MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017026	ATG	2	6	22175	22180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305955
502	NC_017026	GTA	2	6	22207	22212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305955
503	NC_017026	TGC	2	6	22215	22220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305955
504	NC_017026	GAT	2	6	22222	22227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305955
505	NC_017026	CG	3	6	22228	22233	0 %	0 %	50 %	50 %	383305955
506	NC_017026	TCA	2	6	22254	22259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305955
507	NC_017026	ACC	2	6	22302	22307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305955
508	NC_017026	GCTG	2	8	22362	22369	0 %	25 %	50 %	25 %	383305955
509	NC_017026	CGGC	2	8	22382	22389	0 %	0 %	50 %	50 %	383305955
510	NC_017026	GTC	3	9	22414	22422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305955
511	NC_017026	CGTAGT	2	12	22461	22472	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383305955
512	NC_017026	CGA	2	6	22473	22478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305955
513	NC_017026	CGA	3	9	22485	22493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305955
514	NC_017026	GCC	3	9	22510	22518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305955
515	NC_017026	CAG	2	6	22627	22632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305955
516	NC_017026	CCT	2	6	22734	22739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383305955
517	NC_017026	TCG	2	6	22757	22762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305955
518	NC_017026	GTC	2	6	22783	22788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305955
519	NC_017026	GCA	2	6	22818	22823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305955
520	NC_017026	CG	3	6	22830	22835	0 %	0 %	50 %	50 %	383305955
521	NC_017026	GC	3	6	22955	22960	0 %	0 %	50 %	50 %	383305955
522	NC_017026	CAG	2	6	22981	22986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305955
523	NC_017026	TCG	2	6	23000	23005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305955
524	NC_017026	GCCG	2	8	23053	23060	0 %	0 %	50 %	50 %	383305955
525	NC_017026	CCCA	2	8	23065	23072	25 %	0 %	0 %	75 %	383305955
526	NC_017026	GTT	2	6	23122	23127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305955
527	NC_017026	GC	3	6	23152	23157	0 %	0 %	50 %	50 %	383305955
528	NC_017026	CG	3	6	23181	23186	0 %	0 %	50 %	50 %	383305955
529	NC_017026	C	6	6	23216	23221	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
530	NC_017026	GC	3	6	23232	23237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_017026	TCG	2	6	23263	23268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017026	GTC	2	6	23346	23351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305956
533	NC_017026	GTC	2	6	23453	23458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305956
534	NC_017026	GTC	2	6	23477	23482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305956
535	NC_017026	GC	3	6	23484	23489	0 %	0 %	50 %	50 %	383305956
536	NC_017026	CG	3	6	23523	23528	0 %	0 %	50 %	50 %	383305956
537	NC_017026	CAC	2	6	23549	23554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305956
538	NC_017026	CG	3	6	23583	23588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_017026	CGG	2	6	23617	23622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017026	CAT	2	6	23625	23630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017026	CAA	2	6	23697	23702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017026	GGT	2	6	23826	23831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017026	GAT	2	6	23886	23891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305957
544	NC_017026	ATCAC	2	10	23911	23920	40 %	20 %	0 %	40 %	383305957
545	NC_017026	GTG	2	6	23962	23967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305957
546	NC_017026	TGG	2	6	23972	23977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305957
547	NC_017026	AC	3	6	24038	24043	50 %	0 %	0 %	50 %	383305957
548	NC_017026	GAT	2	6	24084	24089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305957
549	NC_017026	CGT	2	6	24128	24133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305957
550	NC_017026	CGG	2	6	24158	24163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305957
551	NC_017026	GCC	2	6	24171	24176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305957
552	NC_017026	GCTG	2	8	24205	24212	0 %	25 %	50 %	25 %	383305957
553	NC_017026	CGTAGT	2	12	24239	24250	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383305957
554	NC_017026	CGGC	2	8	24253	24260	0 %	0 %	50 %	50 %	383305957
555	NC_017026	GAG	2	6	24284	24289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383305957
556	NC_017026	GCC	3	9	24336	24344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305957
557	NC_017026	GCCG	2	8	24353	24360	0 %	0 %	50 %	50 %	383305957
558	NC_017026	CGGG	2	8	24428	24435	0 %	0 %	75 %	25 %	383305957
559	NC_017026	CTC	2	6	24465	24470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_017026	CCG	2	6	24505	24510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_017026	GCC	2	6	24522	24527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_017026	GCC	2	6	24546	24551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_017026	GCCGG	2	10	24598	24607	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
564	NC_017026	AGG	2	6	24615	24620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017026	GCG	2	6	24635	24640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017026	C	6	6	24646	24651	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
