MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 153331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018027	TCGCC	2	10	195058	195067	0 %	20 %	20 %	60 %	392414102
5502	NC_018027	GC	3	6	195115	195120	0 %	0 %	50 %	50 %	392414102
5503	NC_018027	GC	3	6	195175	195180	0 %	0 %	50 %	50 %	392414102
5504	NC_018027	CCG	2	6	195193	195198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414102
5505	NC_018027	CTGC	2	8	195236	195243	0 %	25 %	25 %	50 %	392414102
5506	NC_018027	CAC	2	6	195257	195262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414102
5507	NC_018027	GCC	2	6	195290	195295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414102
5508	NC_018027	CGG	2	6	195356	195361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414102
5509	NC_018027	ACC	2	6	195371	195376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414102
5510	NC_018027	TCG	2	6	195456	195461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414102
5511	NC_018027	GCG	2	6	195560	195565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_018027	TG	3	6	195570	195575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_018027	GC	3	6	195820	195825	0 %	0 %	50 %	50 %	392414103
5514	NC_018027	GAG	2	6	195909	195914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414103
5515	NC_018027	AGC	2	6	195919	195924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414103
5516	NC_018027	GGTCT	2	10	195969	195978	0 %	40 %	40 %	20 %	392414103
5517	NC_018027	CGG	2	6	196006	196011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414103
5518	NC_018027	GCC	2	6	196022	196027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414103
5519	NC_018027	GCT	2	6	196100	196105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414103
5520	NC_018027	GAC	2	6	196122	196127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414103
5521	NC_018027	CCG	2	6	196132	196137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414103
5522	NC_018027	TGC	2	6	196150	196155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414103
5523	NC_018027	TGC	2	6	196195	196200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414103
5524	NC_018027	TCGA	2	8	196251	196258	25 %	25 %	25 %	25 %	392414103
5525	NC_018027	CGC	2	6	196270	196275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414103
5526	NC_018027	ACC	2	6	196276	196281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414103
5527	NC_018027	GGGCCA	2	12	196324	196335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392414103
5528	NC_018027	CGG	2	6	196349	196354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414103
5529	NC_018027	TCG	2	6	196366	196371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414103
5530	NC_018027	CGGC	2	8	196387	196394	0 %	0 %	50 %	50 %	392414103
5531	NC_018027	CGC	2	6	196403	196408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414103
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5533	NC_018027	TCG	2	6	196546	196551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414103
5534	NC_018027	CGT	3	9	196565	196573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414103
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5536	NC_018027	CCG	2	6	196647	196652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414103
5537	NC_018027	TCG	2	6	196711	196716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414103
5538	NC_018027	GC	3	6	196724	196729	0 %	0 %	50 %	50 %	392414103
5539	NC_018027	GGT	2	6	196742	196747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414103
5540	NC_018027	GCG	2	6	196812	196817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414103
5541	NC_018027	ACCGAA	2	12	196852	196863	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	392414103
5542	NC_018027	TA	3	6	196886	196891	50 %	50 %	0 %	0 %	392414103
5543	NC_018027	GCTGT	2	10	196945	196954	0 %	40 %	40 %	20 %	392414104
5544	NC_018027	CCA	2	6	197127	197132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414104
5545	NC_018027	CGGG	2	8	197201	197208	0 %	0 %	75 %	25 %	392414104
5546	NC_018027	CGT	2	6	197209	197214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414104
5547	NC_018027	CGA	2	6	197220	197225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414104
5548	NC_018027	CGGC	2	8	197232	197239	0 %	0 %	50 %	50 %	392414104
5549	NC_018027	GGCG	2	8	197301	197308	0 %	0 %	75 %	25 %	392414104
5550	NC_018027	CCA	2	6	197334	197339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414104
5551	NC_018027	TGCT	2	8	197372	197379	0 %	50 %	25 %	25 %	392414104
5552	NC_018027	AGG	2	6	197396	197401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414104
5553	NC_018027	CGAC	2	8	197429	197436	25 %	0 %	25 %	50 %	392414104
5554	NC_018027	G	6	6	197450	197455	0 %	0 %	100 %	0 %	392414104
5555	NC_018027	CG	3	6	197496	197501	0 %	0 %	50 %	50 %	392414104
5556	NC_018027	CGG	2	6	197539	197544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414104
5557	NC_018027	CCCG	2	8	197582	197589	0 %	0 %	25 %	75 %	392414104
5558	NC_018027	CCG	3	9	197596	197604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414104
5559	NC_018027	CGACG	2	10	197625	197634	20 %	0 %	40 %	40 %	392414104
5560	NC_018027	CGCTGG	2	12	197654	197665	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414104
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5562	NC_018027	TGC	2	6	197753	197758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414104
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5564	NC_018027	ATC	2	6	197777	197782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414104
5565	NC_018027	GCT	2	6	197784	197789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414104
5566	NC_018027	CCGGA	2	10	197821	197830	20 %	0 %	40 %	40 %	392414104
