MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB423 chromosome

Total Repeats: 11370

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017528	CGAC	2	8	312	319	25 %	0 %	25 %	50 %	386003091
2	NC_017528	CGTT	2	8	528	535	0 %	50 %	25 %	25 %	386003091
3	NC_017528	CCCG	2	8	590	597	0 %	0 %	25 %	75 %	386003091
4	NC_017528	GGCA	2	8	661	668	25 %	0 %	50 %	25 %	386003091
5	NC_017528	CCCA	2	8	919	926	25 %	0 %	0 %	75 %	386003091
6	NC_017528	CCGA	2	8	1726	1733	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017528	GTGG	2	8	2133	2140	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017528	GCCA	2	8	2151	2158	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017528	TCAG	2	8	2495	2502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017528	ACGG	2	8	3074	3081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017528	GCCT	2	8	3136	3143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017528	CGTC	2	8	3288	3295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017528	GGTA	2	8	3468	3475	25 %	25 %	50 %	0 %	386003092
14	NC_017528	GGTT	2	8	3650	3657	0 %	50 %	50 %	0 %	386003092
15	NC_017528	CCGC	2	8	3878	3885	0 %	0 %	25 %	75 %	386003092
16	NC_017528	CCAC	2	8	5503	5510	25 %	0 %	0 %	75 %	386003095
17	NC_017528	ACCG	2	8	5522	5529	25 %	0 %	25 %	50 %	386003095
18	NC_017528	CAAG	2	8	5717	5724	50 %	0 %	25 %	25 %	386003095
19	NC_017528	CGCC	2	8	5813	5820	0 %	0 %	25 %	75 %	386003095
20	NC_017528	CGGC	2	8	6628	6635	0 %	0 %	50 %	50 %	386003095
21	NC_017528	GACA	2	8	7308	7315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017528	CGGT	2	8	7528	7535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017528	CGAG	2	8	8460	8467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017528	CCAC	2	8	8991	8998	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_017528	CGAC	2	8	9360	9367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017528	GGTT	2	8	9588	9595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017528	CCCG	2	8	10137	10144	0 %	0 %	25 %	75 %	386003096
28	NC_017528	GCAC	2	8	11613	11620	25 %	0 %	25 %	50 %	386003098
29	NC_017528	GAGC	2	8	12097	12104	25 %	0 %	50 %	25 %	386003099
30	NC_017528	CTCA	2	8	12308	12315	25 %	25 %	0 %	50 %	386003099
31	NC_017528	GCCC	2	8	12458	12465	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_017528	AACC	2	8	13343	13350	50 %	0 %	0 %	50 %	386003101
33	NC_017528	CCCG	2	8	13452	13459	0 %	0 %	25 %	75 %	386003101
34	NC_017528	ATTC	2	8	13696	13703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017528	ACCC	2	8	14103	14110	25 %	0 %	0 %	75 %	386003104
36	NC_017528	TGAT	2	8	14140	14147	25 %	50 %	25 %	0 %	386003104
37	NC_017528	TGCT	2	8	14187	14194	0 %	50 %	25 %	25 %	386003104
38	NC_017528	GCCC	2	8	14674	14681	0 %	0 %	25 %	75 %	386003104
39	NC_017528	GGGC	2	8	15455	15462	0 %	0 %	75 %	25 %	386003105
40	NC_017528	CTGA	2	8	15911	15918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017528	TGGC	2	8	16054	16061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017528	GCTT	2	8	16113	16120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017528	CAGT	2	8	16141	16148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017528	CGGT	2	8	16514	16521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017528	GCCG	2	8	16573	16580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017528	CGGG	2	8	17808	17815	0 %	0 %	75 %	25 %	386003106
47	NC_017528	CTGG	2	8	17916	17923	0 %	25 %	50 %	25 %	386003106
48	NC_017528	GTGC	2	8	18416	18423	0 %	25 %	50 %	25 %	386003106
