MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017527	GAG	2	6	186858	186863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000887
5002	NC_017527	CGC	2	6	186906	186911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000887
5003	NC_017527	CCA	2	6	186923	186928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000887
5004	NC_017527	CCA	2	6	187013	187018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000887
5005	NC_017527	TTC	2	6	187023	187028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000887
5006	NC_017527	GCC	3	9	187054	187062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000887
5007	NC_017527	GCC	3	9	187074	187082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000887
5008	NC_017527	CT	3	6	187103	187108	0 %	50 %	0 %	50 %	386000887
5009	NC_017527	GCC	2	6	187132	187137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000887
5010	NC_017527	GCC	2	6	187158	187163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000887
5011	NC_017527	TCG	2	6	187258	187263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000887
5012	NC_017527	GTC	2	6	187284	187289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000887
5013	NC_017527	TC	3	6	187295	187300	0 %	50 %	0 %	50 %	386000887
5014	NC_017527	GCC	2	6	187303	187308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000887
5015	NC_017527	C	8	8	187337	187344	0 %	0 %	0 %	100 %	386000887
5016	NC_017527	CCG	2	6	187370	187375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000887
5017	NC_017527	CCG	2	6	187391	187396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000887
5018	NC_017527	GTC	2	6	187413	187418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000887
5019	NC_017527	TCC	2	6	187502	187507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000887
5020	NC_017527	GGC	2	6	187524	187529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000887
5021	NC_017527	GCC	2	6	187573	187578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000887
5022	NC_017527	AGA	2	6	187604	187609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000887
5023	NC_017527	ATCC	2	8	187617	187624	25 %	25 %	0 %	50 %	386000887
5024	NC_017527	CTC	2	6	187641	187646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000887
5025	NC_017527	GTA	2	6	187671	187676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000887
5026	NC_017527	CTG	2	6	187707	187712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000887
5027	NC_017527	CGA	2	6	187724	187729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000887
5028	NC_017527	GTT	2	6	187752	187757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386000887
5029	NC_017527	CGA	2	6	187772	187777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000887
5030	NC_017527	GAG	2	6	187833	187838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000887
5031	NC_017527	ACC	2	6	187864	187869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000887
5032	NC_017527	TCTCC	2	10	187946	187955	0 %	40 %	0 %	60 %	386000887
5033	NC_017527	CTT	2	6	187956	187961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000887
5034	NC_017527	TCA	2	6	187979	187984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000887
5035	NC_017527	CGC	2	6	188076	188081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000888
5036	NC_017527	GAC	2	6	188083	188088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000888
5037	NC_017527	GGTC	2	8	188178	188185	0 %	25 %	50 %	25 %	386000888
5038	NC_017527	CCTTCG	2	12	188232	188243	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386000888
5039	NC_017527	C	7	7	188260	188266	0 %	0 %	0 %	100 %	386000888
5040	NC_017527	GGA	2	6	188286	188291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000888
5041	NC_017527	CCT	2	6	188328	188333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000888
5042	NC_017527	GTC	2	6	188398	188403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000888
5043	NC_017527	CCT	3	9	188418	188426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000888
5044	NC_017527	ATC	2	6	188510	188515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000888
5045	NC_017527	CGA	2	6	188583	188588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000888
5046	NC_017527	CCA	2	6	188658	188663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000888
5047	NC_017527	AT	3	6	188697	188702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017527	ATCG	2	8	188753	188760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_017527	TCT	2	6	188791	188796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017527	GGT	2	6	188866	188871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017527	GGC	2	6	188932	188937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_017527	ACT	2	6	188994	188999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000889
5053	NC_017527	ACG	2	6	189000	189005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000889
5054	NC_017527	CCGA	2	8	189059	189066	25 %	0 %	25 %	50 %	386000889
5055	NC_017527	AT	4	8	189135	189142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017527	GAA	2	6	189224	189229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017527	GC	3	6	189337	189342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_017527	CGT	2	6	189351	189356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_017527	CTT	2	6	189358	189363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_017527	GAT	2	6	189369	189374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017527	CAC	2	6	189416	189421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000890
5062	NC_017527	GAA	2	6	189452	189457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000890
5063	NC_017527	CTG	2	6	189480	189485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000890
5064	NC_017527	TA	3	6	189617	189622	50 %	50 %	0 %	0 %	386000890
5065	NC_017527	ATC	2	6	189628	189633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000890
5066	NC_017527	AT	4	8	189659	189666	50 %	50 %	0 %	0 %	386000890
5067	NC_017527	AG	3	6	189738	189743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017527	GAG	2	6	189854	189859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000891
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5070	NC_017527	CTA	2	6	189925	189930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000891
