MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.01

Total Repeats: 11413

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018022	GTC	2	6	25	30	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018022	CGA	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018022	CAC	2	6	77	82	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_018022	GCA	2	6	101	106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018022	TAA	2	6	435	440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392405728
6	NC_018022	AGC	2	6	444	449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405728
7	NC_018022	TCG	3	9	543	551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405728
8	NC_018022	GTC	2	6	689	694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405728
9	NC_018022	GTT	3	9	915	923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018022	GGC	2	6	953	958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018022	GTG	2	6	1067	1072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018022	TTC	2	6	1073	1078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018022	ACG	2	6	1258	1263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018022	GCC	2	6	1348	1353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405729
15	NC_018022	TCG	2	6	1397	1402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405729
16	NC_018022	CGC	2	6	1422	1427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405729
17	NC_018022	CCA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018022	TCG	2	6	1531	1536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018022	ATC	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018022	CGC	2	6	1661	1666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405730
21	NC_018022	TGC	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405730
22	NC_018022	TCG	2	6	1841	1846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405730
23	NC_018022	CGG	2	6	1892	1897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405730
24	NC_018022	CGG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405730
25	NC_018022	CAG	2	6	2025	2030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405730
26	NC_018022	CGA	2	6	2165	2170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405730
27	NC_018022	GCC	2	6	2201	2206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405730
28	NC_018022	AAG	3	9	2251	2259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405730
29	NC_018022	CTC	2	6	2360	2365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405730
30	NC_018022	GAC	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405730
31	NC_018022	CGG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405730
32	NC_018022	GGC	2	6	2523	2528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405730
33	NC_018022	TCT	2	6	2538	2543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405730
34	NC_018022	TTG	2	6	2550	2555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405730
35	NC_018022	CAG	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405730
36	NC_018022	CGA	2	6	2789	2794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405731
37	NC_018022	GGC	2	6	2798	2803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405731
38	NC_018022	CAA	2	6	2820	2825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405731
39	NC_018022	CGT	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405731
40	NC_018022	CGA	2	6	2909	2914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405731
41	NC_018022	CCT	2	6	2978	2983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405731
42	NC_018022	GCG	2	6	2988	2993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405731
43	NC_018022	CAA	2	6	3025	3030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405731
44	NC_018022	CCG	2	6	3061	3066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_018022	CAA	2	6	3077	3082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018022	CGA	2	6	3129	3134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018022	CGA	2	6	3142	3147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018022	GCA	2	6	3285	3290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018022	CGC	2	6	3314	3319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018022	ACG	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405732
51	NC_018022	GGC	2	6	3636	3641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405732
52	NC_018022	CCG	2	6	3674	3679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405732
53	NC_018022	CCG	2	6	3998	4003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018022	CCG	2	6	4044	4049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405733
55	NC_018022	CGC	2	6	4068	4073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405733
56	NC_018022	CGC	2	6	4095	4100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405733
57	NC_018022	GCG	2	6	4207	4212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405733
58	NC_018022	GCT	2	6	4269	4274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405733
59	NC_018022	CCG	2	6	4490	4495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405734
60	NC_018022	CGT	2	6	4596	4601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405734
61	NC_018022	GTG	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405734
62	NC_018022	GGT	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405734
63	NC_018022	ATC	2	6	4857	4862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405734
64	NC_018022	CTT	2	6	4914	4919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405734
65	NC_018022	CCG	2	6	4950	4955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018022	TCT	2	6	5018	5023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018022	GCA	2	6	5067	5072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018022	TGC	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018022	GAA	2	6	5125	5130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018022	CGA	2	6	5367	5372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018022	AGG	2	6	5405	5410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018022	AGG	2	6	5439	5444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018022	GCT	2	6	5520	5525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018022	AGC	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018022	CAA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405735
76	NC_018022	TCA	2	6	5755	5760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405735
77	NC_018022	CAT	2	6	5804	5809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405735
78	NC_018022	TGC	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405735
79	NC_018022	GTT	2	6	5837	5842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405735
80	NC_018022	GCG	2	6	5889	5894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405735
81	NC_018022	TGA	2	6	6091	6096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405735
82	NC_018022	ACT	2	6	6130	6135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405735
83	NC_018022	CCG	2	6	6191	6196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405735
84	NC_018022	CCG	2	6	6233	6238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405735
85	NC_018022	CGC	2	6	6260	6265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405735
86	NC_018022	CGC	2	6	6275	6280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405735
87	NC_018022	GGT	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405735
88	NC_018022	CAT	2	6	6329	6334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405735
89	NC_018022	ATG	2	6	6651	6656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405735
90	NC_018022	ACT	2	6	6676	6681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405735
91	NC_018022	AAG	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405735
