MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017527	TCG	2	6	168551	168556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4502	NC_017527	C	6	6	168558	168563	0 %	0 %	0 %	100 %	386000869
4503	NC_017527	GGC	2	6	168574	168579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000869
4504	NC_017527	GAC	2	6	168598	168603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4505	NC_017527	CCTT	2	8	168632	168639	0 %	50 %	0 %	50 %	386000869
4506	NC_017527	GGC	2	6	168661	168666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000869
4507	NC_017527	GGC	2	6	168682	168687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000869
4508	NC_017527	GCA	2	6	168700	168705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4509	NC_017527	TCC	2	6	168788	168793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000869
4510	NC_017527	CCG	2	6	168830	168835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000869
4511	NC_017527	GAA	2	6	168863	168868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000869
4512	NC_017527	CTT	2	6	168987	168992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000869
4513	NC_017527	GTC	2	6	168997	169002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4514	NC_017527	GAGC	2	8	169167	169174	25 %	0 %	50 %	25 %	386000869
4515	NC_017527	TC	3	6	169196	169201	0 %	50 %	0 %	50 %	386000869
4516	NC_017527	CCA	2	6	169311	169316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000869
4517	NC_017527	GAAGA	2	10	169333	169342	60 %	0 %	40 %	0 %	386000869
4518	NC_017527	AGC	2	6	169403	169408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4519	NC_017527	TCG	2	6	169428	169433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4520	NC_017527	TCT	2	6	169437	169442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000869
4521	NC_017527	ATGC	2	8	169478	169485	25 %	25 %	25 %	25 %	386000869
4522	NC_017527	CAT	2	6	169491	169496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000869
4523	NC_017527	AG	3	6	169525	169530	50 %	0 %	50 %	0 %	386000869
4524	NC_017527	AT	3	6	169617	169622	50 %	50 %	0 %	0 %	386000869
4525	NC_017527	CTT	2	6	169639	169644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000869
4526	NC_017527	ACG	2	6	169676	169681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4527	NC_017527	TCG	2	6	169685	169690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4528	NC_017527	GTC	2	6	169712	169717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4529	NC_017527	AGC	2	6	170133	170138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4530	NC_017527	C	6	6	170154	170159	0 %	0 %	0 %	100 %	386000869
4531	NC_017527	GTA	2	6	170182	170187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000869
4532	NC_017527	AGGAG	2	10	170217	170226	40 %	0 %	60 %	0 %	386000869
4533	NC_017527	GCG	2	6	170261	170266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000869
4534	NC_017527	AGT	2	6	170343	170348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000869
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4536	NC_017527	GGA	2	6	170512	170517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000869
4537	NC_017527	GAC	2	6	170521	170526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000869
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4539	NC_017527	CAT	2	6	170545	170550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000869
4540	NC_017527	AGT	2	6	170598	170603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000869
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4542	NC_017527	GTA	2	6	170779	170784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000869
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4544	NC_017527	GGT	3	9	170868	170876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000869
4545	NC_017527	TAGG	2	8	170881	170888	25 %	25 %	50 %	0 %	386000869
4546	NC_017527	G	7	7	170887	170893	0 %	0 %	100 %	0 %	386000869
4547	NC_017527	GAG	3	9	170896	170904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000869
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4549	NC_017527	CGT	2	6	171018	171023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000869
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4551	NC_017527	GGT	2	6	171066	171071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000869
4552	NC_017527	GAG	2	6	171079	171084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000869
4553	NC_017527	TCCA	2	8	171134	171141	25 %	25 %	0 %	50 %	386000869
4554	NC_017527	CCG	2	6	171148	171153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000869
4555	NC_017527	CCG	2	6	171174	171179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000869
4556	NC_017527	CCT	3	9	171180	171188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000869
4557	NC_017527	GGA	2	6	171237	171242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000869
4558	NC_017527	GCT	2	6	171243	171248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4559	NC_017527	CAC	2	6	171250	171255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000869
4560	NC_017527	TCA	2	6	171273	171278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000869
4561	NC_017527	GGT	2	6	171289	171294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000869
4562	NC_017527	CTG	2	6	171340	171345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000869
4563	NC_017527	GAA	2	6	171412	171417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017527	C	6	6	171424	171429	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4565	NC_017527	CGA	2	6	171606	171611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_017527	C	6	6	171639	171644	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4567	NC_017527	CCG	2	6	171687	171692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_017527	CAT	2	6	171753	171758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000870
4569	NC_017527	CGTC	2	8	171759	171766	0 %	25 %	25 %	50 %	386000870
4570	NC_017527	CCG	2	6	171768	171773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000870
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4573	NC_017527	GTC	2	6	171860	171865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000870
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4584	NC_017527	GAT	2	6	172187	172192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000870
