MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 chromosome

Total Repeats: 5854

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015636	ACAT	2	8	105	112	50 %	25 %	0 %	25 %	336121002
2	NC_015636	TTAA	2	8	604	611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015636	ATTA	2	8	618	625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015636	TTTA	2	8	810	817	25 %	75 %	0 %	0 %	336121003
5	NC_015636	ATTA	2	8	985	992	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
6	NC_015636	TGAT	2	8	1480	1487	25 %	50 %	25 %	0 %	336121004
7	NC_015636	ATAA	2	8	1572	1579	75 %	25 %	0 %	0 %	336121004
8	NC_015636	ATTA	2	8	1733	1740	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
9	NC_015636	ATTT	2	8	2068	2075	25 %	75 %	0 %	0 %	336121004
10	NC_015636	TAAA	2	8	2431	2438	75 %	25 %	0 %	0 %	336121004
11	NC_015636	TGGA	2	8	3268	3275	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015636	AAAC	2	8	3510	3517	75 %	0 %	0 %	25 %	336121005
13	NC_015636	CAAA	2	8	4409	4416	75 %	0 %	0 %	25 %	336121006
14	NC_015636	GAAA	2	8	4503	4510	75 %	0 %	25 %	0 %	336121006
15	NC_015636	TCAA	2	8	5347	5354	50 %	25 %	0 %	25 %	336121007
16	NC_015636	AATT	2	8	6039	6046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015636	AAGA	2	8	6765	6772	75 %	0 %	25 %	0 %	336121009
18	NC_015636	ATTT	2	8	6960	6967	25 %	75 %	0 %	0 %	336121009
19	NC_015636	ATAA	2	8	7002	7009	75 %	25 %	0 %	0 %	336121009
20	NC_015636	TTAT	2	8	7329	7336	25 %	75 %	0 %	0 %	336121009
21	NC_015636	GATA	2	8	7647	7654	50 %	25 %	25 %	0 %	336121010
22	NC_015636	GACT	2	8	8000	8007	25 %	25 %	25 %	25 %	336121010
23	NC_015636	TATT	2	8	8948	8955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015636	TAAT	2	8	8992	8999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015636	GAAA	2	8	9131	9138	75 %	0 %	25 %	0 %	336121012
26	NC_015636	GTGG	2	8	9681	9688	0 %	25 %	75 %	0 %	336121012
27	NC_015636	ATAA	2	8	10510	10517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015636	GAAT	2	8	11372	11379	50 %	25 %	25 %	0 %	336121014
29	NC_015636	TAAG	2	8	11536	11543	50 %	25 %	25 %	0 %	336121015
30	NC_015636	ATAA	2	8	12063	12070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015636	ATGT	2	8	12081	12088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015636	CAAA	2	8	12267	12274	75 %	0 %	0 %	25 %	336121016
33	NC_015636	GTTT	2	8	12293	12300	0 %	75 %	25 %	0 %	336121016
34	NC_015636	TAAA	2	8	12393	12400	75 %	25 %	0 %	0 %	336121016
35	NC_015636	AAAT	2	8	12822	12829	75 %	25 %	0 %	0 %	336121016
36	NC_015636	TTAA	2	8	12898	12905	50 %	50 %	0 %	0 %	336121016
37	NC_015636	TTAA	2	8	12915	12922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015636	ATTT	2	8	13022	13029	25 %	75 %	0 %	0 %	336121017
39	NC_015636	CATA	2	8	13694	13701	50 %	25 %	0 %	25 %	336121017
40	NC_015636	AATA	2	8	14031	14038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015636	TATT	2	8	14114	14121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015636	ATTA	2	8	14146	14153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015636	TTCC	2	8	14364	14371	0 %	50 %	0 %	50 %	336121018
44	NC_015636	TAGG	2	8	14872	14879	25 %	25 %	50 %	0 %	336121018
45	NC_015636	ATTT	2	8	15302	15309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015636	ATTT	2	8	15353	15360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015636	ATTA	2	8	15727	15734	50 %	50 %	0 %	0 %	336121019