5071	NC_017527	CGA	2	6	189931	189936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000891
5072	NC_017527	GAG	2	6	189956	189961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000891
5073	NC_017527	GGC	2	6	189988	189993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000891
5074	NC_017527	GGGCG	2	10	190015	190024	0 %	0 %	80 %	20 %	386000891
5075	NC_017527	TGC	2	6	190035	190040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000891
5076	NC_017527	CCGT	2	8	190065	190072	0 %	25 %	25 %	50 %	386000891
5077	NC_017527	CAGC	2	8	190102	190109	25 %	0 %	25 %	50 %	386000891
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5082	NC_017527	AG	3	6	190294	190299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017527	CAGG	2	8	190371	190378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_017527	CTA	2	6	190411	190416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_017527	CCA	2	6	190432	190437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_017527	CCA	2	6	190494	190499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_017527	TAC	2	6	190511	190516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_017527	TTG	2	6	190572	190577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017527	ATT	2	6	190587	190592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017527	TA	3	6	190604	190609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017527	GAG	2	6	190673	190678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017527	CGT	2	6	190734	190739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017527	GA	3	6	190749	190754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017527	CGA	2	6	190785	190790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_017527	CGC	2	6	190808	190813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_017527	GATC	2	8	190906	190913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_017527	CCCAG	2	10	190972	190981	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5098	NC_017527	TGA	2	6	190984	190989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017527	GAG	2	6	190998	191003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017527	ATC	2	6	191017	191022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017527	GAGAG	2	10	191026	191035	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017527	CCAG	2	8	191083	191090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_017527	GAA	2	6	191276	191281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017527	TGGG	2	8	191325	191332	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017527	GAGCT	2	10	191352	191361	20 %	20 %	40 %	20 %	386000892
5106	NC_017527	AGA	2	6	191363	191368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000892
5107	NC_017527	TAC	2	6	191457	191462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000892
5108	NC_017527	GAC	2	6	191466	191471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000892
5109	NC_017527	GGA	2	6	191508	191513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000892
5110	NC_017527	CCG	2	6	191584	191589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_017527	AGC	2	6	191596	191601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_017527	GGA	2	6	191634	191639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017527	ATGA	2	8	191646	191653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017527	CGA	2	6	191705	191710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017527	GCA	2	6	191728	191733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_017527	GAG	2	6	191769	191774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017527	GCG	2	6	191777	191782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_017527	GAG	2	6	191795	191800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017527	GAA	2	6	191921	191926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017527	TGG	2	6	191954	191959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017527	ATG	2	6	191968	191973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017527	GAG	2	6	192059	192064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017527	AGG	2	6	192118	192123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017527	GGA	3	9	192165	192173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017527	TCC	2	6	192186	192191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_017527	AT	3	6	192203	192208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017527	CAC	2	6	192305	192310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000893
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5141	NC_017527	GCG	2	6	192627	192632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000893
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5371	NC_017527	CTT	2	6	200394	200399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000903
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5415	NC_017527	GA	3	6	202563	202568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5468	NC_017527	ATCGGC	2	12	204695	204706	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386000907
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5489	NC_017527	C	6	6	205457	205462	0 %	0 %	0 %	100 %	386000907
5490	NC_017527	TCCT	2	8	205494	205501	0 %	50 %	0 %	50 %	386000907
5491	NC_017527	CTC	2	6	205549	205554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000907
5492	NC_017527	TC	3	6	205630	205635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5493	NC_017527	CAC	2	6	205651	205656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5494	NC_017527	G	6	6	205683	205688	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_017527	GAGG	2	8	205706	205713	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_017527	GGC	2	6	205825	205830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5497	NC_017527	GAT	3	9	205860	205868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_017527	CCA	2	6	205905	205910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5499	NC_017527	TCGA	2	8	205918	205925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5500	NC_017527	AGG	2	6	206005	206010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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