MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium africanum GM041182 chromosome

Total Repeats: 83051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015758	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630084
2	NC_015758	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630084
3	NC_015758	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
4	NC_015758	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
5	NC_015758	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630084
6	NC_015758	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
7	NC_015758	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630084
8	NC_015758	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630084
9	NC_015758	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
10	NC_015758	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630084
11	NC_015758	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
12	NC_015758	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339630084
13	NC_015758	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630084
14	NC_015758	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630084
15	NC_015758	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
16	NC_015758	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339630084
17	NC_015758	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339630084
18	NC_015758	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
19	NC_015758	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630084
20	NC_015758	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
21	NC_015758	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
22	NC_015758	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630084
23	NC_015758	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630084
24	NC_015758	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630084
25	NC_015758	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015758	CGG	2	6	1644	1649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015758	TCG	2	6	1802	1807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015758	ACC	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015758	TCG	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015758	ATG	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015758	GTT	3	9	1926	1934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015758	CTG	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015758	CGT	2	6	1951	1956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015758	TCG	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015758	GTT	2	6	2187	2192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630085
36	NC_015758	CCG	2	6	2243	2248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630085
37	NC_015758	TTG	2	6	2305	2310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630085
38	NC_015758	CGA	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630085
39	NC_015758	TTG	2	6	2464	2469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630085
40	NC_015758	ATT	2	6	2478	2483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339630085
41	NC_015758	CGC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630085
42	NC_015758	GAC	2	6	2524	2529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630085
43	NC_015758	GGT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630085
44	NC_015758	CGT	2	6	2636	2641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630085
45	NC_015758	GCC	2	6	2692	2697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630085
46	NC_015758	CGG	2	6	2709	2714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630085
47	NC_015758	GCA	2	6	2795	2800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630085
48	NC_015758	CTT	2	6	2809	2814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339630085
49	NC_015758	CCA	2	6	2870	2875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630085
50	NC_015758	GAT	2	6	2989	2994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339630085
51	NC_015758	TTG	3	9	3017	3025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630085
52	NC_015758	CGG	2	6	3206	3211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630085
53	NC_015758	TTG	2	6	3363	3368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630086
54	NC_015758	CGA	2	6	3417	3422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630086
55	NC_015758	GTG	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630086
56	NC_015758	ACG	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630086
57	NC_015758	CAA	2	6	3556	3561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339630086
58	NC_015758	ATC	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339630086
59	NC_015758	TGT	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630086
60	NC_015758	CGG	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630086
61	NC_015758	GAT	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339630086
62	NC_015758	TGG	2	6	3870	3875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630086
63	NC_015758	GAA	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339630086
64	NC_015758	AGC	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630086
65	NC_015758	GGC	2	6	4045	4050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630086
66	NC_015758	GGC	2	6	4054	4059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630086
67	NC_015758	GAC	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630086
68	NC_015758	GGC	2	6	4201	4206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630086
69	NC_015758	TGG	2	6	4228	4233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630086
70	NC_015758	GTT	2	6	4243	4248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630086
71	NC_015758	CGA	2	6	4252	4257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630086
72	NC_015758	CGG	2	6	4302	4307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630086
73	NC_015758	CCG	2	6	4314	4319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630086
74	NC_015758	CCG	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630086
75	NC_015758	GGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630086
76	NC_015758	TGC	3	9	4533	4541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630087
77	NC_015758	CGA	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630087
78	NC_015758	GGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630087
79	NC_015758	CCA	2	6	4755	4760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630087
80	NC_015758	ACG	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630087
81	NC_015758	CGC	2	6	4878	4883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630087
82	NC_015758	CGG	2	6	4928	4933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630087
83	NC_015758	GAA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015758	AGA	2	6	5142	5147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339630088
85	NC_015758	GTG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
86	NC_015758	GCG	2	6	5192	5197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630088
87	NC_015758	GAG	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339630088
88	NC_015758	AAG	2	6	5256	5261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339630088
89	NC_015758	GGT	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
90	NC_015758	CGA	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630088
91	NC_015758	TGC	2	6	5443	5448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630088
92	NC_015758	CGA	2	6	5474	5479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630088
93	NC_015758	GTG	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
94	NC_015758	CGG	2	6	5555	5560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630088
95	NC_015758	TGG	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
96	NC_015758	GGT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
97	NC_015758	AAG	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339630088
98	NC_015758	CAA	2	6	5840	5845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339630088
99	NC_015758	CGA	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630088
100	NC_015758	GTC	2	6	5892	5897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630088
101	NC_015758	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
102	NC_015758	AGC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630088
103	NC_015758	GGC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630088
104	NC_015758	GGT	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
105	NC_015758	GCG	2	6	6521	6526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630088
106	NC_015758	ATC	2	6	6693	6698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339630088
107	NC_015758	ATC	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339630088
108	NC_015758	ACG	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630088
109	NC_015758	TGT	2	6	6868	6873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630088
110	NC_015758	GTT	3	9	6878	6886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630088
111	NC_015758	CCG	2	6	6936	6941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630088
112	NC_015758	CTG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630088
113	NC_015758	GAA	2	6	7034	7039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339630088
114	NC_015758	CAA	2	6	7043	7048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339630088
