MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma bovis Hubei-1 chromosome

Total Repeats: 525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015725	ATTTTT	2	12	3353	3364	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	339320532
2	NC_015725	ACCTTT	2	12	4371	4382	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	339320532
3	NC_015725	AATTAG	2	12	7562	7573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320535
4	NC_015725	AACTTC	2	12	10979	10990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320538
5	NC_015725	TTCCTT	2	12	11432	11443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320539
6	NC_015725	CCAATA	2	12	11926	11937	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	339320539
7	NC_015725	TTTTCA	2	12	12062	12073	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	339320540
8	NC_015725	AATCAA	2	12	13398	13409	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	339320542
9	NC_015725	TTAAAA	2	12	13999	14010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320543
10	NC_015725	CAAAAT	2	12	18815	18826	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	339320547
11	NC_015725	CCACTA	2	12	18984	18995	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	339320547
12	NC_015725	ATGAAG	2	12	21895	21906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339320549
13	NC_015725	AATATT	2	12	23681	23692	50 %	50 %	0 %	0 %	339320551
14	NC_015725	CCATTT	2	12	23781	23792	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	339320551
15	NC_015725	TTTACA	2	12	28030	28041	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	339320555
16	NC_015725	AGTTAA	2	12	29055	29066	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320555
17	NC_015725	AATTTC	2	12	30572	30583	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	339320556
18	NC_015725	AAAATA	2	12	31668	31679	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	339320558
19	NC_015725	TTGACT	2	12	32770	32781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	339320559
20	NC_015725	CTTTTC	2	12	33140	33151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320560
21	NC_015725	ACCAGA	2	12	34079	34090	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	339320560
22	NC_015725	ATTCAT	2	12	35922	35933	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	339320561
23	NC_015725	TTCTCT	2	12	36897	36908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320562
24	NC_015725	ACCTTT	2	12	41297	41308	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	339320565
25	NC_015725	AGCTCT	2	12	41645	41656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339320565
26	NC_015725	TTAGTT	2	12	45765	45776	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	339320565
27	NC_015725	AGTTTA	2	12	49266	49277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	339320565
28	NC_015725	GAAAAT	2	12	53360	53371	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339320567
29	NC_015725	TAAGTA	2	12	54936	54947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320569
30	NC_015725	ATTTAT	2	12	56492	56503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015725	AAATGA	2	12	58367	58378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339320572
32	NC_015725	ATGAAC	2	12	58714	58725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339320572
33	NC_015725	TAAGTG	2	12	59420	59431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320573
34	NC_015725	CCAATT	2	12	64195	64206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320578
35	NC_015725	TCAGTT	2	12	65758	65769	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	339320580
36	NC_015725	GAAAAT	2	12	67834	67845	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339320582
37	NC_015725	TAAGAA	2	12	67940	67951	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339320582
38	NC_015725	TAAATA	2	12	69623	69634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015725	AGCTCT	2	12	70034	70045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339320584
40	NC_015725	TCAAAA	2	12	70514	70525	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	339320584
41	NC_015725	TAATTT	2	12	71299	71310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320585
42	NC_015725	TTTTGA	2	12	73485	73496	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	339320588
43	NC_015725	GACAAA	2	12	73513	73524	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	339320588
44	NC_015725	ATGCAA	2	12	75280	75291	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339320589
45	NC_015725	TGAAAA	2	12	75782	75793	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339320589
46	NC_015725	AGTTAA	2	12	79794	79805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320593
47	NC_015725	GCTTCA	2	12	84730	84741	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339320594
48	NC_015725	AATTGA	2	12	95362	95373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320604
49	NC_015725	TTATCT	2	12	95659	95670	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	339320605
50	NC_015725	TAAATA	2	12	97192	97203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320607
51	NC_015725	TGTTCG	2	12	98781	98792	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339320609
52	NC_015725	CCTGTT	2	12	98911	98922	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339320609
53	NC_015725	CTTTGA	2	12	99560	99571	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	339320610
54	NC_015725	AACTCC	2	12	99671	99682	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	339320610
55	NC_015725	AGAATT	2	12	101532	101543	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320612
56	NC_015725	TGAAAA	2	12	103833	103844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339320615
57	NC_015725	TGTTTT	2	12	108046	108057	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	339320621
58	NC_015725	TAAATT	2	12	109346	109357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015725	TAATAT	2	12	109453	109464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015725	TTGATG	2	12	109598	109609	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	339320623
61	NC_015725	GAAAAA	2	12	110380	110391	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	339320623
62	NC_015725	TTAGCT	2	12	114206	114217	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	339320627
63	NC_015725	CACCCA	2	12	114260	114271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339320627
64	NC_015725	GAATCT	2	12	116637	116648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339320630
65	NC_015725	TTAGAA	2	12	118479	118490	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320632
66	NC_015725	TGTATT	2	12	121674	121685	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	339320633
67	NC_015725	AATTAA	2	12	123605	123616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320634
68	NC_015725	TCTGGT	2	12	123863	123874	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339320635
69	NC_015725	TTTAAA	2	12	124084	124095	50 %	50 %	0 %	0 %	339320635
70	NC_015725	TGAAGT	2	12	126437	126448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320636
71	NC_015725	GAATAT	2	12	128151	128162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320637