567	NC_017026	GCC	2	6	24832	24837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305958
568	NC_017026	C	6	6	24853	24858	0 %	0 %	0 %	100 %	383305958
569	NC_017026	CCA	2	6	24890	24895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305958
570	NC_017026	GTC	2	6	24925	24930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305958
571	NC_017026	TCG	2	6	24938	24943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305958
572	NC_017026	GCCCCT	2	12	24948	24959	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	383305958
573	NC_017026	CGG	2	6	25054	25059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305959
574	NC_017026	CGA	2	6	25120	25125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305959
575	NC_017026	GAC	2	6	25138	25143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305959
576	NC_017026	ATG	2	6	25265	25270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305960
577	NC_017026	GCC	2	6	25322	25327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305960
578	NC_017026	GCA	2	6	25335	25340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305960
579	NC_017026	TCG	2	6	25487	25492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305960
580	NC_017026	TCAA	2	8	25525	25532	50 %	25 %	0 %	25 %	383305960
581	NC_017026	GAGC	2	8	25553	25560	25 %	0 %	50 %	25 %	383305960
582	NC_017026	GGCC	2	8	25567	25574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_017026	CCG	2	6	25588	25593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_017026	CTA	2	6	25623	25628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017026	TCC	2	6	25640	25645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_017026	GTT	2	6	25647	25652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017026	TCG	3	9	25767	25775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017026	GCC	2	6	25781	25786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_017026	GC	3	6	25931	25936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_017026	GC	3	6	25947	25952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_017026	CGC	2	6	25956	25961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_017026	TTG	2	6	25962	25967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017026	CGG	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017026	CGG	2	6	26030	26035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017026	GCA	2	6	26062	26067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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597	NC_017026	GT	3	6	26167	26172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017026	GTG	2	6	26212	26217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017026	GTC	2	6	26226	26231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_017026	GCC	2	6	26239	26244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_017026	AGC	2	6	26245	26250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017026	CGG	2	6	26318	26323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017026	CGG	2	6	26339	26344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017026	CGG	2	6	26372	26377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017026	CG	3	6	26401	26406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_017026	CGA	2	6	26417	26422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017026	CCA	2	6	26489	26494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_017026	GCTC	2	8	26518	26525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017026	G	7	7	26568	26574	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017026	AGC	2	6	26655	26660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017026	TGA	2	6	26686	26691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017026	GCG	2	6	26715	26720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017026	CCAA	2	8	26737	26744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_017026	GCC	2	6	26759	26764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_017026	CAGC	2	8	26803	26810	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
616	NC_017026	CCG	2	6	26814	26819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_017026	CAC	2	6	26891	26896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_017026	AAC	2	6	26897	26902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017026	CGT	2	6	26915	26920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017026	CTT	2	6	26966	26971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017026	CGAGC	2	10	26983	26992	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
622	NC_017026	CAC	2	6	27080	27085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305961
623	NC_017026	CAG	2	6	27128	27133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305961
624	NC_017026	CGC	2	6	27169	27174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305961
625	NC_017026	GCA	2	6	27187	27192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305961
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628	NC_017026	GCT	2	6	27307	27312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305961
629	NC_017026	GCG	2	6	27384	27389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305961
630	NC_017026	CGT	2	6	27400	27405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305961
631	NC_017026	CCT	2	6	27465	27470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_017026	TA	3	6	27541	27546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017026	GTA	2	6	27580	27585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017026	CGGC	2	8	27623	27630	0 %	0 %	50 %	50 %	383305962
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