MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 87465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016112	CGT	2	6	186635	186640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_016112	TGC	2	6	186981	186986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403548
3503	NC_016112	GCG	2	6	187014	187019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403548
3504	NC_016112	T	7	7	187054	187060	0 %	100 %	0 %	0 %	357403548
3505	NC_016112	AGT	2	6	187149	187154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403548
3506	NC_016112	GCT	2	6	187302	187307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403548
3507	NC_016112	TGC	2	6	187373	187378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403548
3508	NC_016112	T	6	6	187381	187386	0 %	100 %	0 %	0 %	357403548
3509	NC_016112	AAC	2	6	187417	187422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403548
3510	NC_016112	ATCC	2	8	187466	187473	25 %	25 %	0 %	50 %	357403548
3511	NC_016112	CAT	2	6	187507	187512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403548
3512	NC_016112	TCA	2	6	187528	187533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403548
3513	NC_016112	GA	3	6	187552	187557	50 %	0 %	50 %	0 %	357403548
3514	NC_016112	TGA	2	6	187567	187572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403548
3515	NC_016112	CAT	2	6	187591	187596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403548
3516	NC_016112	AC	3	6	187643	187648	50 %	0 %	0 %	50 %	357403548
3517	NC_016112	CAC	2	6	187748	187753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403548
3518	NC_016112	TG	3	6	187803	187808	0 %	50 %	50 %	0 %	357403548
3519	NC_016112	TTG	2	6	187829	187834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403548
3520	NC_016112	CCAGCT	2	12	188102	188113	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_016112	ATGG	2	8	188135	188142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_016112	GAG	2	6	188208	188213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_016112	CCT	2	6	188239	188244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_016112	TA	3	6	188276	188281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_016112	TCGA	2	8	188307	188314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_016112	AG	3	6	188355	188360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_016112	T	7	7	188433	188439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_016112	AT	3	6	188509	188514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_016112	A	7	7	188555	188561	100 %	0 %	0 %	0 %	357403549
3530	NC_016112	GCG	2	6	188751	188756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403549
3531	NC_016112	ATC	2	6	188764	188769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403549
3532	NC_016112	ATT	2	6	188791	188796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403549
3533	NC_016112	CTTT	2	8	188922	188929	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_016112	TTAAA	2	10	188931	188940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_016112	GCTT	2	8	188960	188967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_016112	TTG	2	6	188987	188992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_016112	ATTT	2	8	188999	189006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_016112	CCG	2	6	189016	189021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_016112	GAAAT	2	10	189026	189035	60 %	20 %	20 %	0 %	357403550
3540	NC_016112	A	6	6	189065	189070	100 %	0 %	0 %	0 %	357403550
3541	NC_016112	AAG	2	6	189126	189131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403550
3542	NC_016112	TGT	2	6	189146	189151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403550
3543	NC_016112	TGC	2	6	189177	189182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403550
3544	NC_016112	AAT	2	6	189247	189252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_016112	GCC	2	6	189424	189429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403551
3546	NC_016112	ATT	2	6	189460	189465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403551
3547	NC_016112	TTTTG	2	10	189501	189510	0 %	80 %	20 %	0 %	357403551
3548	NC_016112	CAA	2	6	189511	189516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403551
3549	NC_016112	AGA	2	6	189528	189533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403551
3550	NC_016112	AAT	2	6	189554	189559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403551
3551	NC_016112	ATT	2	6	189604	189609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_016112	ATT	2	6	189642	189647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_016112	CTA	2	6	189787	189792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_016112	AAG	2	6	189820	189825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403552
3555	NC_016112	ACA	2	6	189964	189969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403552
3556	NC_016112	TAA	2	6	190120	190125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403552
3557	NC_016112	GTC	2	6	190199	190204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403552
3558	NC_016112	A	7	7	190219	190225	100 %	0 %	0 %	0 %	357403552
3559	NC_016112	T	6	6	190234	190239	0 %	100 %	0 %	0 %	357403552
3560	NC_016112	GCA	2	6	190312	190317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403552
