MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 2081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017527	GCAGG	2	10	57	66	20 %	0 %	60 %	20 %	386000718
2	NC_017527	GCCCG	2	10	1089	1098	0 %	0 %	40 %	60 %	386000718
3	NC_017527	AATCC	2	10	2581	2590	40 %	20 %	0 %	40 %	386000718
4	NC_017527	TTTTA	2	10	2843	2852	20 %	80 %	0 %	0 %	386000718
5	NC_017527	CCTTC	2	10	3519	3528	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_017527	GTGAG	2	10	3537	3546	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017527	AGAGA	2	10	3553	3562	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017527	ACCTC	2	10	6680	6689	20 %	20 %	0 %	60 %	386000721
9	NC_017527	TCCCC	2	10	6740	6749	0 %	20 %	0 %	80 %	386000721
10	NC_017527	CCACC	2	10	7567	7576	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_017527	GGGCC	2	10	10733	10742	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017527	CGTCT	2	10	11799	11808	0 %	40 %	20 %	40 %	386000725
13	NC_017527	GAGGG	2	10	12690	12699	20 %	0 %	80 %	0 %	386000727
14	NC_017527	CCGGG	2	10	12929	12938	0 %	0 %	60 %	40 %	386000727
15	NC_017527	CCTTC	2	10	13857	13866	0 %	40 %	0 %	60 %	386000729
16	NC_017527	CCTGG	2	10	17837	17846	0 %	20 %	40 %	40 %	386000733
17	NC_017527	AGATC	2	10	18270	18279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017527	GCCCC	2	10	19019	19028	0 %	0 %	20 %	80 %	386000734
19	NC_017527	CCCCG	2	10	19927	19936	0 %	0 %	20 %	80 %	386000735
20	NC_017527	CCTCA	2	10	21471	21480	20 %	20 %	0 %	60 %	386000736
21	NC_017527	GGGCC	2	10	21956	21965	0 %	0 %	60 %	40 %	386000736
22	NC_017527	CCCCG	2	10	23195	23204	0 %	0 %	20 %	80 %	386000737
23	NC_017527	ATATG	2	10	24176	24185	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017527	CCGGG	2	10	25649	25658	0 %	0 %	60 %	40 %	386000739
25	NC_017527	CCCCG	2	10	27616	27625	0 %	0 %	20 %	80 %	386000740
26	NC_017527	TCGTC	2	10	29634	29643	0 %	40 %	20 %	40 %	386000742
27	NC_017527	TCGGA	2	10	31801	31810	20 %	20 %	40 %	20 %	386000744
28	NC_017527	GGTCA	2	10	32941	32950	20 %	20 %	40 %	20 %	386000745
29	NC_017527	TCGAC	2	10	33150	33159	20 %	20 %	20 %	40 %	386000745
30	NC_017527	ATTTT	2	10	33417	33426	20 %	80 %	0 %	0 %	386000745
31	NC_017527	CTTCC	2	10	39493	39502	0 %	40 %	0 %	60 %	386000751
32	NC_017527	GCGGA	2	10	40082	40091	20 %	0 %	60 %	20 %	386000752
33	NC_017527	AGGAG	2	10	40131	40140	40 %	0 %	60 %	0 %	386000752
34	NC_017527	CGTCC	2	10	41010	41019	0 %	20 %	20 %	60 %	386000753
35	NC_017527	CGGAG	2	10	41585	41594	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017527	ATCCT	2	10	42338	42347	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017527	CGACC	2	10	43223	43232	20 %	0 %	20 %	60 %	386000754
38	NC_017527	AGACG	2	10	45143	45152	40 %	0 %	40 %	20 %	386000754
39	NC_017527	TCCGA	2	10	46752	46761	20 %	20 %	20 %	40 %	386000755
40	NC_017527	GAAGA	2	10	48347	48356	60 %	0 %	40 %	0 %	386000755
41	NC_017527	GCCGA	2	10	49007	49016	20 %	0 %	40 %	40 %	386000756
42	NC_017527	GTCCG	2	10	49657	49666	0 %	20 %	40 %	40 %	386000757
43	NC_017527	CGTTT	2	10	50118	50127	0 %	60 %	20 %	20 %	386000759
44	NC_017527	TCCGA	2	10	53224	53233	20 %	20 %	20 %	40 %	386000760
45	NC_017527	TCGTC	2	10	53830	53839	0 %	40 %	20 %	40 %	386000761
46	NC_017527	CCCGG	2	10	56552	56561	0 %	0 %	40 %	60 %	386000764
47	NC_017527	AAGAG	2	10	56809	56818	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017527	TGAGG	2	10	59302	59311	20 %	20 %	60 %	0 %	386000765
49	NC_017527	CCGGG	2	10	59623	59632	0 %	0 %	60 %	40 %	386000765
50	NC_017527	GGCAG	2	10	59853	59862	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017527	TGTCG	2	10	62001	62010	0 %	40 %	40 %	20 %	386000768
52	NC_017527	GGTTT	2	10	62094	62103	0 %	60 %	40 %	0 %	386000768
53	NC_017527	CCGAG	2	10	62728	62737	20 %	0 %	40 %	40 %	386000769
