MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017527	CTC	2	6	224480	224485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000928
6002	NC_017527	CCGG	2	8	224533	224540	0 %	0 %	50 %	50 %	386000928
6003	NC_017527	TGG	3	9	224556	224564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000928
6004	NC_017527	GAG	2	6	224597	224602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017527	AGGAG	2	10	224643	224652	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017527	GGC	2	6	224661	224666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_017527	GGC	2	6	224735	224740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000929
6008	NC_017527	GCC	2	6	224772	224777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000929
6009	NC_017527	CTC	2	6	224808	224813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000929
6010	NC_017527	AGG	2	6	224838	224843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000929
6011	NC_017527	CCT	2	6	224881	224886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000929
6012	NC_017527	GCC	2	6	224889	224894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000929
6013	NC_017527	GCC	2	6	224904	224909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000929
6014	NC_017527	GGC	2	6	225032	225037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000929
6015	NC_017527	CCGCC	2	10	225119	225128	0 %	0 %	20 %	80 %	386000929
6016	NC_017527	CGA	2	6	225161	225166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000929
6017	NC_017527	TCC	2	6	225169	225174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000929
6018	NC_017527	GGT	2	6	225203	225208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000929
6019	NC_017527	ACT	2	6	225238	225243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000929
6020	NC_017527	AGG	3	9	225261	225269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000929
6021	NC_017527	TCG	2	6	225285	225290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000930
6022	NC_017527	GTC	2	6	225359	225364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000930
6023	NC_017527	GCT	2	6	225391	225396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000930
6024	NC_017527	TCG	2	6	225417	225422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000930
6025	NC_017527	CAA	2	6	225427	225432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386000930
6026	NC_017527	GAG	2	6	225443	225448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000930
6027	NC_017527	GTG	2	6	225491	225496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000930
6028	NC_017527	GCG	2	6	225507	225512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000930
6029	NC_017527	CCCT	2	8	225515	225522	0 %	25 %	0 %	75 %	386000930
6030	NC_017527	GGA	2	6	225556	225561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000930
6031	NC_017527	GTGGAG	2	12	225569	225580	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386000930
6032	NC_017527	GTC	2	6	225581	225586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000930
6033	NC_017527	TCGCCG	2	12	225606	225617	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386000930
6034	NC_017527	CGG	2	6	225678	225683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000930
6035	NC_017527	GAC	2	6	225685	225690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000930
6036	NC_017527	GAC	2	6	225730	225735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000930
6037	NC_017527	GAC	2	6	225772	225777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000930
6038	NC_017527	CGG	2	6	225807	225812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000930
6039	NC_017527	CGT	2	6	225814	225819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000930
6040	NC_017527	CCT	2	6	225828	225833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000930
6041	NC_017527	TCG	2	6	225852	225857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000930
6042	NC_017527	TCG	2	6	225921	225926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000930
6043	NC_017527	GAG	2	6	225940	225945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000930
6044	NC_017527	TCGC	2	8	226025	226032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_017527	GTC	3	9	226060	226068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_017527	CCG	2	6	226071	226076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_017527	TGG	3	9	226121	226129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000931
6048	NC_017527	GTG	2	6	226150	226155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000931
6049	NC_017527	CGT	2	6	226200	226205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000931
6050	NC_017527	CTC	2	6	226215	226220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000931
6051	NC_017527	CTCCG	2	10	226222	226231	0 %	20 %	20 %	60 %	386000931
6052	NC_017527	GGT	2	6	226239	226244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000931
6053	NC_017527	G	6	6	226245	226250	0 %	0 %	100 %	0 %	386000931
6054	NC_017527	CCA	2	6	226251	226256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000931
6055	NC_017527	GGA	2	6	226258	226263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000931
6056	NC_017527	ATC	2	6	226277	226282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000931
6057	NC_017527	CAC	2	6	226314	226319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000931
6058	NC_017527	CGG	2	6	226358	226363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000931
6059	NC_017527	CGT	2	6	226380	226385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000931
