MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 109291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017524	GCA	2	6	185803	185808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996930
4502	NC_017524	GGA	2	6	185836	185841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996930
4503	NC_017524	GCCG	2	8	185879	185886	0 %	0 %	50 %	50 %	385996930
4504	NC_017524	TGC	2	6	185907	185912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996930
4505	NC_017524	GGCCGA	2	12	185914	185925	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385996930
4506	NC_017524	ACG	2	6	185934	185939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996930
4507	NC_017524	GAC	2	6	185954	185959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996930
4508	NC_017524	ACG	2	6	185964	185969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996930
4509	NC_017524	ACG	2	6	186009	186014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996930
4510	NC_017524	CGG	2	6	186024	186029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996930
4511	NC_017524	CAC	2	6	186166	186171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996930
4512	NC_017524	TGT	2	6	186174	186179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996930
4513	NC_017524	GAA	2	6	186190	186195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996930
4514	NC_017524	GC	3	6	186235	186240	0 %	0 %	50 %	50 %	385996930
4515	NC_017524	CGG	3	9	186269	186277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_017524	GAA	3	9	186326	186334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_017524	TCG	2	6	186342	186347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_017524	CGT	2	6	186352	186357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_017524	CGC	2	6	186450	186455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_017524	AAC	2	6	186469	186474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_017524	TTGA	2	8	186478	186485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_017524	CGA	2	6	186523	186528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_017524	GCC	2	6	186572	186577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996931
4524	NC_017524	GAG	2	6	186580	186585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996931
4525	NC_017524	GCTG	2	8	186588	186595	0 %	25 %	50 %	25 %	385996931
4526	NC_017524	CCA	2	6	186599	186604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996931
4527	NC_017524	GC	3	6	186616	186621	0 %	0 %	50 %	50 %	385996931
4528	NC_017524	GAC	2	6	186643	186648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996931
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4530	NC_017524	ACT	2	6	186689	186694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996931
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4533	NC_017524	ACG	2	6	186764	186769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996931
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4541	NC_017524	CGG	2	6	187094	187099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996931
4542	NC_017524	CTG	2	6	187114	187119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996931
4543	NC_017524	CGA	2	6	187134	187139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996931
4544	NC_017524	GGAA	2	8	187172	187179	50 %	0 %	50 %	0 %	385996931
4545	NC_017524	AATC	2	8	187204	187211	50 %	25 %	0 %	25 %	385996932
4546	NC_017524	GATACG	2	12	187305	187316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385996932
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4549	NC_017524	CGTAGC	2	12	187458	187469	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385996932
4550	NC_017524	GTA	2	6	187588	187593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996932
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4552	NC_017524	CGT	2	6	187752	187757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996932
4553	NC_017524	CGC	2	6	187863	187868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996932
4554	NC_017524	AGCC	2	8	187903	187910	25 %	0 %	25 %	50 %	385996932
4555	NC_017524	GGT	2	6	187934	187939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996932
4556	NC_017524	ACG	3	9	188000	188008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996932
4557	NC_017524	GTT	2	6	188041	188046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996932
4558	NC_017524	CAG	2	6	188047	188052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996932
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4560	NC_017524	GTT	2	6	188137	188142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996932
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4562	NC_017524	CAT	2	6	188224	188229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996932
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4570	NC_017524	CGA	2	6	188449	188454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996932
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4572	NC_017524	CAG	2	6	188476	188481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996932
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4575	NC_017524	CCG	2	6	188641	188646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_017524	TCA	2	6	188740	188745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996933
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4578	NC_017524	CAAT	2	8	188842	188849	50 %	25 %	0 %	25 %	385996933
4579	NC_017524	CCGG	2	8	188952	188959	0 %	0 %	50 %	50 %	385996933
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4586	NC_017524	GC	3	6	189386	189391	0 %	0 %	50 %	50 %	385996933
4587	NC_017524	CAG	2	6	189392	189397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996933
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4593	NC_017524	GTTG	2	8	189550	189557	0 %	50 %	50 %	0 %	385996933
4594	NC_017524	CGG	2	6	189562	189567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996933
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4605	NC_017524	GCC	2	6	190038	190043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996933
