MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 11330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017524	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	385996773
2	NC_017524	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	385996773
3	NC_017524	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	385996773
4	NC_017524	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	385996773
5	NC_017524	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	385996773
6	NC_017524	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017524	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	385996774
8	NC_017524	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	385996774
9	NC_017524	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	385996774
10	NC_017524	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	385996774
11	NC_017524	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	385996774
12	NC_017524	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	385996774
13	NC_017524	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	385996775
14	NC_017524	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	385996775
15	NC_017524	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	385996775
16	NC_017524	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	385996775
17	NC_017524	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	385996777
18	NC_017524	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	385996777
19	NC_017524	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	385996777
20	NC_017524	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	385996777
21	NC_017524	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	385996777
22	NC_017524	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	385996778
23	NC_017524	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	385996778
24	NC_017524	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	385996778
25	NC_017524	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	385996778
26	NC_017524	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	385996778
27	NC_017524	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	385996778
28	NC_017524	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	385996779
29	NC_017524	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017524	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	385996780
31	NC_017524	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	385996780
32	NC_017524	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_017524	AACC	2	8	13338	13345	50 %	0 %	0 %	50 %	385996782
34	NC_017524	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	385996782
35	NC_017524	ATTC	2	8	13691	13698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017524	ACCC	2	8	14098	14105	25 %	0 %	0 %	75 %	385996784
37	NC_017524	TGAT	2	8	14135	14142	25 %	50 %	25 %	0 %	385996784
38	NC_017524	TGCT	2	8	14182	14189	0 %	50 %	25 %	25 %	385996784
39	NC_017524	GCCC	2	8	14669	14676	0 %	0 %	25 %	75 %	385996784
40	NC_017524	GGGC	2	8	15450	15457	0 %	0 %	75 %	25 %	385996785
41	NC_017524	CTGA	2	8	15905	15912	25 %	25 %	25 %	25 %	385996786
42	NC_017524	TGGC	2	8	16048	16055	0 %	25 %	50 %	25 %	385996786
43	NC_017524	GCTT	2	8	16107	16114	0 %	50 %	25 %	25 %	385996786
