MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 chromosome

Total Repeats: 6131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015636	AT	4	8	274	281	50 %	50 %	0 %	0 %	336121002
2	NC_015636	AT	3	6	538	543	50 %	50 %	0 %	0 %	336121002
3	NC_015636	AT	3	6	659	664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015636	TA	3	6	724	729	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
5	NC_015636	AT	3	6	748	753	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
6	NC_015636	AT	3	6	755	760	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
7	NC_015636	AT	4	8	799	806	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
8	NC_015636	AT	3	6	912	917	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
9	NC_015636	TA	3	6	962	967	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
10	NC_015636	AT	3	6	1649	1654	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
11	NC_015636	TA	3	6	1799	1804	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
12	NC_015636	AT	3	6	1969	1974	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
13	NC_015636	TC	3	6	2601	2606	0 %	50 %	0 %	50 %	336121004
14	NC_015636	AT	4	8	3233	3240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015636	GA	3	6	3603	3608	50 %	0 %	50 %	0 %	336121005
16	NC_015636	AT	3	6	3961	3966	50 %	50 %	0 %	0 %	336121006
17	NC_015636	TA	3	6	4577	4582	50 %	50 %	0 %	0 %	336121006
18	NC_015636	AT	4	8	5207	5214	50 %	50 %	0 %	0 %	336121007
19	NC_015636	AT	3	6	5290	5295	50 %	50 %	0 %	0 %	336121007
20	NC_015636	AT	3	6	5423	5428	50 %	50 %	0 %	0 %	336121007
21	NC_015636	GA	3	6	5569	5574	50 %	0 %	50 %	0 %	336121007
22	NC_015636	AT	3	6	5861	5866	50 %	50 %	0 %	0 %	336121007
23	NC_015636	TG	3	6	6396	6401	0 %	50 %	50 %	0 %	336121008
24	NC_015636	AT	3	6	6403	6408	50 %	50 %	0 %	0 %	336121008
25	NC_015636	TA	3	6	6449	6454	50 %	50 %	0 %	0 %	336121008
26	NC_015636	AT	4	8	6549	6556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015636	AT	3	6	6749	6754	50 %	50 %	0 %	0 %	336121009
28	NC_015636	AT	3	6	7351	7356	50 %	50 %	0 %	0 %	336121009
29	NC_015636	TA	3	6	8097	8102	50 %	50 %	0 %	0 %	336121010
30	NC_015636	TA	3	6	8106	8111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015636	TA	3	6	8122	8127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015636	AT	3	6	8131	8136	50 %	50 %	0 %	0 %	336121011
33	NC_015636	TA	3	6	8418	8423	50 %	50 %	0 %	0 %	336121011
34	NC_015636	AT	3	6	8424	8429	50 %	50 %	0 %	0 %	336121011
35	NC_015636	AT	3	6	8590	8595	50 %	50 %	0 %	0 %	336121011
36	NC_015636	TA	3	6	8808	8813	50 %	50 %	0 %	0 %	336121011
37	NC_015636	TA	3	6	8912	8917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015636	TA	4	8	9024	9031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015636	TA	3	6	9054	9059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015636	TA	3	6	10045	10050	50 %	50 %	0 %	0 %	336121012
41	NC_015636	GA	3	6	10173	10178	50 %	0 %	50 %	0 %	336121012
42	NC_015636	AT	3	6	10237	10242	50 %	50 %	0 %	0 %	336121012
43	NC_015636	TA	3	6	11032	11037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015636	CA	3	6	11322	11327	50 %	0 %	0 %	50 %	336121014
45	NC_015636	AT	3	6	11629	11634	50 %	50 %	0 %	0 %	336121015
46	NC_015636	AT	3	6	11800	11805	50 %	50 %	0 %	0 %	336121015
47	NC_015636	AT	3	6	11877	11882	50 %	50 %	0 %	0 %	336121015