49	NC_017528	GCCG	2	8	18434	18441	0 %	0 %	50 %	50 %	386003106
50	NC_017528	CCGC	2	8	18799	18806	0 %	0 %	25 %	75 %	386003107
51	NC_017528	GCCG	2	8	20263	20270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017528	CCAG	2	8	20751	20758	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017528	CACC	2	8	20934	20941	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_017528	CGGG	2	8	21891	21898	0 %	0 %	75 %	25 %	386003108
55	NC_017528	GCCG	2	8	21982	21989	0 %	0 %	50 %	50 %	386003108
56	NC_017528	GCTG	2	8	22362	22369	0 %	25 %	50 %	25 %	386003108
57	NC_017528	CGGC	2	8	22382	22389	0 %	0 %	50 %	50 %	386003108
58	NC_017528	CAGC	2	8	22968	22975	25 %	0 %	25 %	50 %	386003108
59	NC_017528	GCCG	2	8	23053	23060	0 %	0 %	50 %	50 %	386003108
60	NC_017528	CCCA	2	8	23065	23072	25 %	0 %	0 %	75 %	386003108
61	NC_017528	GCTG	2	8	24204	24211	0 %	25 %	50 %	25 %	386003110
62	NC_017528	CGGC	2	8	24252	24259	0 %	0 %	50 %	50 %	386003110
63	NC_017528	GCCG	2	8	24352	24359	0 %	0 %	50 %	50 %	386003110
64	NC_017528	CGGG	2	8	24427	24434	0 %	0 %	75 %	25 %	386003110
65	NC_017528	TCAA	2	8	25523	25530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017528	GAGC	2	8	25551	25558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017528	GGCC	2	8	25565	25572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017528	GCTC	2	8	26514	26521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017528	CCAA	2	8	26732	26739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017528	CAGC	2	8	26798	26805	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017528	CGGC	2	8	27618	27625	0 %	0 %	50 %	50 %	386003112
72	NC_017528	CCGG	2	8	28104	28111	0 %	0 %	50 %	50 %	386003112
73	NC_017528	GCTC	2	8	28660	28667	0 %	25 %	25 %	50 %	386003113
74	NC_017528	TGCG	2	8	28799	28806	0 %	25 %	50 %	25 %	386003113
75	NC_017528	CCGG	2	8	29064	29071	0 %	0 %	50 %	50 %	386003113
76	NC_017528	CGTC	2	8	29395	29402	0 %	25 %	25 %	50 %	386003114
77	NC_017528	CACG	2	8	29755	29762	25 %	0 %	25 %	50 %	386003115
78	NC_017528	ACCG	2	8	29836	29843	25 %	0 %	25 %	50 %	386003115
79	NC_017528	CCGG	2	8	30155	30162	0 %	0 %	50 %	50 %	386003115
80	NC_017528	GTCG	2	8	30331	30338	0 %	25 %	50 %	25 %	386003115
81	NC_017528	CCCG	2	8	30953	30960	0 %	0 %	25 %	75 %	386003115
82	NC_017528	ACCA	2	8	31134	31141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017528	CGAG	2	8	31465	31472	25 %	0 %	50 %	25 %	386003116
84	NC_017528	CGAC	2	8	31762	31769	25 %	0 %	25 %	50 %	386003117
85	NC_017528	GCCG	2	8	32489	32496	0 %	0 %	50 %	50 %	386003119
86	NC_017528	CCGA	2	8	33481	33488	25 %	0 %	25 %	50 %	386003120
87	NC_017528	GCTA	2	8	33868	33875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017528	GGCC	2	8	34616	34623	0 %	0 %	50 %	50 %	386003121
89	NC_017528	ATCG	2	8	35109	35116	25 %	25 %	25 %	25 %	386003121
90	NC_017528	GATC	2	8	35447	35454	25 %	25 %	25 %	25 %	386003121
91	NC_017528	CCAC	2	8	36268	36275	25 %	0 %	0 %	75 %	386003121
92	NC_017528	ACCG	2	8	36662	36669	25 %	0 %	25 %	50 %	386003122
93	NC_017528	CTGG	2	8	37006	37013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017528	GCAT	2	8	37405	37412	25 %	25 %	25 %	25 %	386003123
95	NC_017528	GCTG	2	8	37919	37926	0 %	25 %	50 %	25 %	386003123
96	NC_017528	AACG	2	8	38674	38681	50 %	0 %	25 %	25 %	386003123
97	NC_017528	CCGA	2	8	38735	38742	25 %	0 %	25 %	50 %	386003123
98	NC_017528	CCAC	2	8	38891	38898	25 %	0 %	0 %	75 %	386003123
99	NC_017528	CAGC	2	8	39118	39125	25 %	0 %	25 %	50 %	386003124