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4586	NC_017527	GAT	2	6	172280	172285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000870
4587	NC_017527	GCC	2	6	172349	172354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4588	NC_017527	GATC	2	8	172358	172365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4589	NC_017527	GCTCC	2	10	172373	172382	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4590	NC_017527	GGT	2	6	172455	172460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_017527	GAG	2	6	172509	172514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000871
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4593	NC_017527	CTG	2	6	172680	172685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000871
4594	NC_017527	CGG	2	6	172712	172717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000871
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4597	NC_017527	ATC	2	6	172881	172886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000871
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4600	NC_017527	GATCGA	2	12	172958	172969	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386000871
4601	NC_017527	A	6	6	173062	173067	100 %	0 %	0 %	0 %	386000872
4602	NC_017527	CCGGC	2	10	173097	173106	0 %	0 %	40 %	60 %	386000872
4603	NC_017527	G	6	6	173123	173128	0 %	0 %	100 %	0 %	386000872
4604	NC_017527	CGT	2	6	173248	173253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000872
4605	NC_017527	CGT	2	6	173269	173274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000872
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4608	NC_017527	CG	3	6	173374	173379	0 %	0 %	50 %	50 %	386000872
4609	NC_017527	TGG	2	6	173391	173396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000872
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4612	NC_017527	GCT	2	6	173478	173483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_017527	GATC	2	8	173575	173582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4614	NC_017527	ATT	2	6	173592	173597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_017527	AGG	2	6	173756	173761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000873
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4620	NC_017527	GGTA	2	8	173937	173944	25 %	25 %	50 %	0 %	386000873
4621	NC_017527	GCT	2	6	173962	173967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000873
4622	NC_017527	TCA	2	6	173996	174001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000873
4623	NC_017527	AGA	2	6	174024	174029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000873
4624	NC_017527	GCCC	2	8	174031	174038	0 %	0 %	25 %	75 %	386000873
4625	NC_017527	TCT	2	6	174099	174104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000873
4626	NC_017527	AGG	2	6	174113	174118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000873
4627	NC_017527	AGC	2	6	174365	174370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000873
4628	NC_017527	GCA	2	6	174400	174405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000873
4629	NC_017527	CGCC	2	8	174596	174603	0 %	0 %	25 %	75 %	386000873
4630	NC_017527	CTC	2	6	174610	174615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000873
4631	NC_017527	TGG	2	6	174662	174667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000873
4632	NC_017527	ACGA	2	8	174694	174701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4633	NC_017527	GGA	2	6	174718	174723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000874
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4635	NC_017527	GA	3	6	174767	174772	50 %	0 %	50 %	0 %	386000874
4636	NC_017527	CGG	2	6	174793	174798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000874
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4642	NC_017527	AAC	2	6	175026	175031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386000874
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4650	NC_017527	GCT	2	6	175411	175416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000874
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4652	NC_017527	GAAA	2	8	175430	175437	75 %	0 %	25 %	0 %	386000874
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4655	NC_017527	GCTG	2	8	175527	175534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4656	NC_017527	AGG	2	6	175538	175543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4657	NC_017527	GCA	2	6	175561	175566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4658	NC_017527	CGT	2	6	175630	175635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4659	NC_017527	CCG	2	6	175721	175726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000875
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4661	NC_017527	TGG	2	6	175773	175778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000875
4662	NC_017527	GTG	2	6	175796	175801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000875
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4733	NC_017527	CCG	2	6	178601	178606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000879
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4739	NC_017527	TCC	2	6	178772	178777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000879
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4988	NC_017527	GTA	2	6	186413	186418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000886
4989	NC_017527	G	6	6	186428	186433	0 %	0 %	100 %	0 %	386000886
4990	NC_017527	CCAT	2	8	186492	186499	25 %	25 %	0 %	50 %	386000886
4991	NC_017527	GAC	2	6	186512	186517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000886
4992	NC_017527	CGA	2	6	186556	186561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000886
4993	NC_017527	GGC	2	6	186672	186677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000886
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4996	NC_017527	CAGG	2	8	186740	186747	25 %	0 %	50 %	25 %	386000886
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4998	NC_017527	C	6	6	186800	186805	0 %	0 %	0 %	100 %	386000887
4999	NC_017527	CGA	2	6	186809	186814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000887
5000	NC_017527	TGG	2	6	186848	186853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000887

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