MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 11351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017523	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	385993126
2	NC_017523	CGTT	2	8	526	533	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017523	CCCG	2	8	588	595	0 %	0 %	25 %	75 %	385993127
4	NC_017523	GGCA	2	8	659	666	25 %	0 %	50 %	25 %	385993127
5	NC_017523	CCCA	2	8	917	924	25 %	0 %	0 %	75 %	385993127
6	NC_017523	CCGA	2	8	1724	1731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017523	GTGG	2	8	2131	2138	0 %	25 %	75 %	0 %	385993128
8	NC_017523	GCCA	2	8	2149	2156	25 %	0 %	25 %	50 %	385993128
9	NC_017523	TCAG	2	8	2493	2500	25 %	25 %	25 %	25 %	385993128
10	NC_017523	CGTT	2	8	2719	2726	0 %	50 %	25 %	25 %	385993128
11	NC_017523	ACGG	2	8	3071	3078	25 %	0 %	50 %	25 %	385993128
12	NC_017523	GCCT	2	8	3133	3140	0 %	25 %	25 %	50 %	385993128
13	NC_017523	CGTC	2	8	3284	3291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017523	GGTA	2	8	3464	3471	25 %	25 %	50 %	0 %	385993129
15	NC_017523	GGTT	2	8	3646	3653	0 %	50 %	50 %	0 %	385993129
16	NC_017523	CCGC	2	8	3874	3881	0 %	0 %	25 %	75 %	385993129
17	NC_017523	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	385993131
18	NC_017523	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	385993131
19	NC_017523	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	385993131
20	NC_017523	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	385993131
21	NC_017523	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	385993131
22	NC_017523	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	385993132
23	NC_017523	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	385993132
24	NC_017523	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	385993132
25	NC_017523	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	385993132
26	NC_017523	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	385993132
27	NC_017523	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	385993132
28	NC_017523	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_017523	CCCG	2	8	10571	10578	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_017523	CCCG	2	8	11010	11017	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_017523	GCAC	2	8	12486	12493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017523	GAGC	2	8	12970	12977	25 %	0 %	50 %	25 %	385993134
33	NC_017523	CTCA	2	8	13181	13188	25 %	25 %	0 %	50 %	385993134
34	NC_017523	GCCC	2	8	13331	13338	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_017523	AACC	2	8	14216	14223	50 %	0 %	0 %	50 %	385993136
36	NC_017523	CCCG	2	8	14325	14332	0 %	0 %	25 %	75 %	385993136
37	NC_017523	ATTC	2	8	14569	14576	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017523	ACCC	2	8	14976	14983	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_017523	TGAT	2	8	15013	15020	25 %	50 %	25 %	0 %	385993137
40	NC_017523	TGCT	2	8	15060	15067	0 %	50 %	25 %	25 %	385993137
41	NC_017523	GCCC	2	8	15547	15554	0 %	0 %	25 %	75 %	385993137
42	NC_017523	GGGC	2	8	16328	16335	0 %	0 %	75 %	25 %	385993138
43	NC_017523	CTGA	2	8	16783	16790	25 %	25 %	25 %	25 %	385993139
44	NC_017523	TGGC	2	8	16926	16933	0 %	25 %	50 %	25 %	385993139
45	NC_017523	GCTT	2	8	16985	16992	0 %	50 %	25 %	25 %	385993139
