MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017026	TGG	2	6	248524	248529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306141
6002	NC_017026	GGC	2	6	248542	248547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306141
6003	NC_017026	TGG	2	6	248553	248558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306141
6004	NC_017026	GAA	2	6	248582	248587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306141
6005	NC_017026	GCA	2	6	248629	248634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306141
6006	NC_017026	AGC	2	6	248703	248708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306141
6007	NC_017026	AGCC	2	8	248711	248718	25 %	0 %	25 %	50 %	383306141
6008	NC_017026	TCGCCA	2	12	248767	248778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383306141
6009	NC_017026	ACC	2	6	248814	248819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306141
6010	NC_017026	CG	3	6	248863	248868	0 %	0 %	50 %	50 %	383306141
6011	NC_017026	AGG	2	6	248886	248891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306141
6012	NC_017026	CCG	2	6	248948	248953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306141
6013	NC_017026	GT	3	6	248995	249000	0 %	50 %	50 %	0 %	383306141
6014	NC_017026	GCAT	2	8	249027	249034	25 %	25 %	25 %	25 %	383306141
6015	NC_017026	TGG	2	6	249042	249047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306141
6016	NC_017026	GCC	2	6	249067	249072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_017026	CGG	2	6	249105	249110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_017026	CTG	2	6	249122	249127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_017026	CGG	2	6	249138	249143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_017026	CCA	2	6	249152	249157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_017026	GAAC	2	8	249162	249169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6022	NC_017026	TCG	2	6	249209	249214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306142
6023	NC_017026	CCA	2	6	249233	249238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306142
6024	NC_017026	CCG	2	6	249242	249247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306142
6025	NC_017026	GCC	2	6	249277	249282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306142
6026	NC_017026	GGGT	2	8	249317	249324	0 %	25 %	75 %	0 %	383306142
6027	NC_017026	GC	4	8	249337	249344	0 %	0 %	50 %	50 %	383306142
6028	NC_017026	TCG	2	6	249364	249369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306142
6029	NC_017026	CGC	2	6	249396	249401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306142
6030	NC_017026	GTC	2	6	249421	249426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306142
6031	NC_017026	CGC	2	6	249471	249476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306142
6032	NC_017026	GGT	2	6	249489	249494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306142
6033	NC_017026	GGCC	2	8	249519	249526	0 %	0 %	50 %	50 %	383306142
6034	NC_017026	GC	3	6	249569	249574	0 %	0 %	50 %	50 %	383306142
6035	NC_017026	CTC	2	6	249586	249591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383306142
6036	NC_017026	CGA	2	6	249640	249645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306142
6037	NC_017026	TGA	2	6	249649	249654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306142
6038	NC_017026	TGC	2	6	249669	249674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306143
6039	NC_017026	GCC	2	6	249683	249688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306143
6040	NC_017026	GGC	2	6	249736	249741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306143
6041	NC_017026	CGGTTG	2	12	249767	249778	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383306143
6042	NC_017026	CCGG	2	8	249826	249833	0 %	0 %	50 %	50 %	383306143
6043	NC_017026	CCG	3	9	249915	249923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306143
6044	NC_017026	CGG	2	6	249941	249946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306143
6045	NC_017026	CGG	2	6	250000	250005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306143
6046	NC_017026	CGA	3	9	250027	250035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306143
6047	NC_017026	GGC	2	6	250054	250059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306143
6048	NC_017026	GCC	2	6	250115	250120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306143
6049	NC_017026	GCGGT	2	10	250133	250142	0 %	20 %	60 %	20 %	383306143
6050	NC_017026	GCG	2	6	250185	250190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306143
6051	NC_017026	CGG	2	6	250231	250236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306143
6052	NC_017026	CG	3	6	250273	250278	0 %	0 %	50 %	50 %	383306144
6053	NC_017026	TGA	2	6	250284	250289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306144
6054	NC_017026	CCGG	2	8	250291	250298	0 %	0 %	50 %	50 %	383306144
6055	NC_017026	TGG	2	6	250310	250315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306144
6056	NC_017026	TCA	2	6	250355	250360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306144
6057	NC_017026	CCG	2	6	250362	250367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306144
6058	NC_017026	GGT	2	6	250371	250376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306144
6059	NC_017026	TGGC	2	8	250393	250400	0 %	25 %	50 %	25 %	383306144
6060	NC_017026	GC	3	6	250416	250421	0 %	0 %	50 %	50 %	383306144
6061	NC_017026	TCG	2	6	250454	250459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306144
6062	NC_017026	CGGTGG	2	12	250490	250501	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383306144
6063	NC_017026	GTT	2	6	250507	250512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306144
6064	NC_017026	CCG	2	6	250559	250564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306144
6065	NC_017026	GGT	2	6	250581	250586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306144