3561	NC_016112	ATGG	2	8	190363	190370	25 %	25 %	50 %	0 %	357403552
3562	NC_016112	TCT	2	6	190374	190379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403552
3563	NC_016112	TATT	2	8	190388	190395	25 %	75 %	0 %	0 %	357403552
3564	NC_016112	A	6	6	190409	190414	100 %	0 %	0 %	0 %	357403552
3565	NC_016112	GCC	2	6	190433	190438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_016112	TGT	2	6	190470	190475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_016112	TCA	2	6	190551	190556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403553
3568	NC_016112	A	7	7	190593	190599	100 %	0 %	0 %	0 %	357403553
3569	NC_016112	CTA	2	6	190630	190635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403553
3570	NC_016112	A	6	6	190635	190640	100 %	0 %	0 %	0 %	357403553
3571	NC_016112	CAA	2	6	190786	190791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403553
3572	NC_016112	AAGA	3	12	190794	190805	75 %	0 %	25 %	0 %	357403553
3573	NC_016112	AAG	2	6	190823	190828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403553
3574	NC_016112	CGT	2	6	190859	190864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3575	NC_016112	CGCAA	2	10	191030	191039	40 %	0 %	20 %	40 %	357403553
3576	NC_016112	CGT	3	9	191080	191088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3577	NC_016112	CGT	2	6	191118	191123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3578	NC_016112	CGT	2	6	191144	191149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3579	NC_016112	GCTG	2	8	191153	191160	0 %	25 %	50 %	25 %	357403553
3580	NC_016112	GAC	2	6	191181	191186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3581	NC_016112	CGT	2	6	191190	191195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3582	NC_016112	CCGG	2	8	191204	191211	0 %	0 %	50 %	50 %	357403553
3583	NC_016112	GCC	2	6	191251	191256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403553
3584	NC_016112	ATT	2	6	191316	191321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403553
3585	NC_016112	ATTT	2	8	191338	191345	25 %	75 %	0 %	0 %	357403553
3586	NC_016112	GCC	2	6	191353	191358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403553
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3589	NC_016112	GTT	2	6	191466	191471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403553
3590	NC_016112	GAA	2	6	191482	191487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403553
3591	NC_016112	CGAT	2	8	191492	191499	25 %	25 %	25 %	25 %	357403553
3592	NC_016112	CGA	2	6	191502	191507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3593	NC_016112	CGA	2	6	191517	191522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3594	NC_016112	TTG	2	6	191527	191532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403553
3595	NC_016112	A	6	6	191546	191551	100 %	0 %	0 %	0 %	357403553
3596	NC_016112	ACCG	2	8	191553	191560	25 %	0 %	25 %	50 %	357403553
3597	NC_016112	CGA	2	6	191592	191597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3598	NC_016112	GTC	2	6	191626	191631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3599	NC_016112	GGC	2	6	191656	191661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403553
3600	NC_016112	GCG	2	6	191675	191680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403553
3601	NC_016112	CGGT	2	8	191702	191709	0 %	25 %	50 %	25 %	357403553
3602	NC_016112	TCAGGC	2	12	191748	191759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3603	NC_016112	CGG	2	6	191798	191803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403553
3604	NC_016112	T	6	6	191825	191830	0 %	100 %	0 %	0 %	357403553
3605	NC_016112	GGC	2	6	191845	191850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403553
3606	NC_016112	TGGT	2	8	191858	191865	0 %	50 %	50 %	0 %	357403553
3607	NC_016112	ATTG	2	8	191907	191914	25 %	50 %	25 %	0 %	357403553
3608	NC_016112	GCA	2	6	191947	191952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3609	NC_016112	TGG	2	6	191957	191962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403553
3610	NC_016112	TGC	2	6	191973	191978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403553
3611	NC_016112	GC	3	6	191977	191982	0 %	0 %	50 %	50 %	357403553
3612	NC_016112	GGC	2	6	192021	192026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403553
3613	NC_016112	G	6	6	192274	192279	0 %	0 %	100 %	0 %	357403553
3614	NC_016112	TAT	2	6	192287	192292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403553
3615	NC_016112	TTGA	2	8	192310	192317	25 %	50 %	25 %	0 %	357403553
3616	NC_016112	TCGA	2	8	192328	192335	25 %	25 %	25 %	25 %	357403553
3617	NC_016112	CGGC	2	8	192350	192357	0 %	0 %	50 %	50 %	357403553
3618	NC_016112	CGG	2	6	192413	192418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403553
3619	NC_016112	A	6	6	192518	192523	100 %	0 %	0 %	0 %	357403553
3620	NC_016112	TA	3	6	192532	192537	50 %	50 %	0 %	0 %	357403553
3621	NC_016112	ATT	2	6	192598	192603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403553
3622	NC_016112	CAA	3	9	192613	192621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403553
3623	NC_016112	ATG	2	6	192656	192661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403553
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3625	NC_016112	GCG	2	6	192749	192754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403553
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