MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.01

Total Repeats: 15345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018022	CCA	2	6	21701	21706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405749
502	NC_018022	AGC	2	6	21745	21750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405749
503	NC_018022	CGC	2	6	21759	21764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405749
504	NC_018022	TGG	2	6	21895	21900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405749
505	NC_018022	CGG	2	6	21925	21930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_018022	CTG	2	6	21948	21953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_018022	TGA	3	9	22034	22042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018022	GCCG	2	8	22161	22168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_018022	GTG	2	6	22196	22201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018022	TGT	2	6	22205	22210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018022	TCA	2	6	22216	22221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_018022	CAC	2	6	22241	22246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_018022	CGG	2	6	22293	22298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_018022	TG	3	6	22377	22382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_018022	GCCT	2	8	22429	22436	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
516	NC_018022	GCC	2	6	22544	22549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_018022	CT	3	6	22575	22580	0 %	50 %	0 %	50 %	392405750
518	NC_018022	ACC	2	6	22615	22620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405750
519	NC_018022	CTGGT	2	10	22650	22659	0 %	40 %	40 %	20 %	392405750
520	NC_018022	CGC	2	6	22694	22699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405750
521	NC_018022	ACC	2	6	22743	22748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405750
522	NC_018022	GAAG	2	8	22763	22770	50 %	0 %	50 %	0 %	392405750
523	NC_018022	TCC	2	6	22828	22833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405750
524	NC_018022	TCA	2	6	22849	22854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405750
525	NC_018022	ACCG	2	8	22855	22862	25 %	0 %	25 %	50 %	392405750
526	NC_018022	CAG	2	6	22880	22885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405750
527	NC_018022	GCA	2	6	22951	22956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405750
528	NC_018022	CA	3	6	22982	22987	50 %	0 %	0 %	50 %	392405750
529	NC_018022	CAC	2	6	23014	23019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405750
530	NC_018022	CGC	2	6	23068	23073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405750
531	NC_018022	CCG	2	6	23123	23128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405750
532	NC_018022	TCG	2	6	23246	23251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_018022	TAC	2	6	23263	23268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_018022	CCCT	2	8	23271	23278	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
535	NC_018022	CAC	2	6	23412	23417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_018022	CGA	2	6	23450	23455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_018022	TGA	2	6	23493	23498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018022	CGG	2	6	23577	23582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_018022	GAT	2	6	23664	23669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018022	TGCGG	2	10	23740	23749	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
541	NC_018022	ACT	2	6	23769	23774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_018022	GC	3	6	23797	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_018022	TCG	2	6	23852	23857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_018022	GCG	2	6	23883	23888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_018022	GTC	2	6	23903	23908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_018022	TTG	2	6	23971	23976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018022	CCAA	2	8	23981	23988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_018022	AGTG	2	8	24008	24015	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018022	CAG	2	6	24026	24031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_018022	ACCC	2	8	24050	24057	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
551	NC_018022	GTCGC	2	10	24142	24151	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
552	NC_018022	TG	3	6	24172	24177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018022	GC	3	6	24203	24208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_018022	CGC	2	6	24241	24246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_018022	GTT	2	6	24249	24254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018022	GGA	2	6	24310	24315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018022	GGC	2	6	24321	24326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405751
558	NC_018022	ACG	2	6	24334	24339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405751
559	NC_018022	CG	3	6	24381	24386	0 %	0 %	50 %	50 %	392405751
560	NC_018022	CGG	2	6	24393	24398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405751
561	NC_018022	GCC	3	9	24421	24429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405751
562	NC_018022	CTCG	2	8	24471	24478	0 %	25 %	25 %	50 %	392405751
563	NC_018022	ACCG	2	8	24510	24517	25 %	0 %	25 %	50 %	392405751
564	NC_018022	CTC	2	6	24527	24532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405751
565	NC_018022	GTTG	2	8	24591	24598	0 %	50 %	50 %	0 %	392405751
566	NC_018022	GCC	2	6	24610	24615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405751
567	NC_018022	TGG	2	6	24635	24640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405751
568	NC_018022	CG	3	6	24646	24651	0 %	0 %	50 %	50 %	392405751
569	NC_018022	GCCC	2	8	24664	24671	0 %	0 %	25 %	75 %	392405751
570	NC_018022	CGT	2	6	24708	24713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405751
571	NC_018022	CG	3	6	24733	24738	0 %	0 %	50 %	50 %	392405751
572	NC_018022	GCC	2	6	24739	24744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405751
573	NC_018022	CGA	2	6	24780	24785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405751
574	NC_018022	CGG	2	6	24801	24806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405751
575	NC_018022	CGATG	2	10	24813	24822	20 %	20 %	40 %	20 %	392405751
576	NC_018022	TC	3	6	24849	24854	0 %	50 %	0 %	50 %	392405751
577	NC_018022	TCGC	2	8	24878	24885	0 %	25 %	25 %	50 %	392405751
578	NC_018022	TCAG	2	8	24902	24909	25 %	25 %	25 %	25 %	392405751
579	NC_018022	CGG	2	6	24995	25000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405751
580	NC_018022	AGC	2	6	25029	25034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405751
