MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_017527	ACG	2	6	2556509	2556514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003067
68002	NC_017527	CTC	2	6	2556529	2556534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386003067
68003	NC_017527	AGC	2	6	2556580	2556585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003067
68004	NC_017527	GAT	2	6	2556636	2556641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003067
68005	NC_017527	CCG	2	6	2556659	2556664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003067
68006	NC_017527	CGG	2	6	2556677	2556682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003067
68007	NC_017527	CAT	2	6	2556705	2556710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003067
68008	NC_017527	CCCG	2	8	2556714	2556721	0 %	0 %	25 %	75 %	386003067
68009	NC_017527	GCG	2	6	2556730	2556735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003067
68010	NC_017527	CCT	2	6	2556782	2556787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386003068
68011	NC_017527	GAG	2	6	2556793	2556798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386003068
68012	NC_017527	C	6	6	2556802	2556807	0 %	0 %	0 %	100 %	386003068
68013	NC_017527	CCCAC	2	10	2556839	2556848	20 %	0 %	0 %	80 %	386003068
68014	NC_017527	CCT	2	6	2556851	2556856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386003068
68015	NC_017527	ATC	2	6	2556859	2556864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003068
68016	NC_017527	CAT	2	6	2556897	2556902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003068
68017	NC_017527	GGC	2	6	2556903	2556908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003068
68018	NC_017527	CGGC	2	8	2556943	2556950	0 %	0 %	50 %	50 %	386003068
68019	NC_017527	AGGCCC	2	12	2557021	2557032	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386003068
68020	NC_017527	CGA	2	6	2557034	2557039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003068
68021	NC_017527	CGG	2	6	2557043	2557048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003068
68022	NC_017527	TCG	2	6	2557079	2557084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003068
68023	NC_017527	TCA	2	6	2557112	2557117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003068
68024	NC_017527	CGG	2	6	2557130	2557135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003068
68025	NC_017527	CGA	2	6	2557139	2557144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003068
68026	NC_017527	TCG	2	6	2557150	2557155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003068
68027	NC_017527	CCG	2	6	2557170	2557175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003068
68028	NC_017527	AAG	2	6	2557198	2557203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003068
68029	NC_017527	GA	3	6	2557293	2557298	50 %	0 %	50 %	0 %	386003068
68030	NC_017527	GTC	2	6	2557324	2557329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003068
68031	NC_017527	CCT	3	9	2557331	2557339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386003068
68032	NC_017527	AGG	2	6	2557462	2557467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386003068
68033	NC_017527	CGC	2	6	2557560	2557565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003068
68034	NC_017527	CGC	2	6	2557626	2557631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003068
68035	NC_017527	CTC	2	6	2557709	2557714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386003068
68036	NC_017527	C	6	6	2557756	2557761	0 %	0 %	0 %	100 %	386003069
68037	NC_017527	GAC	3	9	2557766	2557774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003069
68038	NC_017527	CGCTC	2	10	2557804	2557813	0 %	20 %	20 %	60 %	386003069
68039	NC_017527	GCA	2	6	2557820	2557825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003069
68040	NC_017527	TGA	2	6	2557831	2557836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003069
68041	NC_017527	TCG	2	6	2557857	2557862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003069
68042	NC_017527	CGA	2	6	2557945	2557950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003069
68043	NC_017527	GTC	2	6	2557958	2557963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003069
68044	NC_017527	CTCTGT	2	12	2557972	2557983	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386003069
68045	NC_017527	CCA	2	6	2558104	2558109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003069
68046	NC_017527	CGA	2	6	2558116	2558121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003069
68047	NC_017527	ACG	2	6	2558134	2558139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003069
68048	NC_017527	GAC	2	6	2558150	2558155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003069
68049	NC_017527	GATCTC	2	12	2558162	2558173	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386003069
68050	NC_017527	CGG	3	9	2558179	2558187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003069
68051	NC_017527	TCG	2	6	2558217	2558222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003069
68052	NC_017527	C	6	6	2558224	2558229	0 %	0 %	0 %	100 %	386003069
68053	NC_017527	TGG	2	6	2558443	2558448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003069
68054	NC_017527	GCCTC	2	10	2558470	2558479	0 %	20 %	20 %	60 %	386003069
68055	NC_017527	CGC	2	6	2558483	2558488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003069
68056	NC_017527	TCCT	2	8	2558527	2558534	0 %	50 %	0 %	50 %	386003070
68057	NC_017527	C	6	6	2558560	2558565	0 %	0 %	0 %	100 %	386003070
68058	NC_017527	GGA	2	6	2558571	2558576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386003070
68059	NC_017527	GAG	2	6	2558581	2558586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386003070
68060	NC_017527	TCC	2	6	2558616	2558621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386003070
68061	NC_017527	C	6	6	2558620	2558625	0 %	0 %	0 %	100 %	386003070
68062	NC_017527	TCCACC	2	12	2558651	2558662	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386003070
68063	NC_017527	CGA	2	6	2558679	2558684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003070
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68069	NC_017527	CGA	2	6	2558835	2558840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003070
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68071	NC_017527	CGT	2	6	2558964	2558969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003070

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.