48	NC_015636	ATGA	2	8	16214	16221	50 %	25 %	25 %	0 %	336121020
49	NC_015636	GGAA	2	8	16863	16870	50 %	0 %	50 %	0 %	336121021
50	NC_015636	GTTG	2	8	17122	17129	0 %	50 %	50 %	0 %	336121021
51	NC_015636	TTGG	2	8	17186	17193	0 %	50 %	50 %	0 %	336121021
52	NC_015636	AGAT	2	8	17988	17995	50 %	25 %	25 %	0 %	336121022
53	NC_015636	ACCA	2	8	18067	18074	50 %	0 %	0 %	50 %	336121022
54	NC_015636	AAAG	2	8	18719	18726	75 %	0 %	25 %	0 %	336121023
55	NC_015636	TTTC	2	8	18807	18814	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015636	TGAG	2	8	19050	19057	25 %	25 %	50 %	0 %	336121024
57	NC_015636	TTCA	2	8	19908	19915	25 %	50 %	0 %	25 %	336121025
58	NC_015636	TAAA	2	8	19989	19996	75 %	25 %	0 %	0 %	336121025
59	NC_015636	TATT	2	8	20279	20286	25 %	75 %	0 %	0 %	336121026
60	NC_015636	TCTT	2	8	20405	20412	0 %	75 %	0 %	25 %	336121026
61	NC_015636	TCCA	2	8	20607	20614	25 %	25 %	0 %	50 %	336121026
62	NC_015636	TGAA	2	8	20985	20992	50 %	25 %	25 %	0 %	336121026
63	NC_015636	ATTT	2	8	21014	21021	25 %	75 %	0 %	0 %	336121026
64	NC_015636	TTAA	2	8	21257	21264	50 %	50 %	0 %	0 %	336121027
65	NC_015636	TTTA	2	8	21287	21294	25 %	75 %	0 %	0 %	336121027
66	NC_015636	ATGT	2	8	23463	23470	25 %	50 %	25 %	0 %	336121028
67	NC_015636	CAAT	2	8	23572	23579	50 %	25 %	0 %	25 %	336121028
68	NC_015636	AATA	2	8	23768	23775	75 %	25 %	0 %	0 %	336121028
69	NC_015636	ATTT	2	8	23776	23783	25 %	75 %	0 %	0 %	336121028
70	NC_015636	CCTA	2	8	24107	24114	25 %	25 %	0 %	50 %	336121028
71	NC_015636	GGCA	2	8	24160	24167	25 %	0 %	50 %	25 %	336121028
72	NC_015636	TAAA	2	8	25305	25312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015636	TAAT	2	8	25337	25344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015636	ACAG	2	8	25697	25704	50 %	0 %	25 %	25 %	336121030
75	NC_015636	ATAA	2	8	26104	26111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015636	TTTA	2	8	26163	26170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015636	TAAT	2	8	26186	26193	50 %	50 %	0 %	0 %	336121031
78	NC_015636	TAAT	2	8	26261	26268	50 %	50 %	0 %	0 %	336121031
79	NC_015636	TTGC	2	8	26647	26654	0 %	50 %	25 %	25 %	336121031
80	NC_015636	AATA	2	8	27240	27247	75 %	25 %	0 %	0 %	336121031
81	NC_015636	GAAT	2	8	27277	27284	50 %	25 %	25 %	0 %	336121031
82	NC_015636	TTTA	2	8	27419	27426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015636	TTTA	2	8	27898	27905	25 %	75 %	0 %	0 %	336121032
84	NC_015636	ATGA	2	8	28026	28033	50 %	25 %	25 %	0 %	336121032
85	NC_015636	TAAT	2	8	28134	28141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015636	AAAT	2	8	29825	29832	75 %	25 %	0 %	0 %	336121034
87	NC_015636	TAAT	2	8	30111	30118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015636	ACCC	2	8	30315	30322	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_015636	GGAT	2	8	30760	30767	25 %	25 %	50 %	0 %	336121035
90	NC_015636	AGAT	2	8	30845	30852	50 %	25 %	25 %	0 %	336121035
91	NC_015636	ATTT	2	8	30862	30869	25 %	75 %	0 %	0 %	336121035
92	NC_015636	ATAA	2	8	31343	31350	75 %	25 %	0 %	0 %	336121035
93	NC_015636	AATG	2	8	31357	31364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015636	ATAA	2	8	31391	31398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015636	CATC	2	8	31547	31554	25 %	25 %	0 %	50 %	336121036
