MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB423 chromosome

Total Repeats: 109632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017528	CGGG	2	8	43224	43231	0 %	0 %	75 %	25 %	386003127
1002	NC_017528	GGC	2	6	43265	43270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017528	GCA	2	6	43275	43280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017528	CGG	2	6	43302	43307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017528	CAC	2	6	43315	43320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_017528	GCC	2	6	43344	43349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_017528	GC	3	6	43368	43373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_017528	CGT	2	6	43425	43430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017528	GTG	2	6	43502	43507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017528	GGC	2	6	43611	43616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003128
1011	NC_017528	CGA	2	6	43628	43633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1012	NC_017528	CCG	2	6	43666	43671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003128
1013	NC_017528	GAC	2	6	43785	43790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1014	NC_017528	CGAC	2	8	43867	43874	25 %	0 %	25 %	50 %	386003128
1015	NC_017528	TGG	2	6	43897	43902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003128
1016	NC_017528	TGC	2	6	43912	43917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1017	NC_017528	CCG	2	6	43948	43953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003128
1018	NC_017528	CGT	2	6	44006	44011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1019	NC_017528	CGC	2	6	44019	44024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003128
1020	NC_017528	CGA	2	6	44058	44063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1021	NC_017528	ACC	2	6	44073	44078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003128
1022	NC_017528	CAA	2	6	44150	44155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003128
1023	NC_017528	GC	3	6	44157	44162	0 %	0 %	50 %	50 %	386003128
1024	NC_017528	GGC	2	6	44214	44219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003128
1025	NC_017528	GAGC	2	8	44247	44254	25 %	0 %	50 %	25 %	386003128
1026	NC_017528	CGA	2	6	44264	44269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1027	NC_017528	CCG	2	6	44350	44355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003128
1028	NC_017528	GAT	2	6	44411	44416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003128
1029	NC_017528	GCT	2	6	44441	44446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1030	NC_017528	CGA	2	6	44447	44452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1031	NC_017528	CAC	2	6	44588	44593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003128
1032	NC_017528	CGA	2	6	44654	44659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1033	NC_017528	CGC	2	6	44666	44671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003128
1034	NC_017528	CGG	3	9	44708	44716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003128
1035	NC_017528	CGC	2	6	44735	44740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003128
1036	NC_017528	CGC	2	6	44756	44761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003128
1037	NC_017528	TCT	2	6	44806	44811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386003128
1038	NC_017528	GGTAC	2	10	44884	44893	20 %	20 %	40 %	20 %	386003128
1039	NC_017528	GGGACT	2	12	44929	44940	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386003128
1040	NC_017528	CGG	2	6	44981	44986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003128
1041	NC_017528	CAG	2	6	45061	45066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1042	NC_017528	TCG	2	6	45079	45084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1043	NC_017528	TCGAA	2	10	45116	45125	40 %	20 %	20 %	20 %	386003128
1044	NC_017528	CGA	2	6	45218	45223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1045	NC_017528	ACT	2	6	45259	45264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003128
1046	NC_017528	CGA	2	6	45284	45289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1047	NC_017528	GGGC	2	8	45406	45413	0 %	0 %	75 %	25 %	386003128
1048	NC_017528	CGGC	2	8	45501	45508	0 %	0 %	50 %	50 %	386003128
1049	NC_017528	CGG	2	6	45551	45556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003128
1050	NC_017528	CTG	2	6	45579	45584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1051	NC_017528	GCTTAC	2	12	45678	45689	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386003128
1052	NC_017528	GC	3	6	45696	45701	0 %	0 %	50 %	50 %	386003128
1053	NC_017528	GAA	2	6	45815	45820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003128
1054	NC_017528	TGT	2	6	45929	45934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003128
1055	NC_017528	GTC	2	6	45972	45977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1056	NC_017528	GCACC	2	10	46046	46055	20 %	0 %	20 %	60 %	386003128
1057	NC_017528	TCG	2	6	46057	46062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1058	NC_017528	AGA	2	6	46070	46075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003128
