MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 3182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017527	GA	4	8	1292	1299	50 %	0 %	50 %	0 %	386000718
2	NC_017527	TC	3	6	2035	2040	0 %	50 %	0 %	50 %	386000718
3	NC_017527	CT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	0 %	50 %	386000718
4	NC_017527	AT	3	6	2931	2936	50 %	50 %	0 %	0 %	386000718
5	NC_017527	TA	3	6	3648	3653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017527	AG	3	6	4838	4843	50 %	0 %	50 %	0 %	386000719
7	NC_017527	AT	3	6	6244	6249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017527	AG	3	6	7532	7537	50 %	0 %	50 %	0 %	386000721
9	NC_017527	CT	3	6	8339	8344	0 %	50 %	0 %	50 %	386000722
10	NC_017527	AG	3	6	11646	11651	50 %	0 %	50 %	0 %	386000725
11	NC_017527	TC	3	6	11668	11673	0 %	50 %	0 %	50 %	386000725
12	NC_017527	CT	3	6	14246	14251	0 %	50 %	0 %	50 %	386000729
13	NC_017527	TC	3	6	14717	14722	0 %	50 %	0 %	50 %	386000729
14	NC_017527	AT	3	6	16938	16943	50 %	50 %	0 %	0 %	386000732
15	NC_017527	AG	3	6	17921	17926	50 %	0 %	50 %	0 %	386000733
16	NC_017527	GA	3	6	18152	18157	50 %	0 %	50 %	0 %	386000733
17	NC_017527	AG	3	6	19294	19299	50 %	0 %	50 %	0 %	386000734
18	NC_017527	GA	3	6	19643	19648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017527	GA	3	6	19761	19766	50 %	0 %	50 %	0 %	386000735
20	NC_017527	GA	3	6	22220	22225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017527	GA	4	8	22966	22973	50 %	0 %	50 %	0 %	386000737
22	NC_017527	GA	4	8	23409	23416	50 %	0 %	50 %	0 %	386000737
23	NC_017527	CT	3	6	23962	23967	0 %	50 %	0 %	50 %	386000738
24	NC_017527	GA	3	6	24921	24926	50 %	0 %	50 %	0 %	386000739
25	NC_017527	CT	3	6	25815	25820	0 %	50 %	0 %	50 %	386000739
26	NC_017527	GA	3	6	26246	26251	50 %	0 %	50 %	0 %	386000740
27	NC_017527	AT	3	6	26477	26482	50 %	50 %	0 %	0 %	386000740
28	NC_017527	CT	4	8	27723	27730	0 %	50 %	0 %	50 %	386000741
29	NC_017527	TC	3	6	27898	27903	0 %	50 %	0 %	50 %	386000741
30	NC_017527	GA	3	6	27953	27958	50 %	0 %	50 %	0 %	386000741
31	NC_017527	TC	3	6	33020	33025	0 %	50 %	0 %	50 %	386000745
32	NC_017527	TC	3	6	34664	34669	0 %	50 %	0 %	50 %	386000746
33	NC_017527	GC	3	6	39043	39048	0 %	0 %	50 %	50 %	386000750
34	NC_017527	CT	3	6	39099	39104	0 %	50 %	0 %	50 %	386000750
35	NC_017527	GA	3	6	42060	42065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017527	CT	3	6	42149	42154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017527	GA	3	6	42354	42359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017527	GA	3	6	43177	43182	50 %	0 %	50 %	0 %	386000754
39	NC_017527	AG	3	6	43320	43325	50 %	0 %	50 %	0 %	386000754
40	NC_017527	CT	3	6	43499	43504	0 %	50 %	0 %	50 %	386000754
41	NC_017527	GA	3	6	43791	43796	50 %	0 %	50 %	0 %	386000754
42	NC_017527	AG	3	6	44094	44099	50 %	0 %	50 %	0 %	386000754
43	NC_017527	TA	3	6	44509	44514	50 %	50 %	0 %	0 %	386000754
44	NC_017527	AT	3	6	44517	44522	50 %	50 %	0 %	0 %	386000754
45	NC_017527	TC	5	10	44561	44570	0 %	50 %	0 %	50 %	386000754
46	NC_017527	AT	3	6	44991	44996	50 %	50 %	0 %	0 %	386000754
47	NC_017527	TC	3	6	45505	45510	0 %	50 %	0 %	50 %	386000754
48	NC_017527	AT	3	6	45643	45648	50 %	50 %	0 %	0 %	386000754
49	NC_017527	GA	3	6	45747	45752	50 %	0 %	50 %	0 %	386000755
50	NC_017527	AT	3	6	46025	46030	50 %	50 %	0 %	0 %	386000755
51	NC_017527	TA	4	8	46060	46067	50 %	50 %	0 %	0 %	386000755