6060	NC_017527	TCC	2	6	226393	226398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000931
6061	NC_017527	AGG	2	6	226403	226408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000931
6062	NC_017527	TCC	2	6	226442	226447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000931
6063	NC_017527	GTC	2	6	226465	226470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000931
6064	NC_017527	CGA	2	6	226476	226481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000931
6065	NC_017527	GAG	3	9	226497	226505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000931
6066	NC_017527	TCG	3	9	226514	226522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000931
6067	NC_017527	G	6	6	226538	226543	0 %	0 %	100 %	0 %	386000931
6068	NC_017527	GAG	2	6	226606	226611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000931
6069	NC_017527	CCG	2	6	226628	226633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000931
6070	NC_017527	GGC	2	6	226665	226670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000931
6071	NC_017527	AG	3	6	226671	226676	50 %	0 %	50 %	0 %	386000931
6072	NC_017527	GTC	2	6	226690	226695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000931
6073	NC_017527	CGA	2	6	226701	226706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000931
6074	NC_017527	CGA	2	6	226730	226735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000931
6075	NC_017527	GA	3	6	226749	226754	50 %	0 %	50 %	0 %	386000931
6076	NC_017527	TCG	2	6	226763	226768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000931
6077	NC_017527	CGG	2	6	226781	226786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000931
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6079	NC_017527	TCG	2	6	226869	226874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000932
6080	NC_017527	CGG	2	6	226885	226890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000932
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6082	NC_017527	GGA	2	6	226915	226920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000932
6083	NC_017527	CGT	2	6	226942	226947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000932
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6085	NC_017527	GTC	2	6	226997	227002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000932
6086	NC_017527	CCT	2	6	227053	227058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000932
6087	NC_017527	TCA	2	6	227079	227084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000932
6088	NC_017527	GTC	2	6	227168	227173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000932
6089	NC_017527	CCT	2	6	227184	227189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000932
6090	NC_017527	CGG	3	9	227193	227201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000932
6091	NC_017527	TCA	2	6	227241	227246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000932
6092	NC_017527	GCGG	2	8	227293	227300	0 %	0 %	75 %	25 %	386000932
6093	NC_017527	AGG	3	9	227345	227353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000932
6094	NC_017527	GGC	2	6	227393	227398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000932
6095	NC_017527	TGG	2	6	227418	227423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000932
6096	NC_017527	TGG	2	6	227456	227461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000932
6097	NC_017527	ACG	2	6	227462	227467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000932
6098	NC_017527	GAGG	2	8	227485	227492	25 %	0 %	75 %	0 %	386000932
6099	NC_017527	CTC	2	6	227522	227527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000932
6100	NC_017527	ATC	2	6	227528	227533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000932
6101	NC_017527	GGAGG	2	10	227534	227543	20 %	0 %	80 %	0 %	386000932
6102	NC_017527	TGGGA	2	10	227564	227573	20 %	20 %	60 %	0 %	386000932
6103	NC_017527	GTG	2	6	227598	227603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000932
6104	NC_017527	AGG	2	6	227623	227628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000932
6105	NC_017527	CGC	2	6	227647	227652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000932
6106	NC_017527	TGG	2	6	227685	227690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000932
6107	NC_017527	CCT	3	9	227755	227763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000932
6108	NC_017527	GAG	2	6	227852	227857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000932
6109	NC_017527	GCG	3	9	227876	227884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000932
6110	NC_017527	GAG	2	6	227885	227890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000932
6111	NC_017527	CGGC	2	8	227892	227899	0 %	0 %	50 %	50 %	386000932
6112	NC_017527	G	7	7	227927	227933	0 %	0 %	100 %	0 %	386000932
6113	NC_017527	CCCG	2	8	227970	227977	0 %	0 %	25 %	75 %	386000932
6114	NC_017527	CGG	4	12	228012	228023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000932
6115	NC_017527	C	6	6	228036	228041	0 %	0 %	0 %	100 %	386000932
6116	NC_017527	CTC	2	6	228059	228064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000932
6117	NC_017527	CGG	2	6	228098	228103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000932
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6119	NC_017527	CGC	2	6	228172	228177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000932
6120	NC_017527	CTC	2	6	228178	228183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000932
6121	NC_017527	CGA	2	6	228232	228237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000932
6122	NC_017527	GGA	2	6	228339	228344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000932