6066	NC_017026	CG	5	10	250659	250668	0 %	0 %	50 %	50 %	383306144
6067	NC_017026	GCC	2	6	250702	250707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306144
6068	NC_017026	GAC	2	6	250735	250740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306144
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6070	NC_017026	CG	3	6	250782	250787	0 %	0 %	50 %	50 %	383306144
6071	NC_017026	TGCG	2	8	250799	250806	0 %	25 %	50 %	25 %	383306144
6072	NC_017026	CG	3	6	250830	250835	0 %	0 %	50 %	50 %	383306144
6073	NC_017026	CGG	2	6	250867	250872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306144
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6075	NC_017026	GC	4	8	250956	250963	0 %	0 %	50 %	50 %	383306144
6076	NC_017026	TGC	2	6	251018	251023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306144
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6081	NC_017026	ACA	2	6	251269	251274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306144
6082	NC_017026	TGG	2	6	251324	251329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306144
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6086	NC_017026	CTG	2	6	251422	251427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306144
6087	NC_017026	GTG	2	6	251440	251445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306144
6088	NC_017026	GGTGA	2	10	251458	251467	20 %	20 %	60 %	0 %	383306144
6089	NC_017026	GTG	2	6	251485	251490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306144
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6092	NC_017026	GCT	2	6	251529	251534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306144
6093	NC_017026	CGA	2	6	251556	251561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306144
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6096	NC_017026	CGG	2	6	251669	251674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306144
6097	NC_017026	GTGC	2	8	251695	251702	0 %	25 %	50 %	25 %	383306144
6098	NC_017026	GTT	2	6	251758	251763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_017026	CCA	2	6	251862	251867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_017026	CGA	2	6	251966	251971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306145
6101	NC_017026	GGT	2	6	252030	252035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306145
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6104	NC_017026	TCCG	2	8	252153	252160	0 %	25 %	25 %	50 %	383306145
6105	NC_017026	CG	3	6	252165	252170	0 %	0 %	50 %	50 %	383306145
6106	NC_017026	CAA	2	6	252225	252230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306145
6107	NC_017026	TGGA	2	8	252232	252239	25 %	25 %	50 %	0 %	383306145
6108	NC_017026	CAT	2	6	252258	252263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306145
6109	NC_017026	ATGT	2	8	252301	252308	25 %	50 %	25 %	0 %	383306145
6110	NC_017026	CGT	3	9	252381	252389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306145
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6113	NC_017026	CGC	2	6	252482	252487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306145
6114	NC_017026	TGGCC	2	10	252509	252518	0 %	20 %	40 %	40 %	383306145
6115	NC_017026	CGG	2	6	252588	252593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306145
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6117	NC_017026	GCTG	2	8	252659	252666	0 %	25 %	50 %	25 %	383306145
6118	NC_017026	TAC	2	6	252715	252720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306145
6119	NC_017026	TGC	2	6	252767	252772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306145
6120	NC_017026	GAC	2	6	252811	252816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306145
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6122	NC_017026	GCC	2	6	252937	252942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306145
6123	NC_017026	CGA	2	6	252975	252980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306145
6124	NC_017026	GTG	2	6	252990	252995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306145
6125	NC_017026	GCA	2	6	253017	253022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306145
6126	NC_017026	CGG	2	6	253179	253184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306145
6127	NC_017026	CCG	2	6	253185	253190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306145
6128	NC_017026	GC	3	6	253219	253224	0 %	0 %	50 %	50 %	383306145
6129	NC_017026	GCA	2	6	253230	253235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306145
6130	NC_017026	CCG	2	6	253274	253279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306145
6131	NC_017026	CGC	2	6	253306	253311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306145
6132	NC_017026	TGC	2	6	253325	253330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306145
6133	NC_017026	ACT	2	6	253355	253360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306145
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6135	NC_017026	GAC	2	6	253444	253449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306145
6136	NC_017026	TCG	2	6	253502	253507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306145
6137	NC_017026	CGG	2	6	253527	253532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306145
6138	NC_017026	ACC	2	6	253537	253542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306145
6139	NC_017026	GGA	2	6	253566	253571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306145
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6141	NC_017026	CGC	2	6	253599	253604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306145
6142	NC_017026	GAA	2	6	253666	253671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306145
6143	NC_017026	TCG	2	6	253682	253687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306145
6144	NC_017026	CGCA	2	8	253773	253780	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6145	NC_017026	GCG	2	6	253820	253825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306146