115	NC_015758	ACC	2	6	7110	7115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630088
116	NC_015758	GAC	2	6	7155	7160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630088
117	NC_015758	GCC	4	12	7161	7172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630088
118	NC_015758	GTT	2	6	7178	7183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630088
119	NC_015758	GCC	2	6	7320	7325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630089
120	NC_015758	GAC	2	6	7327	7332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
121	NC_015758	CAG	2	6	7363	7368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
122	NC_015758	TCG	2	6	7409	7414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630089
123	NC_015758	ACC	2	6	7553	7558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630089
124	NC_015758	TGG	2	6	7628	7633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630089
125	NC_015758	CGG	2	6	7673	7678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630089
126	NC_015758	CGA	2	6	7737	7742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
127	NC_015758	ACG	2	6	7769	7774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
128	NC_015758	CTG	2	6	7819	7824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630089
129	NC_015758	GGC	2	6	7837	7842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630089
130	NC_015758	CGC	2	6	7871	7876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630089
131	NC_015758	ACG	2	6	7925	7930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
132	NC_015758	CGA	2	6	7932	7937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
133	NC_015758	CCG	2	6	7991	7996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630089
134	NC_015758	TCG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630089
135	NC_015758	GTT	2	6	8068	8073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630089
136	NC_015758	AGA	2	6	8079	8084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339630089
137	NC_015758	TCA	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339630089
138	NC_015758	GGT	2	6	8277	8282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630089
139	NC_015758	TCG	2	6	8345	8350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630089
140	NC_015758	ACC	2	6	8402	8407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630089
141	NC_015758	GCG	2	6	8424	8429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630089
142	NC_015758	CAC	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630089
143	NC_015758	GCT	2	6	8571	8576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630089
144	NC_015758	CGA	2	6	8583	8588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
145	NC_015758	GCG	2	6	8622	8627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630089
146	NC_015758	CAT	2	6	8652	8657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339630089
147	NC_015758	CGA	2	6	8658	8663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
148	NC_015758	CGA	2	6	8742	8747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
149	NC_015758	CGA	2	6	8775	8780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
150	NC_015758	ATC	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339630089
151	NC_015758	CGA	2	6	8820	8825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
152	NC_015758	CGT	2	6	8847	8852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630089
153	NC_015758	CGG	2	6	8919	8924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630089
154	NC_015758	GAC	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
155	NC_015758	TCG	2	6	8963	8968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630089
156	NC_015758	CTT	2	6	8973	8978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339630089
157	NC_015758	TTC	2	6	9007	9012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339630089
158	NC_015758	ACC	2	6	9013	9018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630089
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160	NC_015758	ACG	2	6	9269	9274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
161	NC_015758	CGA	3	9	9303	9311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
162	NC_015758	CTG	3	9	9313	9321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630089
163	NC_015758	CGA	2	6	9423	9428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
164	NC_015758	GCT	2	6	9432	9437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630089
165	NC_015758	CGT	2	6	9447	9452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630089
166	NC_015758	CTG	2	6	9469	9474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630089
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168	NC_015758	CCG	2	6	9570	9575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630089
169	NC_015758	CGA	3	9	9606	9614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
170	NC_015758	CGG	2	6	9639	9644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630089
171	NC_015758	TGA	2	6	9710	9715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339630089
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173	NC_015758	CGA	2	6	9771	9776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630089
174	NC_015758	CGA	3	9	9831	9839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_015758	GAG	2	6	9860	9865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_015758	CGC	2	6	10042	10047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630090
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198	NC_015758	TCG	2	6	11031	11036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_015758	CCT	2	6	11084	11089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
200	NC_015758	CGG	2	6	11321	11326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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202	NC_015758	ACC	2	6	11426	11431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
203	NC_015758	ACC	3	9	11496	11504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
204	NC_015758	GCC	2	6	11533	11538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
205	NC_015758	CCG	2	6	11638	11643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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207	NC_015758	ACT	2	6	11742	11747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
208	NC_015758	CAT	2	6	11803	11808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
209	NC_015758	GAC	2	6	11864	11869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
210	NC_015758	GGT	2	6	11903	11908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630091
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220	NC_015758	GCC	2	6	12316	12321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
221	NC_015758	CGG	2	6	12396	12401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
222	NC_015758	ACG	2	6	12665	12670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630092
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235	NC_015758	CAA	2	6	13736	13741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339630094
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239	NC_015758	GCT	3	9	14197	14205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630095
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246	NC_015758	CCG	2	6	14397	14402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630095
247	NC_015758	GGC	2	6	14416	14421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630095
248	NC_015758	TGG	2	6	14448	14453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630095
249	NC_015758	CAT	2	6	14605	14610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339630095
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252	NC_015758	CGC	3	9	14701	14709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630095
253	NC_015758	GCT	2	6	14717	14722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630095
254	NC_015758	GAA	2	6	14789	14794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339630095
255	NC_015758	ACT	2	6	14871	14876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339630095
256	NC_015758	ACG	2	6	15009	15014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630096
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382	NC_015758	ATG	2	6	22167	22172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339630101
383	NC_015758	GTA	2	6	22199	22204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339630101
384	NC_015758	TGC	2	6	22207	22212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630101
385	NC_015758	GAT	2	6	22214	22219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339630101
386	NC_015758	TCA	2	6	22246	22251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339630101
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400	NC_015758	TCG	2	6	23255	23260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_015758	GTC	2	6	23338	23343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630102
402	NC_015758	GTC	2	6	23445	23450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630102
403	NC_015758	GTC	2	6	23469	23474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630102
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411	NC_015758	GAT	2	6	24075	24080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339630103
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500	NC_015758	GGC	2	6	28764	28769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630107

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