MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 22802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015847	CCA	2	6	90	95	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015847	AGG	2	6	119	124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015847	CTC	2	6	161	166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015847	TCT	2	6	324	329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015847	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015847	CAG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015847	ACG	2	6	547	552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015847	CTG	2	6	608	613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015847	CAA	2	6	790	795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015847	CCT	2	6	863	868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015847	AGG	2	6	880	885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015847	GTG	2	6	955	960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015847	CCG	2	6	1225	1230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015847	CCT	2	6	1564	1569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015847	TCA	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015847	TTA	2	6	1605	1610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015847	AAG	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015847	CGG	2	6	1819	1824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015847	TAC	3	9	1852	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015847	CGG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015847	GCT	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015847	CTG	2	6	2060	2065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015847	CGA	3	9	2186	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015847	TTC	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015847	ACC	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015847	AGA	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015847	CAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015847	TTG	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015847	CAA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015847	GAC	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015847	AAG	2	6	2919	2924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015847	TAA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015847	ATA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015847	TAG	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015847	AGG	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015847	GTG	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015847	TAT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015847	TAC	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015847	GGA	2	6	3749	3754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015847	CAC	2	6	3837	3842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015847	GTC	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015847	TCA	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015847	GGC	2	6	4001	4006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015847	GGT	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015847	CAG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015847	CCA	2	6	4334	4339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015847	GCT	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015847	CTG	2	6	4488	4493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015847	TGG	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015847	CCA	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015847	TAT	2	6	4674	4679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015847	CGG	2	6	4801	4806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015847	TAG	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015847	ATA	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015847	TGA	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623185
56	NC_015847	CTT	2	6	5213	5218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623185
57	NC_015847	TTG	2	6	5223	5228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623185
58	NC_015847	AGA	2	6	5231	5236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623185
59	NC_015847	GAA	3	9	5258	5266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623185
60	NC_015847	ATA	2	6	5420	5425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
61	NC_015847	GAA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
62	NC_015847	GAA	2	6	5501	5506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
63	NC_015847	AAT	2	6	5561	5566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
64	NC_015847	CTT	2	6	5628	5633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623186
65	NC_015847	AAT	2	6	5650	5655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
66	NC_015847	AGA	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
67	NC_015847	TGA	2	6	5794	5799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623186
68	NC_015847	GAA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
69	NC_015847	ATA	2	6	5870	5875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
70	NC_015847	GAT	2	6	5912	5917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623186
71	NC_015847	CTT	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623186
72	NC_015847	AAT	2	6	6106	6111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
73	NC_015847	AAT	2	6	6149	6154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
74	NC_015847	TAA	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
75	NC_015847	TCA	2	6	6257	6262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623186
76	NC_015847	GAA	2	6	6263	6268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
77	NC_015847	TGA	2	6	6397	6402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623186
78	NC_015847	TAA	2	6	6408	6413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
79	NC_015847	ATA	2	6	6436	6441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
80	NC_015847	TAA	2	6	6442	6447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015847	CCA	2	6	6516	6521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623187
82	NC_015847	ACT	2	6	6537	6542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
83	NC_015847	ATC	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
84	NC_015847	TTC	2	6	6826	6831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623187
85	NC_015847	CTG	2	6	6853	6858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623187
86	NC_015847	TGG	2	6	6935	6940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623187
87	NC_015847	TCT	2	6	6969	6974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623187
88	NC_015847	ACT	2	6	7014	7019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
89	NC_015847	TCA	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
90	NC_015847	TGA	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623187
91	NC_015847	CAT	2	6	7184	7189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
92	NC_015847	GCT	2	6	7203	7208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623187
93	NC_015847	TTG	2	6	7321	7326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623187
94	NC_015847	ATT	2	6	7362	7367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623187
95	NC_015847	TCC	2	6	7475	7480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340623187
96	NC_015847	ATT	2	6	7578	7583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015847	TTC	2	6	7714	7719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
98	NC_015847	CTT	2	6	7731	7736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
99	NC_015847	AAT	2	6	7795	7800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623188
100	NC_015847	AAT	2	6	7855	7860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623188
101	NC_015847	CCA	2	6	7887	7892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623188
102	NC_015847	TTC	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
103	NC_015847	AAG	2	6	7933	7938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623188
104	NC_015847	TTC	2	6	7954	7959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
105	NC_015847	ATT	3	9	7976	7984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623188
106	NC_015847	TGG	2	6	8159	8164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623188
107	NC_015847	CTT	2	6	8217	8222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
108	NC_015847	CCA	2	6	8240	8245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623188
109	NC_015847	TTG	2	6	8333	8338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623188
110	NC_015847	ATT	2	6	8456	8461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623188
111	NC_015847	CAA	2	6	8464	8469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623188
112	NC_015847	ATT	2	6	8575	8580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
113	NC_015847	AGT	2	6	8603	8608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623189
114	NC_015847	CAA	2	6	8661	8666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623189
115	NC_015847	ATT	2	6	8786	8791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
116	NC_015847	TTC	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623189
