MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017527	AAG	2	6	206043	206048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000908
5503	NC_017527	GAAC	2	8	206132	206139	50 %	0 %	25 %	25 %	386000908
5504	NC_017527	AAG	2	6	206145	206150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000908
5505	NC_017527	ACA	2	6	206203	206208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386000908
5506	NC_017527	GAA	2	6	206291	206296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000908
5507	NC_017527	CGAT	3	12	206312	206323	25 %	25 %	25 %	25 %	386000908
5508	NC_017527	GA	3	6	206338	206343	50 %	0 %	50 %	0 %	386000908
5509	NC_017527	CAG	2	6	206364	206369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000908
5510	NC_017527	AGC	2	6	206398	206403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000908
5511	NC_017527	CCGAG	2	10	206426	206435	20 %	0 %	40 %	40 %	386000908
5512	NC_017527	AGGA	2	8	206445	206452	50 %	0 %	50 %	0 %	386000908
5513	NC_017527	GAA	2	6	206462	206467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000908
5514	NC_017527	GA	3	6	206477	206482	50 %	0 %	50 %	0 %	386000908
5515	NC_017527	GAT	2	6	206579	206584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000908
5516	NC_017527	GCC	3	9	206616	206624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000908
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5518	NC_017527	AGC	2	6	206671	206676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000908
5519	NC_017527	TCA	2	6	206686	206691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000908
5520	NC_017527	AG	4	8	206698	206705	50 %	0 %	50 %	0 %	386000908
5521	NC_017527	ATC	2	6	206724	206729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000908
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5523	NC_017527	GGA	2	6	206762	206767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000908
5524	NC_017527	AGGA	2	8	206787	206794	50 %	0 %	50 %	0 %	386000908
5525	NC_017527	GAG	2	6	206799	206804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000908
5526	NC_017527	GA	3	6	206827	206832	50 %	0 %	50 %	0 %	386000908
5527	NC_017527	CCG	2	6	206842	206847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000908
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5530	NC_017527	G	8	8	206907	206914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017527	C	6	6	206921	206926	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5532	NC_017527	CGA	2	6	206968	206973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_017527	TCG	2	6	207030	207035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000909
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5536	NC_017527	GAG	2	6	207161	207166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000909
5537	NC_017527	CGCC	2	8	207169	207176	0 %	0 %	25 %	75 %	386000909
5538	NC_017527	CCG	2	6	207226	207231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000909
5539	NC_017527	G	6	6	207231	207236	0 %	0 %	100 %	0 %	386000909
5540	NC_017527	G	6	6	207260	207265	0 %	0 %	100 %	0 %	386000909
5541	NC_017527	CTC	2	6	207313	207318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000909
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5549	NC_017527	CGC	2	6	207517	207522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000909
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5552	NC_017527	TCG	2	6	207642	207647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000909
5553	NC_017527	G	7	7	207680	207686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017527	AT	3	6	207715	207720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017527	CTTC	2	8	207734	207741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_017527	CCCT	2	8	207748	207755	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5557	NC_017527	C	7	7	207774	207780	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5558	NC_017527	AACC	2	8	207814	207821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_017527	GCG	2	6	207886	207891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000910
5560	NC_017527	GAGG	2	8	207894	207901	25 %	0 %	75 %	0 %	386000910
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5563	NC_017527	ACGCC	2	10	207960	207969	20 %	0 %	20 %	60 %	386000910
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5574	NC_017527	CG	3	6	208476	208481	0 %	0 %	50 %	50 %	386000911
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5581	NC_017527	CGG	2	6	208616	208621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000911
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5603	NC_017527	AG	3	6	209150	209155	50 %	0 %	50 %	0 %	386000912
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5624	NC_017527	GTA	2	6	209945	209950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000913
5625	NC_017527	GAC	2	6	209969	209974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000913
5626	NC_017527	GAGG	2	8	210008	210015	25 %	0 %	75 %	0 %	386000913
5627	NC_017527	CTC	2	6	210095	210100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000913
5628	NC_017527	GCC	2	6	210177	210182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000913
5629	NC_017527	CAC	2	6	210185	210190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000913
5630	NC_017527	GGA	2	6	210229	210234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000913
