MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.01

Total Repeats: 15345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018022	CG	3	6	42725	42730	0 %	0 %	50 %	50 %	392405769
1002	NC_018022	ACG	2	6	42937	42942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405769
1003	NC_018022	GGC	2	6	42999	43004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405770
1004	NC_018022	GGT	2	6	43005	43010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405770
1005	NC_018022	GGGTG	2	10	43023	43032	0 %	20 %	80 %	0 %	392405770
1006	NC_018022	GC	3	6	43081	43086	0 %	0 %	50 %	50 %	392405770
1007	NC_018022	GCG	2	6	43135	43140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405770
1008	NC_018022	CG	3	6	43173	43178	0 %	0 %	50 %	50 %	392405770
1009	NC_018022	GTT	2	6	43246	43251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405770
1010	NC_018022	CGG	2	6	43271	43276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405770
1011	NC_018022	CAA	2	6	43293	43298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405770
1012	NC_018022	GTC	2	6	43308	43313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405770
1013	NC_018022	CGC	2	6	43422	43427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405770
1014	NC_018022	CGG	3	9	43588	43596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405770
1015	NC_018022	GCAC	2	8	43678	43685	25 %	0 %	25 %	50 %	392405770
1016	NC_018022	ATC	2	6	43690	43695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405770
1017	NC_018022	CAG	2	6	43698	43703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405770
1018	NC_018022	CGA	2	6	43786	43791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405770
1019	NC_018022	CGG	2	6	43799	43804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405770
1020	NC_018022	GGCC	2	8	43884	43891	0 %	0 %	50 %	50 %	392405770
1021	NC_018022	CAG	2	6	43923	43928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405770
1022	NC_018022	GC	3	6	43959	43964	0 %	0 %	50 %	50 %	392405770
1023	NC_018022	GAG	2	6	43984	43989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405770
1024	NC_018022	CGCGG	2	10	44038	44047	0 %	0 %	60 %	40 %	392405770
1025	NC_018022	GCT	2	6	44087	44092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405770
1026	NC_018022	CAC	2	6	44106	44111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405770
1027	NC_018022	GGC	2	6	44160	44165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405770
1028	NC_018022	CAGC	2	8	44186	44193	25 %	0 %	25 %	50 %	392405770
1029	NC_018022	AGC	2	6	44227	44232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405770
1030	NC_018022	CGT	2	6	44273	44278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405770
1031	NC_018022	TCG	2	6	44323	44328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405771
1032	NC_018022	CGAC	2	8	44351	44358	25 %	0 %	25 %	50 %	392405771
1033	NC_018022	AC	3	6	44357	44362	50 %	0 %	0 %	50 %	392405771
1034	NC_018022	GGT	2	6	44483	44488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405771
1035	NC_018022	GCGT	2	8	44570	44577	0 %	25 %	50 %	25 %	392405771
1036	NC_018022	CG	3	6	44642	44647	0 %	0 %	50 %	50 %	392405772
1037	NC_018022	CCT	2	6	44665	44670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405772
1038	NC_018022	AGG	2	6	44703	44708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405772
1039	NC_018022	TTC	2	6	44712	44717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405772
1040	NC_018022	AGC	2	6	44763	44768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405772
1041	NC_018022	TGAG	2	8	44883	44890	25 %	25 %	50 %	0 %	392405772
1042	NC_018022	CGA	2	6	44911	44916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405772
1043	NC_018022	GTC	2	6	45006	45011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_018022	CGC	3	9	45094	45102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_018022	GGC	2	6	45183	45188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_018022	CTT	2	6	45214	45219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_018022	CCA	2	6	45277	45282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_018022	CGG	2	6	45304	45309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_018022	GGT	2	6	45337	45342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018022	GCT	2	6	45364	45369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_018022	G	6	6	45461	45466	0 %	0 %	100 %	0 %	392405773
1052	NC_018022	GCG	2	6	45471	45476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405773
1053	NC_018022	TCG	2	6	45481	45486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405773
1054	NC_018022	TGG	2	6	45589	45594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405773
1055	NC_018022	CCGA	2	8	45610	45617	25 %	0 %	25 %	50 %	392405773
1056	NC_018022	GGC	2	6	45624	45629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405773
1057	NC_018022	TCG	2	6	45664	45669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405773
1058	NC_018022	ACCCC	2	10	45676	45685	20 %	0 %	0 %	80 %	392405773
1059	NC_018022	ACG	2	6	45745	45750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405773
1060	NC_018022	GTCG	2	8	45779	45786	0 %	25 %	50 %	25 %	392405773
1061	NC_018022	AAG	2	6	45793	45798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405773
1062	NC_018022	CGA	2	6	45829	45834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405773
1063	NC_018022	TCA	2	6	45835	45840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405773
1064	NC_018022	GTG	2	6	45855	45860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405773
1065	NC_018022	TCA	2	6	45892	45897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405773
1066	NC_018022	GCT	2	6	45947	45952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405773
1067	NC_018022	CTT	2	6	45977	45982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405773
1068	NC_018022	TGC	2	6	46078	46083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405773
1069	NC_018022	GGC	2	6	46084	46089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405773