581	NC_018022	GCCG	2	8	25067	25074	0 %	0 %	50 %	50 %	392405751
582	NC_018022	ACC	2	6	25109	25114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405751
583	NC_018022	AGCG	2	8	25211	25218	25 %	0 %	50 %	25 %	392405751
584	NC_018022	CAT	2	6	25236	25241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405751
585	NC_018022	CAG	2	6	25273	25278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405751
586	NC_018022	GCCG	2	8	25293	25300	0 %	0 %	50 %	50 %	392405751
587	NC_018022	CGC	2	6	25323	25328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405751
588	NC_018022	CTA	2	6	25356	25361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405751
589	NC_018022	AGCC	2	8	25376	25383	25 %	0 %	25 %	50 %	392405751
590	NC_018022	CGC	2	6	25394	25399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405751
591	NC_018022	CCA	2	6	25402	25407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405751
592	NC_018022	GCC	2	6	25408	25413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405751
593	NC_018022	GCG	2	6	25447	25452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405751
594	NC_018022	GTT	2	6	25464	25469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405751
595	NC_018022	CCT	2	6	25498	25503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405751
596	NC_018022	GTT	2	6	25521	25526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405751
597	NC_018022	GCC	2	6	25528	25533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405751
598	NC_018022	CGC	2	6	25551	25556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405751
599	NC_018022	CGGC	2	8	25571	25578	0 %	0 %	50 %	50 %	392405751
600	NC_018022	GGC	2	6	25605	25610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405751
601	NC_018022	ACCGC	2	10	25649	25658	20 %	0 %	20 %	60 %	392405751
602	NC_018022	ATC	2	6	25763	25768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405751
603	NC_018022	TGC	2	6	25790	25795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405751
604	NC_018022	GC	3	6	25800	25805	0 %	0 %	50 %	50 %	392405751
605	NC_018022	ACT	2	6	25808	25813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405751
606	NC_018022	CGC	2	6	25842	25847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405751
607	NC_018022	CAG	2	6	25896	25901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405751
608	NC_018022	CAG	2	6	25983	25988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_018022	CTG	2	6	26094	26099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_018022	CCGA	2	8	26169	26176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
611	NC_018022	GGC	2	6	26191	26196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_018022	CAC	2	6	26246	26251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405752
613	NC_018022	GGCA	2	8	26270	26277	25 %	0 %	50 %	25 %	392405752
614	NC_018022	GAC	2	6	26288	26293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405752
615	NC_018022	CGT	2	6	26297	26302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405752
616	NC_018022	TCG	2	6	26347	26352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405752
617	NC_018022	CGA	2	6	26432	26437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405752
618	NC_018022	CGA	5	15	26486	26500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405752
619	NC_018022	GCC	2	6	26580	26585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405752
620	NC_018022	GCTC	2	8	26618	26625	0 %	25 %	25 %	50 %	392405752
621	NC_018022	CCGGT	2	10	26629	26638	0 %	20 %	40 %	40 %	392405752
622	NC_018022	ACC	2	6	26724	26729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405752
623	NC_018022	GCT	2	6	26846	26851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405752
624	NC_018022	CGTGC	2	10	26858	26867	0 %	20 %	40 %	40 %	392405752
625	NC_018022	GTC	2	6	26868	26873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405752
626	NC_018022	GGA	2	6	26912	26917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405752
627	NC_018022	CGG	2	6	26958	26963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405752
628	NC_018022	TTG	2	6	26971	26976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405752
629	NC_018022	CCG	2	6	27092	27097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405752
630	NC_018022	CGC	2	6	27104	27109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405752
631	NC_018022	GC	3	6	27167	27172	0 %	0 %	50 %	50 %	392405753
632	NC_018022	GCG	2	6	27189	27194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405753
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634	NC_018022	CGGAC	2	10	27239	27248	20 %	0 %	40 %	40 %	392405753
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639	NC_018022	CG	3	6	27506	27511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_018022	GAC	2	6	27654	27659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_018022	CG	3	6	27721	27726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
642	NC_018022	GGC	2	6	27818	27823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405754
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751	NC_018022	GCGG	2	8	32127	32134	0 %	0 %	75 %	25 %	392405758
752	NC_018022	GCA	2	6	32161	32166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405758
753	NC_018022	CAG	2	6	32196	32201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405758
754	NC_018022	GGCA	2	8	32248	32255	25 %	0 %	50 %	25 %	392405758
755	NC_018022	GC	3	6	32265	32270	0 %	0 %	50 %	50 %	392405758
756	NC_018022	GC	3	6	32340	32345	0 %	0 %	50 %	50 %	392405758
757	NC_018022	GCGCC	2	10	32372	32381	0 %	0 %	40 %	60 %	392405758
758	NC_018022	GCTG	3	12	32386	32397	0 %	25 %	50 %	25 %	392405758
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760	NC_018022	GCG	2	6	32469	32474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405759
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879	NC_018022	TCG	2	6	37267	37272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
880	NC_018022	CAC	2	6	37294	37299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
881	NC_018022	TCCAG	2	10	37336	37345	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
882	NC_018022	CAC	2	6	37467	37472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
883	NC_018022	C	6	6	37474	37479	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
884	NC_018022	GTC	2	6	37503	37508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
885	NC_018022	TCA	2	6	37526	37531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405763
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887	NC_018022	CG	4	8	37582	37589	0 %	0 %	50 %	50 %	392405763
888	NC_018022	CCCGG	2	10	37673	37682	0 %	0 %	40 %	60 %	392405763
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