MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Muricauda ruestringensis DSM 13258 chromosome

Total Repeats: 73658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_015945	A	7	7	256547	256553	100 %	0 %	0 %	0 %	344201583
5003	NC_015945	CAT	2	6	256576	256581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201583
5004	NC_015945	ATA	2	6	256614	256619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201583
5005	NC_015945	ATT	2	6	256679	256684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201583
5006	NC_015945	CAA	2	6	256730	256735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201583
5007	NC_015945	ATC	2	6	256773	256778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201583
5008	NC_015945	CAA	2	6	256954	256959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201583
5009	NC_015945	ACG	2	6	257055	257060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201583
5010	NC_015945	ACTTTT	2	12	257110	257121	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	344201583
5011	NC_015945	AGA	2	6	257125	257130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201583
5012	NC_015945	TAT	2	6	257171	257176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201583
5013	NC_015945	TCAC	2	8	257183	257190	25 %	25 %	0 %	50 %	344201583
5014	NC_015945	GGT	2	6	257243	257248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201583
5015	NC_015945	T	6	6	257248	257253	0 %	100 %	0 %	0 %	344201583
5016	NC_015945	A	6	6	257263	257268	100 %	0 %	0 %	0 %	344201583
5017	NC_015945	TGA	2	6	257323	257328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201583
5018	NC_015945	CAA	2	6	257353	257358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201583
5019	NC_015945	GAT	2	6	257387	257392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201583
5020	NC_015945	TAT	2	6	257446	257451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201583
5021	NC_015945	A	6	6	257454	257459	100 %	0 %	0 %	0 %	344201583
5022	NC_015945	A	6	6	257481	257486	100 %	0 %	0 %	0 %	344201583
5023	NC_015945	TGC	2	6	257615	257620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201584
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5025	NC_015945	AGA	2	6	257733	257738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201584
5026	NC_015945	CCATGA	2	12	257917	257928	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344201584
5027	NC_015945	TGA	2	6	258257	258262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201584
5028	NC_015945	T	7	7	258282	258288	0 %	100 %	0 %	0 %	344201584
5029	NC_015945	TCAAT	2	10	258365	258374	40 %	40 %	0 %	20 %	344201584
5030	NC_015945	CAA	2	6	258452	258457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201584
5031	NC_015945	ACC	2	6	258468	258473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201584
5032	NC_015945	GGC	2	6	258485	258490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201584
5033	NC_015945	TACA	2	8	258514	258521	50 %	25 %	0 %	25 %	344201584
5034	NC_015945	CTAC	2	8	258546	258553	25 %	25 %	0 %	50 %	344201584
5035	NC_015945	AC	3	6	258580	258585	50 %	0 %	0 %	50 %	344201584
5036	NC_015945	CAG	2	6	258597	258602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201584
5037	NC_015945	GAA	2	6	258765	258770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201584
5038	NC_015945	GCC	3	9	258771	258779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201584
5039	NC_015945	A	6	6	258780	258785	100 %	0 %	0 %	0 %	344201584
5040	NC_015945	GAC	2	6	258852	258857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201584
5041	NC_015945	GCAA	2	8	258892	258899	50 %	0 %	25 %	25 %	344201584
5042	NC_015945	AGC	2	6	258927	258932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201584
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5044	NC_015945	A	6	6	258984	258989	100 %	0 %	0 %	0 %	344201584
5045	NC_015945	AGC	2	6	259040	259045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201584
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5049	NC_015945	AGT	2	6	259274	259279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201584
5050	NC_015945	AAGC	2	8	259353	259360	50 %	0 %	25 %	25 %	344201584
5051	NC_015945	ACG	2	6	259369	259374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201584
5052	NC_015945	A	6	6	259446	259451	100 %	0 %	0 %	0 %	344201584
5053	NC_015945	G	6	6	259481	259486	0 %	0 %	100 %	0 %	344201584
5054	NC_015945	TTG	2	6	259515	259520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201584
5055	NC_015945	GCGGTT	2	12	259530	259541	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344201584
5056	NC_015945	TAAA	2	8	259622	259629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_015945	CTTT	2	8	259637	259644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5058	NC_015945	GCA	2	6	259648	259653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_015945	AAT	2	6	259704	259709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_015945	ATT	2	6	259748	259753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201585
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5062	NC_015945	GT	3	6	259821	259826	0 %	50 %	50 %	0 %	344201585
5063	NC_015945	A	7	7	259830	259836	100 %	0 %	0 %	0 %	344201585
5064	NC_015945	ATTG	2	8	259843	259850	25 %	50 %	25 %	0 %	344201585
5065	NC_015945	AC	3	6	259933	259938	50 %	0 %	0 %	50 %	344201585
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5070	NC_015945	GAA	2	6	260074	260079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201585
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5089	NC_015945	TCA	2	6	261111	261116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201586
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5091	NC_015945	A	7	7	261242	261248	100 %	0 %	0 %	0 %	344201586
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5107	NC_015945	CCATT	2	10	262139	262148	20 %	40 %	0 %	40 %	344201588
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5109	NC_015945	TGA	2	6	262328	262333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201588
5110	NC_015945	ATG	2	6	262416	262421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201588