54	NC_017527	TTTAA	2	10	63461	63470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017527	GGAGG	2	10	64102	64111	20 %	0 %	80 %	0 %	386000770
56	NC_017527	CCGTC	2	10	65419	65428	0 %	20 %	20 %	60 %	386000771
57	NC_017527	ACCTC	2	10	65912	65921	20 %	20 %	0 %	60 %	386000773
58	NC_017527	GGGGC	2	10	65992	66001	0 %	0 %	80 %	20 %	386000773
59	NC_017527	GGCCC	2	10	69067	69076	0 %	0 %	40 %	60 %	386000778
60	NC_017527	TTCTC	2	10	69629	69638	0 %	60 %	0 %	40 %	386000778
61	NC_017527	GCCCG	2	10	69728	69737	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_017527	AGGAG	2	10	70769	70778	40 %	0 %	60 %	0 %	386000781
63	NC_017527	GAGGT	2	10	70962	70971	20 %	20 %	60 %	0 %	386000781
64	NC_017527	AGATC	2	10	71188	71197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017527	GATCA	2	10	71209	71218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017527	AGGTC	2	10	71624	71633	20 %	20 %	40 %	20 %	386000782
67	NC_017527	GGCGG	2	10	72597	72606	0 %	0 %	80 %	20 %	386000783
68	NC_017527	GCTCG	2	10	74839	74848	0 %	20 %	40 %	40 %	386000785
69	NC_017527	AGGGA	2	10	75257	75266	40 %	0 %	60 %	0 %	386000785
70	NC_017527	GGAGA	2	10	76723	76732	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017527	CTCGA	2	10	77244	77253	20 %	20 %	20 %	40 %	386000786
72	NC_017527	GATAC	2	10	80810	80819	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017527	GGAGA	2	10	83898	83907	40 %	0 %	60 %	0 %	386000791
74	NC_017527	AGAAT	2	10	85329	85338	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017527	GAGGG	2	10	85952	85961	20 %	0 %	80 %	0 %	386000795
76	NC_017527	CGATC	2	10	86991	87000	20 %	20 %	20 %	40 %	386000796
77	NC_017527	CGGGG	2	10	87028	87037	0 %	0 %	80 %	20 %	386000796
78	NC_017527	AGGGG	2	10	87461	87470	20 %	0 %	80 %	0 %	386000796
79	NC_017527	CGATC	2	10	87530	87539	20 %	20 %	20 %	40 %	386000797
80	NC_017527	CATGC	2	10	89070	89079	20 %	20 %	20 %	40 %	386000799
81	NC_017527	GATCG	2	10	91884	91893	20 %	20 %	40 %	20 %	386000801
82	NC_017527	AGGAG	2	10	92414	92423	40 %	0 %	60 %	0 %	386000802
83	NC_017527	GTCCG	2	10	94629	94638	0 %	20 %	40 %	40 %	386000804
84	NC_017527	ATCGA	2	10	101536	101545	40 %	20 %	20 %	20 %	386000811
85	NC_017527	ATCCT	2	10	102686	102695	20 %	40 %	0 %	40 %	386000811
86	NC_017527	GCCAC	2	10	104022	104031	20 %	0 %	20 %	60 %	386000814
87	NC_017527	GATAT	2	10	105242	105251	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017527	GGCGA	2	10	105279	105288	20 %	0 %	60 %	20 %	386000816
89	NC_017527	TCTCC	2	10	108098	108107	0 %	40 %	0 %	60 %	386000818
90	NC_017527	GTATC	2	10	109750	109759	20 %	40 %	20 %	20 %	386000819
91	NC_017527	GACCG	2	10	110970	110979	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017527	CCCCG	2	10	112530	112539	0 %	0 %	20 %	80 %	386000822
93	NC_017527	CCCCG	2	10	112689	112698	0 %	0 %	20 %	80 %	386000822
94	NC_017527	CGCCC	2	10	113989	113998	0 %	0 %	20 %	80 %	386000823
95	NC_017527	GTCCG	2	10	117225	117234	0 %	20 %	40 %	40 %	386000824
96	NC_017527	GGGGA	2	10	117821	117830	20 %	0 %	80 %	0 %	386000824
97	NC_017527	CCAGG	2	10	120926	120935	20 %	0 %	40 %	40 %	386000828
98	NC_017527	AGGCG	2	10	121306	121315	20 %	0 %	60 %	20 %	386000828
99	NC_017527	TGATC	2	10	121696	121705	20 %	40 %	20 %	20 %	386000828
100	NC_017527	GAGGT	2	10	121866	121875	20 %	20 %	60 %	0 %	386000828
101	NC_017527	CCCCG	2	10	122023	122032	0 %	0 %	20 %	80 %	386000828
102	NC_017527	CCGGT	2	10	122688	122697	0 %	20 %	40 %	40 %	386000828
103	NC_017527	CTGAT	2	10	122741	122750	20 %	40 %	20 %	20 %	386000828
104	NC_017527	GACCA	2	10	123081	123090	40 %	0 %	20 %	40 %	386000828
105	NC_017527	GCCAC	2	10	123205	123214	20 %	0 %	20 %	60 %	386000828
106	NC_017527	GACCA	2	10	123327	123336	40 %	0 %	20 %	40 %	386000828
107	NC_017527	GACGC	2	10	123921	123930	20 %	0 %	40 %	40 %	386000828
