MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 5556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016112	AT	3	6	1663	1668	50 %	50 %	0 %	0 %	357403390
2	NC_016112	CA	3	6	3377	3382	50 %	0 %	0 %	50 %	357403391
3	NC_016112	CG	3	6	4024	4029	0 %	0 %	50 %	50 %	357403391
4	NC_016112	AC	3	6	4335	4340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016112	GA	3	6	7027	7032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016112	GC	3	6	8886	8891	0 %	0 %	50 %	50 %	357403395
7	NC_016112	CG	3	6	10096	10101	0 %	0 %	50 %	50 %	357403396
8	NC_016112	GC	3	6	10713	10718	0 %	0 %	50 %	50 %	357403397
9	NC_016112	CG	3	6	11085	11090	0 %	0 %	50 %	50 %	357403397
10	NC_016112	GC	3	6	11468	11473	0 %	0 %	50 %	50 %	357403397
11	NC_016112	AT	3	6	15267	15272	50 %	50 %	0 %	0 %	357403399
12	NC_016112	GT	3	6	16205	16210	0 %	50 %	50 %	0 %	357403399
13	NC_016112	AG	4	8	18610	18617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016112	TG	3	6	19112	19117	0 %	50 %	50 %	0 %	357403402
15	NC_016112	GC	3	6	19387	19392	0 %	0 %	50 %	50 %	357403402
16	NC_016112	GA	3	6	19773	19778	50 %	0 %	50 %	0 %	357403402
17	NC_016112	AT	3	6	20076	20081	50 %	50 %	0 %	0 %	357403402
18	NC_016112	CG	3	6	20435	20440	0 %	0 %	50 %	50 %	357403402
19	NC_016112	GT	3	6	20615	20620	0 %	50 %	50 %	0 %	357403402
20	NC_016112	GA	3	6	21072	21077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016112	GC	3	6	21599	21604	0 %	0 %	50 %	50 %	357403404
22	NC_016112	CG	3	6	23295	23300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016112	AG	3	6	23398	23403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016112	CG	3	6	27613	27618	0 %	0 %	50 %	50 %	357403412
25	NC_016112	TA	3	6	27817	27822	50 %	50 %	0 %	0 %	357403413
26	NC_016112	CA	3	6	27858	27863	50 %	0 %	0 %	50 %	357403413
27	NC_016112	AT	3	6	28290	28295	50 %	50 %	0 %	0 %	357403413
28	NC_016112	TC	4	8	28835	28842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016112	GC	3	6	29042	29047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016112	GC	3	6	29341	29346	0 %	0 %	50 %	50 %	357403414
31	NC_016112	TC	3	6	30938	30943	0 %	50 %	0 %	50 %	357403414
32	NC_016112	AT	3	6	32895	32900	50 %	50 %	0 %	0 %	357403415
33	NC_016112	GT	3	6	33318	33323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016112	AG	3	6	33816	33821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016112	GA	3	6	35165	35170	50 %	0 %	50 %	0 %	357403417
36	NC_016112	TC	3	6	39024	39029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016112	AG	3	6	39629	39634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016112	GC	3	6	41025	41030	0 %	0 %	50 %	50 %	357403424
39	NC_016112	GT	3	6	41380	41385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016112	AT	3	6	42396	42401	50 %	50 %	0 %	0 %	357403425
41	NC_016112	CG	3	6	43523	43528	0 %	0 %	50 %	50 %	357403425
42	NC_016112	TG	3	6	43741	43746	0 %	50 %	50 %	0 %	357403425
43	NC_016112	GC	3	6	44132	44137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016112	TC	3	6	44664	44669	0 %	50 %	0 %	50 %	357403428
45	NC_016112	CG	3	6	44700	44705	0 %	0 %	50 %	50 %	357403428
46	NC_016112	GT	3	6	45448	45453	0 %	50 %	50 %	0 %	357403429