46	NC_017523	CAGT	2	8	17013	17020	25 %	25 %	25 %	25 %	385993139
47	NC_017523	CGGT	2	8	17384	17391	0 %	25 %	50 %	25 %	385993139
48	NC_017523	GCCG	2	8	17443	17450	0 %	0 %	50 %	50 %	385993139
49	NC_017523	GCCG	2	8	18529	18536	0 %	0 %	50 %	50 %	385993140
50	NC_017523	CGGG	2	8	18678	18685	0 %	0 %	75 %	25 %	385993140
51	NC_017523	CTGG	2	8	18786	18793	0 %	25 %	50 %	25 %	385993140
52	NC_017523	GTGC	2	8	19286	19293	0 %	25 %	50 %	25 %	385993140
53	NC_017523	GCCG	2	8	19304	19311	0 %	0 %	50 %	50 %	385993140
54	NC_017523	CCGC	2	8	19669	19676	0 %	0 %	25 %	75 %	385993141
55	NC_017523	GCCG	2	8	21133	21140	0 %	0 %	50 %	50 %	385993142
56	NC_017523	CCAG	2	8	21621	21628	25 %	0 %	25 %	50 %	385993142
57	NC_017523	CACC	2	8	21804	21811	25 %	0 %	0 %	75 %	385993142
58	NC_017523	CGGG	2	8	22760	22767	0 %	0 %	75 %	25 %	385993143
59	NC_017523	GCCG	2	8	22851	22858	0 %	0 %	50 %	50 %	385993143
60	NC_017523	GCTG	2	8	23231	23238	0 %	25 %	50 %	25 %	385993143
61	NC_017523	CGGC	2	8	23251	23258	0 %	0 %	50 %	50 %	385993143
62	NC_017523	GCCG	2	8	23922	23929	0 %	0 %	50 %	50 %	385993143
63	NC_017523	CCCA	2	8	23934	23941	25 %	0 %	0 %	75 %	385993143
64	NC_017523	GCTG	2	8	25073	25080	0 %	25 %	50 %	25 %	385993145
65	NC_017523	CGGC	2	8	25121	25128	0 %	0 %	50 %	50 %	385993145
66	NC_017523	GCCG	2	8	25221	25228	0 %	0 %	50 %	50 %	385993145
67	NC_017523	CGGG	2	8	25296	25303	0 %	0 %	75 %	25 %	385993145
68	NC_017523	TCAA	2	8	26374	26381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017523	GAGC	2	8	26402	26409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017523	GGCC	2	8	26416	26423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017523	GCTC	2	8	27365	27372	0 %	25 %	25 %	50 %	385993146
72	NC_017523	CCAA	2	8	27582	27589	50 %	0 %	0 %	50 %	385993146
73	NC_017523	CAGC	2	8	27648	27655	25 %	0 %	25 %	50 %	385993146
74	NC_017523	CGGC	2	8	28468	28475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017523	CCGG	2	8	28954	28961	0 %	0 %	50 %	50 %	385993147
76	NC_017523	GCTC	2	8	29509	29516	0 %	25 %	25 %	50 %	385993148
77	NC_017523	TGCG	2	8	29648	29655	0 %	25 %	50 %	25 %	385993148
78	NC_017523	CCGG	2	8	29913	29920	0 %	0 %	50 %	50 %	385993148
79	NC_017523	CGTC	2	8	30244	30251	0 %	25 %	25 %	50 %	385993149
80	NC_017523	CACG	2	8	30604	30611	25 %	0 %	25 %	50 %	385993150
81	NC_017523	ACCG	2	8	30685	30692	25 %	0 %	25 %	50 %	385993150
82	NC_017523	CCGG	2	8	31004	31011	0 %	0 %	50 %	50 %	385993150
83	NC_017523	GTCG	2	8	31180	31187	0 %	25 %	50 %	25 %	385993150
84	NC_017523	CCCG	2	8	31802	31809	0 %	0 %	25 %	75 %	385993150
85	NC_017523	ACCA	2	8	31983	31990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017523	CGAG	2	8	32314	32321	25 %	0 %	50 %	25 %	385993151
87	NC_017523	CGAC	2	8	32611	32618	25 %	0 %	25 %	50 %	385993152
88	NC_017523	GCCG	2	8	33338	33345	0 %	0 %	50 %	50 %	385993153
89	NC_017523	CCGA	2	8	34327	34334	25 %	0 %	25 %	50 %	385993154
90	NC_017523	GCTA	2	8	34715	34722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017523	GGCC	2	8	35463	35470	0 %	0 %	50 %	50 %	385993155
92	NC_017523	ATCG	2	8	35955	35962	25 %	25 %	25 %	25 %	385993156
93	NC_017523	GATC	2	8	36293	36300	25 %	25 %	25 %	25 %	385993156
94	NC_017523	CCAC	2	8	37114	37121	25 %	0 %	0 %	75 %	385993156
