MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017026	GGC	2	6	105362	105367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_017026	ATGG	2	8	105374	105381	25 %	25 %	50 %	0 %	383306030
2503	NC_017026	ACC	2	6	105386	105391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306030
2504	NC_017026	TTG	2	6	105442	105447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306030
2505	NC_017026	GCA	2	6	105452	105457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306030
2506	NC_017026	TTG	2	6	105510	105515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306030
2507	NC_017026	CAG	2	6	105530	105535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306030
2508	NC_017026	CCG	2	6	105547	105552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306030
2509	NC_017026	CTGGC	2	10	105585	105594	0 %	20 %	40 %	40 %	383306030
2510	NC_017026	GCG	2	6	105616	105621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306030
2511	NC_017026	GCC	2	6	105627	105632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306030
2512	NC_017026	GCTGCC	2	12	105648	105659	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383306030
2513	NC_017026	CAG	2	6	105691	105696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306030
2514	NC_017026	GCC	2	6	105702	105707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306030
2515	NC_017026	CCA	2	6	105736	105741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306030
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2517	NC_017026	GCC	2	6	105810	105815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306030
2518	NC_017026	GCC	2	6	105825	105830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306030
2519	NC_017026	CG	3	6	105894	105899	0 %	0 %	50 %	50 %	383306030
2520	NC_017026	CGG	2	6	105902	105907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306030
2521	NC_017026	GTC	2	6	106044	106049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306030
2522	NC_017026	TTG	2	6	106057	106062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306030
2523	NC_017026	CTTT	2	8	106079	106086	0 %	75 %	0 %	25 %	383306030
2524	NC_017026	CCTGCT	2	12	106112	106123	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383306030
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2526	NC_017026	GC	3	6	106165	106170	0 %	0 %	50 %	50 %	383306030
2527	NC_017026	CGC	2	6	106214	106219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306030
2528	NC_017026	TGGCTG	2	12	106255	106266	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383306030
2529	NC_017026	CGG	2	6	106279	106284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306030
2530	NC_017026	CGG	2	6	106292	106297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306030
2531	NC_017026	GCCC	2	8	106300	106307	0 %	0 %	25 %	75 %	383306030
2532	NC_017026	CGCC	2	8	106321	106328	0 %	0 %	25 %	75 %	383306030
2533	NC_017026	CCG	3	9	106450	106458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306030
2534	NC_017026	GCA	2	6	106479	106484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306030
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2537	NC_017026	CGA	2	6	106553	106558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306030
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2539	NC_017026	GCG	2	6	106675	106680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306030
2540	NC_017026	GTC	2	6	106703	106708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306030
2541	NC_017026	GCACA	2	10	106709	106718	40 %	0 %	20 %	40 %	383306030
2542	NC_017026	TGC	2	6	106735	106740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306030
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2550	NC_017026	TGC	2	6	107449	107454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306031
2551	NC_017026	CATA	2	8	107507	107514	50 %	25 %	0 %	25 %	383306031
2552	NC_017026	CAT	2	6	107537	107542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306031
2553	NC_017026	GAC	2	6	107603	107608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306031
2554	NC_017026	CTG	2	6	107729	107734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306032
2555	NC_017026	TCGA	2	8	107972	107979	25 %	25 %	25 %	25 %	383306032
2556	NC_017026	ACT	2	6	107982	107987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306032
2557	NC_017026	CT	3	6	107999	108004	0 %	50 %	0 %	50 %	383306032
2558	NC_017026	CAT	2	6	108024	108029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306032
2559	NC_017026	CCT	2	6	108073	108078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383306032
2560	NC_017026	CGAA	2	8	108100	108107	50 %	0 %	25 %	25 %	383306032
2561	NC_017026	CGG	2	6	108157	108162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306032
2562	NC_017026	GGC	2	6	108163	108168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306032
2563	NC_017026	GGA	2	6	108216	108221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_017026	AAG	2	6	108222	108227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_017026	GCA	2	6	108287	108292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_017026	TCG	2	6	108352	108357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_017026	TGG	2	6	108365	108370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_017026	TCG	2	6	108565	108570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_017026	CCG	2	6	108595	108600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_017026	CAGC	2	8	108682	108689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2571	NC_017026	GAT	2	6	108731	108736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_017026	CTT	2	6	108791	108796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_017026	GTC	2	6	108846	108851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_017026	ACC	2	6	108858	108863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2575	NC_017026	CGC	2	6	108868	108873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2576	NC_017026	TGG	2	6	108900	108905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_017026	CCTG	2	8	108913	108920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2578	NC_017026	CGG	2	6	108926	108931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_017026	TG	3	6	108934	108939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_017026	CGG	2	6	108944	108949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_017026	CAC	2	6	108980	108985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2582	NC_017026	CGA	2	6	108997	109002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_017026	CTT	2	6	109020	109025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_017026	AGTT	2	8	109030	109037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_017026	CTGAA	