MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 153331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018027	CG	3	6	177100	177105	0 %	0 %	50 %	50 %	392414089
5002	NC_018027	GACGCC	2	12	177142	177153	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392414089
5003	NC_018027	GC	3	6	177183	177188	0 %	0 %	50 %	50 %	392414089
5004	NC_018027	GC	3	6	177234	177239	0 %	0 %	50 %	50 %	392414089
5005	NC_018027	CGC	2	6	177288	177293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414089
5006	NC_018027	CG	3	6	177316	177321	0 %	0 %	50 %	50 %	392414089
5007	NC_018027	TCG	2	6	177371	177376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414089
5008	NC_018027	CG	3	6	177375	177380	0 %	0 %	50 %	50 %	392414089
5009	NC_018027	CGA	2	6	177417	177422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414089
5010	NC_018027	GC	3	6	177441	177446	0 %	0 %	50 %	50 %	392414089
5011	NC_018027	CCG	2	6	177452	177457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414089
5012	NC_018027	GGC	2	6	177465	177470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414089
5013	NC_018027	CCG	2	6	177493	177498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414089
5014	NC_018027	CCG	2	6	177528	177533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414089
5015	NC_018027	TGA	2	6	177548	177553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414089
5016	NC_018027	CTG	2	6	177589	177594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414089
5017	NC_018027	ACG	2	6	177595	177600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414089
5018	NC_018027	GCT	2	6	177603	177608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414089
5019	NC_018027	CTG	2	6	177628	177633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414089
5020	NC_018027	CCGGT	2	10	177638	177647	0 %	20 %	40 %	40 %	392414089
5021	NC_018027	CGG	2	6	177651	177656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414089
5022	NC_018027	CTG	2	6	177703	177708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414089
5023	NC_018027	GGTG	2	8	177731	177738	0 %	25 %	75 %	0 %	392414089
5024	NC_018027	GCGCG	2	10	177759	177768	0 %	0 %	60 %	40 %	392414089
5025	NC_018027	CGC	2	6	177798	177803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414089
5026	NC_018027	GGC	2	6	177807	177812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414089
5027	NC_018027	GCG	2	6	177829	177834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414089
5028	NC_018027	CGGC	2	8	177882	177889	0 %	0 %	50 %	50 %	392414089
5029	NC_018027	CG	3	6	177907	177912	0 %	0 %	50 %	50 %	392414089
5030	NC_018027	GCG	2	6	177945	177950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414089
5031	NC_018027	TCG	2	6	178001	178006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414089
5032	NC_018027	ACCG	2	8	178009	178016	25 %	0 %	25 %	50 %	392414089
5033	NC_018027	CGCGT	2	10	178318	178327	0 %	20 %	40 %	40 %	392414090
5034	NC_018027	GAA	2	6	178345	178350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414090
5035	NC_018027	ACC	2	6	178367	178372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414090
5036	NC_018027	CAA	2	6	178515	178520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392414090
5037	NC_018027	TGGA	2	8	178522	178529	25 %	25 %	50 %	0 %	392414090
5038	NC_018027	CGA	2	6	178533	178538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414090
5039	NC_018027	GACC	2	8	178554	178561	25 %	0 %	25 %	50 %	392414090
5040	NC_018027	GCA	2	6	178571	178576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414090
5041	NC_018027	GCGG	2	8	178580	178587	0 %	0 %	75 %	25 %	392414090
5042	NC_018027	GTC	2	6	178597	178602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414090
5043	NC_018027	CGT	3	9	178671	178679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414090
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5045	NC_018027	CGA	2	6	178731	178736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414090
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5048	NC_018027	GCCGTG	2	12	178800	178811	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414090
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5050	NC_018027	GCT	2	6	178890	178895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414090
5051	NC_018027	AAG	2	6	178900	178905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414090
5052	NC_018027	ACG	2	6	178940	178945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414090
5053	NC_018027	GGCT	2	8	178948	178955	0 %	25 %	50 %	25 %	392414090
5054	NC_018027	CGC	2	6	179013	179018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414090
5055	NC_018027	GC	3	6	179082	179087	0 %	0 %	50 %	50 %	392414090
5056	NC_018027	GAC	2	6	179101	179106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414090
5057	NC_018027	CGGC	2	8	179133	179140	0 %	0 %	50 %	50 %	392414090
