MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 2074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015873	TA	3	6	109	114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015873	TC	3	6	1310	1315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015873	TC	3	6	2826	2831	0 %	50 %	0 %	50 %	348025250
4	NC_015873	GA	3	6	4788	4793	50 %	0 %	50 %	0 %	348025251
5	NC_015873	AG	3	6	9569	9574	50 %	0 %	50 %	0 %	348025256
6	NC_015873	CG	3	6	15855	15860	0 %	0 %	50 %	50 %	348025260
7	NC_015873	AT	3	6	16085	16090	50 %	50 %	0 %	0 %	348025260
8	NC_015873	CG	3	6	16620	16625	0 %	0 %	50 %	50 %	348025260
9	NC_015873	GA	5	10	17959	17968	50 %	0 %	50 %	0 %	348025261
10	NC_015873	TA	4	8	18283	18290	50 %	50 %	0 %	0 %	348025261
11	NC_015873	GC	3	6	19040	19045	0 %	0 %	50 %	50 %	348025262
12	NC_015873	AT	3	6	19171	19176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015873	GA	3	6	20964	20969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015873	CA	3	6	21027	21032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015873	GT	3	6	21095	21100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015873	GC	3	6	23449	23454	0 %	0 %	50 %	50 %	348025266
17	NC_015873	CG	3	6	27056	27061	0 %	0 %	50 %	50 %	348025270
18	NC_015873	AT	3	6	27265	27270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015873	CG	3	6	33333	33338	0 %	0 %	50 %	50 %	348025275
20	NC_015873	TA	3	6	38260	38265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015873	AT	3	6	38299	38304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015873	GA	3	6	40303	40308	50 %	0 %	50 %	0 %	348025278
23	NC_015873	TA	3	6	41077	41082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015873	GA	3	6	44740	44745	50 %	0 %	50 %	0 %	348025281
25	NC_015873	TC	3	6	50925	50930	0 %	50 %	0 %	50 %	348025288
26	NC_015873	CG	3	6	51936	51941	0 %	0 %	50 %	50 %	348025289
27	NC_015873	GC	3	6	52561	52566	0 %	0 %	50 %	50 %	348025289
28	NC_015873	AT	3	6	54425	54430	50 %	50 %	0 %	0 %	348025291
29	NC_015873	AT	3	6	55016	55021	50 %	50 %	0 %	0 %	348025291
30	NC_015873	AT	3	6	56319	56324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015873	CG	3	6	56568	56573	0 %	0 %	50 %	50 %	348025293
32	NC_015873	AT	3	6	57806	57811	50 %	50 %	0 %	0 %	348025293
33	NC_015873	CA	3	6	57974	57979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015873	GT	3	6	58809	58814	0 %	50 %	50 %	0 %	348025294
35	NC_015873	AT	3	6	59172	59177	50 %	50 %	0 %	0 %	348025294
36	NC_015873	GA	3	6	59350	59355	50 %	0 %	50 %	0 %	348025294
37	NC_015873	AG	3	6	60399	60404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015873	AT	3	6	61400	61405	50 %	50 %	0 %	0 %	348025296
39	NC_015873	AG	3	6	62771	62776	50 %	0 %	50 %	0 %	348025297
40	NC_015873	TA	3	6	63105	63110	50 %	50 %	0 %	0 %	348025297
41	NC_015873	TC	4	8	63371	63378	0 %	50 %	0 %	50 %	348025297
42	NC_015873	TC	3	6	65366	65371	0 %	50 %	0 %	50 %	348025299
43	NC_015873	AT	3	6	66584	66589	50 %	50 %	0 %	0 %	348025299
44	NC_015873	AG	3	6	67838	67843	50 %	0 %	50 %	0 %	348025299
45	NC_015873	TA	4	8	68388	68395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015873	TA	3	6	69097	69102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015873	AT	3	6	69222	69227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015873	AT	3	6	69423	69428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015873	AC	3	6	70549	70554	50 %	0 %	0 %	50 %	348025301