5567	NC_018027	ACT	2	6	197840	197845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414104
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5569	NC_018027	ACG	2	6	197912	197917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414104
5570	NC_018027	CCGCGG	2	12	197918	197929	0 %	0 %	50 %	50 %	392414104
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5573	NC_018027	CCCG	2	8	197988	197995	0 %	0 %	25 %	75 %	392414104
5574	NC_018027	CCG	2	6	197999	198004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414104
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5576	NC_018027	CAA	2	6	198027	198032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392414104
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5579	NC_018027	GGT	2	6	198103	198108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414104
5580	NC_018027	TCGG	2	8	198130	198137	0 %	25 %	50 %	25 %	392414104
5581	NC_018027	TG	3	6	198171	198176	0 %	50 %	50 %	0 %	392414104
5582	NC_018027	TCG	2	6	198269	198274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414104
5583	NC_018027	GTC	2	6	198313	198318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414104
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5585	NC_018027	CGG	2	6	198401	198406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_018027	GCG	2	6	198419	198424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414105
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5590	NC_018027	GTA	2	6	198526	198531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414105
5591	NC_018027	ACC	2	6	198572	198577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414105
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5594	NC_018027	GTC	2	6	198643	198648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414105
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5606	NC_018027	TCGA	2	8	199061	199068	25 %	25 %	25 %	25 %	392414105
5607	NC_018027	CGGC	2	8	199120	199127	0 %	0 %	50 %	50 %	392414105
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5622	NC_018027	TCG	2	6	199734	199739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414106
5623	NC_018027	GCA	2	6	199831	199836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414106
5624	NC_018027	CGA	2	6	199837	199842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414106
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5631	NC_018027	TCG	3	9	199974	199982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414106
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5639	NC_018027	GTCGCG	2	12	200226	200237	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414106
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5644	NC_018027	TCG	2	6	200382	200387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414106
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5647	NC_018027	TGA	2	6	200494	200499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414106
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5654	NC_018027	CGT	2	6	200728	200733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414106
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5670	NC_018027	CCGCG	2	10	201137	201146	0 %	0 %	40 %	60 %	392414106
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5689	NC_018027	ACC	2	6	201970	201975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414107
5690	NC_018027	GC	3	6	201977	201982	0 %	0 %	50 %	50 %	392414107
5691	NC_018027	GCCG	2	8	201984	201991	0 %	0 %	50 %	50 %	392414107
5692	NC_018027	GGT	2	6	202022	202027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414107
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5696	NC_018027	CGG	2	6	202130	202135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414107
5697	NC_018027	GCT	2	6	202192	202197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5700	NC_018027	TCG	2	6	202256	202261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414108
5701	NC_018027	CGA	2	6	202311	202316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414108
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5722	NC_018027	CTG	2	6	202926	202931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5723	NC_018027	GAC	2	6	202960	202965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5724	NC_018027	GCC	2	6	202983	202988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5725	NC_018027	CGGCG	2	10	202994	203003	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5726	NC_018027	GCA	2	6	203076	203081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5727	NC_018027	ATGTC	2	10	203086	203095	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5728	NC_018027	GCCG	2	8	203105	203112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5729	NC_018027	CGC	2	6	203144	203149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414109
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5732	NC_018027	AGC	2	6	203219	203224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414109
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5734	NC_018027	CGC	2	6	203314	203319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414109
5735	NC_018027	CGC	2	6	203356	203361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414109
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5737	NC_018027	GTC	2	6	203374	203379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414109
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5739	NC_018027	CGC	2	6	203487	203492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414109
5740	NC_018027	GCG	2	6	203520	203525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414109