1059	NC_017528	ACC	2	6	46129	46134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003128
1060	NC_017528	AAG	2	6	46140	46145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003128
1061	NC_017528	GCC	2	6	46167	46172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003128
1062	NC_017528	GAG	2	6	46221	46226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386003128
1063	NC_017528	ACC	2	6	46248	46253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003128
1064	NC_017528	GCC	2	6	46287	46292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003128
1065	NC_017528	TCG	2	6	46297	46302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1066	NC_017528	GTG	3	9	46353	46361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003128
1067	NC_017528	GCC	2	6	46362	46367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003128
1068	NC_017528	CGA	2	6	46373	46378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1069	NC_017528	GCC	2	6	46392	46397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003128
1070	NC_017528	CGA	2	6	46406	46411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003128
1071	NC_017528	GCCG	2	8	46464	46471	0 %	0 %	50 %	50 %	386003128
1072	NC_017528	CGG	2	6	46501	46506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017528	CGC	2	6	46556	46561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_017528	CGG	2	6	46568	46573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017528	TTGC	2	8	46628	46635	0 %	50 %	25 %	25 %	386003129
1076	NC_017528	AGC	2	6	46727	46732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003129
1077	NC_017528	CG	3	6	46744	46749	0 %	0 %	50 %	50 %	386003129
1078	NC_017528	CCGC	2	8	46776	46783	0 %	0 %	25 %	75 %	386003129
1079	NC_017528	GCG	2	6	46788	46793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003129
1080	NC_017528	CCGC	2	8	46809	46816	0 %	0 %	25 %	75 %	386003129
1081	NC_017528	TCT	2	6	46854	46859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386003129
1082	NC_017528	GCC	2	6	46863	46868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003129
1083	NC_017528	GGT	3	9	46879	46887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003129
1084	NC_017528	GGTC	2	8	46917	46924	0 %	25 %	50 %	25 %	386003129
1085	NC_017528	GCA	2	6	47019	47024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003129
1086	NC_017528	CGGTG	2	10	47080	47089	0 %	20 %	60 %	20 %	386003129
1087	NC_017528	ACA	2	6	47219	47224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003129
1088	NC_017528	TCATG	2	10	47226	47235	20 %	40 %	20 %	20 %	386003129
1089	NC_017528	CTAC	2	8	47241	47248	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_017528	GCT	2	6	47358	47363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_017528	ATCGG	2	10	47373	47382	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_017528	GAG	2	6	47401	47406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386003130
1093	NC_017528	CGGG	2	8	47468	47475	0 %	0 %	75 %	25 %	386003130
1094	NC_017528	CGG	3	9	47485	47493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003130
1095	NC_017528	GCAG	2	8	47541	47548	25 %	0 %	50 %	25 %	386003130
1096	NC_017528	GCG	2	6	47581	47586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003130
1097	NC_017528	CGT	2	6	47612	47617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003130
1098	NC_017528	TGG	2	6	47678	47683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003130
1099	NC_017528	TCG	2	6	47707	47712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003130
1100	NC_017528	GGC	2	6	47826	47831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003130
1101	NC_017528	TGG	2	6	47888	47893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003130
1102	NC_017528	CGC	2	6	47918	47923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003130
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1104	NC_017528	T	6	6	48112	48117	0 %	100 %	0 %	0 %	386003130
1105	NC_017528	CGC	2	6	48380	48385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003131
1106	NC_017528	CGG	2	6	48395	48400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003131
1107	NC_017528	GTGC	2	8	48441	48448	0 %	25 %	50 %	25 %	386003131
1108	NC_017528	CGG	2	6	48482	48487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003131
1109	NC_017528	CCG	4	12	48544	48555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003131
1110	NC_017528	CGG	3	9	48579	48587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003131
1111	NC_017528	GCAGC	2	10	48620	48629	20 %	0 %	40 %	40 %	386003131
1112	NC_017528	GTC	2	6	48636	48641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003131
1113	NC_017528	GGC	2	6	48644	48649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003131
1114	NC_017528	TCG	2	6	48679	48684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003131
1115	NC_017528	CCCGA	2	10	48703	48712	20 %	0 %	20 %	60 %	386003131
1116	NC_017528	GCCG	2	8	48725	48732	0 %	0 %	50 %	50 %	386003131
1117	NC_017528	AGC	2	6	48769	48774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003131
1118	NC_017528	AAG	2	6	48901	48906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003131
1119	NC_017528	CGG	2	6	48949	48954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003131