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5113	NC_015945	CCA	2	6	262460	262465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201588
5114	NC_015945	CA	3	6	262669	262674	50 %	0 %	0 %	50 %	344201588
5115	NC_015945	T	6	6	262738	262743	0 %	100 %	0 %	0 %	344201588
5116	NC_015945	A	6	6	262771	262776	100 %	0 %	0 %	0 %	344201588
5117	NC_015945	T	6	6	262815	262820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_015945	ATT	2	6	262841	262846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201589
5119	NC_015945	AGGC	2	8	262902	262909	25 %	0 %	50 %	25 %	344201589
5120	NC_015945	GCC	2	6	262925	262930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201589
5121	NC_015945	TGA	2	6	262956	262961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201589
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5123	NC_015945	TGT	3	9	262992	263000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201589
5124	NC_015945	ATC	2	6	263009	263014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201589
5125	NC_015945	TTGG	2	8	263086	263093	0 %	50 %	50 %	0 %	344201589
5126	NC_015945	TTA	2	6	263119	263124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201589
5127	NC_015945	AT	3	6	263149	263154	50 %	50 %	0 %	0 %	344201589
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5130	NC_015945	TGTT	2	8	263313	263320	0 %	75 %	25 %	0 %	344201589
5131	NC_015945	CTT	2	6	263445	263450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201589
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5133	NC_015945	TG	3	6	263618	263623	0 %	50 %	50 %	0 %	344201589
5134	NC_015945	TC	3	6	263639	263644	0 %	50 %	0 %	50 %	344201589
5135	NC_015945	ATGTAT	2	12	263711	263722	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	344201589
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5151	NC_015945	AAAG	2	8	264550	264557	75 %	0 %	25 %	0 %	344201589
5152	NC_015945	TAAT	2	8	264570	264577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5160	NC_015945	T	6	6	265043	265048	0 %	100 %	0 %	0 %	344201590
5161	NC_015945	A	6	6	265058	265063	100 %	0 %	0 %	0 %	344201590
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5173	NC_015945	TACG	2	8	265649	265656	25 %	25 %	25 %	25 %	344201592
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5187	NC_015945	TTG	2	6	266204	266209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201592
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5199	NC_015945	T	7	7	266645	266651	0 %	100 %	0 %	0 %	344201593
5200	NC_015945	GAT	2	6	266687	266692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201593
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5222	NC_015945	ATGCA	2	10	267853	267862	40 %	20 %	20 %	20 %	344201594
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5228	NC_015945	T	6	6	268200	268205	0 %	100 %	0 %	0 %	344201595
5229	NC_015945	GCAA	2	8	268231	268238	50 %	0 %	25 %	25 %	344201595
5230	NC_015945	CAT	2	6	268420	268425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201595
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5232	NC_015945	CTTT	2	8	268493	268500	0 %	75 %	0 %	25 %	344201595
5233	NC_015945	GCA	2	6	268509	268514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201595
5234	NC_015945	TTA	2	6	268529	268534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201595
5235	NC_015945	TTG	2	6	268561	268566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201595
5236	NC_015945	GATG	2	8	268638	268645	25 %	25 %	50 %	0 %	344201595
5237	NC_015945	TTC	2	6	268714	268719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201595
5238	NC_015945	CTC	2	6	268750	268755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201595
5239	NC_015945	ACTAC	2	10	268772	268781	40 %	20 %	0 %	40 %	344201595
5240	NC_015945	TCA	3	9	269066	269074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201595
5241	NC_015945	TGG	2	6	269091	269096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201595
5242	NC_015945	AGGA	2	8	269118	269125	50 %	0 %	50 %	0 %	344201595
5243	NC_015945	CAAAAA	2	12	269134	269145	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	344201595
5244	NC_015945	AGC	2	6	269185	269190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201595
5245	NC_015945	ATG	2	6	269200	269205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201595
5246	NC_015945	A	6	6	269239	269244	100 %	0 %	0 %	0 %	344201595
5247	NC_015945	TAC	2	6	269305	269310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201595
5248	NC_015945	TTC	2	6	269317	269322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201595
5249	NC_015945	TAC	2	6	269352	269357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201595
5250	NC_015945	TGC	2	6	269607	269612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201595
5251	NC_015945	GAT	2	6	269747	269752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201595
5252	NC_015945	CAT	2	6	269814	269819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201595
5253	NC_015945	ACT	2	6	269822	269827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201595
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5255	NC_015945	TGA	2	6	269853	269858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201595
5256	NC_015945	TAC	2	6	269911	269916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201595
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5258	NC_015945	CTG	2	6	269943	269948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201595
5259	NC_015945	ATG	2	6	269984	269989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201595
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5262	NC_015945	ATC	2	6	270114	270119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201596
5263	NC_015945	A	7	7	270322	270328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_015945	A	6	6	270347	270352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_015945	TTG	2	6	270396	270401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_015945	TGAACT	2	12	270460	270471	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5267	NC_015945	GGC	2	6	270507	270512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201597
