MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017527	TCG	2	6	57540	57545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000765
1502	NC_017527	GGA	2	6	57642	57647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000765
1503	NC_017527	CAT	2	6	57670	57675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000765
1504	NC_017527	CGG	2	6	57680	57685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000765
1505	NC_017527	GA	3	6	57727	57732	50 %	0 %	50 %	0 %	386000765
1506	NC_017527	CTA	2	6	57748	57753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000765
1507	NC_017527	CGC	2	6	57862	57867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000765
1508	NC_017527	ACG	2	6	57879	57884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000765
1509	NC_017527	TGA	3	9	57907	57915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000765
1510	NC_017527	A	7	7	57917	57923	100 %	0 %	0 %	0 %	386000765
1511	NC_017527	GA	3	6	57959	57964	50 %	0 %	50 %	0 %	386000765
1512	NC_017527	AG	3	6	57983	57988	50 %	0 %	50 %	0 %	386000765
1513	NC_017527	TGG	2	6	57999	58004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000765
1514	NC_017527	TA	3	6	58016	58021	50 %	50 %	0 %	0 %	386000765
1515	NC_017527	GAGTTC	2	12	58040	58051	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386000765
1516	NC_017527	GGT	2	6	58072	58077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000765
1517	NC_017527	ACC	2	6	58115	58120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000765
1518	NC_017527	CAT	3	9	58174	58182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000765
1519	NC_017527	AG	3	6	58194	58199	50 %	0 %	50 %	0 %	386000765
1520	NC_017527	CTA	2	6	58222	58227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000765
1521	NC_017527	GAC	2	6	58283	58288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000765
1522	NC_017527	AAC	2	6	58313	58318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386000765
1523	NC_017527	TGG	2	6	58323	58328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000765
1524	NC_017527	TGA	2	6	58338	58343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000765
1525	NC_017527	AG	3	6	58368	58373	50 %	0 %	50 %	0 %	386000765
1526	NC_017527	CGT	2	6	58531	58536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000765
1527	NC_017527	CGT	2	6	58603	58608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000765
1528	NC_017527	TCC	2	6	58614	58619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000765
1529	NC_017527	TCGCCG	2	12	58632	58643	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386000765
1530	NC_017527	GAAT	2	8	58675	58682	50 %	25 %	25 %	0 %	386000765
1531	NC_017527	G	8	8	58741	58748	0 %	0 %	100 %	0 %	386000765
1532	NC_017527	TCA	2	6	58767	58772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000765
1533	NC_017527	CCG	2	6	58797	58802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000765
1534	NC_017527	CGG	2	6	58823	58828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000765
1535	NC_017527	CGA	2	6	58921	58926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000765
1536	NC_017527	CCT	2	6	58933	58938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000765
1537	NC_017527	AGGG	2	8	58956	58963	25 %	0 %	75 %	0 %	386000765
1538	NC_017527	CCG	2	6	58983	58988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000765
1539	NC_017527	GCCGGT	2	12	58990	59001	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386000765
1540	NC_017527	GGA	2	6	59025	59030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000765
1541	NC_017527	CGG	2	6	59049	59054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000765
1542	NC_017527	GA	3	6	59055	59060	50 %	0 %	50 %	0 %	386000765
1543	NC_017527	CTA	2	6	59062	59067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000765
1544	NC_017527	CCG	2	6	59076	59081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000765
1545	NC_017527	CGA	2	6	59128	59133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000765
1546	NC_017527	GCGA	2	8	59171	59178	25 %	0 %	50 %	25 %	386000765
1547	NC_017527	TTC	2	6	59186	59191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000765
1548	NC_017527	GTC	2	6	59195	59200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000765
1549	NC_017527	CGG	2	6	59289	59294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000765
1550	NC_017527	TGAGG	2	10	59302	59311	20 %	20 %	60 %	0 %	386000765
1551	NC_017527	CCG	3	9	59388	59396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000765
1552	NC_017527	CCG	2	6	59450	59455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000765
1553	NC_017527	TGG	2	6	59472	59477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000765
1554	NC_017527	CGC	2	6	59495	59500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000765
1555	NC_017527	CT	3	6	59546	59551	0 %	50 %	0 %	50 %	386000765
1556	NC_017527	GGA	2	6	59563	59568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000765
1557	NC_017527	AGG	2	6	59593	59598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000765
1558	NC_017527	CCGGG	2	10	59623	59632	0 %	0 %	60 %	40 %	386000765
1559	NC_017527	G	9	9	59671	59679	0 %	0 %	100 %	0 %	386000765
1560	NC_017527	GGA	2	6	59739	59744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000765
1561	NC_017527	GGC	2	6	59758	59763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000765
1562	NC_017527	CTG	2	6	59771	59776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000765
1563	NC_017527	CGG	2	6	59807	59812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000765
