MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 44876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015676	A	7	7	23860	23866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015676	TGT	2	6	23867	23872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015676	TCA	2	6	24149	24154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475982
504	NC_015676	CAA	2	6	24195	24200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475982
505	NC_015676	GTT	2	6	24301	24306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475982
506	NC_015676	TCT	2	6	24354	24359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475982
507	NC_015676	CTG	2	6	24407	24412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475982
508	NC_015676	TCA	2	6	24572	24577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475982
509	NC_015676	TTA	2	6	24593	24598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475982
510	NC_015676	CTT	2	6	24630	24635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475982
511	NC_015676	ATC	2	6	24703	24708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475982
512	NC_015676	CAT	2	6	24777	24782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475982
513	NC_015676	CTG	2	6	24797	24802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475982
514	NC_015676	CAA	2	6	24912	24917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475982
515	NC_015676	AGC	2	6	24922	24927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475982
516	NC_015676	TCT	2	6	24930	24935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475982
517	NC_015676	TA	3	6	24982	24987	50 %	50 %	0 %	0 %	336475982
518	NC_015676	CTG	2	6	24995	25000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475982
519	NC_015676	AT	3	6	25052	25057	50 %	50 %	0 %	0 %	336475982
520	NC_015676	CTG	2	6	25063	25068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015676	CAT	2	6	25083	25088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015676	ATG	2	6	25117	25122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015676	AT	3	6	25132	25137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015676	AT	3	6	25141	25146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015676	ATT	2	6	25195	25200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015676	AAT	2	6	25203	25208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015676	TAT	2	6	25211	25216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015676	GAT	2	6	25429	25434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475983
529	NC_015676	CTG	2	6	25456	25461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475983
530	NC_015676	TTG	2	6	25468	25473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475983
531	NC_015676	GAT	2	6	25552	25557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475983
532	NC_015676	CTTC	2	8	25621	25628	0 %	50 %	0 %	50 %	336475983
533	NC_015676	TAC	2	6	25633	25638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475983
534	NC_015676	CTT	2	6	25666	25671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475983
535	NC_015676	AC	3	6	25752	25757	50 %	0 %	0 %	50 %	336475983
536	NC_015676	AGG	2	6	25798	25803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475983
537	NC_015676	ATTG	2	8	25935	25942	25 %	50 %	25 %	0 %	336475984
538	NC_015676	AT	3	6	25976	25981	50 %	50 %	0 %	0 %	336475984
539	NC_015676	GT	3	6	25990	25995	0 %	50 %	50 %	0 %	336475984
540	NC_015676	GCA	2	6	26116	26121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475984
541	NC_015676	T	6	6	26122	26127	0 %	100 %	0 %	0 %	336475984
542	NC_015676	GCAG	2	8	26140	26147	25 %	0 %	50 %	25 %	336475984
543	NC_015676	C	6	6	26333	26338	0 %	0 %	0 %	100 %	336475984
544	NC_015676	CAGG	2	8	26354	26361	25 %	0 %	50 %	25 %	336475984
545	NC_015676	CCT	2	6	26410	26415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475984
546	NC_015676	ATA	2	6	26424	26429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475984
547	NC_015676	C	6	6	26535	26540	0 %	0 %	0 %	100 %	336475984
548	NC_015676	CTTT	2	8	26560	26567	0 %	75 %	0 %	25 %	336475984
549	NC_015676	A	6	6	26570	26575	100 %	0 %	0 %	0 %	336475984
550	NC_015676	TAA	3	9	26598	26606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475984
551	NC_015676	C	6	6	26647	26652	0 %	0 %	0 %	100 %	336475984
552	NC_015676	TCCATT	2	12	26653	26664	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	336475984
553	NC_015676	GA	3	6	26666	26671	50 %	0 %	50 %	0 %	336475984
554	NC_015676	ATCCA	2	10	26808	26817	40 %	20 %	0 %	40 %	336475984
555	NC_015676	CAG	2	6	26837	26842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475984
556	NC_015676	AT	3	6	26893	26898	50 %	50 %	0 %	0 %	336475984
557	NC_015676	TC	3	6	26933	26938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_015676	T	6	6	26965	26970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015676	ATT	2	6	27004	27009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015676	TTA	2	6	27034	27039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015676	ATTGTA	2	12	27061	27072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015676	TAA	2	6	27094	27099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015676	ATA	2	6	27111	27116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015676	ACA	2	6	27180	27185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015676	TAA	2	6	27205	27210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015676	A	7	7	27217	27223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015676	AGT	2	6	27342	27347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015676	GTG	2	6	27352	27357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015676	CGTA	2	8	27391	27398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_015676	AT	3	6	27416	27421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015676	CTG	2	6	27479	27484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_015676	T	7	7	27539	27545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015676	AAT	2	6	27574	27579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015676	GA	3	6	27597	27602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015676	TAC	2	6	27624	27629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475985