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6147	NC_017026	TTC	2	6	253838	253843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306146
6148	NC_017026	GC	3	6	253848	253853	0 %	0 %	50 %	50 %	383306146
6149	NC_017026	CT	3	6	253869	253874	0 %	50 %	0 %	50 %	383306146
6150	NC_017026	CAC	2	6	253892	253897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306146
6151	NC_017026	CGCGG	2	10	253910	253919	0 %	0 %	60 %	40 %	383306146
6152	NC_017026	CGTC	2	8	253971	253978	0 %	25 %	25 %	50 %	383306146
6153	NC_017026	GTG	2	6	254004	254009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306146
6154	NC_017026	GCC	2	6	254063	254068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306146
6155	NC_017026	GTC	2	6	254091	254096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306146
6156	NC_017026	TCC	2	6	254151	254156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383306146
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6161	NC_017026	GCAC	2	8	254347	254354	25 %	0 %	25 %	50 %	383306146
6162	NC_017026	CG	3	6	254387	254392	0 %	0 %	50 %	50 %	383306146
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6171	NC_017026	GAAA	2	8	254843	254850	75 %	0 %	25 %	0 %	383306147
6172	NC_017026	GCCTCA	2	12	254855	254866	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383306147
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6180	NC_017026	GCCC	2	8	255274	255281	0 %	0 %	25 %	75 %	383306147
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6194	NC_017026	GGC	3	9	255982	255990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306147
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6202	NC_017026	TCA	2	6	256372	256377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6232	NC_017026	CCA	2	6	257508	257513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306148
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6237	NC_017026	CGA	3	9	257613	257621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306148
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6239	NC_017026	TGC	2	6	257831	257836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306148
6240	NC_017026	CCA	2	6	257885	257890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306148
6241	NC_017026	CCG	2	6	257935	257940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306148
6242	NC_017026	CGT	2	6	257946	257951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306148
6243	NC_017026	GTAGCC	2	12	257962	257973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383306148
6244	NC_017026	AAC	2	6	258026	258031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306148
6245	NC_017026	CGG	2	6	258081	258086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306148
6246	NC_017026	TGC	2	6	258158	258163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6248	NC_017026	GCC	2	6	258221	258226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6249	NC_017026	CG	3	6	258245	258250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6250	NC_017026	TCA	2	6	258282	258287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6252	NC_017026	CGA	2	6	258432	258437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6254	NC_017026	CGG	2	6	258512	258517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6259	NC_017026	CGA	2	6	258726	258731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6265	NC_017026	TCG	3	9	258981	258989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6316	NC_017026	TGGGGC	2	12	261405	261416	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383306151
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6351	NC_017026	TGC	2	6	262831	262836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306152
6352	NC_017026	TGG	3	9	262885	262893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306152
6353	NC_017026	GGC	2	6	262903	262908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306152
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6355	NC_017026	CCA	2	6	262957	262962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306153
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6357	NC_017026	GGT	2	6	263075	263080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306153
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6367	NC_017026	ATCG	2	8	263534	263541	25 %	25 %	25 %	25 %	383306153
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6484	NC_017026	CG	3	6	268757	268762	0 %	0 %	50 %	50 %	383306158
6485	NC_017026	TCTGC	2	10	268821	268830	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6486	NC_017026	TGC	2	6	268840	268845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6487	NC_017026	G	6	6	268874	268879	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6488	NC_017026	CGCT	2	8	268952	268959	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6489	NC_017026	CGG	2	6	269012	269017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6490	NC_017026	GTC	2	6	269106	269111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6491	NC_017026	TGT	2	6	269147	269152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6492	NC_017026	CGG	2	6	269158	269163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6493	NC_017026	CTGGTA	2	12	269167	269178	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6494	NC_017026	GAT	2	6	269217	269222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6495	NC_017026	GTCGA	2	10	269243	269252	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6496	NC_017026	TGT	2	6	269253	269258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_017026	AGCG	2	8	269339	269346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6498	NC_017026	CGA	2	6	269371	269376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6499	NC_017026	CGC	2	6	269415	269420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6500	NC_017026	GTG	3	9	269423	269431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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