MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 109449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017523	CCA	2	6	22212	22217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993142
502	NC_017523	CCA	2	6	22263	22268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993142
503	NC_017523	CAG	2	6	22405	22410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993142
504	NC_017523	CGG	2	6	22428	22433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993142
505	NC_017523	CAG	4	12	22441	22452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993142
506	NC_017523	GTCGT	2	10	22506	22515	0 %	40 %	40 %	20 %	385993143
507	NC_017523	GCC	3	9	22519	22527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993143
508	NC_017523	TCG	2	6	22574	22579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993143
509	NC_017523	CGG	2	6	22605	22610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993143
510	NC_017523	AGT	2	6	22653	22658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993143
511	NC_017523	GGT	2	6	22680	22685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993143
512	NC_017523	GAG	2	6	22705	22710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385993143
513	NC_017523	TGG	3	9	22736	22744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993143
514	NC_017523	CGGG	2	8	22760	22767	0 %	0 %	75 %	25 %	385993143
515	NC_017523	GGC	2	6	22792	22797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993143
516	NC_017523	GCC	2	6	22810	22815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993143
517	NC_017523	GCCG	2	8	22851	22858	0 %	0 %	50 %	50 %	385993143
518	NC_017523	GC	3	6	22879	22884	0 %	0 %	50 %	50 %	385993143
519	NC_017523	CGG	2	6	22887	22892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993143
520	NC_017523	TCC	2	6	22900	22905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385993143
521	NC_017523	TCA	2	6	22910	22915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993143
522	NC_017523	ATG	2	6	23044	23049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993143
523	NC_017523	GTA	2	6	23076	23081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993143
524	NC_017523	TGC	2	6	23084	23089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993143
525	NC_017523	GAT	2	6	23091	23096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993143
526	NC_017523	CG	3	6	23097	23102	0 %	0 %	50 %	50 %	385993143
527	NC_017523	TCA	2	6	23123	23128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993143
528	NC_017523	ACC	2	6	23171	23176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993143
529	NC_017523	GCTG	2	8	23231	23238	0 %	25 %	50 %	25 %	385993143
530	NC_017523	CGGC	2	8	23251	23258	0 %	0 %	50 %	50 %	385993143
531	NC_017523	GTC	3	9	23283	23291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993143
532	NC_017523	CGTAGT	2	12	23330	23341	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385993143
533	NC_017523	CGA	2	6	23342	23347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993143
534	NC_017523	CGA	3	9	23354	23362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993143
535	NC_017523	GCC	3	9	23379	23387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993143
536	NC_017523	CAG	2	6	23496	23501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993143
537	NC_017523	CCT	2	6	23603	23608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385993143
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539	NC_017523	GTC	2	6	23652	23657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993143
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541	NC_017523	CG	3	6	23699	23704	0 %	0 %	50 %	50 %	385993143
542	NC_017523	GC	3	6	23824	23829	0 %	0 %	50 %	50 %	385993143
543	NC_017523	CAG	2	6	23850	23855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993143
544	NC_017523	TCG	2	6	23869	23874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993143
545	NC_017523	GCCG	2	8	23922	23929	0 %	0 %	50 %	50 %	385993143
546	NC_017523	CCCA	2	8	23934	23941	25 %	0 %	0 %	75 %	385993143
547	NC_017523	GTT	2	6	23991	23996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993143
548	NC_017523	GC	3	6	24021	24026	0 %	0 %	50 %	50 %	385993143
549	NC_017523	CG	3	6	24050	24055	0 %	0 %	50 %	50 %	385993143
550	NC_017523	C	6	6	24085	24090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
551	NC_017523	GC	3	6	24101	24106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_017523	TCG	2	6	24132	24137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017523	GTC	2	6	24215	24220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993144
554	NC_017523	GTC	2	6	24322	24327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993144
555	NC_017523	GTC	2	6	24346	24351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993144
556	NC_017523	GC	3	6	24353	24358	0 %	0 %	50 %	50 %	385993144
557	NC_017523	CG	3	6	24392	24397	0 %	0 %	50 %	50 %	385993144
558	NC_017523	CAC	2	6	24418	24423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993144
559	NC_017523	CG	3	6	24452	24457	0 %	0 %	50 %	50 %	385993144
560	NC_017523	CAT	2	6	24493	24498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993144
561	NC_017523	CAA	2	6	24565	24570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993144
