MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM7 plasmid unnamed

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017858	TC	3	6	1362	1367	0 %	50 %	0 %	50 %	387128927
2	NC_017858	CT	3	6	1470	1475	0 %	50 %	0 %	50 %	387128928
3	NC_017858	TA	3	6	1902	1907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017858	TA	3	6	3396	3401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017858	CT	3	6	4079	4084	0 %	50 %	0 %	50 %	387128930
6	NC_017858	TG	3	6	4194	4199	0 %	50 %	50 %	0 %	387128930
7	NC_017858	GT	3	6	4796	4801	0 %	50 %	50 %	0 %	387128930
8	NC_017858	AT	3	6	5120	5125	50 %	50 %	0 %	0 %	387128930
9	NC_017858	AG	3	6	5632	5637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017858	CA	3	6	6008	6013	50 %	0 %	0 %	50 %	387128932
11	NC_017858	CA	3	6	6878	6883	50 %	0 %	0 %	50 %	387128933
12	NC_017858	TG	3	6	7865	7870	0 %	50 %	50 %	0 %	387128935
13	NC_017858	AC	3	6	9509	9514	50 %	0 %	0 %	50 %	387128936
14	NC_017858	TC	3	6	9825	9830	0 %	50 %	0 %	50 %	387128936
15	NC_017858	GC	3	6	11205	11210	0 %	0 %	50 %	50 %	387128937
16	NC_017858	CT	3	6	11390	11395	0 %	50 %	0 %	50 %	387128938
17	NC_017858	TG	3	6	11593	11598	0 %	50 %	50 %	0 %	387128938
18	NC_017858	CT	3	6	15548	15553	0 %	50 %	0 %	50 %	387128943
19	NC_017858	TC	3	6	16551	16556	0 %	50 %	0 %	50 %	387128944
20	NC_017858	GA	3	6	17846	17851	50 %	0 %	50 %	0 %	387128944
21	NC_017858	CA	3	6	18332	18337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017858	TA	3	6	18355	18360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017858	GC	3	6	18832	18837	0 %	0 %	50 %	50 %	387128946
24	NC_017858	GT	3	6	20471	20476	0 %	50 %	50 %	0 %	387128947
25	NC_017858	TG	3	6	20729	20734	0 %	50 %	50 %	0 %	387128947
26	NC_017858	CT	3	6	21328	21333	0 %	50 %	0 %	50 %	387128949
27	NC_017858	AC	3	6	23594	23599	50 %	0 %	0 %	50 %	387128955
28	NC_017858	CA	3	6	24225	24230	50 %	0 %	0 %	50 %	387128955
29	NC_017858	CT	3	6	24778	24783	0 %	50 %	0 %	50 %	387128957
30	NC_017858	CG	3	6	25635	25640	0 %	0 %	50 %	50 %	387128957
31	NC_017858	CT	3	6	26014	26019	0 %	50 %	0 %	50 %	387128957
32	NC_017858	GT	3	6	26094	26099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017858	AC	3	6	26610	26615	50 %	0 %	0 %	50 %	387128959
34	NC_017858	TC	3	6	26829	26834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017858	CA	3	6	27018	27023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017858	TA	3	6	27413	27418	50 %	50 %	0 %	0 %	387128960
37	NC_017858	CT	3	6	28158	28163	0 %	50 %	0 %	50 %	387128961
38	NC_017858	CT	3	6	28509	28514	0 %	50 %	0 %	50 %	387128962
39	NC_017858	GC	3	6	30017	30022	0 %	0 %	50 %	50 %	387128962
40	NC_017858	TC	3	6	30046	30051	0 %	50 %	0 %	50 %	387128962
41	NC_017858	CT	4	8	31201	31208	0 %	50 %	0 %	50 %	387128962
42	NC_017858	GT	3	6	34129	34134	0 %	50 %	50 %	0 %	387128965
43	NC_017858	CT	3	6	34328	34333	0 %	50 %	0 %	50 %	387128965
44	NC_017858	CA	3	6	38297	38302	50 %	0 %	0 %	50 %	387128967
45	NC_017858	CT	3	6	39146	39151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017858	AC	3	6	40239	40244	50 %	0 %	0 %	50 %	387128970
47	NC_017858	TG	3	6	41846	41851	0 %	50 %	50 %	0 %	387128972
48	NC_017858	CG	3	6	43051	43056	0 %	0 %	50 %	50 %	387128974
49	NC_017858	GC	3	6	45380	45385	0 %	0 %	50 %	50 %	387128976
50	NC_017858	CT	3	6	46269	46274	0 %	50 %	0 %	50 %	387128978
51	NC_017858	AG	3	6	46975	46980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017858	AT	3	6	47328	47333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.