5268	NC_015945	ATC	2	6	270579	270584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201597
5269	NC_015945	AC	3	6	270590	270595	50 %	0 %	0 %	50 %	344201597
5270	NC_015945	CAT	2	6	270611	270616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201597
5271	NC_015945	ATT	2	6	270736	270741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201597
5272	NC_015945	T	7	7	270740	270746	0 %	100 %	0 %	0 %	344201597
5273	NC_015945	CTT	2	6	270827	270832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201597
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5279	NC_015945	T	6	6	271064	271069	0 %	100 %	0 %	0 %	344201598
5280	NC_015945	ACA	2	6	271087	271092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201598
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5290	NC_015945	CTT	2	6	271493	271498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201598
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5293	NC_015945	CTTCCT	2	12	271676	271687	0 %	50 %	0 %	50 %	344201598
5294	NC_015945	T	6	6	271690	271695	0 %	100 %	0 %	0 %	344201598
5295	NC_015945	CT	3	6	271706	271711	0 %	50 %	0 %	50 %	344201598
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5297	NC_015945	TTAT	2	8	271780	271787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5298	NC_015945	TGG	2	6	271937	271942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201599
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5301	NC_015945	A	6	6	272096	272101	100 %	0 %	0 %	0 %	344201599
5302	NC_015945	A	6	6	272128	272133	100 %	0 %	0 %	0 %	344201599
5303	NC_015945	T	6	6	272184	272189	0 %	100 %	0 %	0 %	344201599
5304	NC_015945	TCA	2	6	272198	272203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201599
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5320	NC_015945	GTA	2	6	272931	272936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201599
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5323	NC_015945	GAT	2	6	273008	273013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201600
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5325	NC_015945	AGTG	2	8	273248	273255	25 %	25 %	50 %	0 %	344201600
5326	NC_015945	GAA	2	6	273257	273262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201600
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5328	NC_015945	TACAAA	2	12	273320	273331	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	344201600
5329	NC_015945	AG	3	6	273460	273465	50 %	0 %	50 %	0 %	344201601
5330	NC_015945	AAC	2	6	273496	273501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201601
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5335	NC_015945	CATCT	2	10	273687	273696	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5336	NC_015945	T	6	6	273698	273703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5337	NC_015945	CAA	2	6	273715	273720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5338	NC_015945	AATA	2	8	273727	273734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5339	NC_015945	A	7	7	273734	273740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5340	NC_015945	AGC	2	6	273826	273831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201602
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5342	NC_015945	TC	3	6	273864	273869	0 %	50 %	0 %	50 %	344201602
5343	NC_015945	GCA	2	6	273878	273883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201602
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5345	NC_015945	GTTG	2	8	273922	273929	0 %	50 %	50 %	0 %	344201602
5346	NC_015945	ATC	2	6	273949	273954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201602
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5350	NC_015945	CAG	2	6	274113	274118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201602
5351	NC_015945	T	7	7	274203	274209	0 %	100 %	0 %	0 %	344201602
5352	NC_015945	TGA	2	6	274339	274344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201603
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5356	NC_015945	CCATTG	2	12	274679	274690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344201603
5357	NC_015945	TGA	2	6	274759	274764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201603
5358	NC_015945	CAG	2	6	274813	274818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201603
5359	NC_015945	CTT	2	6	274860	274865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201603
5360	NC_015945	CTG	2	6	274904	274909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201603
5361	NC_015945	CAT	2	6	274942	274947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201603
5362	NC_015945	CTT	2	6	274990	274995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201603
5363	NC_015945	T	6	6	274994	274999	0 %	100 %	0 %	0 %	344201603
5364	NC_015945	CAT	2	6	275059	275064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201603
5365	NC_015945	CGC	2	6	275086	275091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201603
5366	NC_015945	CAA	2	6	275179	275184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201603
5367	NC_015945	ATG	2	6	275239	275244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201603
5368	NC_015945	AAACAG	2	12	275246	275257	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	344201603
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5493	NC_015945	TGA	2	6	281827	281832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201608
5494	NC_015945	AGA	2	6	281846	281851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201608
5495	NC_015945	AAG	2	6	281859	281864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201608
5496	NC_015945	GAC	2	6	281951	281956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201608
5497	NC_015945	GGAAG	2	10	281974	281983	40 %	0 %	60 %	0 %	344201608
5498	NC_015945	A	6	6	282039	282044	100 %	0 %	0 %	0 %	344201608
5499	NC_015945	GAAA	2	8	282113	282120	75 %	0 %	25 %	0 %	344201608
5500	NC_015945	ATTG	2	8	282124	282131	25 %	50 %	25 %	0 %	344201608

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