MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium sp. MOTT36Y chromosome

Total Repeats: 4852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017904	ACCAC	2	10	1440	1449	40 %	0 %	0 %	60 %	387873411
2	NC_017904	GGCCG	2	10	3039	3048	0 %	0 %	60 %	40 %	387873412
3	NC_017904	CCGGG	2	10	3220	3229	0 %	0 %	60 %	40 %	387873412
4	NC_017904	GCGGG	2	10	3558	3567	0 %	0 %	80 %	20 %	387873413
5	NC_017904	TCGCC	2	10	3857	3866	0 %	20 %	20 %	60 %	387873413
6	NC_017904	GCACC	2	10	6015	6024	20 %	0 %	20 %	60 %	387873415
7	NC_017904	GAAGT	2	10	6409	6418	40 %	20 %	40 %	0 %	387873415
8	NC_017904	GCAGC	2	10	6993	7002	20 %	0 %	40 %	40 %	387873415
9	NC_017904	GCAGC	2	10	7428	7437	20 %	0 %	40 %	40 %	387873416
10	NC_017904	GGGCA	2	10	7690	7699	20 %	0 %	60 %	20 %	387873416
11	NC_017904	CGGGC	2	10	8608	8617	0 %	0 %	60 %	40 %	387873416
12	NC_017904	CGCGG	2	10	9913	9922	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017904	CGAGG	2	10	10250	10259	20 %	0 %	60 %	20 %	387873417
14	NC_017904	CCGCA	2	10	10410	10419	20 %	0 %	20 %	60 %	387873417
15	NC_017904	CGCTC	2	10	12287	12296	0 %	20 %	20 %	60 %	387873419
16	NC_017904	CCGCG	2	10	13076	13085	0 %	0 %	40 %	60 %	387873419
17	NC_017904	TCCCG	2	10	16926	16935	0 %	20 %	20 %	60 %	387873426
18	NC_017904	CCAGC	2	10	17032	17041	20 %	0 %	20 %	60 %	387873426
19	NC_017904	TCACC	2	10	17178	17187	20 %	20 %	0 %	60 %	387873426
20	NC_017904	GTTGC	2	10	17248	17257	0 %	40 %	40 %	20 %	387873426
21	NC_017904	GCCGG	2	10	19055	19064	0 %	0 %	60 %	40 %	387873427
22	NC_017904	GGCCC	2	10	19173	19182	0 %	0 %	40 %	60 %	387873427
23	NC_017904	GGCGG	2	10	19202	19211	0 %	0 %	80 %	20 %	387873427
24	NC_017904	CGGCG	2	10	20090	20099	0 %	0 %	60 %	40 %	387873428
25	NC_017904	TTAGC	2	10	20323	20332	20 %	40 %	20 %	20 %	387873428
26	NC_017904	CGGCG	2	10	20780	20789	0 %	0 %	60 %	40 %	387873428
27	NC_017904	GGGGC	2	10	22261	22270	0 %	0 %	80 %	20 %	387873429
28	NC_017904	AGACC	2	10	22467	22476	40 %	0 %	20 %	40 %	387873429
29	NC_017904	GCTGA	2	10	22609	22618	20 %	20 %	40 %	20 %	387873429
30	NC_017904	TGGGG	2	10	22957	22966	0 %	20 %	80 %	0 %	387873430
31	NC_017904	CCAAT	2	10	24101	24110	40 %	20 %	0 %	40 %	387873430
32	NC_017904	CTGCG	2	10	24180	24189	0 %	20 %	40 %	40 %	387873430
33	NC_017904	AGGGC	2	10	26880	26889	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017904	AAGAC	2	10	27158	27167	60 %	0 %	20 %	20 %	387873433
35	NC_017904	ATCGC	2	10	27191	27200	20 %	20 %	20 %	40 %	387873433
36	NC_017904	GCGAT	2	10	29040	29049	20 %	20 %	40 %	20 %	387873437
37	NC_017904	TCGGC	2	10	31088	31097	0 %	20 %	40 %	40 %	387873438
38	NC_017904	AGGCG	2	10	32269	32278	20 %	0 %	60 %	20 %	387873439
39	NC_017904	CAGAA	2	10	32742	32751	60 %	0 %	20 %	20 %	387873439
40	NC_017904	AAGAT	2	10	33189	33198	60 %	20 %	20 %	0 %	387873439
41	NC_017904	CGTGG	2	10	33622	33631	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017904	CTTTC	2	10	34244	34253	0 %	60 %	0 %	40 %	387873441
43	NC_017904	CCAAA	2	10	37136	37145	60 %	0 %	0 %	40 %	387873443
44	NC_017904	GCGCC	2	10	38213	38222	0 %	0 %	40 %	60 %	387873445
45	NC_017904	CAGCG	2	10	39095	39104	20 %	0 %	40 %	40 %	387873446
46	NC_017904	GAACC	2	10	40063	40072	40 %	0 %	20 %	40 %	387873447
47	NC_017904	CCGGG	2	10	42643	42652	0 %	0 %	60 %	40 %	387873450
48	NC_017904	CGACA	2	10	43199	43208	40 %	0 %	20 %	40 %	387873450