1070	NC_018022	ACG	2	6	46109	46114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405773
1071	NC_018022	ATCG	2	8	46170	46177	25 %	25 %	25 %	25 %	392405773
1072	NC_018022	ACG	2	6	46180	46185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405773
1073	NC_018022	GCT	2	6	46196	46201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405773
1074	NC_018022	CCG	2	6	46214	46219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405773
1075	NC_018022	GCAG	2	8	46245	46252	25 %	0 %	50 %	25 %	392405773
1076	NC_018022	GGC	2	6	46272	46277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405773
1077	NC_018022	CAT	2	6	46292	46297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405773
1078	NC_018022	GCG	2	6	46360	46365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405773
1079	NC_018022	CGC	2	6	46377	46382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405773
1080	NC_018022	ACC	2	6	46439	46444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405773
1081	NC_018022	CCG	2	6	46471	46476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405773
1082	NC_018022	CG	3	6	46492	46497	0 %	0 %	50 %	50 %	392405773
1083	NC_018022	AAC	2	6	46498	46503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405773
1084	NC_018022	GCGA	2	8	46555	46562	25 %	0 %	50 %	25 %	392405773
1085	NC_018022	ATC	2	6	46605	46610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405773
1086	NC_018022	CGC	2	6	46616	46621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405773
1087	NC_018022	CGG	2	6	46625	46630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405773
1088	NC_018022	CGC	2	6	46631	46636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405773
1089	NC_018022	ACT	2	6	46642	46647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405773
1090	NC_018022	ACG	2	6	46662	46667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405773
1091	NC_018022	CGG	2	6	46679	46684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405773
1092	NC_018022	TGT	2	6	46733	46738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405773
1093	NC_018022	CGC	2	6	46748	46753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405773
1094	NC_018022	CTG	2	6	46761	46766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405773
1095	NC_018022	CGC	2	6	46783	46788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405773
1096	NC_018022	GAG	2	6	46828	46833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_018022	CTG	2	6	46915	46920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405774
1098	NC_018022	CAC	2	6	46993	46998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405774
1099	NC_018022	GCC	2	6	47048	47053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405774
1100	NC_018022	TGG	2	6	47059	47064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405774
1101	NC_018022	GTCGA	2	10	47086	47095	20 %	20 %	40 %	20 %	392405774
1102	NC_018022	CAC	2	6	47178	47183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405774
1103	NC_018022	CCG	2	6	47204	47209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405774
1104	NC_018022	TCG	2	6	47216	47221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405774
1105	NC_018022	GAT	2	6	47236	47241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405774
1106	NC_018022	GGT	2	6	47298	47303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405774
1107	NC_018022	CGC	2	6	47313	47318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405774
1108	NC_018022	CGC	2	6	47352	47357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405774
1109	NC_018022	CGG	2	6	47358	47363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405774
1110	NC_018022	TCG	2	6	47394	47399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405774
1111	NC_018022	CCG	2	6	47408	47413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405774
1112	NC_018022	CGCGC	2	10	47478	47487	0 %	0 %	40 %	60 %	392405774
1113	NC_018022	TCA	2	6	47546	47551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405774
1114	NC_018022	GCC	2	6	47576	47581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405774
1115	NC_018022	GCC	2	6	47609	47614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405774
1116	NC_018022	GCT	2	6	47701	47706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405774
1117	NC_018022	ACC	3	9	47804	47812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405775
1118	NC_018022	CCAG	2	8	47858	47865	25 %	0 %	25 %	50 %	392405775
1119	NC_018022	GCA	2	6	47878	47883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405775
1120	NC_018022	TCA	2	6	47935	47940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405775
1121	NC_018022	CCCT	2	8	47955	47962	0 %	25 %	0 %	75 %	392405775
1122	NC_018022	TTC	2	6	48060	48065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405775
1123	NC_018022	TCGC	2	8	48088	48095	0 %	25 %	25 %	50 %	392405775
1124	NC_018022	GGC	3	9	48096	48104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405775
1125	NC_018022	TGG	2	6	48118	48123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405775
1126	NC_018022	AGC	2	6	48170	48175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405775
1127	NC_018022	GCT	2	6	48203	48208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405775
1128	NC_018022	CGG	2	6	48247	48252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405775
1129	NC_018022	TGC	2	6	48292	48297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405775
1130	NC_018022	CGA	2	6	48302	48307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405775
1131	NC_018022	AC	3	6	48365	48370	50 %	0 %	0 %	50 %	392405775
1132	NC_018022	CGT	2	6	48396	48401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405775
1133	NC_018022	CAC	2	6	48502	48507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_018022	GATCG	2	10	48519	48528	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1135	NC_018022	GCA	2	6	48551	48556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_018022	TGA	2	6	48610	48615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405776