50	NC_015873	CG	3	6	71812	71817	0 %	0 %	50 %	50 %	348025301
51	NC_015873	TC	3	6	73321	73326	0 %	50 %	0 %	50 %	348025303
52	NC_015873	AT	3	6	73360	73365	50 %	50 %	0 %	0 %	348025303
53	NC_015873	TA	4	8	73567	73574	50 %	50 %	0 %	0 %	348025303
54	NC_015873	CG	3	6	74830	74835	0 %	0 %	50 %	50 %	348025303
55	NC_015873	AT	3	6	75880	75885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015873	GC	3	6	75928	75933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015873	TA	3	6	77457	77462	50 %	50 %	0 %	0 %	348025304
58	NC_015873	AT	3	6	78545	78550	50 %	50 %	0 %	0 %	348025305
59	NC_015873	GC	3	6	78979	78984	0 %	0 %	50 %	50 %	348025306
60	NC_015873	TA	3	6	79856	79861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015873	AT	3	6	79913	79918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015873	AT	5	10	80953	80962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015873	CT	3	6	83859	83864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015873	GC	3	6	83923	83928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015873	TG	3	6	86055	86060	0 %	50 %	50 %	0 %	348025312
66	NC_015873	TG	3	6	86614	86619	0 %	50 %	50 %	0 %	348025313
67	NC_015873	AG	3	6	87058	87063	50 %	0 %	50 %	0 %	348025313
68	NC_015873	AT	3	6	88642	88647	50 %	50 %	0 %	0 %	348025315
69	NC_015873	AT	3	6	92211	92216	50 %	50 %	0 %	0 %	348025319
70	NC_015873	TC	3	6	92995	93000	0 %	50 %	0 %	50 %	348025320
71	NC_015873	AG	3	6	93299	93304	50 %	0 %	50 %	0 %	348025320
72	NC_015873	TC	4	8	94172	94179	0 %	50 %	0 %	50 %	348025321
73	NC_015873	TA	3	6	94248	94253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015873	TA	3	6	94646	94651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015873	AT	3	6	95544	95549	50 %	50 %	0 %	0 %	348025323
76	NC_015873	AT	3	6	98592	98597	50 %	50 %	0 %	0 %	348025326
77	NC_015873	AC	3	6	100263	100268	50 %	0 %	0 %	50 %	348025329
78	NC_015873	CG	3	6	101542	101547	0 %	0 %	50 %	50 %	348025330
79	NC_015873	AT	3	6	101670	101675	50 %	50 %	0 %	0 %	348025331
80	NC_015873	GC	3	6	109098	109103	0 %	0 %	50 %	50 %	348025338
81	NC_015873	GC	3	6	110889	110894	0 %	0 %	50 %	50 %	348025339
82	NC_015873	TA	3	6	111942	111947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015873	TG	3	6	116438	116443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015873	TA	4	8	117900	117907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015873	AT	3	6	119647	119652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015873	GC	3	6	121052	121057	0 %	0 %	50 %	50 %	348025348
87	NC_015873	TG	3	6	121171	121176	0 %	50 %	50 %	0 %	348025348
88	NC_015873	AT	3	6	121769	121774	50 %	50 %	0 %	0 %	348025350
89	NC_015873	CT	3	6	123133	123138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015873	CA	3	6	123245	123250	50 %	0 %	0 %	50 %	348025352
91	NC_015873	TG	4	8	125700	125707	0 %	50 %	50 %	0 %	348025354
92	NC_015873	AG	3	6	125866	125871	50 %	0 %	50 %	0 %	348025354
93	NC_015873	CG	3	6	130331	130336	0 %	0 %	50 %	50 %	348025358
94	NC_015873	TA	3	6	134357	134362	50 %	50 %	0 %	0 %	348025361
95	NC_015873	TA	3	6	134663	134668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015873	AT	3	6	135880	135885	50 %	50 %	0 %	0 %	348025363
97	NC_015873	AT	3	6	136473	136478	50 %	50 %	0 %	0 %	348025363
98	NC_015873	CG	3	6	140203	140208	0 %	0 %	50 %	50 %	348025367
99	NC_015873	GC	3	6	142791	142796	0 %	0 %	50 %	50 %	348025370
