MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017527	CGG	2	6	148052	148057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000853
4002	NC_017527	GAC	2	6	148074	148079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000853
4003	NC_017527	C	6	6	148079	148084	0 %	0 %	0 %	100 %	386000853
4004	NC_017527	GGT	2	6	148085	148090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000853
4005	NC_017527	CGA	2	6	148121	148126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000853
4006	NC_017527	CGG	2	6	148127	148132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000853
4007	NC_017527	A	6	6	148143	148148	100 %	0 %	0 %	0 %	386000853
4008	NC_017527	TGA	2	6	148166	148171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000853
4009	NC_017527	CGG	2	6	148193	148198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000853
4010	NC_017527	ACGGCG	2	12	148228	148239	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386000853
4011	NC_017527	GGT	2	6	148277	148282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000853
4012	NC_017527	AGA	2	6	148313	148318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000853
4013	NC_017527	GTC	2	6	148345	148350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000853
4014	NC_017527	AGAA	2	8	148387	148394	75 %	0 %	25 %	0 %	386000853
4015	NC_017527	TCG	2	6	148435	148440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000853
4016	NC_017527	CCG	3	9	148484	148492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_017527	CGA	2	6	148515	148520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_017527	CCG	2	6	148546	148551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_017527	GCC	2	6	148554	148559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_017527	CCT	2	6	148599	148604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000854
4021	NC_017527	CGA	2	6	148632	148637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000854
4022	NC_017527	GTC	2	6	148660	148665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000854
4023	NC_017527	CCG	2	6	148684	148689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000854
4024	NC_017527	GCC	2	6	148720	148725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000854
4025	NC_017527	GGGA	2	8	148747	148754	25 %	0 %	75 %	0 %	386000854
4026	NC_017527	CCCG	2	8	148788	148795	0 %	0 %	25 %	75 %	386000854
4027	NC_017527	CGA	2	6	148890	148895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000854
4028	NC_017527	GGCC	2	8	148909	148916	0 %	0 %	50 %	50 %	386000854
4029	NC_017527	AGG	2	6	148922	148927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000854
4030	NC_017527	AGG	2	6	148937	148942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000854
4031	NC_017527	CCA	2	6	148950	148955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000854
4032	NC_017527	CGC	2	6	148959	148964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000854
4033	NC_017527	CGG	2	6	148979	148984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000854
4034	NC_017527	CTT	2	6	148987	148992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000854
4035	NC_017527	CGA	2	6	149178	149183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000854
4036	NC_017527	CGG	2	6	149221	149226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000854
4037	NC_017527	GGA	2	6	149257	149262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000854
4038	NC_017527	GGTGGG	2	12	149269	149280	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	386000854
4039	NC_017527	GTAGAG	2	12	149281	149292	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386000854
4040	NC_017527	AG	3	6	149324	149329	50 %	0 %	50 %	0 %	386000854
4041	NC_017527	TTA	2	6	149417	149422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386000854
4042	NC_017527	ATC	2	6	149479	149484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000854
4043	NC_017527	ACC	2	6	149627	149632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000854
4044	NC_017527	GTC	2	6	149750	149755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000854
4045	NC_017527	A	6	6	149800	149805	100 %	0 %	0 %	0 %	386000854
4046	NC_017527	CATC	2	8	149853	149860	25 %	25 %	0 %	50 %	386000854
4047	NC_017527	CTT	2	6	150022	150027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000854
4048	NC_017527	TTC	2	6	150093	150098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000854
4049	NC_017527	GTT	2	6	150124	150129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386000855
4050	NC_017527	TGA	2	6	150132	150137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000855
4051	NC_017527	TGA	2	6	150195	150200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000855
4052	NC_017527	CTT	2	6	150220	150225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000855
4053	NC_017527	TCC	2	6	150285	150290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000855
4054	NC_017527	CAC	2	6	150319	150324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000855
4055	NC_017527	TCA	2	6	150345	150350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000855
4056	NC_017527	TTC	2	6	150398	150403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000855
4057	NC_017527	CCT	2	6	150417	150422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000855
4058	NC_017527	TCG	2	6	150455	150460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000855
4059	NC_017527	CAT	2	6	150520	150525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000855
4060	NC_017527	GAG	2	6	150589	150594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000855
4061	NC_017527	CCT	3	9	150792	150800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000855
4062	NC_017527	GAG	2	6	150815	150820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000855
4063	NC_017527	C	6	6	150833	150838	0 %	0 %	0 %	100 %	386000855
4064	NC_017527	CGGAC	2	10	150870	150879	20 %	0 %	40 %	40 %	386000855
4065	NC_017527	GAC	2	6	150889	150894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000855
4066	NC_017527	GTA	2	6	150907	150912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000855
4067	NC_017527	C	6	6	150915	150920	0 %	0 %	0 %	100 %	386000855
4068	NC_017527	GGC	2	6	150946	150951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000855
4069	NC_017527	GAC	2	6	150973	150978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000855
4070	NC_017527	TCC	2	6	150983	150988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000855
4071	NC_017527	GAC	2	6	151051	151056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000855
4072	NC_017527	TCG	3	9	151082	151090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000855
4073	NC_017527	GGA	2	6	151125	151130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000855
4074	NC_017527	GCC	2	6	151157	151162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000855
4075	NC_017527	GGC	2	6	151167	151172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000855
4076	NC_017527	GCG	2	6	151205	151210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000855
4077	NC_017527	CGG	2	6	151254	151259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000855
4078	NC_017527	TCT	2	6	151260	151265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000855