72	NC_015725	ATATTT	2	12	128461	128472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320638
73	NC_015725	ATATAG	2	12	131561	131572	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320640
74	NC_015725	GTTCCT	2	12	143793	143804	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339320652
75	NC_015725	AAGCAA	2	12	145123	145134	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	339320652
76	NC_015725	GAAAAT	2	12	145773	145784	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339320653
77	NC_015725	AAATCA	2	12	146033	146044	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	339320653
78	NC_015725	GACATT	2	12	149964	149975	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339320655
79	NC_015725	CACTGA	2	12	153128	153139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339320658
80	NC_015725	TAATGG	2	12	153152	153163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320658
81	NC_015725	GACAAA	2	12	153489	153500	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	339320658
82	NC_015725	GAAAAT	2	12	154364	154375	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339320659
83	NC_015725	AAATCA	2	12	154624	154635	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	339320659
84	NC_015725	ACAAAA	2	12	156269	156280	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	339320660
85	NC_015725	TGATAA	2	12	156864	156875	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320660
86	NC_015725	TGCTTC	2	12	159536	159547	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339320664
87	NC_015725	TTTCAT	2	12	159760	159771	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	339320664
88	NC_015725	AAGCAA	2	12	162593	162604	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015725	GTTTGC	2	12	162606	162617	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015725	AAAATT	2	12	162939	162950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320666
91	NC_015725	ACTTTG	2	12	164824	164835	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	339320666
92	NC_015725	CTTTTT	2	12	166768	166779	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	339320667
93	NC_015725	CAAAAA	2	12	168915	168926	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	339320669
94	NC_015725	GGAAAT	2	12	169949	169960	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339320670
95	NC_015725	TGGTTA	2	12	171674	171685	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	339320672
96	NC_015725	TAATGC	2	12	172880	172891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339320673
97	NC_015725	TAAAAT	2	12	173639	173650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015725	ATATAA	2	12	173653	173664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015725	TGTAAA	2	12	176667	176678	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320676
100	NC_015725	AATGGC	2	12	177117	177128	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339320676
101	NC_015725	TAAGAT	2	12	177333	177344	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320676
102	NC_015725	TAGCAC	2	12	178560	178571	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339320677
103	NC_015725	CATATG	2	12	184095	184106	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339320684
104	NC_015725	TATCTT	2	12	186031	186042	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	339320685
105	NC_015725	TATCTT	2	12	187803	187814	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	339320686
106	NC_015725	TAATGT	2	12	188466	188477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	339320686
107	NC_015725	GTTTTG	2	12	190937	190948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339320688
108	NC_015725	TTAAAT	2	12	192205	192216	50 %	50 %	0 %	0 %	339320690
109	NC_015725	ATTTTT	2	12	192546	192557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	339320690
110	NC_015725	TTTATA	2	12	193406	193417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320691
111	NC_015725	TTTTCT	2	12	195813	195824	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	339320693
112	NC_015725	ATCAAA	2	12	195846	195857	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	339320693
113	NC_015725	AATTTT	2	12	196311	196322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320693
114	NC_015725	TCAAAT	2	12	197507	197518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	339320694
115	NC_015725	GACAAA	2	12	198887	198898	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	339320694
116	NC_015725	TTGGTG	2	12	198906	198917	0 %	50 %	50 %	0 %	339320694
117	NC_015725	TTATGG	2	12	199084	199095	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	339320694
118	NC_015725	AAAATA	2	12	199342	199353	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	339320694
119	NC_015725	AATATC	3	18	202978	202995	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	339320697
120	NC_015725	AAATTG	2	12	206073	206084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015725	AGAAAA	2	12	206315	206326	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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236	NC_015725	ATTTTA	2	12	401229	401240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320855
237	NC_015725	AAACAT	2	12	402746	402757	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
238	NC_015725	AGGAAT	2	12	403710	403721	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339320857
239	NC_015725	AAACAT	2	12	405742	405753	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	339320858
240	NC_015725	GGAAAT	2	12	407334	407345	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339320861
241	NC_015725	TTAATT	2	12	412399	412410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320868
242	NC_015725	TTATTT	2	12	412509	412520	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	339320868
243	NC_015725	ATGTTT	2	12	416250	416261	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	339320871
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245	NC_015725	AAAATC	2	12	418212	418223	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	339320872
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249	NC_015725	TAATGA	2	12	431010	431021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339320884
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251	NC_015725	AATAGA	2	12	431595	431606	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339320885
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255	NC_015725	ATGAGA	2	12	437112	437123	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_015725	ATTTTT	2	12	438261	438272	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	339320892
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267	NC_015725	ATGAAA	2	12	451892	451903	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339320903
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269	NC_015725	AGCTAA	2	12	453585	453596	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339320905
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274	NC_015725	CTAAAA	2	12	457338	457349	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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304	NC_015725	AGCTTC	2	12	507159	507170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339320951
