MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 87465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_016112	GAC	2	6	321215	321220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403677
6003	NC_016112	T	7	7	321226	321232	0 %	100 %	0 %	0 %	357403677
6004	NC_016112	CGA	2	6	321352	321357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403677
6005	NC_016112	CAG	2	6	321371	321376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403677
6006	NC_016112	CGA	2	6	321430	321435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403677
6007	NC_016112	CGG	2	6	321477	321482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403677
6008	NC_016112	CCG	2	6	321483	321488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403677
6009	NC_016112	GGCGCC	2	12	321554	321565	0 %	0 %	50 %	50 %	357403677
6010	NC_016112	TTG	2	6	321642	321647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403677
6011	NC_016112	GTT	2	6	321659	321664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403677
6012	NC_016112	TCG	2	6	321713	321718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403677
6013	NC_016112	GACG	2	8	321742	321749	25 %	0 %	50 %	25 %	357403677
6014	NC_016112	ATC	2	6	321756	321761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403677
6015	NC_016112	GATA	2	8	321838	321845	50 %	25 %	25 %	0 %	357403677
6016	NC_016112	TGC	2	6	321852	321857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403677
6017	NC_016112	CGG	2	6	321877	321882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403677
6018	NC_016112	CTT	2	6	321886	321891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403677
6019	NC_016112	AAT	2	6	321959	321964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403677
6020	NC_016112	T	6	6	321971	321976	0 %	100 %	0 %	0 %	357403677
6021	NC_016112	AAC	2	6	322039	322044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403677
6022	NC_016112	CG	3	6	322084	322089	0 %	0 %	50 %	50 %	357403677
6023	NC_016112	ACCGT	2	10	322203	322212	20 %	20 %	20 %	40 %	357403677
6024	NC_016112	A	6	6	322233	322238	100 %	0 %	0 %	0 %	357403677
6025	NC_016112	TGCT	2	8	322259	322266	0 %	50 %	25 %	25 %	357403677
6026	NC_016112	T	6	6	322298	322303	0 %	100 %	0 %	0 %	357403677
6027	NC_016112	TCG	2	6	322314	322319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403677
6028	NC_016112	TCGC	2	8	322326	322333	0 %	25 %	25 %	50 %	357403677
6029	NC_016112	AGCT	2	8	322336	322343	25 %	25 %	25 %	25 %	357403677
6030	NC_016112	CT	3	6	322427	322432	0 %	50 %	0 %	50 %	357403677
6031	NC_016112	CG	3	6	322472	322477	0 %	0 %	50 %	50 %	357403677
6032	NC_016112	T	7	7	322552	322558	0 %	100 %	0 %	0 %	357403677
6033	NC_016112	GCG	2	6	322611	322616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403677
6034	NC_016112	ATC	2	6	322619	322624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403677
6035	NC_016112	TGA	3	9	322641	322649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403677
6036	NC_016112	T	6	6	322696	322701	0 %	100 %	0 %	0 %	357403677
6037	NC_016112	TTGA	2	8	322728	322735	25 %	50 %	25 %	0 %	357403677
6038	NC_016112	CGT	2	6	322736	322741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403677
6039	NC_016112	T	6	6	322838	322843	0 %	100 %	0 %	0 %	357403677
6040	NC_016112	GAAT	2	8	322855	322862	50 %	25 %	25 %	0 %	357403677
6041	NC_016112	TTC	2	6	322871	322876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403677
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6043	NC_016112	TCG	2	6	323029	323034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403677
6044	NC_016112	GC	3	6	323056	323061	0 %	0 %	50 %	50 %	357403677
6045	NC_016112	TTG	2	6	323148	323153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403677
6046	NC_016112	GTC	2	6	323195	323200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403677
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6048	NC_016112	AT	3	6	323460	323465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_016112	TGT	2	6	323478	323483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016112	T	7	7	323495	323501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_016112	GC	3	6	323502	323507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_016112	T	6	6	323531	323536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_016112	A	8	8	323557	323564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_016112	T	6	6	323596	323601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_016112	CG	3	6	323638	323643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_016112	T	6	6	323708	323713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_016112	CTC	2	6	323719	323724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_016112	AAC	2	6	323738	323743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403678
6059	NC_016112	CTGA	2	8	323773	323780	25 %	25 %	25 %	25 %	357403678
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6062	NC_016112	GCTT	2	8	323987	323994	0 %	50 %	25 %	25 %	357403678
6063	NC_016112	CCT	2	6	324086	324091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403678
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6082	NC_016112	CCGAC	2	10	325125	325134	20 %	0 %	20 %	60 %	357403678
