MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Marinobacter adhaerens HP15 plasmid pHP-42

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017508	AGGG	2	8	208	215	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017508	CCCG	2	8	373	380	0 %	0 %	25 %	75 %	385334103
3	NC_017508	AAGA	2	8	843	850	75 %	0 %	25 %	0 %	385334104
4	NC_017508	GATT	2	8	1013	1020	25 %	50 %	25 %	0 %	385334104
5	NC_017508	TGAT	2	8	1150	1157	25 %	50 %	25 %	0 %	385334105
6	NC_017508	AGCG	2	8	1582	1589	25 %	0 %	50 %	25 %	385334105
7	NC_017508	CTAT	2	8	1615	1622	25 %	50 %	0 %	25 %	385334105
8	NC_017508	TTAC	2	8	1645	1652	25 %	50 %	0 %	25 %	385334105
9	NC_017508	TCAA	2	8	1782	1789	50 %	25 %	0 %	25 %	385334105
10	NC_017508	TGAT	2	8	1948	1955	25 %	50 %	25 %	0 %	385334105
11	NC_017508	ATTT	2	8	2733	2740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017508	TCCC	2	8	2831	2838	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_017508	CTCC	2	8	2849	2856	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_017508	GTTT	2	8	3033	3040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017508	GGGC	2	8	3535	3542	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017508	GGGC	2	8	3621	3628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017508	CCGA	2	8	4142	4149	25 %	0 %	25 %	50 %	385334107
18	NC_017508	GTTT	2	8	5159	5166	0 %	75 %	25 %	0 %	385334109
19	NC_017508	AATC	2	8	5819	5826	50 %	25 %	0 %	25 %	385334109
20	NC_017508	AAAC	2	8	5917	5924	75 %	0 %	0 %	25 %	385334109
21	NC_017508	AGGA	2	8	6186	6193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017508	GACT	2	8	6385	6392	25 %	25 %	25 %	25 %	385334111
23	NC_017508	TTTC	2	8	6916	6923	0 %	75 %	0 %	25 %	385334112
24	NC_017508	CGAG	2	8	7379	7386	25 %	0 %	50 %	25 %	385334113
25	NC_017508	AGCA	2	8	7633	7640	50 %	0 %	25 %	25 %	385334114
26	NC_017508	AATG	2	8	7927	7934	50 %	25 %	25 %	0 %	385334114
27	NC_017508	GGAC	2	8	8002	8009	25 %	0 %	50 %	25 %	385334114
28	NC_017508	CTGG	2	8	8859	8866	0 %	25 %	50 %	25 %	385334115
29	NC_017508	AAAG	2	8	9253	9260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017508	CACC	2	8	9494	9501	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_017508	CTTG	2	8	9549	9556	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017508	CGAG	2	8	10070	10077	25 %	0 %	50 %	25 %	385334117
33	NC_017508	AAGC	2	8	10314	10321	50 %	0 %	25 %	25 %	385334117
34	NC_017508	GACC	2	8	10852	10859	25 %	0 %	25 %	50 %	385334118
35	NC_017508	AGGT	2	8	11508	11515	25 %	25 %	50 %	0 %	385334119
36	NC_017508	AGAA	2	8	11872	11879	75 %	0 %	25 %	0 %	385334119
37	NC_017508	ATGT	2	8	12074	12081	25 %	50 %	25 %	0 %	385334119
38	NC_017508	AGGC	2	8	12241	12248	25 %	0 %	50 %	25 %	385334119
39	NC_017508	AAGG	2	8	12290	12297	50 %	0 %	50 %	0 %	385334119
40	NC_017508	GCTG	2	8	12364	12371	0 %	25 %	50 %	25 %	385334119
41	NC_017508	GTTG	2	8	13893	13900	0 %	50 %	50 %	0 %	385334122
42	NC_017508	CGGG	2	8	14591	14598	0 %	0 %	75 %	25 %	385334123
43	NC_017508	GCAG	2	8	16408	16415	25 %	0 %	50 %	25 %	385334124
44	NC_017508	CAGC	2	8	16618	16625	25 %	0 %	25 %	50 %	385334124
45	NC_017508	AGGA	2	8	17171	17178	50 %	0 %	50 %	0 %	385334124
46	NC_017508	TGCC	2	8	17253	17260	0 %	25 %	25 %	50 %	385334125
47	NC_017508	TGGA	2	8	18155	18162	25 %	25 %	50 %	0 %	385334125