5058	NC_018027	CCA	2	6	179147	179152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414090
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5060	NC_018027	CGA	2	6	179265	179270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414090
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5062	NC_018027	TGG	2	6	179281	179286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414090
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5064	NC_018027	GCG	2	6	179365	179370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414090
5065	NC_018027	GAC	2	6	179431	179436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414090
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5070	NC_018027	GCG	2	6	179595	179600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414090
5071	NC_018027	TGC	2	6	179615	179620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414090
5072	NC_018027	ACT	2	6	179645	179650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414090
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5075	NC_018027	GAC	2	6	179734	179739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414090
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5077	NC_018027	CGA	2	6	179901	179906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414090
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5079	NC_018027	GAG	2	6	179956	179961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414090
5080	NC_018027	TCG	2	6	179972	179977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414090
5081	NC_018027	CTCC	2	8	180059	180066	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5082	NC_018027	GCGT	2	8	180075	180082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_018027	CGT	2	6	180242	180247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414091
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5087	NC_018027	CG	3	6	180377	180382	0 %	0 %	50 %	50 %	392414091
5088	NC_018027	TAC	2	6	180396	180401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414091
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5090	NC_018027	CAT	2	6	180443	180448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414091
5091	NC_018027	CGA	2	6	180449	180454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414091
5092	NC_018027	CAG	2	6	180455	180460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414091
5093	NC_018027	TCG	2	6	180472	180477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414091
5094	NC_018027	GCCT	2	8	180532	180539	0 %	25 %	25 %	50 %	392414091
5095	NC_018027	CAT	2	6	180548	180553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414091
5096	NC_018027	CTG	2	6	180645	180650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414091
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5101	NC_018027	GCCCC	2	10	180784	180793	0 %	0 %	20 %	80 %	392414091
5102	NC_018027	CGG	2	6	180839	180844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414091
5103	NC_018027	ACG	2	6	180849	180854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414091
5104	NC_018027	GTG	2	6	180855	180860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414091
5105	NC_018027	GC	3	6	180974	180979	0 %	0 %	50 %	50 %	392414091
5106	NC_018027	ACG	2	6	180985	180990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414091
5107	NC_018027	CGC	2	6	181016	181021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414091
5108	NC_018027	AAG	2	6	181044	181049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414091
5109	NC_018027	GAT	2	6	181052	181057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414091
5110	NC_018027	TGG	2	6	181062	181067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414091
5111	NC_018027	TCG	2	6	181075	181080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414091
5112	NC_018027	TAC	2	6	181086	181091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414091
5113	NC_018027	CCT	2	6	181093	181098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414091
5114	NC_018027	ACCC	2	8	181143	181150	25 %	0 %	0 %	75 %	392414091
5115	NC_018027	TCGG	2	8	181155	181162	0 %	25 %	50 %	25 %	392414091
5116	NC_018027	CGA	2	6	181193	181198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414091
5117	NC_018027	GAAC	2	8	181205	181212	50 %	0 %	25 %	25 %	392414091
5118	NC_018027	CCGG	2	8	181215	181222	0 %	0 %	50 %	50 %	392414091
5119	NC_018027	CG	3	6	181297	181302	0 %	0 %	50 %	50 %	392414091
5120	NC_018027	CGA	2	6	181343	181348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414091
5121	NC_018027	GACC	2	8	181367	181374	25 %	0 %	25 %	50 %	392414091
5122	NC_018027	CAC	2	6	181380	181385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414091
5123	NC_018027	ATC	2	6	181389	181394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414091
5124	NC_018027	CGG	2	6	181397	181402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414091