100	NC_017528	CCGG	2	8	39614	39621	0 %	0 %	50 %	50 %	386003124
101	NC_017528	GGCC	2	8	40145	40152	0 %	0 %	50 %	50 %	386003125
102	NC_017528	CGAT	2	8	40595	40602	25 %	25 %	25 %	25 %	386003125
103	NC_017528	GCCG	2	8	40895	40902	0 %	0 %	50 %	50 %	386003125
104	NC_017528	CACC	2	8	40920	40927	25 %	0 %	0 %	75 %	386003125
105	NC_017528	ACCG	2	8	41143	41150	25 %	0 %	25 %	50 %	386003125
106	NC_017528	GCGT	2	8	41169	41176	0 %	25 %	50 %	25 %	386003125
107	NC_017528	CCAC	2	8	41899	41906	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_017528	CGAT	2	8	41908	41915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017528	GGCC	2	8	42604	42611	0 %	0 %	50 %	50 %	386003127
110	NC_017528	CCCG	2	8	43195	43202	0 %	0 %	25 %	75 %	386003127
111	NC_017528	CGGG	2	8	43224	43231	0 %	0 %	75 %	25 %	386003127
112	NC_017528	CGAC	2	8	43867	43874	25 %	0 %	25 %	50 %	386003128
113	NC_017528	GAGC	2	8	44247	44254	25 %	0 %	50 %	25 %	386003128
114	NC_017528	GGGC	2	8	45406	45413	0 %	0 %	75 %	25 %	386003128
115	NC_017528	CGGC	2	8	45501	45508	0 %	0 %	50 %	50 %	386003128
116	NC_017528	GCCG	2	8	46464	46471	0 %	0 %	50 %	50 %	386003128
117	NC_017528	TTGC	2	8	46628	46635	0 %	50 %	25 %	25 %	386003129
118	NC_017528	CCGC	2	8	46776	46783	0 %	0 %	25 %	75 %	386003129
119	NC_017528	CCGC	2	8	46809	46816	0 %	0 %	25 %	75 %	386003129
120	NC_017528	GGTC	2	8	46917	46924	0 %	25 %	50 %	25 %	386003129
121	NC_017528	CTAC	2	8	47241	47248	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017528	CGGG	2	8	47468	47475	0 %	0 %	75 %	25 %	386003130
123	NC_017528	GCAG	2	8	47541	47548	25 %	0 %	50 %	25 %	386003130
124	NC_017528	GTGC	2	8	48441	48448	0 %	25 %	50 %	25 %	386003131
125	NC_017528	GCCG	2	8	48725	48732	0 %	0 %	50 %	50 %	386003131
126	NC_017528	CAGC	2	8	49913	49920	25 %	0 %	25 %	50 %	386003132
127	NC_017528	CGGG	2	8	50102	50109	0 %	0 %	75 %	25 %	386003133
128	NC_017528	GCCG	2	8	50202	50209	0 %	0 %	50 %	50 %	386003133
129	NC_017528	GGTG	2	8	50527	50534	0 %	25 %	75 %	0 %	386003134
130	NC_017528	CTCA	2	8	51143	51150	25 %	25 %	0 %	50 %	386003134
131	NC_017528	CGCT	2	8	51282	51289	0 %	25 %	25 %	50 %	386003135
132	NC_017528	GGTA	2	8	52148	52155	25 %	25 %	50 %	0 %	386003136
133	NC_017528	CTGG	2	8	52743	52750	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017528	GCCG	2	8	53598	53605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017528	ACCA	2	8	53769	53776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017528	GTGC	2	8	54655	54662	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017528	ACCG	2	8	55533	55540	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017528	CCCG	2	8	55695	55702	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_017528	GGCC	2	8	56369	56376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017528	CGCT	2	8	57096	57103	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017528	GCGG	2	8	58856	58863	0 %	0 %	75 %	25 %	386003139
142	NC_017528	GTTC	2	8	59075	59082	0 %	50 %	25 %	25 %	386003139
143	NC_017528	AGCG	2	8	59280	59287	25 %	0 %	50 %	25 %	386003140
144	NC_017528	CGGC	2	8	60022	60029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017528	GCGG	2	8	60034	60041	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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292	NC_017528	CCGG	2	8	115864	115871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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424	NC_017528	CAGG	2	8	163673	163680	25 %	0 %	50 %	25 %	386003214
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