MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Marinitoga piezophila KA3 plasmid pMARPI01

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016748	TCTT	2	8	122	129	0 %	75 %	0 %	25 %	373231419
2	NC_016748	TGAT	2	8	247	254	25 %	50 %	25 %	0 %	373231419
3	NC_016748	ATTT	2	8	294	301	25 %	75 %	0 %	0 %	373231419
4	NC_016748	TTAA	2	8	349	356	50 %	50 %	0 %	0 %	373231419
5	NC_016748	TCAT	2	8	571	578	25 %	50 %	0 %	25 %	373231419
6	NC_016748	TCCT	2	8	980	987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016748	AAAG	2	8	1519	1526	75 %	0 %	25 %	0 %	373231421
8	NC_016748	ATGA	2	8	1687	1694	50 %	25 %	25 %	0 %	373231421
9	NC_016748	AGAA	2	8	1845	1852	75 %	0 %	25 %	0 %	373231421
10	NC_016748	AAAT	2	8	1869	1876	75 %	25 %	0 %	0 %	373231421
11	NC_016748	AGAA	2	8	2431	2438	75 %	0 %	25 %	0 %	373231422
12	NC_016748	TAAT	2	8	2488	2495	50 %	50 %	0 %	0 %	373231422
13	NC_016748	ACGA	2	8	2995	3002	50 %	0 %	25 %	25 %	373231423
14	NC_016748	ATTT	2	8	3391	3398	25 %	75 %	0 %	0 %	373231424
15	NC_016748	AATT	2	8	3667	3674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016748	AAAT	2	8	3715	3722	75 %	25 %	0 %	0 %	373231425
17	NC_016748	AATG	2	8	4503	4510	50 %	25 %	25 %	0 %	373231425
18	NC_016748	AGAA	2	8	4574	4581	75 %	0 %	25 %	0 %	373231425
19	NC_016748	AAAT	2	8	4817	4824	75 %	25 %	0 %	0 %	373231425
20	NC_016748	AAAT	2	8	4939	4946	75 %	25 %	0 %	0 %	373231425
21	NC_016748	TGAT	2	8	5422	5429	25 %	50 %	25 %	0 %	373231425
22	NC_016748	GATA	2	8	5816	5823	50 %	25 %	25 %	0 %	373231425
23	NC_016748	TGAA	2	8	6727	6734	50 %	25 %	25 %	0 %	373231426
24	NC_016748	TAAA	2	8	6754	6761	75 %	25 %	0 %	0 %	373231426
25	NC_016748	AAAG	2	8	7233	7240	75 %	0 %	25 %	0 %	373231426
26	NC_016748	TAAA	2	8	7348	7355	75 %	25 %	0 %	0 %	373231426
27	NC_016748	AACT	2	8	7602	7609	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016748	CTTA	2	8	7871	7878	25 %	50 %	0 %	25 %	373231427
29	NC_016748	AAAT	2	8	7928	7935	75 %	25 %	0 %	0 %	373231427
30	NC_016748	GTTG	2	8	8157	8164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016748	AGGA	2	8	8325	8332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016748	CAAA	2	8	8651	8658	75 %	0 %	0 %	25 %	373231428
33	NC_016748	TGAA	2	8	9828	9835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016748	TTTC	2	8	10398	10405	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016748	AACA	2	8	10517	10524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016748	ATTT	2	8	10653	10660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016748	TAAT	2	8	10962	10969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016748	TTTA	2	8	11054	11061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016748	TTTG	2	8	11099	11106	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016748	ATTA	2	8	11459	11466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016748	AAGA	2	8	12254	12261	75 %	0 %	25 %	0 %	373231430
42	NC_016748	TACT	2	8	12582	12589	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016748	AGAT	2	8	12652	12659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016748	ATTC	2	8	13065	13072	25 %	50 %	0 %	25 %	373231431
45	NC_016748	ATGG	2	8	13180	13187	25 %	25 %	50 %	0 %	373231431
46	NC_016748	ATAA	2	8	13200	13207	75 %	25 %	0 %	0 %	373231431
47	NC_016748	ATAA	2	8	13376	13383	75 %	25 %	0 %	0 %	373231431

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.