MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM7 plasmid unnamed

Total Repeats: 669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017858	CTT	2	6	63	68	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128926
2	NC_017858	TTC	2	6	133	138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128926
3	NC_017858	GCG	2	6	148	153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128926
4	NC_017858	AGC	2	6	193	198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128926
5	NC_017858	GCA	2	6	225	230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128926
6	NC_017858	CAG	2	6	270	275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128926
7	NC_017858	CGC	2	6	399	404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128927
8	NC_017858	TCG	3	9	435	443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128927
9	NC_017858	TAA	2	6	532	537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128927
10	NC_017858	GCC	2	6	603	608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128927
11	NC_017858	CCT	2	6	628	633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387128927
12	NC_017858	CAA	2	6	709	714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128927
13	NC_017858	GCA	2	6	730	735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128927
14	NC_017858	GGC	2	6	795	800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128927
15	NC_017858	GCG	2	6	816	821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128927
16	NC_017858	GCC	2	6	909	914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128927
17	NC_017858	ACA	3	9	1071	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128927
18	NC_017858	GCC	2	6	1190	1195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128927
19	NC_017858	TCG	2	6	1323	1328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128927
20	NC_017858	GGC	2	6	1337	1342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128927
21	NC_017858	CAT	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128927
22	NC_017858	CGG	2	6	1511	1516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128928
23	NC_017858	CGG	2	6	1529	1534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128928
24	NC_017858	AAC	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128928
25	NC_017858	CGC	2	6	1572	1577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128928
26	NC_017858	GTA	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128928
27	NC_017858	CCG	2	6	1660	1665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128928
28	NC_017858	CGC	2	6	1745	1750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128928
29	NC_017858	GCA	2	6	1774	1779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128928
30	NC_017858	GCG	2	6	1794	1799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128928
31	NC_017858	TTC	2	6	2003	2008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128929
32	NC_017858	TTC	2	6	2089	2094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128929
33	NC_017858	CAG	2	6	2100	2105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128929
34	NC_017858	CAA	2	6	2133	2138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128929
35	NC_017858	CGC	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017858	TCC	2	6	2497	2502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017858	CAG	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017858	CGC	2	6	2606	2611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017858	GTT	2	6	2677	2682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017858	TAA	2	6	2714	2719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017858	TAA	2	6	2798	2803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017858	TAA	2	6	2818	2823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017858	CGC	2	6	2843	2848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017858	CAA	2	6	2880	2885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017858	ACC	3	9	2894	2902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017858	GAA	2	6	2983	2988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017858	GCG	2	6	3000	3005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017858	GCC	2	6	3051	3056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017858	GGA	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017858	AAG	2	6	3411	3416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017858	CAG	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017858	CAG	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017858	CTT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128930
54	NC_017858	AGT	2	6	4206	4211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128930
55	NC_017858	GCG	2	6	4219	4224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128930
56	NC_017858	TAG	2	6	4271	4276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128930
57	NC_017858	TCA	2	6	4304	4309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128930
58	NC_017858	GAC	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128930
59	NC_017858	GTA	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128930
60	NC_017858	ACC	2	6	4479	4484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128930
61	NC_017858	TCT	2	6	4583	4588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128930
62	NC_017858	GCC	2	6	4811	4816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128930
63	NC_017858	CTT	2	6	4876	4881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128930
64	NC_017858	CGT	2	6	4917	4922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128930
65	NC_017858	GTG	2	6	4931	4936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128930
66	NC_017858	ACC	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128930
67	NC_017858	TTG	2	6	5128	5133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128930
68	NC_017858	GTC	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128930
69	NC_017858	CCT	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017858	GCA	2	6	5354	5359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128931
71	NC_017858	ACT	2	6	5467	5472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128931
72	NC_017858	GCC	2	6	5473	5478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128931