44	NC_017524	CAGT	2	8	16135	16142	25 %	25 %	25 %	25 %	385996786
45	NC_017524	CGGT	2	8	16506	16513	0 %	25 %	50 %	25 %	385996786
46	NC_017524	GCCG	2	8	16565	16572	0 %	0 %	50 %	50 %	385996786
47	NC_017524	CGGG	2	8	17800	17807	0 %	0 %	75 %	25 %	385996787
48	NC_017524	CTGG	2	8	17908	17915	0 %	25 %	50 %	25 %	385996787
49	NC_017524	GTGC	2	8	18408	18415	0 %	25 %	50 %	25 %	385996787
50	NC_017524	GCCG	2	8	18426	18433	0 %	0 %	50 %	50 %	385996787
51	NC_017524	CCGC	2	8	18791	18798	0 %	0 %	25 %	75 %	385996788
52	NC_017524	GCCG	2	8	20255	20262	0 %	0 %	50 %	50 %	385996789
53	NC_017524	CCAG	2	8	20743	20750	25 %	0 %	25 %	50 %	385996789
54	NC_017524	CACC	2	8	20926	20933	25 %	0 %	0 %	75 %	385996789
55	NC_017524	CGGG	2	8	21882	21889	0 %	0 %	75 %	25 %	385996790
56	NC_017524	GCCG	2	8	21973	21980	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
57	NC_017524	GCTG	2	8	22353	22360	0 %	25 %	50 %	25 %	385996790
58	NC_017524	CGGC	2	8	22373	22380	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
59	NC_017524	GCCG	2	8	23044	23051	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
60	NC_017524	CCCA	2	8	23056	23063	25 %	0 %	0 %	75 %	385996790
61	NC_017524	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	385996792
62	NC_017524	CGGC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	50 %	50 %	385996792
63	NC_017524	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	385996792
64	NC_017524	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	385996792
65	NC_017524	TCAA	2	8	25514	25521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017524	GAGC	2	8	25542	25549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017524	GGCC	2	8	25556	25563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017524	GCTC	2	8	26505	26512	0 %	25 %	25 %	50 %	385996793
69	NC_017524	CCAA	2	8	26722	26729	50 %	0 %	0 %	50 %	385996793
70	NC_017524	CAGC	2	8	26788	26795	25 %	0 %	25 %	50 %	385996793
71	NC_017524	CGGC	2	8	27608	27615	0 %	0 %	50 %	50 %	385996795
72	NC_017524	CCGG	2	8	28094	28101	0 %	0 %	50 %	50 %	385996795
73	NC_017524	GCTC	2	8	28650	28657	0 %	25 %	25 %	50 %	385996796
74	NC_017524	TGCG	2	8	28789	28796	0 %	25 %	50 %	25 %	385996796
75	NC_017524	CCGG	2	8	29054	29061	0 %	0 %	50 %	50 %	385996796
76	NC_017524	CGTC	2	8	29385	29392	0 %	25 %	25 %	50 %	385996797
77	NC_017524	CACG	2	8	29745	29752	25 %	0 %	25 %	50 %	385996798
78	NC_017524	ACCG	2	8	29826	29833	25 %	0 %	25 %	50 %	385996798
79	NC_017524	CCGG	2	8	30145	30152	0 %	0 %	50 %	50 %	385996798
80	NC_017524	GTCG	2	8	30321	30328	0 %	25 %	50 %	25 %	385996798
81	NC_017524	CCCG	2	8	30943	30950	0 %	0 %	25 %	75 %	385996798
82	NC_017524	ACCA	2	8	31124	31131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017524	CGAG	2	8	31455	31462	25 %	0 %	50 %	25 %	385996799
84	NC_017524	CGAC	2	8	31752	31759	25 %	0 %	25 %	50 %	385996800
85	NC_017524	GCCG	2	8	32479	32486	0 %	0 %	50 %	50 %	385996801
86	NC_017524	CCGA	2	8	33468	33475	25 %	0 %	25 %	50 %	385996802
87	NC_017524	GCTA	2	8	33855	33862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017524	GGCC	2	8	34603	34610	0 %	0 %	50 %	50 %	385996803
89	NC_017524	ATCG	2	8	35096	35103	25 %	25 %	25 %	25 %	385996803
90	NC_017524	GATC	2	8	35434	35441	25 %	25 %	25 %	25 %	385996803
91	NC_017524	CCAC	2	8	36255	36262	25 %	0 %	0 %	75 %	385996803