4606	NC_017524	GCC	2	6	190047	190052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996933
4607	NC_017524	GCCG	2	8	190064	190071	0 %	0 %	50 %	50 %	385996933
4608	NC_017524	CAG	2	6	190076	190081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996933
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4612	NC_017524	GGCC	2	8	190425	190432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4613	NC_017524	GC	3	6	190472	190477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_017524	CGGCT	2	10	190488	190497	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4617	NC_017524	TGG	2	6	190574	190579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017524	ACG	3	9	190598	190606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_017524	TGC	2	6	190607	190612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_017524	CGT	2	6	190632	190637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_017524	GCA	2	6	190701	190706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_017524	CGC	2	6	190707	190712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_017524	GGCTG	2	10	190719	190728	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4624	NC_017524	CGA	2	6	190784	190789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_017524	CGG	2	6	190794	190799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_017524	ACGGT	2	10	190865	190874	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4627	NC_017524	ACA	2	6	190904	190909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_017524	TCG	2	6	190934	190939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4630	NC_017524	GCCG	2	8	191052	191059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4631	NC_017524	ATTG	2	8	191096	191103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_017524	GCC	2	6	191112	191117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4633	NC_017524	C	7	7	191147	191153	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4634	NC_017524	TGG	2	6	191176	191181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4642	NC_017524	TGT	2	6	191449	191454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4646	NC_017524	ACG	2	6	191632	191637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4745	NC_017524	GACC	2	8	196226	196233	25 %	0 %	25 %	50 %	385996938
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4869	NC_017524	GCC	2	6	202021	202026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996943
4870	NC_017524	AGG	2	6	202059	202064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996943
4871	NC_017524	C	6	6	202067	202072	0 %	0 %	0 %	100 %	385996943
4872	NC_017524	GCAC	2	8	202076	202083	25 %	0 %	25 %	50 %	385996943
4873	NC_017524	CGG	2	6	202122	202127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996943
4874	NC_017524	CAC	2	6	202143	202148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996943
4875	NC_017524	TCA	2	6	202179	202184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996943
4876	NC_017524	CGG	2	6	202189	202194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996943
4877	NC_017524	CGG	2	6	202198	202203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996943
4878	NC_017524	TGG	3	9	202304	202312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996944
4879	NC_017524	GCTGGC	2	12	202314	202325	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385996944
4880	NC_017524	TTG	2	6	202334	202339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996944
4881	NC_017524	AAC	2	6	202366	202371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996944
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4883	NC_017524	CGGT	2	8	202442	202449	0 %	25 %	50 %	25 %	385996944
4884	NC_017524	TCGA	2	8	202450	202457	25 %	25 %	25 %	25 %	385996944
4885	NC_017524	TGCC	2	8	202520	202527	0 %	25 %	25 %	50 %	385996944
4886	NC_017524	TGG	2	6	202559	202564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996944
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4889	NC_017524	AGC	2	6	202721	202726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996944
4890	NC_017524	CTT	2	6	202854	202859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996944
4891	NC_017524	GGT	2	6	202863	202868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996944
4892	NC_017524	GAC	2	6	202906	202911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996944
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4894	NC_017524	CGT	2	6	203019	203024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996944
4895	NC_017524	TTC	2	6	203032	203037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996944
4896	NC_017524	AAT	2	6	203071	203076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385996944
4897	NC_017524	ACC	2	6	203089	203094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996944
4898	NC_017524	TGC	2	6	203099	203104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996944
4899	NC_017524	GGC	2	6	203157	203162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996944
4900	NC_017524	AC	3	6	203188	203193	50 %	0 %	0 %	50 %	385996944
4901	NC_017524	GTG	2	6	203200	203205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996944
4902	NC_017524	ACT	2	6	203348	203353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996944
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4904	NC_017524	GTG	2	6	203518	203523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996944
4905	NC_017524	GGT	2	6	203602	203607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996944
4906	NC_017524	CGT	2	6	203624	203629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996944
4907	NC_017524	CCCG	2	8	203643	203650	0 %	0 %	25 %	75 %	385996944
4908	NC_017524	ACG	2	6	203666	203671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996944
4909	NC_017524	TGC	2	6	203681	203686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996944
4910	NC_017524	ACC	2	6	203721	203726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996944