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332	NC_015725	CTGAAA	2	12	568036	568047	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339320998
333	NC_015725	GCTATT	2	12	569369	569380	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	339320998
334	NC_015725	ATCTTT	3	18	569843	569860	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	339320998
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337	NC_015725	ACTTAA	2	12	574470	574481	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	339321003
338	NC_015725	TCAAAG	2	12	577458	577469	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339321004
339	NC_015725	TTCCTT	2	12	577912	577923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339321004
340	NC_015725	CTTTAT	2	12	578035	578046	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	339321004
341	NC_015725	AGGCTT	2	12	580667	580678	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339321005
342	NC_015725	ATAAAA	2	12	580978	580989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_015725	AATTTT	2	12	585549	585560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339321007
344	NC_015725	TTTTCA	2	12	585592	585603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	339321007
345	NC_015725	ATTTAT	2	12	586572	586583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339321008
346	NC_015725	ATTATG	2	12	586918	586929	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	339321008
347	NC_015725	TAATTT	2	12	588112	588123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339321009
348	NC_015725	ACGAAA	2	12	589326	589337	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	339321009
349	NC_015725	AAAAGT	2	12	590688	590699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
350	NC_015725	CTTTGT	2	12	592558	592569	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	339321012
351	NC_015725	TAACTT	2	12	592607	592618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	339321012
352	NC_015725	TTCAAT	2	12	594256	594267	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	339321014
353	NC_015725	TTTTTG	2	12	595599	595610	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	339321015
354	NC_015725	TTTATA	2	12	595739	595750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339321015
355	NC_015725	GCAACA	2	12	598931	598942	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	339321019
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357	NC_015725	ATGAAA	2	12	599700	599711	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339321020
358	NC_015725	ACTTTT	2	12	601647	601658	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	339321021
359	NC_015725	CATTAG	2	12	603944	603955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339321022
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391	NC_015725	ATCAAA	2	12	659986	659997	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	339321070
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431	NC_015725	TTATAA	2	12	746052	746063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_015725	TAAAAA	2	12	747315	747326	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_015725	TTTTTG	2	12	769986	769997	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
444	NC_015725	TAAAAT	2	12	772003	772014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339321177
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450	NC_015725	AGTTAG	2	12	782859	782870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321180
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453	NC_015725	ATTTTT	2	12	790932	790943	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_015725	TAACAA	2	12	791393	791404	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	339321182
455	NC_015725	AGCTTC	2	12	791990	792001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339321183
456	NC_015725	ACAGCA	2	12	792192	792203	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	339321183
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458	NC_015725	CTTGCT	2	12	795505	795516	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339321186
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461	NC_015725	TAATTG	2	12	797735	797746	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	339321188
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464	NC_015725	ATTTTT	2	12	803655	803666	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	339321193
465	NC_015725	ATTAAA	2	12	805725	805736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339321194
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467	NC_015725	AAAGTT	2	12	808286	808297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
468	NC_015725	ATTTAA	2	12	808910	808921	50 %	50 %	0 %	0 %	339321199
469	NC_015725	TCTAAT	2	12	809361	809372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	339321200
470	NC_015725	TCAAGC	2	12	811793	811804	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339321200
471	NC_015725	CCTAAT	2	12	812490	812501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321201
472	NC_015725	TTATCT	2	12	815184	815195	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	339321203
473	NC_015725	AGTTAA	2	12	816845	816856	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339321205
474	NC_015725	AATTAA	2	12	819455	819466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339321209
475	NC_015725	TAAAGA	2	12	821917	821928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339321211
476	NC_015725	TTAAAA	2	12	824910	824921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339321213
477	NC_015725	GATATT	2	12	826748	826759	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
478	NC_015725	GCAATA	2	12	832027	832038	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339321222
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480	NC_015725	CATTTT	2	12	836787	836798	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	339321229
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488	NC_015725	TGCATA	2	12	845685	845696	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339321236
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491	NC_015725	TAAATA	2	12	855929	855940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339321246
492	NC_015725	TATGCA	2	12	857131	857142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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496	NC_015725	AGCAAC	2	12	867152	867163	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	339321259
497	NC_015725	ACTTCC	2	12	871299	871310	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	339321265
498	NC_015725	AAAAAT	2	12	871943	871954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	339321265
499	NC_015725	CTTACG	2	12	877516	877527	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339321271
500	NC_015725	CAATTG	2	12	877925	877936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339321271

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