92	NC_018022	ACT	2	6	6764	6769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405735
93	NC_018022	GGC	2	6	6815	6820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405735
94	NC_018022	ACA	2	6	6824	6829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405735
95	NC_018022	GCG	2	6	6926	6931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018022	GAT	2	6	7025	7030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018022	ACG	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018022	CGC	2	6	7221	7226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018022	CAG	2	6	7294	7299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018022	GCT	2	6	7458	7463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018022	GCC	2	6	7582	7587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018022	GTC	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018022	CTG	2	6	7684	7689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018022	TGA	2	6	7691	7696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018022	GCC	3	9	7790	7798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018022	GGC	2	6	7959	7964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018022	TTC	2	6	8097	8102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018022	GTG	2	6	8124	8129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018022	GTC	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018022	CGT	2	6	8206	8211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018022	GGC	2	6	8216	8221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018022	AGG	2	6	8275	8280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405736
113	NC_018022	GGC	2	6	8285	8290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405736
114	NC_018022	CGC	3	9	8375	8383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405736
115	NC_018022	TGG	2	6	8684	8689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405736
116	NC_018022	TTC	2	6	8935	8940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405736
117	NC_018022	GCC	2	6	8942	8947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405736
118	NC_018022	GCC	2	6	9107	9112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405736
119	NC_018022	ACG	2	6	9317	9322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405736
120	NC_018022	TGG	2	6	9332	9337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405736
121	NC_018022	TGC	2	6	9498	9503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405736
122	NC_018022	CTG	2	6	9553	9558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405736
123	NC_018022	CGC	3	9	9576	9584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405736
124	NC_018022	CGC	2	6	9591	9596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405736
125	NC_018022	CGC	2	6	9612	9617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405736
126	NC_018022	CGC	2	6	9655	9660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405736
127	NC_018022	CAC	2	6	9719	9724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405736
128	NC_018022	ACG	2	6	9740	9745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405736
129	NC_018022	ACC	2	6	9771	9776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405736
130	NC_018022	GAC	3	9	9788	9796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405737
131	NC_018022	GCC	3	9	9804	9812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405737
132	NC_018022	AGC	2	6	9869	9874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405737
133	NC_018022	GCC	2	6	9939	9944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405737
134	NC_018022	CGA	2	6	9950	9955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405737
135	NC_018022	ACG	2	6	9988	9993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405737
136	NC_018022	CGC	2	6	10076	10081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405737
137	NC_018022	GCC	2	6	10186	10191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405737
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139	NC_018022	TCG	2	6	10231	10236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405737
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143	NC_018022	CCA	2	6	10399	10404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405737
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150	NC_018022	TCG	2	6	10640	10645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_018022	TTG	2	6	10660	10665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018022	CCG	2	6	10682	10687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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154	NC_018022	CGC	2	6	10818	10823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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156	NC_018022	GCC	2	6	10954	10959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_018022	TCC	2	6	11012	11017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_018022	TCA	2	6	11127	11132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_018022	TTG	3	9	11214	11222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018022	CGG	2	6	11234	11239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_018022	CCA	2	6	11251	11256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_018022	CTG	2	6	11271	11276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_018022	GGC	2	6	11440	11445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_018022	GCG	2	6	11449	11454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_018022	GCG	2	6	11580	11585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_018022	GCC	2	6	11605	11610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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169	NC_018022	GCC	3	9	11666	11674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_018022	GCG	3	9	11730	11738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_018022	CGC	2	6	11935	11940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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175	NC_018022	ACC	2	6	12048	12053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
176	NC_018022	GCC	3	9	12054	12062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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261	NC_018022	GCG	2	6	17123	17128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405745
262	NC_018022	GCA	3	9	17169	17177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405745
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264	NC_018022	CGG	2	6	17262	17267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405745
265	NC_018022	GCA	2	6	17274	17279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405745
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379	NC_018022	CAC	2	6	23412	23417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
380	NC_018022	CGA	2	6	23450	23455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
381	NC_018022	TGA	2	6	23493	23498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
382	NC_018022	CGG	2	6	23577	23582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_018022	GAT	2	6	23664	23669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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387	NC_018022	GTC	2	6	23903	23908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
388	NC_018022	TTG	2	6	23971	23976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_018022	CAC	2	6	29819	29824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405756
498	NC_018022	CGC	2	6	29863	29868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405756
499	NC_018022	AGC	2	6	30028	30033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_018022	TTC	2	6	30219	30224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405757

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