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4912	NC_017524	AGG	2	6	203808	203813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996944
4913	NC_017524	ATG	2	6	203820	203825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996944
4914	NC_017524	CGG	2	6	203945	203950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996945
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4917	NC_017524	CG	3	6	204060	204065	0 %	0 %	50 %	50 %	385996945
4918	NC_017524	GAA	2	6	204074	204079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996945
4919	NC_017524	ACGCTG	2	12	204090	204101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385996945
4920	NC_017524	GAA	2	6	204107	204112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996945
4921	NC_017524	CTG	2	6	204162	204167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996945
4922	NC_017524	GCA	2	6	204173	204178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996945
4923	NC_017524	GCCGC	2	10	204189	204198	0 %	0 %	40 %	60 %	385996945
4924	NC_017524	CTC	2	6	204251	204256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996945
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4928	NC_017524	GCGG	2	8	204368	204375	0 %	0 %	75 %	25 %	385996945
4929	NC_017524	CGA	2	6	204416	204421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996945
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4932	NC_017524	CCG	2	6	204610	204615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996945
4933	NC_017524	TGG	2	6	204709	204714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996945
4934	NC_017524	GACCT	2	10	204807	204816	20 %	20 %	20 %	40 %	385996945
4935	NC_017524	GC	3	6	204869	204874	0 %	0 %	50 %	50 %	385996945
4936	NC_017524	AC	3	6	204928	204933	50 %	0 %	0 %	50 %	385996945
4937	NC_017524	GGC	2	6	204954	204959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996945
4938	NC_017524	TCG	2	6	205047	205052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996946
4939	NC_017524	TAC	2	6	205064	205069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996946
4940	NC_017524	TGG	2	6	205086	205091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996946
4941	NC_017524	TCC	2	6	205349	205354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996946
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4943	NC_017524	CGA	2	6	205462	205467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996946
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4945	NC_017524	TCG	2	6	205533	205538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996946
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4951	NC_017524	TCC	2	6	205848	205853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996946
4952	NC_017524	TGC	2	6	205900	205905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996946
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4954	NC_017524	TTC	2	6	205959	205964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996946
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4956	NC_017524	GCG	2	6	206105	206110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996946
4957	NC_017524	GC	3	6	206210	206215	0 %	0 %	50 %	50 %	385996946
4958	NC_017524	CCG	2	6	206286	206291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996946
4959	NC_017524	CCG	2	6	206312	206317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996946
4960	NC_017524	GCA	2	6	206368	206373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996946
4961	NC_017524	CGG	2	6	206412	206417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996946
4962	NC_017524	TGG	2	6	206442	206447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996946
4963	NC_017524	GAC	2	6	206495	206500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996946
4964	NC_017524	GTC	3	9	206553	206561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4965	NC_017524	GGC	2	6	206574	206579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4966	NC_017524	CGG	2	6	206585	206590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4967	NC_017524	GGC	2	6	206631	206636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4968	NC_017524	CGG	2	6	206642	206647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4969	NC_017524	TCG	2	6	206696	206701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996947
4970	NC_017524	GCG	2	6	206703	206708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4971	NC_017524	GCG	2	6	206721	206726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4972	NC_017524	GGCT	2	8	206728	206735	0 %	25 %	50 %	25 %	385996947
4973	NC_017524	GCG	2	6	206746	206751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4974	NC_017524	GCT	2	6	206754	206759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996947
4975	NC_017524	TTGCG	2	10	206795	206804	0 %	40 %	40 %	20 %	385996947
4976	NC_017524	CAAT	2	8	206821	206828	50 %	25 %	0 %	25 %	385996947
4977	NC_017524	CG	4	8	206829	206836	0 %	0 %	50 %	50 %	385996947
4978	NC_017524	TTGCG	2	10	206868	206877	0 %	40 %	40 %	20 %	385996947
4979	NC_017524	AGA	2	6	206921	206926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996947
4980	NC_017524	CGT	2	6	206963	206968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996947
4981	NC_017524	TCG	2	6	206984	206989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996947
4982	NC_017524	GC	3	6	207033	207038	0 %	0 %	50 %	50 %	385996947
4983	NC_017524	CAA	3	9	207051	207059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996947
4984	NC_017524	GTCG	2	8	207066	207073	0 %	25 %	50 %	25 %	385996947
4985	NC_017524	TGG	2	6	207080	207085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996947
4986	NC_017524	GGT	3	9	207212	207220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996948
4987	NC_017524	ACC	2	6	207234	207239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996948
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4989	NC_017524	TGC	2	6	207307	207312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996948
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