73	NC_017858	TGT	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128931
74	NC_017858	TGC	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128932
75	NC_017858	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128932
76	NC_017858	AAC	2	6	5756	5761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128932
77	NC_017858	CGC	2	6	5818	5823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128932
78	NC_017858	CAG	2	6	5905	5910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128932
79	NC_017858	AAG	2	6	5961	5966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128932
80	NC_017858	GAA	2	6	5973	5978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128932
81	NC_017858	ATC	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017858	CCT	2	6	6587	6592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387128933
83	NC_017858	CCG	2	6	6678	6683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128933
84	NC_017858	GCA	2	6	6713	6718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128933
85	NC_017858	CGG	2	6	6739	6744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128933
86	NC_017858	TCA	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128933
87	NC_017858	CTG	2	6	6908	6913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128933
88	NC_017858	AAC	2	6	6916	6921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128933
89	NC_017858	GCG	2	6	7014	7019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128933
90	NC_017858	CAA	2	6	7036	7041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128933
91	NC_017858	GGT	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128933
92	NC_017858	GTT	2	6	7139	7144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128933
93	NC_017858	GCC	2	6	7167	7172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128933
94	NC_017858	GGC	2	6	7381	7386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128934
95	NC_017858	CAT	2	6	7458	7463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128934
96	NC_017858	GTC	2	6	7471	7476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128934
97	NC_017858	GGC	2	6	7480	7485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128934
98	NC_017858	CTT	2	6	7515	7520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128934
99	NC_017858	CTG	2	6	7555	7560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128934
100	NC_017858	ATG	2	6	7576	7581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128934
101	NC_017858	CTT	2	6	7587	7592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128934
102	NC_017858	GTG	2	6	7598	7603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128934
103	NC_017858	GCG	2	6	7646	7651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128934
104	NC_017858	CTG	2	6	7782	7787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128935
105	NC_017858	CCG	2	6	7922	7927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128935
106	NC_017858	GCA	2	6	7951	7956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128935
107	NC_017858	ACA	2	6	7974	7979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128935
108	NC_017858	ATG	2	6	8000	8005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128935
109	NC_017858	TGT	2	6	8155	8160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128936
110	NC_017858	TGA	2	6	8161	8166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128936
111	NC_017858	CGT	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128936
112	NC_017858	GAC	2	6	8222	8227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128936
113	NC_017858	CAG	2	6	8233	8238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128936
114	NC_017858	CGA	2	6	8242	8247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128936
115	NC_017858	CTG	2	6	8483	8488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128936
116	NC_017858	ACT	2	6	8612	8617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128936
117	NC_017858	AGA	2	6	8646	8651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128936
118	NC_017858	GCA	2	6	8667	8672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128936
119	NC_017858	CAA	2	6	8746	8751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128936
120	NC_017858	AAG	2	6	8978	8983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128936
121	NC_017858	GTC	3	9	9134	9142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128936
122	NC_017858	GCC	2	6	9294	9299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128936
123	NC_017858	CTG	2	6	9329	9334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128936
124	NC_017858	CCG	2	6	9360	9365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128936
125	NC_017858	CCG	2	6	9538	9543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128936
126	NC_017858	CGG	2	6	9610	9615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128936
127	NC_017858	CCT	2	6	9898	9903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387128936
128	NC_017858	CAC	2	6	9940	9945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128936
129	NC_017858	TGA	2	6	9963	9968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128936
130	NC_017858	CTG	2	6	9998	10003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128936
131	NC_017858	CCG	2	6	10012	10017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128936
132	NC_017858	TCA	2	6	10050	10055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128936
133	NC_017858	TGC	2	6	10125	10130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128936
134	NC_017858	CGA	2	6	10255	10260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128936
135	NC_017858	TAC	3	9	10343	10351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128936
136	NC_017858	CGC	2	6	10367	10372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128936
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139	NC_017858	CGC	2	6	10681	10686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128937
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252	NC_017858	GCA	2	6	18328	18333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_017858	TCT	2	6	18367	18372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128945
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