1120	NC_017528	G	6	6	48980	48985	0 %	0 %	100 %	0 %	386003131
1121	NC_017528	TGC	2	6	48988	48993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003131
1122	NC_017528	GT	3	6	49070	49075	0 %	50 %	50 %	0 %	386003132
1123	NC_017528	GC	3	6	49105	49110	0 %	0 %	50 %	50 %	386003132
1124	NC_017528	CGA	2	6	49145	49150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003132
1125	NC_017528	CGG	2	6	49190	49195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003132
1126	NC_017528	CGA	2	6	49218	49223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003132
1127	NC_017528	GCC	2	6	49224	49229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003132
1128	NC_017528	CGT	2	6	49265	49270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003132
1129	NC_017528	CGG	2	6	49345	49350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003132
1130	NC_017528	CGC	2	6	49364	49369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003132
1131	NC_017528	GCT	2	6	49478	49483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003132
1132	NC_017528	CGG	2	6	49484	49489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003132
1133	NC_017528	CGA	2	6	49529	49534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003132
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1135	NC_017528	TCC	2	6	49690	49695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386003132
1136	NC_017528	CGA	2	6	49754	49759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003132
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1139	NC_017528	CAGCG	2	10	49831	49840	20 %	0 %	40 %	40 %	386003132
1140	NC_017528	CAGC	2	8	49913	49920	25 %	0 %	25 %	50 %	386003132
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1142	NC_017528	GTG	2	6	50025	50030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_017528	GAT	2	6	50052	50057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003133
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1153	NC_017528	TCG	2	6	50305	50310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003133
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1187	NC_017528	CCT	2	6	51762	51767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1188	NC_017528	ACG	2	6	51793	51798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1189	NC_017528	AT	3	6	51830	51835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1190	NC_017528	ACA	2	6	51841	51846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1191	NC_017528	CCG	2	6	51913	51918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003136
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1210	NC_017528	CCG	2	6	52767	52772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1213	NC_017528	CGT	2	6	52820	52825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1229	NC_017528	CGA	2	6	53351	53356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1230	NC_017528	TCC	2	6	53371	53376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1231	NC_017528	GC	3	6	53446	53451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1232	NC_017528	CGC	2	6	53464	53469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1233	NC_017528	GAG	2	6	53481	53486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1234	NC_017528	GCC	2	6	53502	53507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1235	NC_017528	CCG	2	6	53520	53525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1237	NC_017528	TGG	2	6	53540	53545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1238	NC_017528	GCC	2	6	53564	53569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1239	NC_017528	C	6	6	53574	53579	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1240	NC_017528	GCCG	2	8	53598	53605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1241	NC_017528	CGG	2	6	53686	53691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1242	NC_017528	TCG	2	6	53737	53742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1243	NC_017528	ACCA	2	8	53769	53776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1244	NC_017528	CG	3	6	53948	53953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1245	NC_017528	AAC	2	6	53964	53969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1246	NC_017528	CGG	2	6	53975	53980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1247	NC_017528	CGA	2	6	53998	54003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1248	NC_017528	CAG	2	6	54009	54014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1249	NC_017528	CGA	2	6	54094	54099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1250	NC_017528	TGC	2	6	54130	54135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1251	NC_017528	CAT	2	6	54149	54154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_017528	CGG	2	6	54184	54189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_017528	AGC	2	6	54220	54225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_017528	GTT	2	6	54245	54250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1256	NC_017528	CGG	2	6	54286	54291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1386	NC_017528	CG	4	8	59298	59305	0 %	0 %	50 %	50 %	386003140
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