5631	NC_017527	CGA	2	6	210328	210333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000913
5632	NC_017527	GCC	2	6	210345	210350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000913
5633	NC_017527	GA	4	8	210401	210408	50 %	0 %	50 %	0 %	386000913
5634	NC_017527	C	7	7	210446	210452	0 %	0 %	0 %	100 %	386000913
5635	NC_017527	CGG	2	6	210472	210477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000913
5636	NC_017527	GCG	2	6	210485	210490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000913
5637	NC_017527	ATC	2	6	210492	210497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000913
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5641	NC_017527	TCT	2	6	210751	210756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000913
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5645	NC_017527	TCCT	2	8	210804	210811	0 %	50 %	0 %	50 %	386000913
5646	NC_017527	GGCCC	2	10	210812	210821	0 %	0 %	40 %	60 %	386000913
5647	NC_017527	GGAT	2	8	210841	210848	25 %	25 %	50 %	0 %	386000913
5648	NC_017527	CAG	2	6	210863	210868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000913
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5651	NC_017527	GA	3	6	210966	210971	50 %	0 %	50 %	0 %	386000913
5652	NC_017527	GAG	2	6	210985	210990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000913
5653	NC_017527	GA	3	6	211017	211022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_017527	GAT	2	6	211156	211161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000914
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5657	NC_017527	CCGGA	2	10	211199	211208	20 %	0 %	40 %	40 %	386000914
5658	NC_017527	CCG	2	6	211214	211219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000914
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5660	NC_017527	TCG	2	6	211251	211256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000914
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5662	NC_017527	CCCCGG	2	12	211284	211295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000914
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5665	NC_017527	C	7	7	211414	211420	0 %	0 %	0 %	100 %	386000914
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5674	NC_017527	GCC	3	9	211703	211711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000914
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5677	NC_017527	GCG	2	6	211921	211926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5678	NC_017527	CG	3	6	211930	211935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5679	NC_017527	CT	3	6	212007	212012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5680	NC_017527	GAC	2	6	212039	212044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5682	NC_017527	ACA	2	6	212166	212171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5683	NC_017527	AGA	2	6	212217	212222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5684	NC_017527	CTT	3	9	212253	212261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5685	NC_017527	GGCCC	2	10	212285	212294	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5686	NC_017527	CAG	2	6	212299	212304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5687	NC_017527	GGGCG	2	10	212318	212327	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5688	NC_017527	CGG	2	6	212336	212341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5721	NC_017527	A	8	8	213598	213605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5722	NC_017527	CGT	2	6	213639	213644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5726	NC_017527	ATCGC	2	10	213842	213851	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5727	NC_017527	GAT	2	6	213959	213964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000916
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5732	NC_017527	ATA	2	6	214217	214222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386000916
5733	NC_017527	A	6	6	214298	214303	100 %	0 %	0 %	0 %	386000916
5734	NC_017527	CAG	2	6	214324	214329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000916
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5737	NC_017527	AAG	2	6	214427	214432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5738	NC_017527	AG	3	6	214443	214448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5739	NC_017527	CGA	2	6	214500	214505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000917
5740	NC_017527	GCT	2	6	214602	214607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000917
5741	NC_017527	TGA	2	6	214631	214636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000917
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5743	NC_017527	AGATGG	2	12	214715	214726	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386000918
5744	NC_017527	AAGAC	2	10	214745	214754	60 %	0 %	20 %	20 %	386000918
5745	NC_017527	ATGG	2	8	214774	214781	25 %	25 %	50 %	0 %	386000918
5746	NC_017527	TCG	2	6	214793	214798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000918
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5997	NC_017527	CGC	2	6	224431	224436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000928
5998	NC_017527	TGA	2	6	224451	224456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000928
5999	NC_017527	G	6	6	224457	224462	0 %	0 %	100 %	0 %	386000928
6000	NC_017527	GAG	2	6	224474	224479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000928

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