MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 1770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015676	CAATG	2	10	85	94	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015676	ATATT	2	10	158	167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015676	CTGTA	2	10	540	549	20 %	40 %	20 %	20 %	336475960
4	NC_015676	CTGAT	2	10	1302	1311	20 %	40 %	20 %	20 %	336475960
5	NC_015676	AAATG	2	10	4653	4662	60 %	20 %	20 %	0 %	336475963
6	NC_015676	GAAAA	2	10	5669	5678	80 %	0 %	20 %	0 %	336475964
7	NC_015676	AAAAG	2	10	6049	6058	80 %	0 %	20 %	0 %	336475964
8	NC_015676	GTACA	2	10	10833	10842	40 %	20 %	20 %	20 %	336475968
9	NC_015676	TCACA	2	10	13257	13266	40 %	20 %	0 %	40 %	336475970
10	NC_015676	CTTTA	2	10	13929	13938	20 %	60 %	0 %	20 %	336475971
11	NC_015676	AATGA	2	10	14659	14668	60 %	20 %	20 %	0 %	336475971
12	NC_015676	ATATC	2	10	17735	17744	40 %	40 %	0 %	20 %	336475975
13	NC_015676	CATTC	2	10	18581	18590	20 %	40 %	0 %	40 %	336475976
14	NC_015676	TTGCT	2	10	19254	19263	0 %	60 %	20 %	20 %	336475976
15	NC_015676	CATCT	2	10	21052	21061	20 %	40 %	0 %	40 %	336475978
16	NC_015676	AAAAC	2	10	23092	23101	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015676	GAATA	2	10	23678	23687	60 %	20 %	20 %	0 %	336475981
18	NC_015676	ATCCA	2	10	26808	26817	40 %	20 %	0 %	40 %	336475984
19	NC_015676	AGATG	2	10	29716	29725	40 %	20 %	40 %	0 %	336475987
20	NC_015676	GTGAG	2	10	30737	30746	20 %	20 %	60 %	0 %	336475988
21	NC_015676	ATGGT	2	10	31388	31397	20 %	40 %	40 %	0 %	336475988
22	NC_015676	TCTTT	2	10	34539	34548	0 %	80 %	0 %	20 %	336475991
23	NC_015676	CTTTC	2	10	34782	34791	0 %	60 %	0 %	40 %	336475991
24	NC_015676	CCCAT	2	10	35666	35675	20 %	20 %	0 %	60 %	336475991
25	NC_015676	CTGGG	2	10	36005	36014	0 %	20 %	60 %	20 %	336475991
26	NC_015676	GATGG	2	10	36956	36965	20 %	20 %	60 %	0 %	336475993
27	NC_015676	CAGTT	2	10	39437	39446	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015676	GGCTC	2	10	41422	41431	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_015676	TGTGG	2	10	41676	41685	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015676	TCATA	2	10	42028	42037	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015676	GAAAG	2	10	44399	44408	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015676	CATCT	2	10	45674	45683	20 %	40 %	0 %	40 %	336475995
33	NC_015676	ATCTG	2	10	49182	49191	20 %	40 %	20 %	20 %	336475999
34	NC_015676	TCTGG	2	10	49215	49224	0 %	40 %	40 %	20 %	336475999
35	NC_015676	TGAAA	2	10	50826	50835	60 %	20 %	20 %	0 %	336476002
36	NC_015676	TTACT	2	10	51252	51261	20 %	60 %	0 %	20 %	336476002
37	NC_015676	GCTCA	2	10	51577	51586	20 %	20 %	20 %	40 %	336476002
38	NC_015676	ACTAT	2	10	51812	51821	40 %	40 %	0 %	20 %	336476002
39	NC_015676	GAAGA	2	10	52390	52399	60 %	0 %	40 %	0 %	336476002
40	NC_015676	GTCTG	2	10	54439	54448	0 %	40 %	40 %	20 %	336476004
41	NC_015676	ATATT	2	10	58286	58295	40 %	60 %	0 %	0 %	336476009
42	NC_015676	AAATG	2	10	61803	61812	60 %	20 %	20 %	0 %	336476011
43	NC_015676	TCCTC	2	10	62720	62729	0 %	40 %	0 %	60 %	336476012
44	NC_015676	GATCC	2	10	63523	63532	20 %	20 %	20 %	40 %	336476014
45	NC_015676	TATGT	2	10	65912	65921	20 %	60 %	20 %	0 %	336476017
46	NC_015676	AGTGT	2	10	66782	66791	20 %	40 %	40 %	0 %	336476018
47	NC_015676	GAAAT	2	10	66927	66936	60 %	20 %	20 %	0 %	336476018
48	NC_015676	TCCCA	2	10	68898	68907	20 %	20 %	0 %	60 %	336476020
49	NC_015676	TGCCT	2	10	69634	69643	0 %	40 %	20 %	40 %	336476021
50	NC_015676	TGCTG	2	10	71930	71939	0 %	40 %	40 %	20 %	336476023
51	NC_015676	CACAG	2	10	72110	72119	40 %	0 %	20 %	40 %	336476023