5741	NC_018027	CCG	2	6	203528	203533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414109
5742	NC_018027	GCT	2	6	203557	203562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414109
5743	NC_018027	GTC	2	6	203564	203569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414109
5744	NC_018027	CGA	2	6	203578	203583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414109
5745	NC_018027	CG	3	6	203603	203608	0 %	0 %	50 %	50 %	392414109
5746	NC_018027	GTGG	2	8	203629	203636	0 %	25 %	75 %	0 %	392414109
5747	NC_018027	CCGG	2	8	203644	203651	0 %	0 %	50 %	50 %	392414109
5748	NC_018027	GGAC	2	8	203671	203678	25 %	0 %	50 %	25 %	392414109
5749	NC_018027	TGGC	2	8	203732	203739	0 %	25 %	50 %	25 %	392414109
5750	NC_018027	CGC	2	6	203763	203768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414109
5751	NC_018027	TGG	2	6	203790	203795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414109
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5753	NC_018027	GAC	2	6	203822	203827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414109
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5755	NC_018027	CGG	3	9	203865	203873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414109
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5763	NC_018027	GC	3	6	204196	204201	0 %	0 %	50 %	50 %	392414110
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5772	NC_018027	CGGC	2	8	204433	204440	0 %	0 %	50 %	50 %	392414110
5773	NC_018027	CGA	2	6	204446	204451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414110
5774	NC_018027	TGC	2	6	204499	204504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414110
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5777	NC_018027	GAC	2	6	204580	204585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414110
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5780	NC_018027	TGC	2	6	204762	204767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414111
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5783	NC_018027	CACC	2	8	204827	204834	25 %	0 %	0 %	75 %	392414111
5784	NC_018027	CGC	2	6	204847	204852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414111
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5821	NC_018027	GTTCC	2	10	206237	206246	0 %	40 %	20 %	40 %	392414111
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5823	NC_018027	CTG	3	9	206264	206272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414111
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5828	NC_018027	TGC	2	6	206424	206429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414111
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5832	NC_018027	GGCGG	2	10	206503	206512	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5833	NC_018027	CGA	2	6	206530	206535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414112
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5841	NC_018027	TGCG	2	8	206975	206982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5842	NC_018027	GCA	2	6	207025	207030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414113
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5847	NC_018027	CCTCGT	2	12	207262	207273	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	392414113
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5852	NC_018027	CTT	2	6	207431	207436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414113
5853	NC_018027	CGCGCT	2	12	207451	207462	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392414113
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5856	NC_018027	CGA	2	6	207550	207555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414113
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5860	NC_018027	CGC	2	6	207683	207688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414113
5861	NC_018027	GCC	2	6	207695	207700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414113
5862	NC_018027	CGA	2	6	207764	207769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414113
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5864	NC_018027	CCGG	2	8	207815	207822	0 %	0 %	50 %	50 %	392414113
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5984	NC_018027	CGTC	2	8	211579	211586	0 %	25 %	25 %	50 %	392414117
5985	NC_018027	GCCA	2	8	211592	211599	25 %	0 %	25 %	50 %	392414117
5986	NC_018027	CTC	2	6	211604	211609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414117
5987	NC_018027	CCG	2	6	211630	211635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414117
5988	NC_018027	GAC	2	6	211653	211658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414117
5989	NC_018027	CTG	2	6	211684	211689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414118
5990	NC_018027	TGGC	2	8	211732	211739	0 %	25 %	50 %	25 %	392414118
5991	NC_018027	TTC	2	6	211774	211779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414118
5992	NC_018027	GCT	2	6	211809	211814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414118
5993	NC_018027	G	6	6	211833	211838	0 %	0 %	100 %	0 %	392414118
5994	NC_018027	CCTA	2	8	211850	211857	25 %	25 %	0 %	50 %	392414118
5995	NC_018027	CGC	2	6	211916	211921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414119
5996	NC_018027	CGA	3	9	211947	211955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414119
5997	NC_018027	GCG	2	6	211979	211984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414119
5998	NC_018027	GTC	3	9	212044	212052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414119
5999	NC_018027	CGT	2	6	212079	212084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414119
6000	NC_018027	GGC	2	6	212085	212090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414119

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