108	NC_017527	CCCCT	2	10	124874	124883	0 %	20 %	0 %	80 %	386000829
109	NC_017527	ACCGT	2	10	127037	127046	20 %	20 %	20 %	40 %	386000833
110	NC_017527	TGGCG	2	10	127551	127560	0 %	20 %	60 %	20 %	386000833
111	NC_017527	GCCGG	2	10	127849	127858	0 %	0 %	60 %	40 %	386000834
112	NC_017527	GTATG	2	10	128387	128396	20 %	40 %	40 %	0 %	386000834
113	NC_017527	GATCC	2	10	129660	129669	20 %	20 %	20 %	40 %	386000835
114	NC_017527	CGGGG	2	10	130461	130470	0 %	0 %	80 %	20 %	386000836
115	NC_017527	AGGAG	2	10	132168	132177	40 %	0 %	60 %	0 %	386000838
116	NC_017527	GGACG	2	10	132637	132646	20 %	0 %	60 %	20 %	386000838
117	NC_017527	ACGGG	2	10	133039	133048	20 %	0 %	60 %	20 %	386000839
118	NC_017527	TCGAG	2	10	133992	134001	20 %	20 %	40 %	20 %	386000841
119	NC_017527	CGGGG	2	10	136110	136119	0 %	0 %	80 %	20 %	386000843
120	NC_017527	CCTCG	2	10	138469	138478	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_017527	TCCGG	2	10	138495	138504	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017527	AGGCC	2	10	138525	138534	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017527	AATAA	2	10	140035	140044	80 %	20 %	0 %	0 %	386000846
124	NC_017527	TCGCT	2	10	140691	140700	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017527	CGATC	2	10	141017	141026	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017527	CTCGA	2	10	141141	141150	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017527	GATCT	2	10	142285	142294	20 %	40 %	20 %	20 %	386000847
128	NC_017527	GCTTT	2	10	142777	142786	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017527	CCTCC	2	10	142790	142799	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
130	NC_017527	CGAGG	2	10	145128	145137	20 %	0 %	60 %	20 %	386000850
131	NC_017527	AGGGA	2	10	146894	146903	40 %	0 %	60 %	0 %	386000851
132	NC_017527	CGGAC	2	10	150870	150879	20 %	0 %	40 %	40 %	386000855
133	NC_017527	CGAGG	2	10	151330	151339	20 %	0 %	60 %	20 %	386000855
134	NC_017527	AGTTG	2	10	152004	152013	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017527	TAAGA	2	10	153750	153759	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017527	GTAGG	2	10	160165	160174	20 %	20 %	60 %	0 %	386000862
137	NC_017527	GTCCC	2	10	161051	161060	0 %	20 %	20 %	60 %	386000862
138	NC_017527	CCTCG	2	10	164921	164930	0 %	20 %	20 %	60 %	386000867
139	NC_017527	TAGGC	2	10	166212	166221	20 %	20 %	40 %	20 %	386000867
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152	NC_017527	GCCGA	2	10	182723	182732	20 %	0 %	40 %	40 %	386000883
153	NC_017527	CGAGG	2	10	184063	184072	20 %	0 %	60 %	20 %	386000884
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159	NC_017527	GAGCT	2	10	191352	191361	20 %	20 %	40 %	20 %	386000892
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172	NC_017527	GGCCC	2	10	212285	212294	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
173	NC_017527	GGGCG	2	10	212318	212327	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
174	NC_017527	GCGGG	2	10	212919	212928	0 %	0 %	80 %	20 %	386000915
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177	NC_017527	ATCGC	2	10	213842	213851	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_017527	CGTAT	2	10	217021	217030	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
182	NC_017527	TCTCG	2	10	219018	219027	0 %	40 %	20 %	40 %	386000920
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187	NC_017527	CCGCC	2	10	225119	225128	0 %	0 %	20 %	80 %	386000929
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199	NC_017527	CCCTC	2	10	237691	237700	0 %	20 %	0 %	80 %	386000941
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218	NC_017527	CGATA	2	10	275583	275592	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