52	NC_015676	AGATC	2	10	72342	72351	40 %	20 %	20 %	20 %	336476024
53	NC_015676	ATGAT	2	10	79409	79418	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015676	TGGGT	2	10	84918	84927	0 %	40 %	60 %	0 %	336476038
55	NC_015676	TACTG	2	10	85343	85352	20 %	40 %	20 %	20 %	336476038
56	NC_015676	TCTGG	2	10	86590	86599	0 %	40 %	40 %	20 %	336476039
57	NC_015676	TGTAT	2	10	87955	87964	20 %	60 %	20 %	0 %	336476040
58	NC_015676	TACAT	2	10	88533	88542	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015676	TGATT	2	10	94926	94935	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015676	CACTA	2	10	95326	95335	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015676	TACAG	2	10	95612	95621	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015676	AAAAC	2	10	98705	98714	80 %	0 %	0 %	20 %	336476051
63	NC_015676	GTTCA	2	10	99490	99499	20 %	40 %	20 %	20 %	336476053
64	NC_015676	CTGTT	2	10	99596	99605	0 %	60 %	20 %	20 %	336476053
65	NC_015676	TTTCT	2	10	102023	102032	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015676	ATCTG	2	10	104515	104524	20 %	40 %	20 %	20 %	336476058
67	NC_015676	CTATA	2	10	105198	105207	40 %	40 %	0 %	20 %	336476059
68	NC_015676	ATTGC	2	10	107690	107699	20 %	40 %	20 %	20 %	336476062
69	NC_015676	CTCAT	2	10	107884	107893	20 %	40 %	0 %	40 %	336476062
70	NC_015676	ACTGC	2	10	108027	108036	20 %	20 %	20 %	40 %	336476062
71	NC_015676	GTTTG	2	10	108431	108440	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015676	TTCAG	2	10	111063	111072	20 %	40 %	20 %	20 %	336476065
73	NC_015676	TATGA	2	10	114345	114354	40 %	40 %	20 %	0 %	336476067
74	NC_015676	ATTTT	2	10	114425	114434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015676	TACCC	2	10	116069	116078	20 %	20 %	0 %	60 %	336476068
76	NC_015676	TCATA	2	10	116260	116269	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015676	TTATA	2	10	116338	116347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015676	ATAAA	2	10	117947	117956	80 %	20 %	0 %	0 %	336476070
79	NC_015676	TTCTT	2	10	119412	119421	0 %	80 %	0 %	20 %	336476070
80	NC_015676	GAATC	2	10	119551	119560	40 %	20 %	20 %	20 %	336476070
81	NC_015676	ATTCA	2	10	119667	119676	40 %	40 %	0 %	20 %	336476070
82	NC_015676	TATAA	2	10	119936	119945	60 %	40 %	0 %	0 %	336476070
83	NC_015676	TGAAA	2	10	120854	120863	60 %	20 %	20 %	0 %	336476070
84	NC_015676	ATTTT	2	10	121888	121897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015676	TAGTG	2	10	122793	122802	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015676	TTTTA	2	10	123018	123027	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015676	TTTTC	2	10	124455	124464	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015676	TAATA	2	10	124572	124581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015676	ATTTT	2	10	127957	127966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015676	CCAGA	2	10	128463	128472	40 %	0 %	20 %	40 %	336476073
91	NC_015676	ATTTT	2	10	129180	129189	20 %	80 %	0 %	0 %	336476074
92	NC_015676	AAAAT	3	15	129961	129975	80 %	20 %	0 %	0 %	336476074
93	NC_015676	TTTTC	2	10	132177	132186	0 %	80 %	0 %	20 %	336476075
94	NC_015676	ATTTG	2	10	132741	132750	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015676	CTGAA	2	10	134087	134096	40 %	20 %	20 %	20 %	336476077
96	NC_015676	GATAT	2	10	135219	135228	40 %	40 %	20 %	0 %	336476078
97	NC_015676	TTTAA	2	10	136863	136872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015676	TAGAA	2	10	137600	137609	60 %	20 %	20 %	0 %	336476080
99	NC_015676	TGAAT	2	10	137829	137838	40 %	40 %	20 %	0 %	336476080