117	NC_015847	ATT	2	6	8965	8970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
118	NC_015847	CAG	2	6	8994	8999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340623189
119	NC_015847	CAT	2	6	9073	9078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623189
120	NC_015847	ATT	2	6	9323	9328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
121	NC_015847	AAT	2	6	9517	9522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623189
122	NC_015847	ATA	2	6	9523	9528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623189
123	NC_015847	TTA	2	6	9633	9638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
124	NC_015847	TTC	2	6	9680	9685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623189
125	NC_015847	TAT	2	6	9847	9852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
126	NC_015847	CTG	2	6	9904	9909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623189
127	NC_015847	CAA	2	6	9927	9932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623189
128	NC_015847	CAA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623189
129	NC_015847	CAA	2	6	9954	9959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623189
130	NC_015847	TCA	2	6	10007	10012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623189
131	NC_015847	AAT	2	6	10044	10049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623189
132	NC_015847	TGC	2	6	10069	10074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623189
133	NC_015847	ACA	2	6	10304	10309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623190
134	NC_015847	GAA	2	6	10388	10393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623190
135	NC_015847	TAA	2	6	10536	10541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623190
136	NC_015847	AGA	2	6	10549	10554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623190
137	NC_015847	GTT	2	6	10601	10606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623190
138	NC_015847	ATT	2	6	10628	10633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623190
139	NC_015847	CAT	2	6	10645	10650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623190
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142	NC_015847	TAT	2	6	11134	11139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623190
143	NC_015847	TTG	2	6	11175	11180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623190
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147	NC_015847	ATT	3	9	11520	11528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623191
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149	NC_015847	ATT	2	6	11685	11690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015847	ATG	2	6	11746	11751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623192
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208	NC_015847	ATT	2	6	15522	15527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623195
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261	NC_015847	TCC	2	6	20464	20469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340623200
262	NC_015847	AGA	2	6	20535	20540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623200
263	NC_015847	TTC	2	6	20616	20621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623200
264	NC_015847	GAA	2	6	20743	20748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623200
265	NC_015847	TAT	2	6	20754	20759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623200
266	NC_015847	CAT	2	6	20768	20773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623200
267	NC_015847	TAA	2	6	20931	20936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623200
268	NC_015847	GTT	2	6	20996	21001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623200
269	NC_015847	AAG	2	6	21101	21106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623201
270	NC_015847	AAT	2	6	21155	21160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623201
271	NC_015847	AAT	2	6	21192	21197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623201
272	NC_015847	TAA	2	6	21214	21219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623201
273	NC_015847	TCT	2	6	21300	21305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623201
274	NC_015847	TCA	2	6	21361	21366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623201
275	NC_015847	TTA	2	6	21420	21425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623201
276	NC_015847	TTC	2	6	21434	21439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623201
277	NC_015847	TTC	2	6	21494	21499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623201
278	NC_015847	ATA	2	6	21516	21521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623201
279	NC_015847	TAT	2	6	21637	21642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623202
280	NC_015847	CTT	2	6	21866	21871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623202
281	NC_015847	TTA	2	6	21971	21976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623202
282	NC_015847	TTC	2	6	22113	22118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623202
283	NC_015847	TTC	2	6	22257	22262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623202
284	NC_015847	CAA	2	6	22295	22300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623202
285	NC_015847	ATT	2	6	22339	22344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623202
286	NC_015847	CTG	2	6	22368	22373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623202
287	NC_015847	TTC	2	6	22407	22412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623202
288	NC_015847	TCC	2	6	22428	22433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340623202
289	NC_015847	TCT	2	6	22503	22508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623202
290	NC_015847	AGT	2	6	22614	22619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623202
291	NC_015847	GTG	2	6	22629	22634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623202
292	NC_015847	ATA	2	6	22690	22695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623202
293	NC_015847	ATA	2	6	22729	22734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015847	GTT	2	6	22755	22760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015847	TCC	2	6	22907	22912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340623203
296	NC_015847	TTC	2	6	22973	22978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623203
297	NC_015847	TGA	2	6	23111	23116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623203
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299	NC_015847	TGA	2	6	23186	23191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623203
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301	NC_015847	AGA	2	6	23399	23404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623203
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303	NC_015847	GAA	2	6	23544	23549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623203
304	NC_015847	ATT	2	6	23623	23628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_015847	ATT	2	6	23646	23651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623204
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308	NC_015847	TAA	2	6	23904	23909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_015847	ACT	2	6	24073	24078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623205
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317	NC_015847	TAA	2	6	24443	24448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_015847	TAA	3	9	24478	24486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
319	NC_015847	GAA	2	6	24490	24495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
320	NC_015847	GTT	2	6	24503	24508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623206
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349	NC_015847	ATT	2	6	26685	26690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
350	NC_015847	TGA	2	6	26711	26716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623209
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374	NC_015847	AAT	2	6	28018	28023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623210
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376	NC_015847	TTG	2	6	28139	28144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623210
377	NC_015847	ACC	2	6	28159	28164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
378	NC_015847	AGA	2	6	28190	28195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
379	NC_015847	AAT	2	6	28212	28217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
380	NC_015847	ATT	2	6	28221	28226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623211
381	NC_015847	CAT	2	6	28329	28334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623211
382	NC_015847	TCA	2	6	28559	28564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623211
383	NC_015847	CAT	2	6	28612	28617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623211
384	NC_015847	CAT	2	6	28735	28740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623211
385	NC_015847	TGT	2	6	28818	28823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623211
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387	NC_015847	GCC	2	6	28888	28893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340623211
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