95	NC_017523	ACCG	2	8	37508	37515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017523	CTGG	2	8	37852	37859	0 %	25 %	50 %	25 %	385993157
97	NC_017523	GCAT	2	8	38247	38254	25 %	25 %	25 %	25 %	385993158
98	NC_017523	GCTG	2	8	38761	38768	0 %	25 %	50 %	25 %	385993158
99	NC_017523	AACG	2	8	39516	39523	50 %	0 %	25 %	25 %	385993158
100	NC_017523	CCGA	2	8	39577	39584	25 %	0 %	25 %	50 %	385993158
101	NC_017523	CCAC	2	8	39733	39740	25 %	0 %	0 %	75 %	385993158
102	NC_017523	GTTG	2	8	39933	39940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017523	GTTG	2	8	39989	39996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017523	CAGC	2	8	40128	40135	25 %	0 %	25 %	50 %	385993159
105	NC_017523	CCGG	2	8	40624	40631	0 %	0 %	50 %	50 %	385993159
106	NC_017523	GGCC	2	8	41155	41162	0 %	0 %	50 %	50 %	385993160
107	NC_017523	CGAT	2	8	41605	41612	25 %	25 %	25 %	25 %	385993160
108	NC_017523	GCCG	2	8	41905	41912	0 %	0 %	50 %	50 %	385993160
109	NC_017523	CACC	2	8	41930	41937	25 %	0 %	0 %	75 %	385993160
110	NC_017523	ACCG	2	8	42153	42160	25 %	0 %	25 %	50 %	385993160
111	NC_017523	GCGT	2	8	42179	42186	0 %	25 %	50 %	25 %	385993160
112	NC_017523	CCAC	2	8	42908	42915	25 %	0 %	0 %	75 %	385993161
113	NC_017523	CGAT	2	8	42917	42924	25 %	25 %	25 %	25 %	385993161
114	NC_017523	GGCC	2	8	43612	43619	0 %	0 %	50 %	50 %	385993162
115	NC_017523	CCCG	2	8	44203	44210	0 %	0 %	25 %	75 %	385993162
116	NC_017523	CGGG	2	8	44232	44239	0 %	0 %	75 %	25 %	385993162
117	NC_017523	CGAC	2	8	44871	44878	25 %	0 %	25 %	50 %	385993163
118	NC_017523	GAGC	2	8	45251	45258	25 %	0 %	50 %	25 %	385993163
119	NC_017523	GGGC	2	8	46410	46417	0 %	0 %	75 %	25 %	385993163
120	NC_017523	CGGC	2	8	46505	46512	0 %	0 %	50 %	50 %	385993163
121	NC_017523	GCCG	2	8	47468	47475	0 %	0 %	50 %	50 %	385993163
122	NC_017523	TTGC	2	8	47632	47639	0 %	50 %	25 %	25 %	385993164
123	NC_017523	CCGC	2	8	47780	47787	0 %	0 %	25 %	75 %	385993164
124	NC_017523	CCGC	2	8	47813	47820	0 %	0 %	25 %	75 %	385993164
125	NC_017523	GGTC	2	8	47921	47928	0 %	25 %	50 %	25 %	385993164
126	NC_017523	CTAC	2	8	48245	48252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017523	CGGG	2	8	48472	48479	0 %	0 %	75 %	25 %	385993165
128	NC_017523	GCAG	2	8	48545	48552	25 %	0 %	50 %	25 %	385993165
129	NC_017523	GTGC	2	8	49445	49452	0 %	25 %	50 %	25 %	385993166
130	NC_017523	GCCG	2	8	49729	49736	0 %	0 %	50 %	50 %	385993166
131	NC_017523	CAGC	2	8	50912	50919	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017523	CGGG	2	8	51101	51108	0 %	0 %	75 %	25 %	385993168
133	NC_017523	GCCG	2	8	51201	51208	0 %	0 %	50 %	50 %	385993168
134	NC_017523	GGTG	2	8	51524	51531	0 %	25 %	75 %	0 %	385993168
135	NC_017523	CTCA	2	8	52140	52147	25 %	25 %	0 %	50 %	385993168
136	NC_017523	CGCT	2	8	52279	52286	0 %	25 %	25 %	50 %	385993169
137	NC_017523	GGTA	2	8	53145	53152	25 %	25 %	50 %	0 %	385993170
138	NC_017523	CTGG	2	8	53740	53747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017523	GCCG	2	8	54594	54601	0 %	0 %	50 %	50 %	385993172
140	NC_017523	ACCA	2	8	54765	54772	50 %	0 %	0 %	50 %	385993172
141	NC_017523	GTGC	2	8	55650	55657	0 %	25 %	50 %	25 %	385993172
142	NC_017523	ACCG	2	8	56528	56535	25 %	0 %	25 %	50 %	385993172
143	NC_017523	CCCG	2	8	56699	56706	0 %	0 %	25 %	75 %	385993172
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