4079	NC_017527	CAGGTC	2	12	151270	151281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386000855
4080	NC_017527	CGC	2	6	151307	151312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000855
4081	NC_017527	CGAGG	2	10	151330	151339	20 %	0 %	60 %	20 %	386000855
4082	NC_017527	GAC	2	6	151357	151362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000855
4083	NC_017527	TC	3	6	151374	151379	0 %	50 %	0 %	50 %	386000855
4084	NC_017527	GAG	2	6	151415	151420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000855
4085	NC_017527	CTT	2	6	151483	151488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000855
4086	NC_017527	GGCG	2	8	151527	151534	0 %	0 %	75 %	25 %	386000855
4087	NC_017527	GCT	2	6	151623	151628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000855
4088	NC_017527	GCC	2	6	151693	151698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000855
4089	NC_017527	GAC	2	6	151705	151710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000855
4090	NC_017527	CGA	2	6	151755	151760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000855
4091	NC_017527	CGC	2	6	151887	151892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_017527	TA	3	6	151983	151988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017527	AGTTG	2	10	152004	152013	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017527	AGA	2	6	152025	152030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017527	CCA	2	6	152047	152052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_017527	TGG	2	6	152090	152095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017527	AGA	2	6	152096	152101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017527	AAG	2	6	152119	152124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017527	TGG	2	6	152206	152211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017527	TCC	2	6	152293	152298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000856
4101	NC_017527	TCG	2	6	152302	152307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000856
4102	NC_017527	CTAT	2	8	152338	152345	25 %	50 %	0 %	25 %	386000856
4103	NC_017527	GGA	2	6	152414	152419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000856
4104	NC_017527	CGA	2	6	152501	152506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000856
4105	NC_017527	GAC	2	6	152587	152592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000856
4106	NC_017527	AGT	2	6	152628	152633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017527	AATCCC	2	12	152640	152651	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386000857
4108	NC_017527	GGT	2	6	152753	152758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000857
4109	NC_017527	AGGT	2	8	152776	152783	25 %	25 %	50 %	0 %	386000857
4110	NC_017527	CCT	2	6	152795	152800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000857
4111	NC_017527	CAC	2	6	152814	152819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000857
4112	NC_017527	CAGG	2	8	152843	152850	25 %	0 %	50 %	25 %	386000857
4113	NC_017527	GAG	2	6	152865	152870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000857
4114	NC_017527	CGT	2	6	152888	152893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000857
4115	NC_017527	CGC	2	6	152937	152942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000857
4116	NC_017527	TCA	2	6	152945	152950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000857
4117	NC_017527	GCG	2	6	152965	152970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000857
4118	NC_017527	GGC	3	9	152985	152993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000857
4119	NC_017527	C	6	6	153072	153077	0 %	0 %	0 %	100 %	386000857
4120	NC_017527	CGA	2	6	153122	153127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000857
4121	NC_017527	GTGG	2	8	153153	153160	0 %	25 %	75 %	0 %	386000857
4122	NC_017527	CCG	2	6	153187	153192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000857
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4136	NC_017527	TCGC	2	8	153714	153721	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4236	NC_017527	TAA	2	6	158000	158005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_017527	TCC	2	6	158131	158136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000861
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4245	NC_017527	TGG	2	6	158605	158610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000861
4246	NC_017527	GTC	2	6	158672	158677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000861
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4249	NC_017527	GATC	2	8	158965	158972	25 %	25 %	25 %	25 %	386000861
4250	NC_017527	ACT	2	6	158991	158996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000861
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4261	NC_017527	GAT	2	6	159643	159648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4263	NC_017527	TTGA	2	8	159685	159692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_017527	CAA	2	6	159734	159739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4266	NC_017527	CATT	2	8	159887	159894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4267	NC_017527	A	8	8	159912	159919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4351	NC_017527	GGC	2	6	163337	163342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4352	NC_017527	TCT	2	6	163363	163368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4353	NC_017527	GCC	3	9	163472	163480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4354	NC_017527	TCC	2	6	163483	163488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4355	NC_017527	TA	4	8	163565	163572	50 %	50 %	0 %	0 %	386000866
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4357	NC_017527	C	7	7	163599	163605	0 %	0 %	0 %	100 %	386000866
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4477	NC_017527	TCC	2	6	167623	167628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4478	NC_017527	CCG	2	6	167629	167634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4488	NC_017527	GTA	2	6	168058	168063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000869
4489	NC_017527	TGG	2	6	168083	168088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000869
4490	NC_017527	GAC	2	6	168121	168126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4491	NC_017527	GCG	2	6	168131	168136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000869
4492	NC_017527	GAG	2	6	168157	168162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000869
4493	NC_017527	CCG	2	6	168195	168200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000869
4494	NC_017527	GGC	2	6	168231	168236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000869
4495	NC_017527	ATCTCC	2	12	168257	168268	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386000869
4496	NC_017527	CCT	2	6	168297	168302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000869
4497	NC_017527	CTT	2	6	168406	168411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000869
4498	NC_017527	TCC	2	6	168453	168458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000869
4499	NC_017527	CGG	2	6	168510	168515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000869
4500	NC_017527	AGG	2	6	168545	168550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000869

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