MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 87465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_016112	GCC	2	6	2940368	2940373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55002	NC_016112	ATGG	2	8	2940382	2940389	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55003	NC_016112	AAT	2	6	2940463	2940468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55004	NC_016112	TA	3	6	2940509	2940514	50 %	50 %	0 %	0 %	357405896
55005	NC_016112	CG	3	6	2940565	2940570	0 %	0 %	50 %	50 %	357405896
55006	NC_016112	GCAAA	2	10	2940589	2940598	60 %	0 %	20 %	20 %	357405896
55007	NC_016112	A	6	6	2940620	2940625	100 %	0 %	0 %	0 %	357405896
55008	NC_016112	AAT	2	6	2940640	2940645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357405896
55009	NC_016112	CGC	2	6	2940700	2940705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357405896
55010	NC_016112	AC	3	6	2940718	2940723	50 %	0 %	0 %	50 %	357405896
55011	NC_016112	GCCAA	2	10	2940787	2940796	40 %	0 %	20 %	40 %	357405896
55012	NC_016112	GCA	2	6	2940808	2940813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357405896
55013	NC_016112	TGA	2	6	2940921	2940926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357405896
55014	NC_016112	TGA	2	6	2940946	2940951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357405896
55015	NC_016112	TAA	2	6	2940965	2940970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357405896
55016	NC_016112	GA	3	6	2941028	2941033	50 %	0 %	50 %	0 %	357405896
55017	NC_016112	CAG	3	9	2941109	2941117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357405896
55018	NC_016112	AGT	2	6	2941159	2941164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357405896
55019	NC_016112	CAGC	2	8	2941171	2941178	25 %	0 %	25 %	50 %	357405896
55020	NC_016112	TAA	2	6	2941231	2941236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357405896
55021	NC_016112	GCC	2	6	2941248	2941253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357405896
55022	NC_016112	AGCC	2	8	2941361	2941368	25 %	0 %	25 %	50 %	357405896
55023	NC_016112	ACA	2	6	2941387	2941392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357405896
55024	NC_016112	GAA	2	6	2941428	2941433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357405896
55025	NC_016112	A	6	6	2941458	2941463	100 %	0 %	0 %	0 %	357405896
55026	NC_016112	ACC	2	6	2941492	2941497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357405897
55027	NC_016112	CTC	2	6	2941654	2941659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357405897
55028	NC_016112	GT	3	6	2941661	2941666	0 %	50 %	50 %	0 %	357405897
55029	NC_016112	TTG	2	6	2941672	2941677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357405897
55030	NC_016112	T	6	6	2941681	2941686	0 %	100 %	0 %	0 %	357405897
55031	NC_016112	CGG	2	6	2941701	2941706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357405897
55032	NC_016112	TCA	2	6	2941744	2941749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55033	NC_016112	TTCA	2	8	2941777	2941784	25 %	50 %	0 %	25 %	357405898
55034	NC_016112	AT	3	6	2941835	2941840	50 %	50 %	0 %	0 %	357405898
55035	NC_016112	AC	4	8	2941870	2941877	50 %	0 %	0 %	50 %	357405898
55036	NC_016112	GGC	2	6	2941935	2941940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357405898
55037	NC_016112	GCC	2	6	2942052	2942057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55038	NC_016112	AAT	2	6	2942130	2942135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55039	NC_016112	TA	3	6	2942178	2942183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55040	NC_016112	GAA	2	6	2942392	2942397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357405899
55041	NC_016112	TA	3	6	2942522	2942527	50 %	50 %	0 %	0 %	357405899
55042	NC_016112	ATA	2	6	2942682	2942687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55043	NC_016112	A	6	6	2942687	2942692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55044	NC_016112	AGTTT	2	10	2942708	2942717	20 %	60 %	20 %	0 %	357405900
55045	NC_016112	CCGT	2	8	2942740	2942747	0 %	25 %	25 %	50 %	357405900
55046	NC_016112	TGCG	2	8	2942850	2942857	0 %	25 %	50 %	25 %	357405900
55047	NC_016112	GAA	2	6	2942951	2942956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357405900
55048	NC_016112	CGGT	2	8	2943011	2943018	0 %	25 %	50 %	25 %	357405900
55049	NC_016112	CAGC	2	8	2943103	2943110	25 %	0 %	25 %	50 %	357405900
55050	NC_016112	CTG	2	6	2943138	2943143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357405900
55051	NC_016112	TTGG	2	8	2943353	2943360	0 %	50 %	50 %	0 %	357405900
55052	NC_016112	GAC	2	6	2943397	2943402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357405900
55053	NC_016112	GCG	2	6	2943413	2943418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357405900
55054	NC_016112	TGG	2	6	2943432	2943437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357405900
55055	NC_016112	TCG	2	6	2943486	2943491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357405900
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55057	NC_016112	CGCT	2	8	2943534	2943541	0 %	25 %	25 %	50 %	357405900
55058	NC_016112	GCG	2	6	2943589	2943594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357405900
55059	NC_016112	TTG	2	6	2943629	2943634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357405900
55060	NC_016112	GGC	2	6	2943677	2943682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357405900
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55062	NC_016112	CAG	2	6	2943763	2943768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357405901
55063	NC_016112	T	8	8	2943778	2943785	0 %	100 %	0 %	0 %	357405901
55064	NC_016112	GAT	2	6	2943793	2943798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357405901