92	NC_017524	ACCG	2	8	36650	36657	25 %	0 %	25 %	50 %	385996804
93	NC_017524	CTGG	2	8	36994	37001	0 %	25 %	50 %	25 %	385996805
94	NC_017524	GCAT	2	8	37389	37396	25 %	25 %	25 %	25 %	385996806
95	NC_017524	GCTG	2	8	37903	37910	0 %	25 %	50 %	25 %	385996806
96	NC_017524	AACG	2	8	38658	38665	50 %	0 %	25 %	25 %	385996806
97	NC_017524	CCGA	2	8	38719	38726	25 %	0 %	25 %	50 %	385996806
98	NC_017524	CCAC	2	8	38875	38882	25 %	0 %	0 %	75 %	385996806
99	NC_017524	CAGC	2	8	39102	39109	25 %	0 %	25 %	50 %	385996807
100	NC_017524	CCGG	2	8	39598	39605	0 %	0 %	50 %	50 %	385996807
101	NC_017524	GGCC	2	8	40129	40136	0 %	0 %	50 %	50 %	385996808
102	NC_017524	CGAT	2	8	40579	40586	25 %	25 %	25 %	25 %	385996808
103	NC_017524	GCCG	2	8	40879	40886	0 %	0 %	50 %	50 %	385996808
104	NC_017524	CACC	2	8	40904	40911	25 %	0 %	0 %	75 %	385996808
105	NC_017524	ACCG	2	8	41127	41134	25 %	0 %	25 %	50 %	385996808
106	NC_017524	GCGT	2	8	41153	41160	0 %	25 %	50 %	25 %	385996808
107	NC_017524	CCAC	2	8	41882	41889	25 %	0 %	0 %	75 %	385996809
108	NC_017524	CGAT	2	8	41891	41898	25 %	25 %	25 %	25 %	385996809
109	NC_017524	GGCC	2	8	42587	42594	0 %	0 %	50 %	50 %	385996811
110	NC_017524	CCCG	2	8	43178	43185	0 %	0 %	25 %	75 %	385996811
111	NC_017524	CGGG	2	8	43207	43214	0 %	0 %	75 %	25 %	385996811
112	NC_017524	CGAC	2	8	43846	43853	25 %	0 %	25 %	50 %	385996812
113	NC_017524	GAGC	2	8	44226	44233	25 %	0 %	50 %	25 %	385996812
114	NC_017524	GGGC	2	8	45385	45392	0 %	0 %	75 %	25 %	385996812
115	NC_017524	CGGC	2	8	45480	45487	0 %	0 %	50 %	50 %	385996812
116	NC_017524	GCCG	2	8	46443	46450	0 %	0 %	50 %	50 %	385996812
117	NC_017524	TTGC	2	8	46607	46614	0 %	50 %	25 %	25 %	385996813
118	NC_017524	CCGC	2	8	46755	46762	0 %	0 %	25 %	75 %	385996813
119	NC_017524	CCGC	2	8	46788	46795	0 %	0 %	25 %	75 %	385996813
120	NC_017524	GGTC	2	8	46896	46903	0 %	25 %	50 %	25 %	385996813
121	NC_017524	CTAC	2	8	47220	47227	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017524	CGGG	2	8	47447	47454	0 %	0 %	75 %	25 %	385996814
123	NC_017524	GCAG	2	8	47520	47527	25 %	0 %	50 %	25 %	385996814
124	NC_017524	GTGC	2	8	48420	48427	0 %	25 %	50 %	25 %	385996815
125	NC_017524	GCCG	2	8	48704	48711	0 %	0 %	50 %	50 %	385996815
126	NC_017524	CAGC	2	8	49889	49896	25 %	0 %	25 %	50 %	385996816
127	NC_017524	CGGG	2	8	50078	50085	0 %	0 %	75 %	25 %	385996817
128	NC_017524	GCCG	2	8	50178	50185	0 %	0 %	50 %	50 %	385996817
129	NC_017524	GGTG	2	8	50501	50508	0 %	25 %	75 %	0 %	385996817
130	NC_017524	CTCA	2	8	51117	51124	25 %	25 %	0 %	50 %	385996817
131	NC_017524	CGCT	2	8	51256	51263	0 %	25 %	25 %	50 %	385996818
132	NC_017524	GGTA	2	8	52122	52129	25 %	25 %	50 %	0 %	385996819
133	NC_017524	CTGG	2	8	52717	52724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017524	GCCG	2	8	53571	53578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017524	ACCA	2	8	53742	53749	50 %	0 %	0 %	50 %	385996821
136	NC_017524	GTGC	2	8	54627	54634	0 %	25 %	50 %	25 %	385996821
137	NC_017524	ACCG	2	8	55505	55512	25 %	0 %	25 %	50 %	385996821
138	NC_017524	CCCG	2	8	55667	55674	0 %	0 %	25 %	75 %	385996821
139	NC_017524	GGCC	2	8	56341	56348	0 %	0 %	50 %	50 %	385996822
140	NC_017524	CGCT	2	8	57068	57075	0 %	25 %	25 %	50 %	385996822
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