48	NC_017508	CAGT	2	8	19571	19578	25 %	25 %	25 %	25 %	385334126
49	NC_017508	TATT	2	8	19649	19656	25 %	75 %	0 %	0 %	385334127
50	NC_017508	AGGC	2	8	20400	20407	25 %	0 %	50 %	25 %	385334127
51	NC_017508	GTCA	2	8	20588	20595	25 %	25 %	25 %	25 %	385334127
52	NC_017508	CATC	2	8	21245	21252	25 %	25 %	0 %	50 %	385334127
53	NC_017508	GCAA	2	8	21293	21300	50 %	0 %	25 %	25 %	385334127
54	NC_017508	GGCT	2	8	21555	21562	0 %	25 %	50 %	25 %	385334127
55	NC_017508	CAAG	2	8	22163	22170	50 %	0 %	25 %	25 %	385334129
56	NC_017508	GAAA	2	8	22301	22308	75 %	0 %	25 %	0 %	385334129
57	NC_017508	AACA	2	8	22897	22904	75 %	0 %	0 %	25 %	385334129
58	NC_017508	AACG	2	8	23007	23014	50 %	0 %	25 %	25 %	385334129
59	NC_017508	TGAA	2	8	23353	23360	50 %	25 %	25 %	0 %	385334129
60	NC_017508	CAGC	2	8	23516	23523	25 %	0 %	25 %	50 %	385334129
61	NC_017508	GCGA	2	8	24040	24047	25 %	0 %	50 %	25 %	385334129
62	NC_017508	AGCA	2	8	24252	24259	50 %	0 %	25 %	25 %	385334129
63	NC_017508	GCCA	2	8	24275	24282	25 %	0 %	25 %	50 %	385334129
64	NC_017508	AAGG	2	8	24453	24460	50 %	0 %	50 %	0 %	385334129
65	NC_017508	GAAC	2	8	24694	24701	50 %	0 %	25 %	25 %	385334129
66	NC_017508	CTTT	2	8	26831	26838	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017508	TTAC	2	8	27869	27876	25 %	50 %	0 %	25 %	385334136
68	NC_017508	TTGA	2	8	28479	28486	25 %	50 %	25 %	0 %	385334137
69	NC_017508	ATAA	2	8	28526	28533	75 %	25 %	0 %	0 %	385334137
70	NC_017508	ATTG	2	8	28597	28604	25 %	50 %	25 %	0 %	385334137
71	NC_017508	TCAT	2	8	28637	28644	25 %	50 %	0 %	25 %	385334137
72	NC_017508	CTTT	2	8	28666	28673	0 %	75 %	0 %	25 %	385334138
73	NC_017508	ACTC	2	8	28726	28733	25 %	25 %	0 %	50 %	385334138
74	NC_017508	CCAT	2	8	29119	29126	25 %	25 %	0 %	50 %	385334139
75	NC_017508	AGCC	2	8	29390	29397	25 %	0 %	25 %	50 %	385334140
76	NC_017508	CGGG	2	8	30162	30169	0 %	0 %	75 %	25 %	385334141
77	NC_017508	GGCA	2	8	31403	31410	25 %	0 %	50 %	25 %	385334143
78	NC_017508	GCTG	2	8	32126	32133	0 %	25 %	50 %	25 %	385334144
79	NC_017508	TTTC	2	8	32623	32630	0 %	75 %	0 %	25 %	385334144
80	NC_017508	GAAT	2	8	32903	32910	50 %	25 %	25 %	0 %	385334144
81	NC_017508	GCCA	2	8	33333	33340	25 %	0 %	25 %	50 %	385334144
82	NC_017508	TGGC	2	8	33370	33377	0 %	25 %	50 %	25 %	385334144
83	NC_017508	GGCT	2	8	33414	33421	0 %	25 %	50 %	25 %	385334145
84	NC_017508	CTGC	2	8	33720	33727	0 %	25 %	25 %	50 %	385334146
85	NC_017508	GTCT	2	8	35593	35600	0 %	50 %	25 %	25 %	385334147
86	NC_017508	CAAA	2	8	35736	35743	75 %	0 %	0 %	25 %	385334147
87	NC_017508	GCGT	2	8	36299	36306	0 %	25 %	50 %	25 %	385334148
88	NC_017508	GCGG	2	8	36933	36940	0 %	0 %	75 %	25 %	385334149
89	NC_017508	CACG	2	8	37312	37319	25 %	0 %	25 %	50 %	385334150
90	NC_017508	CATT	3	12	37569	37580	25 %	50 %	0 %	25 %	385334150
91	NC_017508	GGGC	2	8	38020	38027	0 %	0 %	75 %	25 %	385334150
92	NC_017508	CAGA	2	8	38787	38794	50 %	0 %	25 %	25 %	385334151
93	NC_017508	TTGA	2	8	39404	39411	25 %	50 %	25 %	0 %	385334151
94	NC_017508	CAGC	2	8	40473	40480	25 %	0 %	25 %	50 %	385334151
95	NC_017508	GTCA	2	8	40982	40989	25 %	25 %	25 %	25 %	385334153
96	NC_017508	TTCC	2	8	41230	41237	0 %	50 %	0 %	50 %	385334153
97	NC_017508	GAGT	2	8	41332	41339	25 %	25 %	50 %	0 %	385334153
98	NC_017508	GCTT	2	8	42074	42081	0 %	50 %	25 %	25 %	385334154

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.