96	NC_015636	ATGT	2	8	31786	31793	25 %	50 %	25 %	0 %	336121036
97	NC_015636	TATT	2	8	31841	31848	25 %	75 %	0 %	0 %	336121036
98	NC_015636	GCAA	2	8	32000	32007	50 %	0 %	25 %	25 %	336121036
99	NC_015636	TTCA	2	8	32143	32150	25 %	50 %	0 %	25 %	336121036
100	NC_015636	TAAA	2	8	32268	32275	75 %	25 %	0 %	0 %	336121036
101	NC_015636	TGTT	2	8	32613	32620	0 %	75 %	25 %	0 %	336121036
102	NC_015636	TAAT	2	8	32664	32671	50 %	50 %	0 %	0 %	336121036
103	NC_015636	TATG	2	8	32972	32979	25 %	50 %	25 %	0 %	336121037
104	NC_015636	GAAA	2	8	33280	33287	75 %	0 %	25 %	0 %	336121037
105	NC_015636	TAAA	2	8	33308	33315	75 %	25 %	0 %	0 %	336121037
106	NC_015636	AAAT	2	8	33776	33783	75 %	25 %	0 %	0 %	336121037
107	NC_015636	ATAA	2	8	33921	33928	75 %	25 %	0 %	0 %	336121037
108	NC_015636	TAAA	2	8	34124	34131	75 %	25 %	0 %	0 %	336121038
109	NC_015636	AAAT	2	8	34188	34195	75 %	25 %	0 %	0 %	336121038
110	NC_015636	AGAA	2	8	34272	34279	75 %	0 %	25 %	0 %	336121038
111	NC_015636	AATC	2	8	34937	34944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015636	ATTA	2	8	35097	35104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015636	AATA	2	8	35155	35162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015636	AAAG	2	8	35346	35353	75 %	0 %	25 %	0 %	336121040
115	NC_015636	GGCA	2	8	35369	35376	25 %	0 %	50 %	25 %	336121040
116	NC_015636	TGTT	2	8	35620	35627	0 %	75 %	25 %	0 %	336121040
117	NC_015636	AGTT	2	8	36125	36132	25 %	50 %	25 %	0 %	336121040
118	NC_015636	TAAA	2	8	36230	36237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015636	TTAT	2	8	36990	36997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015636	ATGC	2	8	37020	37027	25 %	25 %	25 %	25 %	336121042
121	NC_015636	ACAA	2	8	37440	37447	75 %	0 %	0 %	25 %	336121042
122	NC_015636	AAAG	2	8	37623	37630	75 %	0 %	25 %	0 %	336121042
123	NC_015636	AAAG	2	8	37641	37648	75 %	0 %	25 %	0 %	336121042
124	NC_015636	ATTT	2	8	37836	37843	25 %	75 %	0 %	0 %	336121042
125	NC_015636	TCAT	2	8	37904	37911	25 %	50 %	0 %	25 %	336121042
126	NC_015636	AGTT	2	8	38053	38060	25 %	50 %	25 %	0 %	336121042
127	NC_015636	ATTA	2	8	38078	38085	50 %	50 %	0 %	0 %	336121042
128	NC_015636	GAAA	2	8	38542	38549	75 %	0 %	25 %	0 %	336121043
129	NC_015636	TGGG	2	8	38564	38571	0 %	25 %	75 %	0 %	336121043
130	NC_015636	TAAA	2	8	39493	39500	75 %	25 %	0 %	0 %	336121043
131	NC_015636	ATTT	2	8	39868	39875	25 %	75 %	0 %	0 %	336121044
132	NC_015636	ATAA	2	8	39940	39947	75 %	25 %	0 %	0 %	336121044
133	NC_015636	CCCT	2	8	40024	40031	0 %	25 %	0 %	75 %	336121044
134	NC_015636	ATTT	2	8	40100	40107	25 %	75 %	0 %	0 %	336121044
135	NC_015636	GCAT	2	8	40408	40415	25 %	25 %	25 %	25 %	336121045
136	NC_015636	CCCA	2	8	41184	41191	25 %	0 %	0 %	75 %	336121045
137	NC_015636	TTTC	2	8	41457	41464	0 %	75 %	0 %	25 %	336121046
138	NC_015636	ATCT	2	8	41747	41754	25 %	50 %	0 %	25 %	336121046
139	NC_015636	TATT	2	8	41809	41816	25 %	75 %	0 %	0 %	336121046
140	NC_015636	CATA	2	8	41960	41967	50 %	25 %	0 %	25 %	336121046
141	NC_015636	TACT	2	8	42965	42972	25 %	50 %	0 %	25 %	336121048
142	NC_015636	ATTA	2	8	43669	43676	50 %	50 %	0 %	0 %	336121049
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144	NC_015636	TTTA	2	8	43915	43922	25 %	75 %	0 %	0 %	336121049
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