48	NC_015636	AT	4	8	12072	12079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015636	TA	3	6	12246	12251	50 %	50 %	0 %	0 %	336121016
50	NC_015636	GA	3	6	12349	12354	50 %	0 %	50 %	0 %	336121016
51	NC_015636	AT	3	6	12409	12414	50 %	50 %	0 %	0 %	336121016
52	NC_015636	GA	3	6	12426	12431	50 %	0 %	50 %	0 %	336121016
53	NC_015636	GA	3	6	12451	12456	50 %	0 %	50 %	0 %	336121016
54	NC_015636	TA	3	6	13949	13954	50 %	50 %	0 %	0 %	336121017
55	NC_015636	AT	3	6	14136	14141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015636	TC	3	6	14308	14313	0 %	50 %	0 %	50 %	336121018
57	NC_015636	AT	4	8	15270	15277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015636	AT	4	8	15376	15383	50 %	50 %	0 %	0 %	336121019
59	NC_015636	AG	3	6	15433	15438	50 %	0 %	50 %	0 %	336121019
60	NC_015636	TA	3	6	15503	15508	50 %	50 %	0 %	0 %	336121019
61	NC_015636	AT	3	6	15550	15555	50 %	50 %	0 %	0 %	336121019
62	NC_015636	TA	5	10	15733	15742	50 %	50 %	0 %	0 %	336121019
63	NC_015636	AT	3	6	16311	16316	50 %	50 %	0 %	0 %	336121020
64	NC_015636	AT	3	6	16393	16398	50 %	50 %	0 %	0 %	336121020
65	NC_015636	TA	3	6	16559	16564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015636	CA	3	6	16765	16770	50 %	0 %	0 %	50 %	336121021
67	NC_015636	TA	4	8	17965	17972	50 %	50 %	0 %	0 %	336121022
68	NC_015636	TA	3	6	18392	18397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015636	TA	3	6	18433	18438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015636	AT	4	8	18491	18498	50 %	50 %	0 %	0 %	336121023
71	NC_015636	TA	3	6	18864	18869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015636	AT	3	6	18879	18884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015636	TA	3	6	18891	18896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015636	AT	3	6	18993	18998	50 %	50 %	0 %	0 %	336121024
75	NC_015636	AT	3	6	19399	19404	50 %	50 %	0 %	0 %	336121024
76	NC_015636	CA	3	6	19824	19829	50 %	0 %	0 %	50 %	336121025
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79	NC_015636	AT	3	6	20959	20964	50 %	50 %	0 %	0 %	336121026
80	NC_015636	TA	3	6	21150	21155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015636	TA	3	6	21203	21208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015636	TA	3	6	21235	21240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015636	TA	4	8	21249	21256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015636	AT	3	6	21265	21270	50 %	50 %	0 %	0 %	336121027
85	NC_015636	AT	3	6	21550	21555	50 %	50 %	0 %	0 %	336121027
86	NC_015636	AT	3	6	21639	21644	50 %	50 %	0 %	0 %	336121027
87	NC_015636	TC	3	6	21651	21656	0 %	50 %	0 %	50 %	336121027
88	NC_015636	AG	3	6	21845	21850	50 %	0 %	50 %	0 %	336121027
89	NC_015636	TC	3	6	21874	21879	0 %	50 %	0 %	50 %	336121027
90	NC_015636	AT	3	6	23392	23397	50 %	50 %	0 %	0 %	336121028
91	NC_015636	AT	3	6	23757	23762	50 %	50 %	0 %	0 %	336121028
92	NC_015636	AT	3	6	24881	24886	50 %	50 %	0 %	0 %	336121028
93	NC_015636	CA	3	6	25326	25331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015636	AC	3	6	25600	25605	50 %	0 %	0 %	50 %	336121029
95	NC_015636	AT	3	6	25676	25681	50 %	50 %	0 %	0 %	336121030
96	NC_015636	AT	3	6	25686	25691	50 %	50 %	0 %	0 %	336121030
97	NC_015636	TA	3	6	26045	26050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015636	TA	3	6	26120	26125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015636	AT	3	6	26532	26537	50 %	50 %	0 %	0 %	336121031