1564	NC_017527	AGG	2	6	59813	59818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000765
1565	NC_017527	GGCAG	2	10	59853	59862	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1566	NC_017527	GGCT	2	8	59877	59884	0 %	25 %	50 %	25 %	386000766
1567	NC_017527	GGCG	2	8	59894	59901	0 %	0 %	75 %	25 %	386000766
1568	NC_017527	CCT	2	6	59922	59927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000766
1569	NC_017527	CGCC	2	8	59937	59944	0 %	0 %	25 %	75 %	386000766
1570	NC_017527	TCT	2	6	60050	60055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000766
1571	NC_017527	GCC	2	6	60065	60070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000766
1572	NC_017527	AG	3	6	60109	60114	50 %	0 %	50 %	0 %	386000766
1573	NC_017527	GCC	2	6	60136	60141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000766
1574	NC_017527	CCA	2	6	60143	60148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000766
1575	NC_017527	GTC	2	6	60259	60264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000766
1576	NC_017527	GCC	2	6	60322	60327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000766
1577	NC_017527	CCA	2	6	60341	60346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000766
1578	NC_017527	CT	3	6	60396	60401	0 %	50 %	0 %	50 %	386000766
1579	NC_017527	GGTC	2	8	60455	60462	0 %	25 %	50 %	25 %	386000766
1580	NC_017527	CTC	2	6	60492	60497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000766
1581	NC_017527	CAGG	2	8	60513	60520	25 %	0 %	50 %	25 %	386000766
1582	NC_017527	GCC	2	6	60547	60552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000766
1583	NC_017527	TCC	2	6	60611	60616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000766
1584	NC_017527	CAC	2	6	60622	60627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000766
1585	NC_017527	TTC	2	6	60698	60703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000766
1586	NC_017527	ATA	2	6	60712	60717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386000766
1587	NC_017527	GCG	2	6	60736	60741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000766
1588	NC_017527	CCGG	2	8	60762	60769	0 %	0 %	50 %	50 %	386000766
1589	NC_017527	TTC	2	6	60940	60945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000767
1590	NC_017527	GA	3	6	60986	60991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017527	GATC	2	8	60994	61001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_017527	GGC	2	6	61094	61099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_017527	AG	3	6	61116	61121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017527	CA	3	6	61167	61172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_017527	GCT	2	6	61196	61201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_017527	CAG	3	9	61232	61240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_017527	GAC	2	6	61261	61266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_017527	ATCT	2	8	61271	61278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_017527	ACC	2	6	61293	61298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_017527	ACT	2	6	61369	61374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_017527	AGG	2	6	61486	61491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017527	GCG	2	6	61525	61530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000768
1603	NC_017527	ATA	2	6	61543	61548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386000768
1604	NC_017527	ATG	2	6	61561	61566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000768
1605	NC_017527	TC	3	6	61583	61588	0 %	50 %	0 %	50 %	386000768
1606	NC_017527	TAC	2	6	61650	61655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000768
1607	NC_017527	CTT	2	6	61686	61691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000768
1608	NC_017527	C	6	6	61777	61782	0 %	0 %	0 %	100 %	386000768
1609	NC_017527	AAAT	2	8	61805	61812	75 %	25 %	0 %	0 %	386000768
1610	NC_017527	ACTTCT	2	12	61813	61824	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386000768
1611	NC_017527	TAC	2	6	61874	61879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000768
1612	NC_017527	GCAA	2	8	61926	61933	50 %	0 %	25 %	25 %	386000768
1613	NC_017527	GGA	2	6	61958	61963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000768
1614	NC_017527	TGTCG	2	10	62001	62010	0 %	40 %	40 %	20 %	386000768
1615	NC_017527	AGG	2	6	62052	62057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000768
1616	NC_017527	GGTTT	2	10	62094	62103	0 %	60 %	40 %	0 %	386000768
1617	NC_017527	GAT	2	6	62113	62118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000768
1618	NC_017527	GA	3	6	62181	62186	50 %	0 %	50 %	0 %	386000768
1619	NC_017527	T	6	6	62194	62199	0 %	100 %	0 %	0 %	386000768
1620	NC_017527	TGA	2	6	62244	62249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000768
1621	NC_017527	CT	3	6	62258	62263	0 %	50 %	0 %	50 %	386000768
1622	NC_017527	ACC	2	6	62284	62289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000768
1623	NC_017527	TGGA	2	8	62303	62310	25 %	25 %	50 %	0 %	386000768
1624	NC_017527	TAT	2	6	62341	62346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386000768
1625	NC_017527	CCG	2	6	62384	62389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000768
1626	NC_017527	GAT	2	6	62412	62417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000768
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1628	NC_017527	GAC	2	6	62443	62448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000768
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