562	NC_017523	GGT	2	6	24694	24699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017523	GAT	2	6	24754	24759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993145
564	NC_017523	ATCAC	2	10	24779	24788	40 %	20 %	0 %	40 %	385993145
565	NC_017523	GTG	2	6	24830	24835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993145
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568	NC_017523	GAT	2	6	24952	24957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993145
569	NC_017523	CGT	2	6	24996	25001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993145
570	NC_017523	CGG	2	6	25026	25031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993145
571	NC_017523	GCC	2	6	25039	25044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993145
572	NC_017523	GCTG	2	8	25073	25080	0 %	25 %	50 %	25 %	385993145
573	NC_017523	CGTAGT	2	12	25107	25118	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385993145
574	NC_017523	CGGC	2	8	25121	25128	0 %	0 %	50 %	50 %	385993145
575	NC_017523	GAG	2	6	25152	25157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385993145
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577	NC_017523	GCCG	2	8	25221	25228	0 %	0 %	50 %	50 %	385993145
578	NC_017523	CGGG	2	8	25296	25303	0 %	0 %	75 %	25 %	385993145
579	NC_017523	CTC	2	6	25333	25338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385993145
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582	NC_017523	GCC	2	6	25414	25419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993145
583	NC_017523	GCCGG	2	10	25466	25475	0 %	0 %	60 %	40 %	385993145
584	NC_017523	AGG	2	6	25483	25488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385993145
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589	NC_017523	C	6	6	25702	25707	0 %	0 %	0 %	100 %	385993145
590	NC_017523	CCA	2	6	25739	25744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993145
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592	NC_017523	TCG	2	6	25787	25792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993145
593	NC_017523	GCCCCT	2	12	25797	25808	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385993145
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597	NC_017523	ATG	2	6	26114	26119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993145
598	NC_017523	GCC	2	6	26171	26176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993145
599	NC_017523	GCA	2	6	26184	26189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993145
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601	NC_017523	TCAA	2	8	26374	26381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_017523	GAGC	2	8	26402	26409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
603	NC_017523	GGCC	2	8	26416	26423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_017523	CCG	2	6	26437	26442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_017523	CTA	2	6	26472	26477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017523	TCC	2	6	26489	26494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_017523	GTT	2	6	26496	26501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017523	TCG	3	9	26616	26624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017523	GCC	2	6	26630	26635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_017523	GC	3	6	26780	26785	0 %	0 %	50 %	50 %	385993146
611	NC_017523	CGC	2	6	26803	26808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993146
612	NC_017523	TTG	2	6	26809	26814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993146
613	NC_017523	CGG	2	6	26835	26840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993146
614	NC_017523	CGG	2	6	26877	26882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993146
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617	NC_017523	GT	3	6	27014	27019	0 %	50 %	50 %	0 %	385993146
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620	NC_017523	GCC	2	6	27086	27091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993146
621	NC_017523	AGC	2	6	27092	27097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993146
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623	NC_017523	CGG	2	6	27186	27191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993146
624	NC_017523	CGG	2	6	27219	27224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993146
625	NC_017523	CG	3	6	27248	27253	0 %	0 %	50 %	50 %	385993146
626	NC_017523	CGA	2	6	27264	27269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993146
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628	NC_017523	GCTC	2	8	27365	27372	0 %	25 %	25 %	50 %	385993146
629	NC_017523	CGG	2	6	27414	27419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993146
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642	NC_017523	CAC	2	6	27925	27930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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655	NC_017523	GGC	2	6	28526	28531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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758	NC_017523	GGC	2	6	32732	32737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
759	NC_017523	TCG	2	6	32792	32797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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763	NC_017523	GAT	2	6	32893	32898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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