100	NC_015676	GAATA	2	10	138117	138126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015676	CTAAA	2	10	138277	138286	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015676	AATTT	2	10	138324	138333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015676	ATTTA	2	10	138846	138855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015676	CTTAT	2	10	139113	139122	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015676	AAAAT	2	10	142914	142923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015676	AATTT	2	10	142945	142954	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015676	AACGT	2	10	143168	143177	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015676	TGTTT	2	10	143826	143835	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015676	CATAT	2	10	144093	144102	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015676	ACTAT	2	10	144227	144236	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015676	ACTTT	2	10	144664	144673	20 %	60 %	0 %	20 %	336476085
112	NC_015676	TATAG	2	10	146647	146656	40 %	40 %	20 %	0 %	336476087
113	NC_015676	ATTCT	2	10	147092	147101	20 %	60 %	0 %	20 %	336476087
114	NC_015676	ATTCA	2	10	148855	148864	40 %	40 %	0 %	20 %	336476087
115	NC_015676	CATTT	2	10	148894	148903	20 %	60 %	0 %	20 %	336476087
116	NC_015676	AATTC	2	10	151230	151239	40 %	40 %	0 %	20 %	336476088
117	NC_015676	CTGAA	2	10	152056	152065	40 %	20 %	20 %	20 %	336476088
118	NC_015676	AAATA	2	10	155166	155175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015676	TCCAG	2	10	155284	155293	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_015676	CCTGC	2	10	155483	155492	0 %	20 %	20 %	60 %	336476089
121	NC_015676	ATATT	2	10	158404	158413	40 %	60 %	0 %	0 %	336476091
122	NC_015676	TGAAC	2	10	158480	158489	40 %	20 %	20 %	20 %	336476091
123	NC_015676	TTCAG	2	10	158522	158531	20 %	40 %	20 %	20 %	336476091
124	NC_015676	CGGAT	2	10	158555	158564	20 %	20 %	40 %	20 %	336476091
125	NC_015676	ATGAA	2	10	160126	160135	60 %	20 %	20 %	0 %	336476091
126	NC_015676	TCCAG	2	10	160213	160222	20 %	20 %	20 %	40 %	336476091
127	NC_015676	TCTTA	2	10	160463	160472	20 %	60 %	0 %	20 %	336476091
128	NC_015676	TGGTC	2	10	161693	161702	0 %	40 %	40 %	20 %	336476092
129	NC_015676	AAACT	2	10	163162	163171	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015676	AAAAT	2	10	163234	163243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015676	ATTAC	2	10	164528	164537	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015676	TATAA	2	10	166041	166050	60 %	40 %	0 %	0 %	336476097
133	NC_015676	ATTCA	2	10	166357	166366	40 %	40 %	0 %	20 %	336476098
134	NC_015676	ATGGC	2	10	166886	166895	20 %	20 %	40 %	20 %	336476098
135	NC_015676	GATCA	2	10	170049	170058	40 %	20 %	20 %	20 %	336476100
136	NC_015676	TGGAA	2	10	171024	171033	40 %	20 %	40 %	0 %	336476100
137	NC_015676	GGGCT	2	10	171162	171171	0 %	20 %	60 %	20 %	336476100
138	NC_015676	GAACA	2	10	171418	171427	60 %	0 %	20 %	20 %	336476100
139	NC_015676	AGAAC	2	10	172965	172974	60 %	0 %	20 %	20 %	336476101
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199	NC_015676	TGTAA	2	10	252620	252629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_015676	TTCAA	2	10	324713	324722	40 %	40 %	0 %	20 %	336476238
263	NC_015676	TTAAA	2	10	327161	327170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_015676	TGAGA	2	10	329936	329945	40 %	20 %	40 %	0 %	336476241
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267	NC_015676	AATAA	2	10	338703	338712	80 %	20 %	0 %	0 %	336476244
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