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1141	NC_018022	ATTGA	2	10	48717	48726	40 %	40 %	20 %	0 %	392405776
1142	NC_018022	CCTC	2	8	48741	48748	0 %	25 %	0 %	75 %	392405776
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1147	NC_018022	GAC	2	6	49089	49094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405776
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1149	NC_018022	GGC	2	6	49131	49136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405776
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1155	NC_018022	GC	3	6	49285	49290	0 %	0 %	50 %	50 %	392405776
1156	NC_018022	CGA	2	6	49304	49309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405776
1157	NC_018022	TCA	2	6	49364	49369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1158	NC_018022	AGT	2	6	49415	49420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1159	NC_018022	CGG	2	6	49441	49446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1160	NC_018022	GC	3	6	49454	49459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1161	NC_018022	CAC	2	6	49495	49500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1162	NC_018022	TTG	2	6	49550	49555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_018022	GAAC	2	8	49571	49578	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1164	NC_018022	CGG	2	6	49592	49597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1165	NC_018022	AC	3	6	49630	49635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1166	NC_018022	ACG	2	6	49648	49653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1167	NC_018022	TGG	4	12	49655	49666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1168	NC_018022	CCG	2	6	49701	49706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1169	NC_018022	TCG	2	6	49725	49730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1170	NC_018022	GT	3	6	49734	49739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1233	NC_018022	GAACA	2	10	52393	52402	60 %	0 %	20 %	20 %	392405779
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1239	NC_018022	GATCCG	2	12	52542	52553	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392405779
1240	NC_018022	AGC	2	6	52645	52650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405779
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1242	NC_018022	GCACC	2	10	52694	52703	20 %	0 %	20 %	60 %	392405779
1243	NC_018022	TCA	2	6	52716	52721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1244	NC_018022	GAT	2	6	52722	52727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_018022	ATGCA	2	10	52738	52747	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1246	NC_018022	CGG	2	6	52803	52808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1247	NC_018022	CAG	2	6	52869	52874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1248	NC_018022	GCA	2	6	52913	52918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1249	NC_018022	TCA	2	6	52929	52934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1250	NC_018022	CGG	2	6	52943	52948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1251	NC_018022	TTC	2	6	52951	52956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_018022	CAG	2	6	53006	53011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_018022	GCT	2	6	53096	53101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_018022	CGC	2	6	53123	53128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1255	NC_018022	CAG	2	6	53175	53180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_018022	GAT	2	6	53182	53187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_018022	GCA	2	6	53255	53260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1282	NC_018022	CGG	2	6	54316	54321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1359	NC_018022	CTTCA	2	10	57248	57257	20 %	40 %	0 %	40 %	392405783
1360	NC_018022	GGCG	2	8	57285	57292	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1361	NC_018022	GCG	2	6	57326	57331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1362	NC_018022	CGC	2	6	57381	57386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1363	NC_018022	TCAC	2	8	57392	57399	25 %	25 %	0 %	50 %	392405784
1364	NC_018022	CA	3	6	57497	57502	50 %	0 %	0 %	50 %	392405784
1365	NC_018022	GC	3	6	57509	57514	0 %	0 %	50 %	50 %	392405784
1366	NC_018022	GGC	2	6	57595	57600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405784
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1370	NC_018022	G	6	6	58119	58124	0 %	0 %	100 %	0 %	392405784
1371	NC_018022	CGT	2	6	58151	58156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405784
1372	NC_018022	GATCTC	2	12	58164	58175	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392405784
1373	NC_018022	GCA	2	6	58197	58202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405784
1374	NC_018022	CAG	2	6	58203	58208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405784
1375	NC_018022	CGTT	2	8	58225	58232	0 %	50 %	25 %	25 %	392405784
1376	NC_018022	GTC	2	6	58263	58268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405784
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1485	NC_018022	GCG	2	6	63345	63350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1490	NC_018022	CG	4	8	63549	63556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1491	NC_018022	AGC	2	6	63565	63570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1492	NC_018022	GAC	2	6	63671	63676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405790
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1495	NC_018022	CCGT	2	8	63799	63806	0 %	25 %	25 %	50 %	392405790
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1498	NC_018022	GGT	2	6	64008	64013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405790
1499	NC_018022	CGC	2	6	64028	64033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405790
1500	NC_018022	CGG	2	6	64061	64066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405790

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