6083	NC_016112	TGGT	2	8	325225	325232	0 %	50 %	50 %	0 %	357403678
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6123	NC_016112	ATC	2	6	326737	326742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403678
6124	NC_016112	GC	3	6	326779	326784	0 %	0 %	50 %	50 %	357403678
6125	NC_016112	TTG	2	6	326866	326871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403678
6126	NC_016112	TGC	2	6	326888	326893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403678
6127	NC_016112	AACAAG	2	12	326894	326905	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	357403678
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6129	NC_016112	CGA	2	6	326949	326954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403678
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6133	NC_016112	GTT	2	6	327407	327412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403678
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6144	NC_016112	GAA	2	6	327828	327833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403678
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6153	NC_016112	ACCA	2	8	328282	328289	50 %	0 %	0 %	50 %	357403679
6154	NC_016112	CGA	2	6	328352	328357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403679
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6164	NC_016112	TGGG	2	8	328815	328822	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6165	NC_016112	CCG	2	6	328913	328918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6166	NC_016112	AT	3	6	328965	328970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6167	NC_016112	T	6	6	328997	329002	0 %	100 %	0 %	0 %	357403680
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6173	NC_016112	A	6	6	329235	329240	100 %	0 %	0 %	0 %	357403680
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6191	NC_016112	TCG	2	6	330281	330286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403681
6192	NC_016112	GC	3	6	330291	330296	0 %	0 %	50 %	50 %	357403681
6193	NC_016112	GCG	2	6	330358	330363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403681
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6208	NC_016112	GAA	2	6	331078	331083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6209	NC_016112	AAG	2	6	331085	331090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6210	NC_016112	TTAA	2	8	331115	331122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6211	NC_016112	TAT	2	6	331158	331163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403682
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6218	NC_016112	ACT	2	6	331462	331467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6220	NC_016112	TAA	2	6	331547	331552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6221	NC_016112	AAT	2	6	331641	331646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6222	NC_016112	TGCC	2	8	331699	331706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6223	NC_016112	ATT	2	6	331722	331727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6224	NC_016112	A	6	6	331917	331922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6225	NC_016112	CAA	2	6	331973	331978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6226	NC_016112	TTC	2	6	331984	331989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6227	NC_016112	TAT	2	6	332084	332089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403683
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6230	NC_016112	TTG	2	6	332230	332235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403683
6231	NC_016112	T	6	6	332237	332242	0 %	100 %	0 %	0 %	357403683
6232	NC_016112	GCA	2	6	332314	332319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403683
6233	NC_016112	GCT	2	6	332365	332370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403683
6234	NC_016112	T	8	8	332412	332419	0 %	100 %	0 %	0 %	357403683
6235	NC_016112	AAT	2	6	332541	332546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403683
6236	NC_016112	T	7	7	332583	332589	0 %	100 %	0 %	0 %	357403683
6237	NC_016112	TTC	2	6	332592	332597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403683
6238	NC_016112	TA	3	6	332706	332711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6239	NC_016112	CG	3	6	332715	332720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6240	NC_016112	GAGCAG	2	12	332797	332808	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6241	NC_016112	A	7	7	332819	332825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_016112	CGT	2	6	332837	332842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6243	NC_016112	CGAA	2	8	332869	332876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6244	NC_016112	AGG	2	6	332925	332930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_016112	TCAC	2	8	332960	332967	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6246	NC_016112	CCTT	2	8	333003	333010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6247	NC_016112	TA	3	6	333059	333064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6249	NC_016112	ACG	2	6	333209	333214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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