6123	NC_017527	AAG	2	6	228420	228425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000933
6124	NC_017527	ACA	2	6	228469	228474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386000933
6125	NC_017527	AGC	2	6	228532	228537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000933
6126	NC_017527	CGC	3	9	228599	228607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000933
6127	NC_017527	CGC	2	6	228614	228619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000933
6128	NC_017527	GGC	2	6	228626	228631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000933
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6130	NC_017527	TCG	2	6	228643	228648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000933
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6132	NC_017527	CAT	2	6	228698	228703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000933
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6135	NC_017527	TCG	2	6	228802	228807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000933
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6137	NC_017527	G	6	6	228859	228864	0 %	0 %	100 %	0 %	386000933
6138	NC_017527	GCCC	2	8	228872	228879	0 %	0 %	25 %	75 %	386000933
6139	NC_017527	CGC	2	6	228911	228916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000933
6140	NC_017527	TCGCCG	2	12	228991	229002	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386000933
6141	NC_017527	G	8	8	229062	229069	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6142	NC_017527	CCA	2	6	229087	229092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6143	NC_017527	GAG	3	9	229125	229133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000934
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6145	NC_017527	GA	3	6	229193	229198	50 %	0 %	50 %	0 %	386000934
6146	NC_017527	GA	3	6	229208	229213	50 %	0 %	50 %	0 %	386000934
6147	NC_017527	ATCC	2	8	229229	229236	25 %	25 %	0 %	50 %	386000934
6148	NC_017527	CTC	2	6	229305	229310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000934
6149	NC_017527	CTC	2	6	229323	229328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000934
6150	NC_017527	CAC	2	6	229340	229345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000934
6151	NC_017527	GAC	2	6	229349	229354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000934
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6153	NC_017527	CGG	2	6	229426	229431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000934
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6160	NC_017527	TCG	2	6	229675	229680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000934
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6163	NC_017527	GAG	2	6	229782	229787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000934
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6165	NC_017527	GGCGA	2	10	229842	229851	20 %	0 %	60 %	20 %	386000934
6166	NC_017527	AG	3	6	229857	229862	50 %	0 %	50 %	0 %	386000934
6167	NC_017527	TCG	2	6	229921	229926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000934
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6171	NC_017527	AGGG	2	8	230088	230095	25 %	0 %	75 %	0 %	386000934
6172	NC_017527	CGA	2	6	230222	230227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000934
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6175	NC_017527	CCG	2	6	230358	230363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6176	NC_017527	AAG	2	6	230367	230372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6177	NC_017527	AG	3	6	230381	230386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6178	NC_017527	GAG	2	6	230410	230415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6179	NC_017527	TCG	2	6	230432	230437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000935
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6183	NC_017527	GTC	2	6	230614	230619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000935
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6186	NC_017527	GAG	2	6	230757	230762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000935
6187	NC_017527	TCG	2	6	230780	230785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000935
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6190	NC_017527	TCG	2	6	230819	230824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000935
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6200	NC_017527	CCG	2	6	231055	231060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6201	NC_017527	GGA	2	6	231062	231067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6202	NC_017527	CCT	2	6	231101	231106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6203	NC_017527	GAC	2	6	231180	231185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6486	NC_017527	TAG	2	6	242629	242634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6494	NC_017527	GGT	2	6	243057	243062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000945
6495	NC_017527	GGT	2	6	243105	243110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000945
6496	NC_017527	AGC	2	6	243135	243140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000945
6497	NC_017527	CCA	2	6	243167	243172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000945
6498	NC_017527	CTG	2	6	243223	243228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000945
6499	NC_017527	ATGT	2	8	243241	243248	25 %	50 %	25 %	0 %	386000945
6500	NC_017527	ATC	2	6	243286	243291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000945

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