47	NC_016112	GC	4	8	45571	45578	0 %	0 %	50 %	50 %	357403429
48	NC_016112	TC	3	6	46351	46356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016112	AC	3	6	46795	46800	50 %	0 %	0 %	50 %	357403430
50	NC_016112	AC	3	6	47208	47213	50 %	0 %	0 %	50 %	357403431
51	NC_016112	GC	3	6	49847	49852	0 %	0 %	50 %	50 %	357403432
52	NC_016112	TG	3	6	49884	49889	0 %	50 %	50 %	0 %	357403432
53	NC_016112	CG	3	6	49966	49971	0 %	0 %	50 %	50 %	357403432
54	NC_016112	GC	3	6	52727	52732	0 %	0 %	50 %	50 %	357403434
55	NC_016112	GC	3	6	58934	58939	0 %	0 %	50 %	50 %	357403438
56	NC_016112	GC	3	6	59516	59521	0 %	0 %	50 %	50 %	357403438
57	NC_016112	GC	4	8	59540	59547	0 %	0 %	50 %	50 %	357403438
58	NC_016112	GC	3	6	60178	60183	0 %	0 %	50 %	50 %	357403438
59	NC_016112	CG	3	6	60299	60304	0 %	0 %	50 %	50 %	357403438
60	NC_016112	GC	3	6	61586	61591	0 %	0 %	50 %	50 %	357403438
61	NC_016112	CG	3	6	62059	62064	0 %	0 %	50 %	50 %	357403438
62	NC_016112	CG	3	6	62144	62149	0 %	0 %	50 %	50 %	357403438
63	NC_016112	GC	3	6	63664	63669	0 %	0 %	50 %	50 %	357403440
64	NC_016112	GA	3	6	64033	64038	50 %	0 %	50 %	0 %	357403440
65	NC_016112	GC	3	6	64280	64285	0 %	0 %	50 %	50 %	357403440
66	NC_016112	AT	3	6	64780	64785	50 %	50 %	0 %	0 %	357403440
67	NC_016112	TG	3	6	66422	66427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016112	GT	4	8	66493	66500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016112	GT	3	6	67139	67144	0 %	50 %	50 %	0 %	357403443
70	NC_016112	GT	3	6	67179	67184	0 %	50 %	50 %	0 %	357403443
71	NC_016112	TA	3	6	67355	67360	50 %	50 %	0 %	0 %	357403443
72	NC_016112	AT	3	6	67492	67497	50 %	50 %	0 %	0 %	357403443
73	NC_016112	TA	3	6	67886	67891	50 %	50 %	0 %	0 %	357403443
74	NC_016112	TA	3	6	68008	68013	50 %	50 %	0 %	0 %	357403443
75	NC_016112	AT	3	6	68021	68026	50 %	50 %	0 %	0 %	357403443
76	NC_016112	TA	3	6	68202	68207	50 %	50 %	0 %	0 %	357403443
77	NC_016112	TA	3	6	69375	69380	50 %	50 %	0 %	0 %	357403445
78	NC_016112	CT	3	6	69922	69927	0 %	50 %	0 %	50 %	357403445
79	NC_016112	AT	3	6	70512	70517	50 %	50 %	0 %	0 %	357403446
80	NC_016112	TA	3	6	70902	70907	50 %	50 %	0 %	0 %	357403446
81	NC_016112	TG	3	6	71393	71398	0 %	50 %	50 %	0 %	357403447
82	NC_016112	GA	3	6	71466	71471	50 %	0 %	50 %	0 %	357403447
83	NC_016112	TA	3	6	71597	71602	50 %	50 %	0 %	0 %	357403447
84	NC_016112	TG	3	6	71963	71968	0 %	50 %	50 %	0 %	357403448
85	NC_016112	CG	3	6	73026	73031	0 %	0 %	50 %	50 %	357403448
86	NC_016112	GA	3	6	74245	74250	50 %	0 %	50 %	0 %	357403450
87	NC_016112	GC	4	8	75369	75376	0 %	0 %	50 %	50 %	357403451
88	NC_016112	CG	3	6	75824	75829	0 %	0 %	50 %	50 %	357403451
89	NC_016112	TG	3	6	78880	78885	0 %	50 %	50 %	0 %	357403453
90	NC_016112	CG	3	6	79417	79422	0 %	0 %	50 %	50 %	357403454
91	NC_016112	TG	3	6	81126	81131	0 %	50 %	50 %	0 %	357403455
92	NC_016112	AT	3	6	81327	81332	50 %	50 %	0 %	0 %	357403455
93	NC_016112	AT	3	6	81867	81872	50 %	50 %	0 %	0 %	357403455
94	NC_016112	AG	3	6	83224	83229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016112	GC	3	6	83300	83305	0 %	0 %	50 %	50 %	357403457
96	NC_016112	GC	3	6	83696	83701	0 %	0 %	50 %	50 %	357403457