576	NC_015676	AT	3	6	27633	27638	50 %	50 %	0 %	0 %	336475985
577	NC_015676	AAAT	2	8	27650	27657	75 %	25 %	0 %	0 %	336475985
578	NC_015676	GAA	2	6	27761	27766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475985
579	NC_015676	GTT	2	6	27781	27786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475985
580	NC_015676	AT	3	6	27818	27823	50 %	50 %	0 %	0 %	336475985
581	NC_015676	TTCC	2	8	27827	27834	0 %	50 %	0 %	50 %	336475985
582	NC_015676	AGA	2	6	27930	27935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475985
583	NC_015676	AGA	2	6	28059	28064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475985
584	NC_015676	TGG	2	6	28133	28138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475985
585	NC_015676	AAGG	2	8	28139	28146	50 %	0 %	50 %	0 %	336475985
586	NC_015676	TG	3	6	28192	28197	0 %	50 %	50 %	0 %	336475985
587	NC_015676	CCT	2	6	28213	28218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475985
588	NC_015676	A	7	7	28240	28246	100 %	0 %	0 %	0 %	336475985
589	NC_015676	GGA	2	6	28276	28281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475985
590	NC_015676	GGC	2	6	28464	28469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336475985
591	NC_015676	AAAG	2	8	28481	28488	75 %	0 %	25 %	0 %	336475985
592	NC_015676	CAGA	2	8	28498	28505	50 %	0 %	25 %	25 %	336475985
593	NC_015676	GCT	2	6	28558	28563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475985
594	NC_015676	A	6	6	28566	28571	100 %	0 %	0 %	0 %	336475985
595	NC_015676	CAA	2	6	28598	28603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475985
596	NC_015676	AGA	2	6	28621	28626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475985
597	NC_015676	AGG	2	6	28634	28639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475985
598	NC_015676	TCT	2	6	28728	28733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475985
599	NC_015676	GTT	2	6	28819	28824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475985
600	NC_015676	TTG	2	6	28886	28891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475985
601	NC_015676	GCA	2	6	28942	28947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475985
602	NC_015676	T	6	6	29003	29008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015676	ATT	2	6	29014	29019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015676	ATC	2	6	29021	29026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_015676	TAA	2	6	29032	29037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015676	A	6	6	29036	29041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015676	TA	3	6	29054	29059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015676	GGA	2	6	29068	29073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015676	TAA	2	6	29087	29092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015676	AAC	2	6	29128	29133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015676	A	7	7	29159	29165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015676	CA	3	6	29209	29214	50 %	0 %	0 %	50 %	336475986
613	NC_015676	GAA	2	6	29269	29274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475986
614	NC_015676	CT	3	6	29284	29289	0 %	50 %	0 %	50 %	336475986
615	NC_015676	AAT	2	6	29367	29372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475986
616	NC_015676	AGA	2	6	29376	29381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475986
617	NC_015676	ATTC	2	8	29475	29482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NC_015676	ATTT	2	8	29498	29505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015676	A	6	6	29695	29700	100 %	0 %	0 %	0 %	336475987
620	NC_015676	AGATG	2	10	29716	29725	40 %	20 %	40 %	0 %	336475987
621	NC_015676	TG	3	6	29724	29729	0 %	50 %	50 %	0 %	336475987
622	NC_015676	ACCCTG	2	12	29735	29746	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336475987
623	NC_015676	CACT	2	8	29781	29788	25 %	25 %	0 %	50 %	336475987
624	NC_015676	GCA	2	6	29808	29813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475987
625	NC_015676	T	7	7	29826	29832	0 %	100 %	0 %	0 %	336475987
626	NC_015676	TTC	2	6	29933	29938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475987
627	NC_015676	ATC	2	6	29967	29972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475987
628	NC_015676	TCC	2	6	30060	30065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475988
629	NC_015676	TTA	2	6	30146	30151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475988
630	NC_015676	TCA	2	6	30187	30192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475988
631	NC_015676	GAAG	2	8	30214	30221	50 %	0 %	50 %	0 %	336475988
632	NC_015676	T	7	7	30413	30419	0 %	100 %	0 %	0 %	336475988
633	NC_015676	CAA	2	6	30584	30589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475988
634	NC_015676	TGC	2	6	30605	30610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475988
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897	NC_015676	T	6	6	44872	44877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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