49	NC_017904	GTCGG	2	10	44786	44795	0 %	20 %	60 %	20 %	387873452
50	NC_017904	TTGTC	2	10	46973	46982	0 %	60 %	20 %	20 %	387873454
51	NC_017904	GCCGG	2	10	47634	47643	0 %	0 %	60 %	40 %	387873456
52	NC_017904	GGGTG	2	10	51850	51859	0 %	20 %	80 %	0 %	387873458
53	NC_017904	CGGTG	2	10	53547	53556	0 %	20 %	60 %	20 %	387873460
54	NC_017904	TCGCC	2	10	55747	55756	0 %	20 %	20 %	60 %	387873462
55	NC_017904	GCGAC	2	10	57970	57979	20 %	0 %	40 %	40 %	387873464
56	NC_017904	CGGCG	2	10	57989	57998	0 %	0 %	60 %	40 %	387873464
57	NC_017904	TCGGC	2	10	59724	59733	0 %	20 %	40 %	40 %	387873466
58	NC_017904	CGGTG	2	10	60513	60522	0 %	20 %	60 %	20 %	387873467
59	NC_017904	GCGCG	2	10	60935	60944	0 %	0 %	60 %	40 %	387873467
60	NC_017904	CAGCG	2	10	60954	60963	20 %	0 %	40 %	40 %	387873467
61	NC_017904	ACGCC	2	10	66253	66262	20 %	0 %	20 %	60 %	387873472
62	NC_017904	ATCGT	2	10	67406	67415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017904	CGGCG	2	10	68853	68862	0 %	0 %	60 %	40 %	387873475
64	NC_017904	CGGGC	2	10	69350	69359	0 %	0 %	60 %	40 %	387873476
65	NC_017904	GCGCC	2	10	69422	69431	0 %	0 %	40 %	60 %	387873476
66	NC_017904	GCGCG	2	10	69926	69935	0 %	0 %	60 %	40 %	387873476
67	NC_017904	CTGGC	2	10	72134	72143	0 %	20 %	40 %	40 %	387873477
68	NC_017904	ACGCG	2	10	72518	72527	20 %	0 %	40 %	40 %	387873477
69	NC_017904	CATGA	2	10	73170	73179	40 %	20 %	20 %	20 %	387873477
70	NC_017904	GCGTC	2	10	75066	75075	0 %	20 %	40 %	40 %	387873481
71	NC_017904	GACGG	2	10	77048	77057	20 %	0 %	60 %	20 %	387873483
72	NC_017904	TGCCG	2	10	80632	80641	0 %	20 %	40 %	40 %	387873485
73	NC_017904	CGGCG	2	10	83645	83654	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017904	TCATA	2	10	84154	84163	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017904	GGGCC	2	10	86886	86895	0 %	0 %	60 %	40 %	387873491
76	NC_017904	TGCGC	2	10	90692	90701	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017904	GCAGC	2	10	92416	92425	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017904	GCTGC	2	10	93342	93351	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017904	TCTGC	2	10	94675	94684	0 %	40 %	20 %	40 %	387873501
80	NC_017904	CGACG	2	10	94960	94969	20 %	0 %	40 %	40 %	387873501
81	NC_017904	CGGCA	2	10	95380	95389	20 %	0 %	40 %	40 %	387873501
82	NC_017904	GCATG	2	10	95673	95682	20 %	20 %	40 %	20 %	387873502
83	NC_017904	CGCAA	2	10	96773	96782	40 %	0 %	20 %	40 %	387873504
84	NC_017904	ACGGC	2	10	96968	96977	20 %	0 %	40 %	40 %	387873504
85	NC_017904	GCGAC	2	10	98225	98234	20 %	0 %	40 %	40 %	387873505
86	NC_017904	CGCGA	2	10	99412	99421	20 %	0 %	40 %	40 %	387873506
87	NC_017904	GCGTC	2	10	102724	102733	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017904	CTCGC	2	10	103042	103051	0 %	20 %	20 %	60 %	387873511
89	NC_017904	CCGTG	2	10	103921	103930	0 %	20 %	40 %	40 %	387873512
90	NC_017904	CATGC	2	10	104573	104582	20 %	20 %	20 %	40 %	387873512
91	NC_017904	CGGTC	2	10	108241	108250	0 %	20 %	40 %	40 %	387873515
92	NC_017904	CGGCC	2	10	110159	110168	0 %	0 %	40 %	60 %	387873517
93	NC_017904	GGCCT	2	10	110804	110813	0 %	20 %	40 %	40 %	387873518
94	NC_017904	GCTGG	2	10	112169	112178	0 %	20 %	60 %	20 %	387873519
95	NC_017904	GCACG	2	10	112391	112400	20 %	0 %	40 %	40 %	387873519
96	NC_017904	CCGCG	2	10	113120	113129	0 %	0 %	40 %	60 %	387873520