219	NC_017527	CAGCT	2	10	276072	276081	20 %	20 %	20 %	40 %	386000979
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221	NC_017527	CCTCC	2	10	278543	278552	0 %	20 %	0 %	80 %	386000981
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223	NC_017527	AGGTC	2	10	279566	279575	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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237	NC_017527	CTCGA	2	10	298581	298590	20 %	20 %	20 %	40 %	386000998
238	NC_017527	CGGAT	2	10	299224	299233	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
239	NC_017527	TCCAC	2	10	301520	301529	20 %	20 %	0 %	60 %	386001003
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243	NC_017527	TCCTA	2	10	306673	306682	20 %	40 %	0 %	40 %	386001005
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247	NC_017527	GCTCC	2	10	310027	310036	0 %	20 %	20 %	60 %	386001008
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249	NC_017527	GGGGA	2	10	317210	317219	20 %	0 %	80 %	0 %	386001014
250	NC_017527	GGTGG	2	10	321192	321201	0 %	20 %	80 %	0 %	386001018
251	NC_017527	CGATC	2	10	321353	321362	20 %	20 %	20 %	40 %	386001018
252	NC_017527	AGGCG	2	10	323844	323853	20 %	0 %	60 %	20 %	386001020
253	NC_017527	CCATA	2	10	324975	324984	40 %	20 %	0 %	40 %	386001021
254	NC_017527	TTGAC	2	10	327594	327603	20 %	40 %	20 %	20 %	386001023
255	NC_017527	TCTCC	2	10	328464	328473	0 %	40 %	0 %	60 %	386001023
256	NC_017527	TGGTT	2	10	328482	328491	0 %	60 %	40 %	0 %	386001023
257	NC_017527	TTTTG	2	10	328997	329006	0 %	80 %	20 %	0 %	386001024
258	NC_017527	CGGTC	2	10	329772	329781	0 %	20 %	40 %	40 %	386001025
259	NC_017527	GCCTC	2	10	329872	329881	0 %	20 %	20 %	60 %	386001025
260	NC_017527	TCGGC	2	10	330015	330024	0 %	20 %	40 %	40 %	386001025
261	NC_017527	GTACC	2	10	332042	332051	20 %	20 %	20 %	40 %	386001027
262	NC_017527	CGGGC	2	10	332829	332838	0 %	0 %	60 %	40 %	386001028
263	NC_017527	ATCGG	2	10	334160	334169	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
264	NC_017527	CCGGA	2	10	334835	334844	20 %	0 %	40 %	40 %	386001030
265	NC_017527	GAAGC	2	10	336160	336169	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_017527	GGGGC	2	10	338509	338518	0 %	0 %	80 %	20 %	386001033
267	NC_017527	CGGGT	2	10	338573	338582	0 %	20 %	60 %	20 %	386001033
268	NC_017527	GAGGT	2	10	340770	340779	20 %	20 %	60 %	0 %	386001034
269	NC_017527	CTCTC	2	10	341759	341768	0 %	40 %	0 %	60 %	386001035
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396	NC_017527	CTTTC	2	10	468963	468972	0 %	60 %	0 %	40 %	386001158
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401	NC_017527	GATGT	2	10	481260	481269	20 %	40 %	40 %	0 %	386001180
402	NC_017527	ACCTC	2	10	482486	482495	20 %	20 %	0 %	60 %	386001183
403	NC_017527	GATCG	2	10	483150	483159	20 %	20 %	40 %	20 %	386001184
404	NC_017527	GCGCC	2	10	483294	483303	0 %	0 %	40 %	60 %	386001184
405	NC_017527	TCCCT	2	10	483883	483892	0 %	40 %	0 %	60 %	386001185
406	NC_017527	GGGAG	2	10	486253	486262	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
407	NC_017527	ACCTC	2	10	488673	488682	20 %	20 %	0 %	60 %	386001192
408	NC_017527	CGGGG	2	10	489896	489905	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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463	NC_017527	TTCAG	2	10	550982	550991	20 %	40 %	20 %	20 %	386001248
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486	NC_017527	ATCCT	2	10	575799	575808	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
487	NC_017527	GGAGG	2	10	578977	578986	20 %	0 %	80 %	0 %	386001271
488	NC_017527	ACCTG	2	10	579414	579423	20 %	20 %	20 %	40 %	386001271
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500	NC_017527	GCTGG	2	10	602509	602518	0 %	20 %	60 %	20 %	386001286

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