	512425	0 %	0 %	50 %	50 %	392414390
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14446	NC_018027	CGGCG	2	10	515998	516007	0 %	0 %	60 %	40 %	392414394
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