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55071	NC_016112	CGC	2	6	2944174	2944179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357405901
55072	NC_016112	GTCA	2	8	2944207	2944214	25 %	25 %	25 %	25 %	357405901
55073	NC_016112	TAAT	2	8	2944240	2944247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55074	NC_016112	T	8	8	2944294	2944301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55075	NC_016112	A	6	6	2944309	2944314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55076	NC_016112	AC	3	6	2944322	2944327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55077	NC_016112	TAT	2	6	2944420	2944425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55079	NC_016112	T	6	6	2944494	2944499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55080	NC_016112	TAT	2	6	2944524	2944529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55083	NC_016112	ATA	2	6	2944574	2944579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55084	NC_016112	CAAT	2	8	2944598	2944605	50 %	25 %	0 %	25 %	357405902
55085	NC_016112	T	7	7	2944610	2944616	0 %	100 %	0 %	0 %	357405902
55086	NC_016112	AT	3	6	2944703	2944708	50 %	50 %	0 %	0 %	357405902
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55102	NC_016112	GA	3	6	2945354	2945359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55103	NC_016112	A	6	6	2945394	2945399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55114	NC_016112	CCT	2	6	2946347	2946352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55115	NC_016112	TGC	2	6	2946491	2946496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357405904
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55117	NC_016112	GGC	3	9	2946635	2946643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357405904
55118	NC_016112	CGG	2	6	2946661	2946666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357405904
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55120	NC_016112	GA	3	6	2946675	2946680	50 %	0 %	50 %	0 %	357405904
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55239	NC_016112	TTCGT	2	10	2952745	2952754	0 %	60 %	20 %	20 %	357405911
55240	NC_016112	GAT	2	6	2953164	2953169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357405911
55241	NC_016112	GCC	2	6	2953258	2953263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357405911
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55243	NC_016112	GC	3	6	2953359	2953364	0 %	0 %	50 %	50 %	357405911
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55245	NC_016112	CGA	2	6	2953499	2953504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357405911
55246	NC_016112	CCTC	2	8	2953576	2953583	0 %	25 %	0 %	75 %	357405911
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55251	NC_016112	CGT	2	6	2953836	2953841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357405911
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55254	NC_016112	TGC	2	6	2953944	2953949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357405911
55255	NC_016112	GC	3	6	2954027	2954032	0 %	0 %	50 %	50 %	357405912
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55265	NC_016112	CGC	2	6	2954481	2954486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357405912
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55300	NC_016112	TGA	2	6	2956219	2956224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357405912
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55321	NC_016112	GAT	2	6	2957411	2957416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357405912
55322	NC_016112	CCTT	2	8	2957466	2957473	0 %	50 %	0 %	50 %	357405912
55323	NC_016112	CGG	2	6	2957566	2957571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357405912
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55326	NC_016112	CTTTC	2	10	2957667	2957676	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55327	NC_016112	TC	3	6	2957686	2957691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55328	NC_016112	GTAT	2	8	2957767	2957774	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55329	NC_016112	CTT	2	6	2957792	2957797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357405913
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55336	NC_016112	ATGT	2	8	2958216	2958223	25 %	50 %	25 %	0 %	357405913
55337	NC_016112	CCAT	2	8	2958242	2958249	25 %	25 %	0 %	50 %	357405913
55338	NC_016112	GTA	2	6	2958257	2958262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357405913
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55342	NC_016112	GA	3	6	2958388	2958393	50 %	0 %	50 %	0 %	357405913
55343	NC_016112	TTC	2	6	2958476	2958481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357405913
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55345	NC_016112	T	6	6	2958565	2958570	0 %	100 %	0 %	0 %	357405914
55346	NC_016112	GTC	2	6	2958593	2958598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357405914
55347	NC_016112	AGC	2	6	2958674	2958679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357405914
55348	NC_016112	ACA	2	6	2958732	2958737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55349	NC_016112	ACCC	2	8	2958766	2958773	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55350	NC_016112	T	6	6	2958845	2958850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55351	NC_016112	CTT	2	6	2958872	2958877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357405915
55352	NC_016112	CTC	2	6	2958993	2958998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357405915
55353	NC_016112	CTT	2	6	2959056	2959061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357405915
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55355	NC_016112	AC	3	6	2959077	2959082	50 %	0 %	0 %	50 %	357405915
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