100	NC_015636	CT	3	6	27007	27012	0 %	50 %	0 %	50 %	336121031
101	NC_015636	TA	3	6	27033	27038	50 %	50 %	0 %	0 %	336121031
102	NC_015636	TA	4	8	27492	27499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015636	AT	3	6	27860	27865	50 %	50 %	0 %	0 %	336121032
104	NC_015636	TA	3	6	28179	28184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015636	AT	3	6	28488	28493	50 %	50 %	0 %	0 %	336121033
106	NC_015636	GA	3	6	28637	28642	50 %	0 %	50 %	0 %	336121033
107	NC_015636	AT	4	8	29188	29195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015636	AT	3	6	29655	29660	50 %	50 %	0 %	0 %	336121034
109	NC_015636	AT	3	6	29893	29898	50 %	50 %	0 %	0 %	336121034
110	NC_015636	AT	3	6	30135	30140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015636	AT	3	6	30251	30256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015636	TA	3	6	30455	30460	50 %	50 %	0 %	0 %	336121035
113	NC_015636	AG	3	6	30478	30483	50 %	0 %	50 %	0 %	336121035
114	NC_015636	AT	3	6	30542	30547	50 %	50 %	0 %	0 %	336121035
115	NC_015636	AT	3	6	30624	30629	50 %	50 %	0 %	0 %	336121035
116	NC_015636	TA	3	6	30668	30673	50 %	50 %	0 %	0 %	336121035
117	NC_015636	AT	3	6	30766	30771	50 %	50 %	0 %	0 %	336121035
118	NC_015636	TA	3	6	30839	30844	50 %	50 %	0 %	0 %	336121035
119	NC_015636	TA	4	8	30965	30972	50 %	50 %	0 %	0 %	336121035
120	NC_015636	TA	3	6	31381	31386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015636	TA	4	8	31418	31425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015636	TA	3	6	31510	31515	50 %	50 %	0 %	0 %	336121036
123	NC_015636	AT	3	6	31600	31605	50 %	50 %	0 %	0 %	336121036
124	NC_015636	AT	3	6	31982	31987	50 %	50 %	0 %	0 %	336121036
125	NC_015636	GA	3	6	31989	31994	50 %	0 %	50 %	0 %	336121036
126	NC_015636	CA	3	6	32808	32813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015636	AT	3	6	33074	33079	50 %	50 %	0 %	0 %	336121037
128	NC_015636	AT	3	6	33414	33419	50 %	50 %	0 %	0 %	336121037
129	NC_015636	AT	3	6	33713	33718	50 %	50 %	0 %	0 %	336121037
130	NC_015636	TA	3	6	33994	33999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015636	AT	3	6	34472	34477	50 %	50 %	0 %	0 %	336121038
132	NC_015636	AT	3	6	34714	34719	50 %	50 %	0 %	0 %	336121039
133	NC_015636	AT	3	6	34915	34920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015636	AT	3	6	35653	35658	50 %	50 %	0 %	0 %	336121040
135	NC_015636	TA	3	6	35770	35775	50 %	50 %	0 %	0 %	336121040
136	NC_015636	AT	3	6	35955	35960	50 %	50 %	0 %	0 %	336121040
137	NC_015636	AT	3	6	36014	36019	50 %	50 %	0 %	0 %	336121040
138	NC_015636	AT	3	6	36546	36551	50 %	50 %	0 %	0 %	336121041
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140	NC_015636	AT	3	6	36798	36803	50 %	50 %	0 %	0 %	336121041
141	NC_015636	AT	4	8	36920	36927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015636	TA	3	6	37137	37142	50 %	50 %	0 %	0 %	336121042
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144	NC_015636	AT	3	6	37607	37612	50 %	50 %	0 %	0 %	336121042
145	NC_015636	TA	3	6	37635	37640	50 %	50 %	0 %	0 %	336121042
146	NC_015636	AT	5	10	37894	37903	50 %	50 %	0 %	0 %	336121042
147	NC_015636	AT	4	8	38261	38268	50 %	50 %	0 %	0 %	336121043
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