100	NC_015873	CG	3	6	143646	143651	0 %	0 %	50 %	50 %	348025371
101	NC_015873	GC	3	6	153355	153360	0 %	0 %	50 %	50 %	348025381
102	NC_015873	GA	3	6	155761	155766	50 %	0 %	50 %	0 %	348025383
103	NC_015873	TA	3	6	160008	160013	50 %	50 %	0 %	0 %	348025386
104	NC_015873	TC	3	6	161109	161114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015873	TA	4	8	162215	162222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015873	GC	3	6	162823	162828	0 %	0 %	50 %	50 %	348025390
107	NC_015873	AT	3	6	163723	163728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015873	CA	3	6	164407	164412	50 %	0 %	0 %	50 %	348025391
109	NC_015873	AG	3	6	171814	171819	50 %	0 %	50 %	0 %	348025401
110	NC_015873	GA	4	8	172683	172690	50 %	0 %	50 %	0 %	348025402
111	NC_015873	AT	4	8	174115	174122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015873	AT	3	6	174549	174554	50 %	50 %	0 %	0 %	348025403
113	NC_015873	AT	3	6	175140	175145	50 %	50 %	0 %	0 %	348025403
114	NC_015873	GC	3	6	178040	178045	0 %	0 %	50 %	50 %	348025405
115	NC_015873	GT	3	6	179660	179665	0 %	50 %	50 %	0 %	348025406
116	NC_015873	TG	3	6	181070	181075	0 %	50 %	50 %	0 %	348025408
117	NC_015873	AG	3	6	181207	181212	50 %	0 %	50 %	0 %	348025408
118	NC_015873	CG	3	6	184072	184077	0 %	0 %	50 %	50 %	348025411
119	NC_015873	GC	3	6	184110	184115	0 %	0 %	50 %	50 %	348025411
120	NC_015873	GA	3	6	184898	184903	50 %	0 %	50 %	0 %	348025411
121	NC_015873	GC	3	6	186014	186019	0 %	0 %	50 %	50 %	348025412
122	NC_015873	AT	5	10	186112	186121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015873	AC	3	6	187911	187916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015873	CT	3	6	189245	189250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015873	TA	3	6	189303	189308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015873	TC	3	6	190772	190777	0 %	50 %	0 %	50 %	348025415
127	NC_015873	CT	3	6	190897	190902	0 %	50 %	0 %	50 %	348025415
128	NC_015873	CG	3	6	191378	191383	0 %	0 %	50 %	50 %	348025415
129	NC_015873	TA	3	6	197284	197289	50 %	50 %	0 %	0 %	348025418
130	NC_015873	AC	3	6	199587	199592	50 %	0 %	0 %	50 %	348025420
131	NC_015873	AC	3	6	199665	199670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015873	CA	3	6	199733	199738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015873	GA	3	6	199744	199749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015873	TA	3	6	199843	199848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015873	AG	3	6	201270	201275	50 %	0 %	50 %	0 %	348025422
136	NC_015873	GA	3	6	201895	201900	50 %	0 %	50 %	0 %	348025422
137	NC_015873	AT	3	6	204626	204631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015873	CT	3	6	205540	205545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015873	GA	4	8	205566	205573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015873	AT	3	6	205709	205714	50 %	50 %	0 %	0 %	348025425
141	NC_015873	TA	4	8	206053	206060	50 %	50 %	0 %	0 %	348025426
142	NC_015873	GA	3	6	208133	208138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015873	CT	3	6	208191	208196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015873	CG	3	6	208280	208285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015873	CT	3	6	208833	208838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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