52	NC_017527	TC	3	6	46290	46295	0 %	50 %	0 %	50 %	386000755
53	NC_017527	TA	3	6	46548	46553	50 %	50 %	0 %	0 %	386000755
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61	NC_017527	CT	3	6	52226	52231	0 %	50 %	0 %	50 %	386000760
62	NC_017527	TC	3	6	52380	52385	0 %	50 %	0 %	50 %	386000760
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65	NC_017527	AG	3	6	54030	54035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017527	TC	4	8	54501	54508	0 %	50 %	0 %	50 %	386000762
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71	NC_017527	GA	3	6	57727	57732	50 %	0 %	50 %	0 %	386000765
72	NC_017527	GA	3	6	57959	57964	50 %	0 %	50 %	0 %	386000765
73	NC_017527	AG	3	6	57983	57988	50 %	0 %	50 %	0 %	386000765
74	NC_017527	TA	3	6	58016	58021	50 %	50 %	0 %	0 %	386000765
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91	NC_017527	TC	3	6	71565	71570	0 %	50 %	0 %	50 %	386000782
92	NC_017527	AG	3	6	71764	71769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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94	NC_017527	AT	3	6	76615	76620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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98	NC_017527	AT	3	6	80595	80600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_017527	GA	3	6	82306	82311	50 %	0 %	50 %	0 %	386000790
104	NC_017527	GA	4	8	82472	82479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_017527	AT	3	6	85764	85769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017527	GC	3	6	85809	85814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017527	GA	3	6	86784	86789	50 %	0 %	50 %	0 %	386000796
111	NC_017527	CT	3	6	88788	88793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017527	CT	3	6	89854	89859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017527	TC	3	6	90729	90734	0 %	50 %	0 %	50 %	386000800
114	NC_017527	GA	3	6	92301	92306	50 %	0 %	50 %	0 %	386000801
115	NC_017527	TA	3	6	92334	92339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017527	CT	3	6	92613	92618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017527	GA	4	8	94736	94743	50 %	0 %	50 %	0 %	386000804
118	NC_017527	TA	3	6	95565	95570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017527	AG	3	6	97211	97216	50 %	0 %	50 %	0 %	386000807
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121	NC_017527	TA	3	6	98875	98880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017527	AG	3	6	100065	100070	50 %	0 %	50 %	0 %	386000808
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124	NC_017527	AT	3	6	101296	101301	50 %	50 %	0 %	0 %	386000810
125	NC_017527	AT	3	6	101326	101331	50 %	50 %	0 %	0 %	386000810
126	NC_017527	AT	3	6	101346	101351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_017527	AG	3	6	105206	105211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017527	AG	3	6	105715	105720	50 %	0 %	50 %	0 %	386000817
133	NC_017527	GA	3	6	105799	105804	50 %	0 %	50 %	0 %	386000817
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138	NC_017527	AT	3	6	108576	108581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_017527	AG	3	6	110682	110687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017527	GA	3	6	110904	110909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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