97	NC_017904	CGACG	2	10	113750	113759	20 %	0 %	40 %	40 %	387873521
98	NC_017904	GCGTG	2	10	116157	116166	0 %	20 %	60 %	20 %	387873525
99	NC_017904	GCCAG	2	10	116511	116520	20 %	0 %	40 %	40 %	387873525
100	NC_017904	ATCCT	2	10	117159	117168	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017904	GGGCC	2	10	117981	117990	0 %	0 %	60 %	40 %	387873528
102	NC_017904	CGGGC	2	10	118142	118151	0 %	0 %	60 %	40 %	387873529
103	NC_017904	CCTGG	2	10	118298	118307	0 %	20 %	40 %	40 %	387873529
104	NC_017904	CCATG	2	10	118421	118430	20 %	20 %	20 %	40 %	387873529
105	NC_017904	CGGGC	2	10	119833	119842	0 %	0 %	60 %	40 %	387873530
106	NC_017904	GCCAG	2	10	121032	121041	20 %	0 %	40 %	40 %	387873531
107	NC_017904	ACCAA	2	10	121863	121872	60 %	0 %	0 %	40 %	387873532
108	NC_017904	GCCCG	2	10	121962	121971	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_017904	AGGTC	2	10	123749	123758	20 %	20 %	40 %	20 %	387873534
110	NC_017904	GTCGA	2	10	124426	124435	20 %	20 %	40 %	20 %	387873534
111	NC_017904	GCATC	2	10	125225	125234	20 %	20 %	20 %	40 %	387873535
112	NC_017904	GGACA	2	10	127787	127796	40 %	0 %	40 %	20 %	387873538
113	NC_017904	GCCGG	2	10	128444	128453	0 %	0 %	60 %	40 %	387873538
114	NC_017904	CGGCC	2	10	129142	129151	0 %	0 %	40 %	60 %	387873538
115	NC_017904	ACAGC	2	10	130399	130408	40 %	0 %	20 %	40 %	387873540
116	NC_017904	AACCC	2	10	130735	130744	40 %	0 %	0 %	60 %	387873540
117	NC_017904	TCGAT	2	10	135889	135898	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017904	CGCGG	2	10	137390	137399	0 %	0 %	60 %	40 %	387873546
119	NC_017904	CCATC	2	10	137692	137701	20 %	20 %	0 %	60 %	387873547
120	NC_017904	CTCGA	2	10	138331	138340	20 %	20 %	20 %	40 %	387873549
121	NC_017904	CAGGG	2	10	138619	138628	20 %	0 %	60 %	20 %	387873549
122	NC_017904	ACCCG	2	10	139525	139534	20 %	0 %	20 %	60 %	387873550
123	NC_017904	TCACC	2	10	140059	140068	20 %	20 %	0 %	60 %	387873551
124	NC_017904	GGATT	2	10	141043	141052	20 %	40 %	40 %	0 %	387873552
125	NC_017904	CCGCG	2	10	145843	145852	0 %	0 %	40 %	60 %	387873558
126	NC_017904	GCCGC	2	10	146396	146405	0 %	0 %	40 %	60 %	387873558
127	NC_017904	CCGGC	2	10	147556	147565	0 %	0 %	40 %	60 %	387873559
128	NC_017904	TCGCG	2	10	147848	147857	0 %	20 %	40 %	40 %	387873560
129	NC_017904	GTCCC	2	10	148700	148709	0 %	20 %	20 %	60 %	387873560
130	NC_017904	TCGGC	2	10	148781	148790	0 %	20 %	40 %	40 %	387873560
131	NC_017904	GCCGC	2	10	150226	150235	0 %	0 %	40 %	60 %	387873562
132	NC_017904	CCGCG	2	10	150762	150771	0 %	0 %	40 %	60 %	387873562
133	NC_017904	CACTA	2	10	151520	151529	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017904	CCTCG	2	10	151825	151834	0 %	20 %	20 %	60 %	387873563
135	NC_017904	GGGGC	2	10	153953	153962	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017904	CCGCC	2	10	156755	156764	0 %	0 %	20 %	80 %	387873569
137	NC_017904	GGCCG	2	10	157936	157945	0 %	0 %	60 %	40 %	387873570
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139	NC_017904	CGGCA	2	10	159565	159574	20 %	0 %	40 %	40 %	387873571
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141	NC_017904	CGGCT	2	10	159814	159823	0 %	20 %	40 %	40 %	387873571
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186	NC_017904	AGCGA	2	10	208805	208814	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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