2	10	109039	109048	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2586	NC_017026	GGT	2	6	109092	109097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_017026	CCGA	2	8	109202	109209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2588	NC_017026	CCGT	2	8	109249	109256	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2589	NC_017026	CTG	2	6	109439	109444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_017026	CTT	2	6	109462	109467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_017026	GAT	2	6	109492	109497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_017026	TGG	2	6	109504	109509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_017026	CGA	2	6	109525	109530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_017026	ATCGC	2	10	109536	109545	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2595	NC_017026	GC	3	6	109605	109610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2596	NC_017026	TGG	2	6	109611	109616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_017026	GCG	2	6	109793	109798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_017026	CAG	2	6	109803	109808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_017026	TCGT	2	8	109824	109831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2600	NC_017026	CGC	2	6	109859	109864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306033
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2603	NC_017026	CTG	2	6	109959	109964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306033
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2605	NC_017026	TG	3	6	110057	110062	0 %	50 %	50 %	0 %	383306033
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2607	NC_017026	CACC	2	8	110422	110429	25 %	0 %	0 %	75 %	383306034
2608	NC_017026	CTG	2	6	110435	110440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
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2611	NC_017026	CGG	2	6	110499	110504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
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2621	NC_017026	CGGTC	2	10	111148	111157	0 %	20 %	40 %	40 %	383306034
2622	NC_017026	GAA	2	6	111188	111193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306034
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2624	NC_017026	GGC	2	6	111295	111300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
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2626	NC_017026	TGGT	2	8	111482	111489	0 %	50 %	50 %	0 %	383306034
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2745	NC_017026	CGT	2	6	116199	116204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2746	NC_017026	CGA	2	6	116205	116210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2747	NC_017026	CGAC	2	8	116243	116250	25 %	0 %	25 %	50 %	383306034
2748	NC_017026	CCG	2	6	116352	116357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306034
2749	NC_017026	ACGG	2	8	116386	116393	25 %	0 %	50 %	25 %	383306034
2750	NC_017026	CTG	2	6	116396	116401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2751	NC_017026	TGC	2	6	116445	116450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2752	NC_017026	GGC	2	6	116451	116456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
2753	NC_017026	GCGG	2	8	116488	116495	0 %	0 %	75 %	25 %	383306034
2754	NC_017026	CGA	2	6	116500	116505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306034
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2777	NC_017026	CCGA	3	12	117471	117482	25 %	0 %	25 %	50 %	383306035
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2782	NC_017026	CTG	2	6	117870	117875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2784	NC_017026	GGT	2	6	117887	117892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2785	NC_017026	GC	3	6	117918	117923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2786	NC_017026	TTC	2	6	117987	117992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2859	NC_017026	GCC	2	6	121313	121318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2860	NC_017026	ATCG	2	8	121363	121370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2861	NC_017026	CTT	2	6	121441	121446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2862	NC_017026	TCGC	2	8	121451	121458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2863	NC_017026	GCA	3	9	121485	121493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2864	NC_017026	GC	3	6	121533	121538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2865	NC_017026	GGC	2	6	121670	121675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2866	NC_017026	GACG	2	8	121687	121694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2867	NC_017026	GGC	2	6	121711	121716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2868	NC_017026	CCGA	2	8	121724	121731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2869	NC_017026	GTC	2	6	121751	121756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2870	NC_017026	GC	3	6	121762	121767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2871	NC_017026	AAC	2	6	121880	121885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2872	NC_017026	CAGC	2	8	121896	121903	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2873	NC_017026	AAC	2	6	121910	121915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2874	NC_017026	CCG	2	6	121917	121922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2875	NC_017026	AGC	2	6	121928	121933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2876	NC_017026	CGC	2	6	121934	121939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2877	NC_017026	ACC	2	6	122036	122041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2878	NC_017026	TTG	2	6	122129	122134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2879	NC_017026	CCG	2	6	122197	122202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2880	NC_017026	GCC	2	6	122237	122242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2881	NC_017026	CTC	2	6	122249	122254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2994	NC_017026	TCA	2	6	126958	126963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306039
2995	NC_017026	GGT	2	6	126966	126971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306039
2996	NC_017026	TGCGC	2	10	126986	126995	0 %	20 %	40 %	40 %	383306039
2997	NC_017026	CGG	2	6	127160	127165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306039
2998	NC_017026	CAC	2	6	127203	127208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306039
2999	NC_017026	CTA	2	6	127228	127233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306039
3000	NC_017026	GCC	2	6	127255	127260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306039

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