5125	NC_018027	AGG	2	6	181420	181425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414091
5126	NC_018027	CACC	2	8	181442	181449	25 %	0 %	0 %	75 %	392414091
5127	NC_018027	CGC	2	6	181463	181468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414091
5128	NC_018027	GAC	2	6	181485	181490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414091
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5132	NC_018027	TTCG	2	8	181619	181626	0 %	50 %	25 %	25 %	392414091
5133	NC_018027	TGA	2	6	181675	181680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414091
5134	NC_018027	CGA	2	6	181777	181782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414092
5135	NC_018027	CG	3	6	181785	181790	0 %	0 %	50 %	50 %	392414092
5136	NC_018027	CGACG	2	10	181810	181819	20 %	0 %	40 %	40 %	392414092
5137	NC_018027	CG	3	6	181843	181848	0 %	0 %	50 %	50 %	392414092
5138	NC_018027	TGA	2	6	181873	181878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414092
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5143	NC_018027	CGGCC	2	10	181993	182002	0 %	0 %	40 %	60 %	392414092
5144	NC_018027	TGT	2	6	182026	182031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392414092
5145	NC_018027	GAC	3	9	182042	182050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414092
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5147	NC_018027	CG	3	6	182108	182113	0 %	0 %	50 %	50 %	392414092
5148	NC_018027	CTG	2	6	182117	182122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414092
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5150	NC_018027	CGT	2	6	182187	182192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414092
5151	NC_018027	GCG	3	9	182199	182207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414092
5152	NC_018027	CG	3	6	182299	182304	0 %	0 %	50 %	50 %	392414092
5153	NC_018027	GCTC	2	8	182422	182429	0 %	25 %	25 %	50 %	392414092
5154	NC_018027	CAG	2	6	182467	182472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414092
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5156	NC_018027	GC	3	6	182580	182585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5157	NC_018027	GCC	2	6	182595	182600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5158	NC_018027	GAC	2	6	182602	182607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5159	NC_018027	ATC	2	6	182618	182623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414093
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5173	NC_018027	GGT	3	9	183199	183207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5174	NC_018027	GCC	2	6	183250	183255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5175	NC_018027	G	6	6	183302	183307	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5176	NC_018027	CCG	2	6	183313	183318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5181	NC_018027	CCG	2	6	183466	183471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5182	NC_018027	GGCCG	2	10	183501	183510	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5183	NC_018027	CG	3	6	183546	183551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5184	NC_018027	ACC	2	6	183622	183627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5185	NC_018027	GGA	2	6	183643	183648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5202	NC_018027	CTT	2	6	184310	184315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5204	NC_018027	TGCG	2	8	184339	184346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5241	NC_018027	TTC	2	6	185909	185914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414095
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5488	NC_018027	GCG	3	9	194622	194630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414102
5489	NC_018027	GTC	2	6	194651	194656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414102
5490	NC_018027	CG	3	6	194661	194666	0 %	0 %	50 %	50 %	392414102
5491	NC_018027	GGC	2	6	194714	194719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414102
5492	NC_018027	GCC	2	6	194802	194807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414102
5493	NC_018027	CGG	2	6	194827	194832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414102
5494	NC_018027	TCGCG	2	10	194857	194866	0 %	20 %	40 %	40 %	392414102
5495	NC_018027	GGC	2	6	194867	194872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414102
5496	NC_018027	GCA	2	6	194878	194883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414102
5497	NC_018027	CGG	2	6	194890	194895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414102
5498	NC_018027	CCGAT	2	10	194920	194929	20 %	20 %	20 %	40 %	392414102
5499	NC_018027	CGA	2	6	194989	194994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414102
5500	NC_018027	ACG	2	6	194997	195002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414102

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