97	NC_016112	AT	3	6	83956	83961	50 %	50 %	0 %	0 %	357403457
98	NC_016112	AT	3	6	84334	84339	50 %	50 %	0 %	0 %	357403458
99	NC_016112	TG	3	6	84484	84489	0 %	50 %	50 %	0 %	357403458
100	NC_016112	TC	3	6	84841	84846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016112	AT	3	6	85179	85184	50 %	50 %	0 %	0 %	357403459
102	NC_016112	CG	3	6	85285	85290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016112	TA	3	6	85363	85368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016112	GT	3	6	86680	86685	0 %	50 %	50 %	0 %	357403460
105	NC_016112	GC	3	6	86980	86985	0 %	0 %	50 %	50 %	357403460
106	NC_016112	GC	3	6	87663	87668	0 %	0 %	50 %	50 %	357403461
107	NC_016112	AC	3	6	87681	87686	50 %	0 %	0 %	50 %	357403461
108	NC_016112	CG	3	6	88169	88174	0 %	0 %	50 %	50 %	357403461
109	NC_016112	CG	3	6	90247	90252	0 %	0 %	50 %	50 %	357403464
110	NC_016112	CG	3	6	90276	90281	0 %	0 %	50 %	50 %	357403464
111	NC_016112	TA	3	6	93788	93793	50 %	50 %	0 %	0 %	357403471
112	NC_016112	GC	3	6	93962	93967	0 %	0 %	50 %	50 %	357403471
113	NC_016112	GA	3	6	94886	94891	50 %	0 %	50 %	0 %	357403472
114	NC_016112	AG	3	6	95195	95200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016112	GC	3	6	95512	95517	0 %	0 %	50 %	50 %	357403473
116	NC_016112	CG	3	6	95717	95722	0 %	0 %	50 %	50 %	357403473
117	NC_016112	TG	3	6	96974	96979	0 %	50 %	50 %	0 %	357403475
118	NC_016112	CG	3	6	98096	98101	0 %	0 %	50 %	50 %	357403476
119	NC_016112	TA	3	6	98292	98297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016112	GC	3	6	99207	99212	0 %	0 %	50 %	50 %	357403479
121	NC_016112	CA	3	6	99222	99227	50 %	0 %	0 %	50 %	357403479
122	NC_016112	CG	3	6	99388	99393	0 %	0 %	50 %	50 %	357403479
123	NC_016112	GA	3	6	100721	100726	50 %	0 %	50 %	0 %	357403479
124	NC_016112	TG	3	6	101743	101748	0 %	50 %	50 %	0 %	357403480
125	NC_016112	GC	3	6	101993	101998	0 %	0 %	50 %	50 %	357403480
126	NC_016112	AG	3	6	102495	102500	50 %	0 %	50 %	0 %	357403480
127	NC_016112	GT	3	6	102511	102516	0 %	50 %	50 %	0 %	357403480
128	NC_016112	GC	4	8	104184	104191	0 %	0 %	50 %	50 %	357403482
129	NC_016112	GC	3	6	104659	104664	0 %	0 %	50 %	50 %	357403482
130	NC_016112	AG	3	6	105653	105658	50 %	0 %	50 %	0 %	357403483
131	NC_016112	CG	3	6	106308	106313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016112	CT	3	6	107040	107045	0 %	50 %	0 %	50 %	357403484
133	NC_016112	CA	3	6	107076	107081	50 %	0 %	0 %	50 %	357403484
134	NC_016112	GT	3	6	109067	109072	0 %	50 %	50 %	0 %	357403487
135	NC_016112	TA	3	6	109439	109444	50 %	50 %	0 %	0 %	357403487
136	NC_016112	CG	3	6	111086	111091	0 %	0 %	50 %	50 %	357403489
137	NC_016112	GT	3	6	112636	112641	0 %	50 %	50 %	0 %	357403490
138	NC_016112	CG	3	6	112884	112889	0 %	0 %	50 %	50 %	357403490
139	NC_016112	TG	3	6	112958	112963	0 %	50 %	50 %	0 %	357403490
140	NC_016112	TG	3	6	113313	113318	0 %	50 %	50 %	0 %	357403490
141	NC_016112	GC	3	6	113960	113965	0 %	0 %	50 %	50 %	357403490
142	NC_016112	TG	3	6	114374	114379	0 %	50 %	50 %	0 %	357403491
143	NC_016112	GT	3	6	115501	115506	0 %	50 %	50 %	0 %	357403492
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